Kinetic analysis of a protein tyrosine kinase reaction transition state in the forward and reverse directions

Journal of the American Chemical Society

Volumn 120, Issue 28, 1998, Pages 6851-6858

  Kim, Kyonghee ^a   Cole, Philip A ^a  

^a ROCKEFELLER UNIVERSITY   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

PROTEIN TYROSINE KINASE;

ARTICLE; CATALYSIS; CONFORMATIONAL TRANSITION; ENZYME ACTIVITY; ENZYME KINETICS; REACTION ANALYSIS; SIGNAL TRANSDUCTION;

EID: 0032558125     PISSN: 00027863     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ja9808393     Document Type: Article

References (46)

1. (a) Hunter, T. Cell 1995, 80, 225-236.
2. (b) Shokat, K. M. Chem. Biol. 1995, 2, 509-514.
3. (a) Cheng, H. J.; Flanagan, J. G. Cell 1994, 79, 157-168.
4. (b) Banker, N.; Evers, B. M.; Hellmich, M. R.; Townsend, C. M. Surg. Oncol. 1996, 5, 201-210.
5. (c) Creedon, D. J.; Tansey, M. G.; Baloh, R. H.; Osborne, P. A.; Lampe, P. A.; Fahrner, T. J.; Heuckeroth, R. O.; Millbrandt, J.; Johnson, E. M. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1997, 94, 7018-7023.
6. (d) White, M. F.; Kahn, C. R. J. Biol. Chem. 1994, 269, 1-4.
7. (e) Heyeck, S. D.; Wilcox, H. M.; Bunnell, S. C.; Berg, L. J. J. Biol. Chem. 1997, 272, 25401-25408.
8. (a) Levitzki, A.; Gazit, A. Science 1995, 267, 1782-1788.
9. (b) Mohammadi, M.; McMahon, G.; Sun, L.; Tang, C.; Hirth, P.; Yeh, B. K.; Hubbard, S. R.; Schlessinger, J. Science 1997, 276, 955-960.
10. (a) Madhusudan; Trafny, E. A.; Xuong, N.-H.; Adams, J. A.; Ten Eyck, L. F.; Taylor, S. S.; Sowadski, J. M. Protein Sci. 1994, 3, 176-187.
11. (b) Johnson, L. N.; Noble, M. E. M.; Owen, D. J. Cell 1996, 85, 149-158.
12. (c) Xu, W.; Harrison, S. C.; Eck, M. J. Nature 1997, 385, 595-601.
13. (d) Sicheri, F.; Moarefi, I.; Kuriyan, J. Nature 1997, 385, 602-608.
14. (a) Admiraal, S. J.; Herschlag, D. Chem. Biol. 1995, 2, 729-739.
15. (b) Maegley, K. A.; Admiraal, S. J.; Herschlag, D. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1996, 93, 8160-8166.
16. (a) Mildvan, A. S.; Fry, D. C. Adv. Enzymol. Relat. Areas Mol. Biol. 1987, 59, 241-313.
17. (b) Schlichting, I.; Reinstein, J. Biochemistry 1997, 36, 9290-9296.
18. (c) Granot, J.; Mildvan, A. S.; Bramson, H. N.; Kaiser, E. T. Biochemistry 1980, 19, 3537-3543.
19. (a) Khan, S. A.; Kirby, A. J. J. Chem. Soc. B, 1970, 1172-1182.
20. (b) Epstein. J.; Plapinger, R. E.; Michel, H. O.; Cable, J. R.; Stephani, R. A.; Billington, C. A.; West, G. R. J. Am. Chem. Soc. 1964. 86, 3075-3084.
21. (a) Bossemeyer, D.; Engh, R. A.; Kinzel, V.; Ponstingl, H.; Huber, R. EMBO J. 1993, 12, 849-859.
22. (b) Zheng, J.; Knighton, D. R.; Ten Eyck, L. F.; Karlsson, R.; Xuong, N.-H.; Taylor, S. S.; Sowadski, J. M. Biochemistry 1993, 32, 2154-2161.
23. Jencks, W. P. Catalysis in Chemistry and Enzymology; McGrawHill: New York, 1969.
24. (a) Kirby, A. J.; Varvoglis, A. G. J. Chem. Soc. B 1968, 135-141.
25. (b) Herschlag, D.; Jencks, W. P. J. Am. Chem. Soc. 1987, 109, 4665-4674.
26. Kim, K.; Cole, P. A. J. Am. Chem. Soc. 1997, 119, 11096-11097.
27. Kirby, A. J.; Varvoglis, A. G. J. Am. Chem. Soc. 1967, 89, 415-423.
28. Filler, R.; Ayyangar, N. R.; Gustowski, W.; Kang, H. H. J. Org. Chem. 1969, 34, 534-538.
29. (a) Hebel, D.; Furlano, D. C.; Phillips, R. S.; Koushik, S.; Creveling, C. R.; Kirk, K. L. Bioorg. Med. Chem. Lett. 1992, 2, 41-44.
30. (b) Nagasawa, T.; Utagawa, T.; Goto, J.; Kim C.-J.; Tani, Y.; Kumagai, H.; Yamada, H. Eur. J. Biochem. 1981, 117, 33-40.
31. (a) Dixon, M.; Webb, E. C. Enzymes; Academic Press: New York, 1964.
32. (b) Wu, C. Y.; Arnett, E. M. J. Am. Chem. Soc. 1960, 82, 5660-5665.
33. 24
34. Herschlag, D.; Jencks, W. P. J. Am. Chem. Soc. 1989, 111, 7587-7596.
35. Kirby, A. J.; Younas, M. J. Chem. Soc. B. 1970, 1165-1172.
36. Boerner, R. J.; Barker, S. C.; Knight, W. B. Biochemistry 1995, 34, 16419-16423.
37. Oliver, I. T. J. Biol. Chem. 1955, 61, 116-122.
38. Grace, M. R.; Walsh, C. T.; Cole, P. A. Biochemistry 1997, 36, 1874-1881.
39. Williams, A. Adv. Phys. Org. Chem. 1992, 27, 1-55.
40. Hubbard, S. R. EMBO J. 1997 16, 5572-5581.
41. Cole, P. A.; Grace, M. R.; Phillips, R. S.; Burn, P.; Walsh, C. T. J. Biol. Chem. 1995, 270, 22105-22108.
42. Gibbs, C. S.; Zoller, M. J. Biochemistry 1991, 30, 8923-8931.
43. Zhou, J.; Adams, J. A. Biochemistry 1997, 36, 2977-2984.
44. Jones, J. P.; Weiss, P. M.; Cleland, W. W. Biochemistry 1991, 30, 3634-3639.
45. Mildvan, A. S. Proteins: Struct. Funct. Genet. 1997, 29, 401-416.
46. Chen, H.; Gollnick, P.; Phillips, R. S. Eur. J. Biochem. 1995, 229, 540-549.