Multiple pathways process stalled replication forks

Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America

Volumn 101, Issue 35, 2004, Pages 12783-12788

  Michel, Bénédicte ^a   Grompone, Gianfranco ^a,b   Florès, Maria Jose ^a   Bidnenko, Vladimir ^a  

^a CEMAGREF   (France)

^b INSTITUT PASTEUR   (France)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

DOUBLE STRANDED DNA; HYDROXYUREA; RECA PROTEIN; RIBONUCLEOTIDE REDUCTASE; SINGLE STRANDED DNA;

DNA DAMAGE; DNA REPAIR; DNA REPLICATION; DNA STRAND BREAKAGE; DNA SUPERCOILING; ESCHERICHIA COLI; GENETIC RECOMBINATION; MUTAGENESIS; MUTANT; NONHUMAN; PRIORITY JOURNAL; REVIEW; ULTRAVIOLET IRRADIATION;

BACTERIA; DNA; DNA GYRASE; DNA REPAIR; DNA REPLICATION; MUTATION;

ESCHERICHIA COLI; PROKARYOTA;

EID: 4444267632     PISSN: 00278424     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1073/pnas.0401586101     Document Type: Review

References (70)

1. Kogoma, T. (1997) Microbiol. Mol. Biol. Rev. 61, 212-238.
2. Sandler, S. J. & Marians, K. J. (2000) J. Bacteriol. 182, 9-13.
3. Xu, L. & Marians, K. J. (2003) Mol. Cell 11, 817-826.
4. Kraus, E., Leung, W. Y. & Haber, J. E. (2001) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 98, 8255-8262.
5. Ira, G. & Haber, J. E. (2002) Mol. Cell. Biol. 22, 6384-6392.
6. Higgins, N. P., Kato, K. & Strauss, B. (1976) J. Mol. Biol. 101, 417-425.
7. Tatsumi, K. & Strauss, B. (1978) Nucleic Acids Res. 5, 331-347.
8. Seigneur, M., Bidnenko, V., Ehrlich, S. D. & Michel, B. (1998) Cell 95, 419-430.
9. Michel, B., Flores, M. J., Viguera, E., Grompone, G., Seigneur, M. & Bidnenko, V. (2001) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 98, 8181-8188.
10. Kuzminov, A. (1999) Microbiol. Mol. Biol. Rev. 63, 751-813.
11. Taylor, A. F. & Smith, G. R. (2003) Nature 423, 889-893.
12. Dillingham, M. S., Spies, M. & Kowalczykowski, S. C. (2003) Nature 423, 893-897.
13. Spies, M., Bianco, P. R., Dillingham, M. S., Handa, N., Baskin, R. J. & Kowalczykowski, S. C. (2003) Cell 114, 647-654.
14. Whitby, M. C., Vincent, S. D. & Lloyd, R. G. (1994) EMBO J. 13, 5220-5228.
15. West, S. C. (1997) Annu. Rev. Genet. 31, 213-244.
16. Sandler, S. J., Samra, H. S. & Clark, A. J. (1996) Genetics 143, 5-13.
17. Kogoma, T., Cadwell, G. W., Barnard, K. G. & Asai, T. (1996) J. Bacteriol. 178, 1258-1264.
18. Flores, M. J., Bierne, H., Ehrlich, S. D. & Michel, B. (2001) EMBO J. 20, 619-629.
19. Grompone, G., Seigneur, M., Ehrlich, S. D. & Michel, B. (2002) Mol. Microbiol. 44, 1331-1339.
20. Gruss, A. & Michel, B. (2001) Curr. Opin. Microbiol. 4, 595-601.
21. Flores, M. J., Ehrlich, S. D. & Michel, B. (2002) Mol. Microbiol. 44, 783-792.
22. Paques, F. & Haber, J. E. (1999) Microbiol. Mol. Biol. Rev. 63, 349-404.
23. Prado, F., Cortes-Ledesma, F., Huertas, P. & Aguilera, A. (2003) Curr. Genet. 42, 185-198.
24. Seigneur, M., Ehrlich, S. D. & Michel, B. (2000) Mol. Microbiol. 38, 565-574.
25. Robu, M. E., Inman, R. B. & Cox, M. M. (2001) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 98, 8211-8218.
26. Morimatsu, K. & Kowalczykowski, S. C. (2003) Mol. Cell. 11, 1337-1347.
27. Postow, L., Ullsperger, C., Keller, R. W., Bustamante, C., Vologodskii, A. V. & Cozzarelli, N. R. (2001) J. Biol. Chem. 276, 2790-2796.
28. Olavarrieta, L., MartinezRobles, M. L., Sogo, J. M., Stasiak, A., Hernandez, P., Krimer, D. B. & Schvartzman, J. B. (2002) Nucleic Acids Res. 30, 656-666.
29. Liu, L. F. & Wang, J. C. (1987) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 84, 7024-7027.
30. Khodursky, A. B., Peter, B. J., Schmidt, M. B., DeRisi, J., Botstein, D., Brown, P. O. & Cozzarelli, N. R. (2000) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 97, 9419-9424.
31. Grompone, G., Ehrlich, S. D. & Michel, B. (2003) Mol. Microbiol. 48, 845-854.
32. Levine, C., Hiasa, H. & Marians, K. J. (1998) Biochim. Biophys. Acta 1400, 29-43.
33. Postow, L., Peter, B. J. & Cozzarelli, N. B. (1999) BioEssays 21, 805-808.
34. Bidnenko, V., Ehrlich, S. D. & Michel, B. (2002) EMBO J. 21, 3898-3907.
35. Hill, T. M. (1996) in Escherichia coli and Salmonella thyphimurium: Cellular and Molecular Biology, eds. Neidhardt, F. C., Curtiss, R., III, Ingraham, J. L., Lin, E. C. C., Low, K. B., Magasanik, B., Reznikoff, W. S., Riley, M., Schaechter, M. & Umbarger, H. E. (Am. Soc. Microbiol., Washington, DC), pp. 1602-1614.
36. Kuzminov, A. (1995) Mol. Microbiol. 16, 373-384.
37. Kuzminov, A. (2001) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 98, 8241-8246.
38. Setlow, R. B., Swenson, P. A. & Carrier, W. L. (1963) Science 142, 1464-1466.
39. Khidhir, M. A., Casaregola, S. & Holland, I. B. (1985) Mol. Gen. Genet. 199, 133-140.
40. Witkin, E. M. (1991) Biochimie 73, 133-141.
41. Courcelle, J., CarswellCrumpton, C. & Hanawalt, P. C. (1997) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 94, 3714-3719.
42. Rangarajan, S., Woodgate, R. & Goodman, M. F. (2002) Mol. Microbiol. 43, 617-628.
43. Chow, K. H. & Courcelle, J. (2004) J. Biol. Chem. 279, 3492-3496.
44. Courcelle, J. & Hanawalt, P. C. (2003) Annu. Rev. Genet. 37, 611-646.
45. Wang, T. C. & Smith, K. C. (1983) J. Bacteriol. 156, 1093-1098.
46. Rupp, W. D. & Howard-Flanders, P. (1968) J. Mol. Biol. 31, 291-304.
47. Wang, T. C. & Smith, K. C. (1986) Mutat. Res. 165, 39-44.
48. McPartland, A., Green, L. & Echols, H. (1980) Cell 20, 731-737.
49. Sommer, S., Boudsocq, F., Devoret, R. & Bailone, A. (1998) Mol. Microbiol. 28, 281-291.
50. Pham, P., Bertram, J. G., ODonnell, M., Woodgate, R. & Goodman, M. F. (2001) Nature 409, 366-370.
51. Donaldson, J. R., Courcelle, C. T. & Courcelle, J. (2004) Genetics 166, 1631-1640.
52. Pages, V. & Fuchs, R. P. (2003) Science 300, 1300-1303.
53. Higuchi, K., Katayama, T., Iwai, S., Hidaka, M., Horiuchi, T. & Maki, H. (2003) Genes Cells 8, 437-449.
54. McGlynn, P. & Lloyd, R. G. (2000) Cell 101, 35-45.
55. McGlynn, P., Lloyd, R. G. & Marians, K. J. (2001) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 98, 8235-8240.
56. Robu, M. E., Inman, R. B. & Cox, M. M. (2004) J. Biol. Chem. 10973-10981.
57. McGlynn, P. & Lloyd, R. G. (2002) Nat. Rev. Mol. Cell. Biol. 3, 859-870.
58. Marians, K. J. (2000) Trends Biochem. Sci. 25, 185-189.
59. Grompone, G., Ehrlich, S. D. & Michel, B. (2004) EMBO Rep. 5, 607-612.
60. Beam, C. E., Saveson, C. J. & Lovett, S. T. (2002) J. Bacteriol. 184, 6836-6844.
61. Grigorian, A. V., Lustig, R. B., Guzman, E. C., Mahaffy, J. M. & Zyskind, J. W. (2003) J. Bacteriol. 185, 630-644.
62. Simmons, L. A., Breier, A. M., Cozzarelli, N. R. & Kaguni, J. M. (2004) Mol. Microbiol. 51, 349-358.
63. Schapiro, J. M., Libby, S. J. & Fang, F. C. (2003) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 100, 8496-8501.
64. Nyberg, K. A., Michelson, R. J., Putnam, C. W. & Weinert, T. A. (2002) Annu. Rev. Genet. 36, 617-656.
65. Longhese, M. P., Clerici, M. & Lucchini, G. (2003) Mutat. Res. 532, 41-58.
66. Kai, M. & Wang, T. S. (2003) Mutat. Res. 532, 59-73.
67. Michel, B. (2000) Trends Biochem. Sci. 25, 173-178.
68. Kolodner, R. D., Putnam, C. D. & Myung, K. (2002) Science 297, 552-557.
69. Michel, B., Ehrlich, S. D. & Uzest, M. (1997) EMBO J. 16, 430-438.
70. Sogo, J. M., Lopes, M. & Foiani, M. (2002) Science 297, 599-602.