Photophysics and X-ray structure of crystalline 2-aminopurine

ChemPhysChem

Volumn 8, Issue 7, 2007, Pages 1095-1102

  Neely, Robert K ^a   Magennis, Steven W ^a   Parsons, Simon ^a   Jones, Anita C ^a  

^a UNIVERSITY OF EDINBURGH   (United Kingdom)

Author keywords

DNA; Fluorescence; Fluorescence lifetime; Nucleic acids; X ray diffraction

Indexed keywords

CRYSTAL STRUCTURE; DNA; EMISSION SPECTROSCOPY; FLUORESCENCE; GROUND STATE; HYDROGEN BONDS; NUCLEIC ACIDS; OLIGONUCLEOTIDES; PHOTOPHYSICS; RED SHIFT; X RAY DIFFRACTION;

EXCITATION AND EMISSION SPECTRA; FLUORESCENCE LIFETIMES; FLUORESCENCE PROPERTIES; HYDROGEN BONDING INTERACTIONS; INTER-MODULAR INTERACTIONS; INTERMOLECULAR INTERACTIONS; OLIGONUCLEOTIDE DUPLEXES; RED-SHIFTED EMISSION;

EXCITED STATES;

EID: 34249283102     PISSN: 14394235     EISSN: 14397641     Source Type: Journal    
DOI: 10.1002/cphc.200600593     Document Type: Article

References (51)

1. P. R. Callis, Annu. Rev. Phys. Chem. 1983, 34, 329-357.
2. L. Stryer, D. C. Ward, E. Reich, J. Biol. Chem. 1969, 244, 1228-1237.
3. T. J. Su, B. A. Connolly, C. Darlington, R. Mallin, D. T. F. Dryden, Nucleic Acids Res. 2004, 32, 2223-2230.
4. B. W. Allan, N. O. Reich, Biochemistry 1996, 35, 14 757-14 762.
5. Y. V. R. Reddy, D. N. Rao, J. Mol. Biol. 2000, 298, 597-610.
6. B. Holz, S. Klimasauskas, S. Serva, E. Weinhold, Nucleic Acids Res. 1998, 26, 1076-1083.
7. J. T. Stivers, Nucleic Acids Res. 1998, 26, 3837-3844.
8. E. L. Rachofsky, E. Seibert, J. T. Stivers, R. Osman, J. B. A. Ross, Biochemistry 2001, 40, 957-967.
9. D. Daujotyte, S. Serva, G. Vilkaitis, E. Merkiene, D. Venclovas, S. Klimasauskas, Structure 2004, 12, 1047-1055.
10. G. Vilkaitis, A. Dong, E. Weinhold, X. Cheng, S. Klimasauskas, J. Biol. Chem. 2000, 275, 38 722-38 730.
11. S. O. Kelley, J. K. Barton, Science 1999, 283, 375-381.
12. M. A. O'Neill, H. C. Becker, C. Z. Wan, J. K. Barton, A. H. Zewail, Angew. Chem. 2003, 115, 1676-1680;
13. Angew. Chem. Int. Ed. 2003, 42, 5896-5900.
14. M. A. O'Neill, J. K. Barton, J. Am. Chem. Soc. 2002, 124, 13 053-13 066.
15. M. A. O'Neill, J. K. Barton, J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 13 234-13 235.
16. M. A. O'Neill, J. K. Barton, J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 11 471-11 483.
17. M. A. O'Neill, J. K. Barton, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2002, 99, 16 543-16 550.
18. C. Wan, T. Fiebig, S. O. Kelley, C. R. Treadway, J. K. Barton, A. H. Zewail, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1999, 96, 6014-6019.
19. R. Eritja, B. E. Kaplan, D. Mhaskar, L. C. Sowers, J. Petruska, M. F. Goodman, Nucleic Acids Res. 1986, 14, 5869-5884.
20. K. Evans, D. Xu, Y. Kim, T. M. Nordlund, J. Fluoresc. 1992, 2, 209-216.
21. E. L. Rachofsky, R. Osman, J. B. A. Ross, Biochemistry 2001, 40, 946-956.
22. M. Kawai, M. J. Lee, K. O. Evans, T. M. Nordlund, J. Fluoresc. 2001, 11, 23-32.
23. R. K. Neely, S. W. Magennis, D. T. F. Dryden, A. C. Jones, J. Phys. Chem. B 2004, 108, 17 606-17 610.
24. T. M. Nordlund, S. Andersson, L. Nilsson, R. Rigler, Biochemistry 1989, 28, 9095-9103.
25. R. A. Hochstrasser, T. E. Carver, L. C. Sowers, D. P. Millar, Biochemistry 1994, 33, 11 971-11 979.
26. C. R. Guest, R. A. Hochstrasser, L. C. Sowers, D. P. Millar, Biochemistry 1991, 30, 3271-3279.
27. R. K. Neely, D. Daujotyte, S. Grazulis, S. W. Magennis, D. T. F. Dryden, S. Klimasauskas, A. C. Jones, Nucleic Acids Res. 2005, 33, 6953-6960.
28. D. E. Lynch, I. McClenaghan, Acta Crystallogr. Sect. C 2003, 59, 053-056.
29. M. R. Harnden, R. L. Jarvest, A. M. Z. Slawin, D. J. Williams, Nucleosides Nucleotides 1992, 9, 499.
30. H. H. Chen, L. B. Clark, J. Chem. Phys. 1973, 58, 2593-2603.
31. M. Rist, H. A. Wagenknecht, T. Fiebig, ChemPhysChem 2002, 3, 704-707.
32. N. P. Johnson, W. A. Baase, P. H. von Hippel, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2004, 101, 3426-3431.
33. R-X. He, X-H. Duan, X-Y. Li, Phys. Chem. Chem. Phys. 2006, 8, 587-591.
34. A. Broo, A. Holmen, Chem. Phys. 1996, 211, 147-161.
35. H. R. Drew, R. E. Dickerson, J. Mol. Biol. 1981, 151, 535-556.
36. M. A. El Hassan, C. R. Calladine, Philos. Trans. R. Soc. London Ser. A 1997, 355, 43-100.
37. J. D. Wright, Molecular Crystals, Cambridge University Press, Cambridge, 1995.
38. D. P. Craig, S. H. Walmsley, Excitons in Molecular Crystals: Theory and Applications, W. A. Benjamin, New York, 1968.
39. J. N. Murrell, J. Tanaka, Mol. Phys. 1964, 7, 363-380.
40. A. Holmen, B. Norden, B. Albinsson, J. Am. Chem. Soc. 1997, 119, 3114-3121.
41. J. M. Jean, K. B. Hall, J. Phys. Chem. A 2000, 104, 1930-1937.
42. A. C. Borin, L. Serrano-Andres, V. Ludwig, K. Coutinho, S. Canuto, Int. J. Quantum Chem. 2006, 106, 2564-2577.
43. K. A. Seefeld, C. Plutzer, D. Lowenich, T. Haber, R. Under, K. Kleinermanns, J. Tatchen, C. M. Marian, Phys. Chem. Chem. Phys. 2005, 7, 3021-3026.
44. M. A. O'Neill, C. Dohno, J. K. Barton, J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 1316-1317.
45. R. K. Neely, A. C. Jones, J. Am. Chem. Soc. 2006, 128, 15 952-15 953.
46. O. J. G. Somsen, G. Trinkunas, M. Niels de Keijzer, A. Van Hoek, H. van Amerongen, J. Lumin. 2006, 119-120, 100-104.
47. J. M. Jean, K. B. Hall, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2001, 98, 37-41.
48. O. F. A. Larsen, I. H. M. van Stokkum, F. L. de Weerd, M. Vengris, C. T. Aravindakumar, R. van Grondelle, N. E. Geacintov, H. van Amerongen, Phys. Chem. Chem. Phys. 2004, 6, 154-160.
49. G. M. Sheldrick, SADABS, version 2004/1, University of Göttingen, Germany, 2004,.
50. A. Altomare, G. Cascarano, G. Giacovazzo, A. Guagliardi, M. C. Burla, G. Polidori, M. Camalli, J. Appl. Crystallogr. 2004, 37, 435.
51. P. W. Betteridge, J. R. Carruthers, R. I. Cooper, K. Prout, D. J. Watkin, J. Appl. Crystallogr. 2003, 36, 1487.