Two-dimensional infrared investigation of N-acetyl tryptophan methyl amide in solution

Journal of Physical Chemistry B

Volumn 111, Issue 11, 2007, Pages 3010-3018

  Bagchi, Sayan ^a   Kim, Yung Sam ^a   Charnley, Adam K ^a   Smith III, Amos B ^a   Hochstrasser, Robin M ^a  

^a UNIVERSITY OF PENNSYLVANIA   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

HYDROGEN BONDS; INFRARED RADIATION; ISOTOPES; MOLECULAR STRUCTURE; ORGANIC SOLVENTS; SUBSTITUTION REACTIONS;

METHYL AMIDE; N-ACETYL TRYPTOPHAN; TRANSITION FREQUENCY;

AMIDES;

EID: 34047211423     PISSN: 15206106     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp067348m     Document Type: Article

References (62)

1. Krimm, S.; Bandekar, J. Adv. Prot. Chem. 1986, 38, 181-364.
2. Jackson, M.; Mantsch, H. Crit. Rev. Biochem. Mol. Biol. 1995, 30, 95-120.
3. Ernst, R. R.; Bodenhausen, G.; Wokaun, A. Principles of Nuclear Magnetic Resonance in One and Two Dimensions; Clarendon Press: Oxford, 1987.
4. Asplund, M. C.; Zanni, M. T.; Hochstrasser, R. M. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2000, 97, 8219-8224.
5. Hamm, P.; Lim, M.; Hochstrasser, R. M. J. Phys. Chem. B 1998, 102, 6123-6138.
6. Kim, Y. S.; Hochstrasser, R. M. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2005, 102, 11185-11190.
7. Ding, F.; Fulmer, E. C.; Zanni, M. T. J. Chem. Phys. 2005, 123, 094502 (1-13).
8. Zheng, J.; Kwak, K.; Asbury, J.; Chen, X.; Piletic, I. R.; Fayer, M. D. Science 2005, 309, 1338-1343.
9. Hamm, P.; Lim, M.; DeGrado, W. F.; Hochstrasser, R. M. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1999, 96, 2036-2041.
10. Woutersen, S.; Hamm, P. J. Phys. Chem. B 2000, 104, 11316-11320.
11. Zanni, M. T.; Gnanakaran, S.; Stenger, J.; Hochstrasser, R. M. J. Phys. Chem. B 2001, 105, 6520-6535.
12. Hahn, S.; Lee, H.; Cho, M. J. Chem. Phys. 2004, 121, 1849-1865.
13. Lee, K.-K.; Hahn, S.; Oh, K.-I.; Choi, J. S.; Joo, C.; Lee, H.; Han, H.; Cho, M. J. Phys. Chem. B 2006, 110, 18834-18843.
14. Kim, Y. S.; Wang, J.; Hochstrasser, R. M. J. Phys. Chem. B 2005, 109, 7511-7521.
15. Fang, C.; Wang, J.; Charnley, A. K.; Barber-Armstrong, W.; Smith, A. B., III; Decatur, S. M.; Hochstrasser, R. M. Chem. Phys. Lett. 2003, 382, 586-592.
16. Fang, C.; Wang, J.; Kim, Y. S.; Charnley, A. K.; Barber-Armstrong, W.; Smith, A. B., III; Decatur, S. M.; Hochstrasser, R. M. J. Phys. Chem. B 2004, 108, 10415-10427.
17. Fang, C.; Hochstrasser, R. M. J. Phys. Chem. B 2005, 109, 18652-18663.
18. Huang, R.; Kubelka, J.; Barber-Armstrong, W.; Silva, R. A. G. D.; Decatur, S. M.; Keiderling, T. A. J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 2346-2354.
19. Ham, S.; Kim, J.-H.; Lee, H.; Cho, M. J. Chem. Phys. 2003, 118, 3491-3498.
20. Choi, J.-H.; Ham, S.; Cho, M. J. Phys. Chem. B 2003, 107, 9132-9138.
21. Ham, S.; Cho, M. J. Chem. Phys. 2003, 118, 6915-6922.
22. Ham, S.; Cha, S.; Choi, J.-H.; Cho, M. J. Chem. Phys. 2003, 119, 1451-1461.
23. Choi, J.-H.; Cho, M. J. Chem. Phys. 2004, 120, 4383-4392.
24. Choi, J.-H.; Hahn, S.; Cho, M. Int. J. Quantum Chem. 2005, 104, 616-634.
25. Kubelka, J.; Huang, R.; Keiderling, T. A. J. Phys. Chem. B 2005, 109, 8231-8243.
26. Demirdoven, N.; Cheatum, C. M.; Chung, H. S.; Khalil, M.; Knoester, J.; Tokmakoff, A. J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 7981-7990.
27. Cheatum, C. M.; Tokmakoff, A.; Knoester, J. J. Chem. Phys. 2004, 120, 8201-8215.
28. Hahn, S.; Kim, S.-S.; Lee, C.; Cho, M. J. Chem. Phys. 2005, 123, 084905-084910.
29. Lee, C.; Cho, M. J. Phys. Chem. B 2004, 108, 20397-20407.
30. Bour, P.; Keiderling, T. A. J. Phys. Chem. B 2005, 109, 5348-5357.
31. Wang, J.; Chen, J.; Hochstrasser, R. M. J. Phys. Chem. B 2006, 110, 7545-7555.
32. Bour, P.; Keiderling, T. A. J. Phys. Chem. B 2005, 109, 23687-23697.
33. Smith, A. W.; Chung, H. S.; Ganim, Z.; Tokmakoff, A. J. Phys. Chem. B 2005, 109, 17025-17027.
34. Hahn, S.; Ham, S.; Cho, M. J. Phys. Chem. B 2005, 109, 11789-11801.
35. Maekawa, H.; Toniolo, C.; Moretto, A.; Broxterman, Q. B.; Ge, N.-H. J. Phys. Chem. B 2006, 110, 5834-5837.
36. Schweitzer-Stenner, R.; Eker, F.; Huang, Q.; Griebenow, K.; Mroz, P. A.; Kozlowski, P. M. J. Phys. Chem. B 2002, 106, 4294-4304.
37. Measey, T.; Hagarman, A.; Eker, F.; Griebenow, K.; Schweitzer-Stenner, R. J. Phys. Chem. B 2005, 109, 8195-8205.
38. Eker, F.; Cao, X.; Nafie, L.; Schweitzer-Stenner, R. J. Am. Chem. Soc. 2002, 124, 14330-14341.
39. Eker, F.; Griebenow, K.; Cao, X.; Nafie, L. A.; Schweitzer-Stenner, R. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2004, 107, 10054-10059.
40. Thomas Measey, R. S.-S. J. Roman Spectrosc. 2006, 37, 248-254.
41. Hayashi, T.; Zhuang, W.; Mukamel, S. J. Phys. Chem. A 2005, 109, 9747-9759.
42. Zhuang, W.; Abramavicius, D.; Hayashi, T.; Mukamel, S. J. Phys. Chem. B 2006, 110, 3362-3374.
43. Bour, P.; Keiderling, T. A. J. Chem. Phys. 2003, 119, 11253-11262.
44. Kubelka, J.; Keiderling, T. A. J. Phys. Chem. A 2001, 105, 10922-10928.
45. Cable, J. R.; Tubergen, M. J.; Levy, D. H. J. Am. Chem. Soc. 1989, 111, 9032-9039.
46. Cohen, R.; Brauer, B.; Nir, E.; Grace, L.; de Vries, M. S. J. Phys. Chem. A 2000, 104, 6351-6355.
47. Snoek, L. C.; Robertson, E. G.; Kroemer, R. T.; Simons, J. P. Chem. Phys. Lett 2000, 321, 49-56.
48. Bakker, J. M.; Aleese, L. M.; Meijer, G.; von Helden, G. Phys. Rev. Lett. 2003, 97, 203003-203004.
49. Hunig, I.; Seefeld, K. A.; Kleinermanns, K. Chem. Phys. Lett 2003, 369, 173-179.
50. Unterberg, C.; Gerlach, A.; Schrader, T.; Gerhards, M. J. Chem. Phys. 2003, 118, 8296-8300.
51. Dian, B. C.; Longarte, A.; Winter, P. R.; Zwier, T. S. J. Chem. Phys. 2004, 120, 133-147.
52. Dian, B. C.; Longarte, A.; Mercier, S.; Evans, D. A.; Wales, D. J.; Zwier, T. S. J. Chem. Phys. 2002, 117, 10688-10702.
53. Evans, D. A.; Wales, D. J.; Dian, B. C.; Zwier, T. S. J. Chem. Phys. 2004, 120, 148-157.
54. Souhassou, M.; Lecomte, C.; Blessing, R. H.; Aubry, A.; Rohmer, M.-M.; Wiest, R.; Benard, M.; Marraud, M. Acta Crystallogr., Sect. B: Struct. Sci. 1991, 47, 253-266.
55. Zanni, M. T.; Gnanakaran, S.; Stenger, J.; Hochstrasser, R. M. J. Phys. Chem. B 2001, 105, 6520-6535.
56. Kwac, K.; Cho, M. J. Phys. Chem. A 2003, 107, 5903-5912.
57. Kwac, K.; Cho, M. J. Chem. Phys. 2003, 119, 2256-2263.
58. Ge, N.-H.; Zanni, M. T.; Hochstrasser, R. M. J. Phys. Chem. A 2002, 106, 962-972.
59. Hochstrasser, R. M. Chem. Phys. 2001, 266, 273-284.
60. Hamm, P.; Hochstrasser, R. M. In Ultrafast Infrared and Raman Spectroscopy; Fayer, M. D., Ed.; Marcel Dekker, Inc.: New York, 2001; p 273.
61. Schaftenaar, G.; Noordik, J. H. J. Comput.-Aided Mol. Design 2000, 14, 123-134.
62. Frisch, M. J.; Trucks, G. W.; Schlegel, H. B.; Scuseria, G. E.; Robb, M. A.; Cheeseman, J. R.; Montgomery, J. A., Jr.; Vreven, T.; Kudin, K. N.; Burant, J. C.; Millam, J. M.; Iyengar, S. S.; Tomasi, J.; Barone, V.; Mennucci, B.; Cossi, M.; Scalmani, G.; Rega, N.; Petersson, G. A.; Nakatsuji, H.; Hada, M.; Ehara, M.; Toyota, K.; Fukuda, R.; Hasegawa, J.; Ishida, M.; Nakajima, T.; Honda, Y.; Kitao, O.; Nakai, H.; Kiene, M.; Li X.; Knox, J. E.; Hratchian, H. P.; Cross, J. B.; Bakken, V.; Adamo, C.; Jaramillo, J.; Gomperts, R.; Stratmann, R. E.; Yazyev, O.; Austin, A. J.; Cammi, R.; Pomelli, C.; Ochterski, J. W.; Ayala, P. Y.; Morokuma, K.; Voth, G. A.; Salvador, P.; Dannenberg, J. J.; Zakrzewski, V. G.; Dapprich, S.; Daniels, A. D.; Strain, M. C.; Farkas, O.; Malick, D. K.; Rabuck, A. D.; Raghavachari, K.; Foresman, J. B.; Ortiz, J. V.; Cui, Q.; Baboul, A. G.; Clifford, S.; Cioslowski, J.; Stefanov, B. B.; Liu, G.; Liashenko, A.; Piskorz, P.; Komaromi, I.; Martin, R. L.; Fox, D. J.; Keith, T.; Al-Laham, M. A.; Peng, C. Y.; Nanayakkara, A.; Challacombe, M.; Gill, P. M. W.; Johnson, B.; Chen, W.; Wong, M. W.; Gonzalez, C.; Pople, J. A. Gaussian 03, Revision C.02; Gaussian, Inc.: Wallingford, CT, 2004.