'Top-down' characterization of site-directed mutagenesis products of Staphylococcus aureus dihydroneopterin aldolase by multistage tandem mass spectrometry in a linear quadrupole ion trap

Analyst

Volumn 131, Issue 2, 2006, Pages 291-302

  Scherperel, Gwynyth ^a   Yan, Honggao ^b   Wang, Yi ^b   Reid, Gavin E ^a,b  

^a MICHIGAN STATE UNIVERSITY   (United States)

^b Michigan State University   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ALANINE; DIHYDRONEOPTERIN ALDOLASE; FRUCTOSE BISPHOSPHATE ALDOLASE; LYSINE; PROLINE; RECOMBINANT PROTEIN; UNCLASSIFIED DRUG;

AMINO ACID SEQUENCE; AMINO TERMINAL SEQUENCE; ARTICLE; CHEMICAL BOND; DISSOCIATION; ENERGY; ION TRAP MASS SPECTROMETRY; NONHUMAN; PROTEIN DEGRADATION; PROTEIN STRUCTURE; PROTEIN TRANSPORT; SITE DIRECTED MUTAGENESIS; STAPHYLOCOCCUS AUREUS; TANDEM MASS SPECTROMETRY;

EID: 33645467752     PISSN: 00032654     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/b512012h     Document Type: Article

References (54)

1. J. B. Fenn M. Mann C. K. Meng S. F. Wong C. M. Whitehouse Science 1989 246 64
2. M. Karas F. Hillenkamp Anal. Chem. 1988 60 2299
3. R. Aebersold D. R. Goodlett Chem. Rev. 2001 101 269
4. S. L. Cohen B. T. Chait Annu. Rev. Biophys. Biomol. Struct. 2001 30 67
5. B. T. Chait S. B. H. Kent Weighing naked proteins Science 1992 257 1885
6. F. Hillenkamp M. Karas R. C. Beavis B. T. Chait Anal. Chem. 1991 63 1193A
7. J. B. Smith Y. Sun D. L. Smith B. Green Protein Sci. 1992 1 601
8. J. G. Zhang G. E. Reid R. L. Moritz L. D. Ward R. J. Simpson Eur. J. Biochem. 1993 217 53
9. S.-W. Lee S. J. Berger S. Martinovic L. Pasa-Tolic G. A. Anderson Y. Shen R. Zhao R. D. Smith Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2002 99 5942
10. J. R. Hayter D. H. L. Robertson S. J. Gaskell R. J. Beynon Mol. Cell. Proteomics 2003 2 85
11. J. G. Zhang R. L. Moritz G. E. Reid L. D. Ward R. J. Simpson Eur. J. Biochem. 1992 207 903
12. G.-F. Tu G. E. Reid J.-G. Zhang R. L. Simpson R. J. Moritz J. Biol. Chem. 1995 270 9322
13. A. Hammacher G. E. Reid R. L. Moritz R. J. Simpson Biomed. Chromatogr. 1997 11 337
14. D. F. Hunt J. R. Yates J. Shabanowitz S. Winston C. R. Hauer Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1986 83 6233
15. W. J. Henzel T. M. Billeci J. T. Stults S. C. Wong C. Grimley C. Watanabe Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1993 90 5011
16. G. E. Reid R. K. Rasmussen D. S. Dorow R. J. Simpson Electrophoresis 1998 19 946
17. E. A. Kapp F. Schuetz G. E. Reid J. S. Eddes R. L. Moritz R. A. J. O'Hair T. P. Speed R. J. Simpson Anal. Chem. 2003 75 6251
18. N. L. Kelleher H. Y. Lin G. A. Valaskovic D. J. Aaserud E. K. Fridriksson F. W. McLafferty J. Am. Chem. Soc. 1999 121 806
19. G. E. Reid S. A. McLuckey J. Mass Spectrom. 2002 37 663
20. Q. Van Orden S. Wu X. Cheng R. Bakhtiar R. D. Smith Anal. Chem. 1995 67 2498
21. T. D. Wood L. H. Chen C. B. White P. C. Babbitt G. L. Kenyon F. W. McLafferty Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1995 92 11451
22. C. S. Maier X. Yan M. E. Harder M. I. Schimerlik M. L. Deinzer L. Pasa-Tolic R. D. Smith J. Am. Soc. Mass Spectrom. 2000 11 237
23. E. K. Fridriksson A. Holowka D. Gould H. J. Beavil B. Baird F. W. McLafferty Biochemistry 2000 39 3369
24. D. M. Horn R. A. Zubarev F. W. McLafferty Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2000 97 10313
25. S. K. Sze Y. Ge H.-B. Oh F. W. McLafferty Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2002 99 1774
26. F. Meng B. J. Cargille L. M. Miller A. J. Forbes J. R. Johnson N. L. Kelleher Nat. Biotechnol. 2001 19 952
27. D. K. Rai B. Landin G. Alvelius W. J. Griffiths Anal. Chem. 2002 74 2097
28. J. F. Nemeth-Cawley J. C. Rouse J. Mass Spectrom. 2002 37 270
29. J. A. Loo C. G. Edmonds R. D. Smith Anal. Chem. 1991 63 2488
30. K. L. Schey L. A. Cook J. D. Hildebrandt Int. J. Mass Spectrom. 2001 212 377
31. S. Claverol O. Burlet-Schiltz J. E. Gairin B. Monsarrat Mol. Cell. Proteomics 2003 2 483
32. J. L. Stephenson S. A. McLuckey Anal. Chem. 1998 70 3533
33. G. E. Reid J. Wu P. A. Chrisman J. M. Wells S. A. McLuckey Anal. Chem. 2001 73 3274
34. K. A. Newton P. A. Chrisman G. E. Reid J. M Wells S. A. McLuckey Int. J. Mass Spectrom. 2001 212 359
35. B. J. Engel P. Pan G. E. Reid J. M. Wells S. A. McLuckey Int. J. Mass Spectrom. 2002 219 171
36. J. M. Hogan S. A. McLuckey J. Mass Spectrom. 2003 38 245
37. J. B. Cargile A. S. McLuckey L. J. Stephenson Anal. Chem. 2001 73 1277
38. N. C. VerBerkmoes M. B. Strader R. D. Smiley E. E. Howell G. B. Hurst R. L. Hettich J. L. Stephenson Anal. Biochem. 2002 305 68
39. G. E. Reid J. L. Stephenson S. A. McLuckey Anal. Chem. 2002 74 577
40. J. M. Hogan S. J. Pitteri S. A. McLuckey Anal. Chem. 2003 75 6509
41. G. E. Reid H. Shang J. M. Hogan G. U. Lee S. A. McLuckey J. Am. Chem. Soc. 2002 124 7353
42. R. Amunugama J. M. Hogan K. A. Newton S. A. McLuckey Anal. Chem. 2004 76 720
43. K. A. Newton S. J. Pitteri M. Laskowski S. A. McLuckey J. Proteome Res. 2004 3 1033
44. J. E. P. Syka J. J. Coon M. J. Schroeder J. Shabanowitz D. F. Hunt Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2004 101 9528
45. J. J. Coon B. Ueberheide J. E. P. Syka D. D. Dryhurst J. Ausio J. Shabanowitz D. F. Hunt Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2004 102 9463
46. S. J. Pitteri P. A. Chrisman J. M. Hogan S. A. McLuckey Anal. Chem. 2005 77 1831
47. A. S. Misharin O. A. Silivra F. Kjeldsen R. A. Zubarev Rapid Commun. Mass Spectrom. 2005 19 2163
48. B. A. Collings J. M. Campbell D. Mao D. J. Douglas Rapid Commun. Mass Spectrom. 2001 15 1777
49. J. C. Schwartz M. W. Senko J. E. P. Syka J. Am. Soc. Mass Spectrom. 2002 13 659
50. J. W. Hager Rapid Commun. Mass Spectrom. 2002 16 512
51. M. Hennig A. D'Arcy I. C. Hampele M. G. Page C. Oefner G. E. Dale Nat. Struct. Biol. 1998 5 357
52. V. H. Wysocki G. Tsaprailis L. L. Smith L. A. Breci J. Mass Spectrom. 2000 35 1399
53. R. A. J. O'Hair J. Mass Spectrom. 2000 35 1377
54. H. Prakash S. Mazumdar J. Am. Soc. Mass Spectrom. 2005 16 1409