Is there hydrogen scrambling in the gas phase? Energetic and structural determinants of proton mobility within protein ions

Journal of the American Chemical Society

Volumn 126, Issue 24, 2004, Pages 7709-7717

  Hoerner, Joshua K ^a   Xiao, Hui ^a   Dobo, Andras ^a   Kaltashov, Igor A ^a  

^a UNIVERSITY OF MASSACHUSETTS   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

CONFORMATIONS; GAS DYNAMICS; NUCLEAR MAGNETIC RESONANCE SPECTROSCOPY; PROTEINS;

GAS PHASES; PROTEIN ION FRAGMENTATION;

HYDROGEN;

AMIDE; HYDROGEN; PROTEIN;

ARTICLE; ENERGY TRANSFER; GAS; MODEL; NUCLEAR MAGNETIC RESONANCE; PROTEIN CONFORMATION; PROTON TRANSPORT; STRUCTURE ANALYSIS;

AMIDES; AMINO ACID SEQUENCE; GASES; HYDROGEN; IONS; LINEAR ENERGY TRANSFER; MODELS, CHEMICAL; MOLECULAR SEQUENCE DATA; PROTEIN STRUCTURE, TERTIARY; PROTEINS; PROTONS;

EID: 2942650157     PISSN: 00027863     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ja049513m     Document Type: Article

References (46)

1. Englander, S. W.; Mayne, L.; Bai, Y.; Sosnick, T. R. Protein Sci. 1997, 6, 1101-1109.
2. Engen, J. R.; Smith, D. L. Anal. Chem. 2001, 73, 256A-265A.
3. Kaltashov, I. A.; Eyles, S. J. Mass Spectrom. Rev. 2002, 21, 37-71.
4. Konermann, L.; Simmons, D. A. Mass Spectrom. Rev. 2003, 22, 1-26.
5. Hoofnagle, A. N.; Resing, K. A.; Ahn, N. G. Annu. Rev. Biophys. Biomol. Struct. 2003, 32, 1-25.
6. Anderegg, R. J.; Wagner, D. S.; Stevenson, C. L.; Borchardt, R. J. Am. Soc. Mass Spectrom. 1994, 5, 425-433.
7. Ge, Y.; Lawhorn, B. G.; ElNaggar, M.; Strauss, E.; Park, J. H.; Begley, T. P.; McLafferty, F. W. J. Am. Chem. Soc. 2002, 124, 672-678.
8. Eyles, S. J.; Dresch, T.; Gierasch, L. M.; Kaltashov, I. A. J. Mass Spectrom. 1999, 34, 1289-1295.
9. Akashi, S.; Naito, Y.; Takio, K. Anal. Chem. 1999, 71, 4974-4980.
10. Eyles, S. J.; Speir, P.; Kruppa, G.; Gierasch, L. M.; Kaltashov, I. A. J. Am. Chem. Soc. 2000, 122, 495-500.
11. Akashi, S.; Takio, K. Protein Sci. 2000, 9, 2497-2505.
12. Kraus, M.; Janek, K.; Bienert, M.; Krause, E. Rapid Commun. Mass Spectrom. 2000, 14, 1094-1104.
13. Kraus, M.; Bienert, M.; Krause, E. Rapid Commun. Mass Spectrom. 2003, 17, 222-228.
14. Kaltashov, I. A.; Eyles, S. J. J. Mass Spectrom. 2002, 37, 557-565.
15. Johnson, R. S.; Krylov, D.; Walsh, K. A. J. Mass. Spectrom. 1995, 30, 386-387.
16. McLafferty, F. W.; Guan, Z. Q.; Haupts, U.; Wood, T. D.; Kelleher, N. L. J. Am. Chem. Soc. 1998, 120, 4732-4740.
17. Wysocki, V. H.; Tsaprailis, G.; Smith, L. L.; Breci, L. A. J. Mass Spectrom. 2000, 35, 1399-1406.
18. Krishtalik, L. I. Biochim. Biophys. Acta 2000, 1458, 6-27.
19. Deng, Y.; Pan, H.; Smith, D. L. J. Am. Chem. Soc. 1999, 121, 1966-1967.
20. Kim, M. Y.; Maier, C. S.; Reed, D. J.; Deinzer, M. L. J. Am. Chem. Soc. 2001, 123, 9860-9866.
21. Demmers, J. A.; Rijkers, D. T.; Haverkamp, J.; Killian, J. A.; Heck, A. J. J. Am. Chem. Soc. 2002, 124, 11191-11198.
22. Buijs, J.; Hagman, C.; Hakansson, K.; Richter, J. H.; Hakansson, P.; Oscarsson, S. J. Am. Soc. Mass Spectrom. 2001, 12, 410-419.
23. McLuckey, S. A.; Goeringer, D. E. J. Mass Spectrom. 1997, 32, 461-474.
24. Campbell, S.; Rodgers, M. T.; Marzluff, E. M.; Beauchamp, J. L. J. Am. Chem. Soc. 1995, 117, 12840-12854.
25. Hoaglund-Hyzer, C. S.; Counterman, A. E.; Clemmer, D. E. Chem. Rev. 1999, 99, 3037-3080.
26. Vonhelden, G.; Wyttenbach, T.; Bowers, M. T. Science 1995, 267, 1483-1485.
27. Neira, J. L.; Itzhaki, L. S.; Otzen, D. E.; Davis, B.; Fersht, A. R. J. Mol. Biol. 1997, 270, 99-110.
28. Silow, M.; Oliveberg, M. J. Mol. Biol. 2003, 326, 263-271.
29. Dempsey, C. E. Prog. Nucl. Magn. Res. Spectrosc. 2001, 39, 135-170.
30. Vachet, R. W.; Bishop, B. M.; Erickson, B. W.; Glish, G. L. J. Am. Chem. Soc. 1997, 119, 5481-5488.
31. Kazmirski, S. L.; Wong, K. B.; Freund, S. M.; Tan, Y. J.; Fersht, A. R.; Daggett, V. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2001, 98, 4349-4354.
32. Green, M. K.; Lebrilla, C. B. Int. J. Mass Spectrom. 1998, 175, 15-26.
33. He, F.; Marshall, A. G.; Freitas, M. A. J. Phys. Chem. B 2001, 105, 2244-2249.
34. Green, M. K.; Lebrilla, C. B. Mass Spectrom. Rev. 1997, 16, 53-71.
35. Kaltashov, I. A.; Doroshenko, V. M.; Cotter, R. J. Proteins 1997, 28, 53-58.
36. Schnier, P. D.; Jurchen, J. C.; Williams, E. R. J. Phys. Chem. B 1999, 103, 737-745.
37. Laskin, J.; Denisov, E.; Futrell, J. H. Int. J. Mass Spectrom. 2002, 219, 189-201.
38. Guo, X.; Duursma, M. C.; Al-Khalili, A.; Heeren, R. M. A. Int. J. Mass Spectrom. 2003, 225, 71-82.
39. Dunbar, R. C. Mass Spectrom. Rev. 1992, 11, 309-339.
40. Antoine, R.; Compagnon, I.; Rayane, D.; Broyer, M.; Dugourd, P.; Breaux, G.; Hagemeister, F. C.; Pippen, D.; Hudgins, R. R.; Jarrold, M. F. Eur. Phys. J. D 2002, 20, 583-587.
41. Kaltashov, I. A.; Fenselau, C. Proteins 1997, 27, 165-170.
42. Gross, D. S.; Schnier, P. D.; Rodriges-Cruz, S. E.; Hagerquist, C.; Williams, E. R. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1996, 93, 3143-3148.
43. Wang, F.; Freitas, M. A.; Marshall, A. G.; Sykes, B. D. Int. J. Mass Spectrom. 1999, 192, 319-325.
44. Shelimov, K. B.; Clemmer, D. E.; Hudgins, R. R.; Jarrold, M. F. J. Am. Chem. Soc. 1997, 119, 2240-2248.
45. Li, J. W.; Taraszka, J. A.; Counterman, A. E.; Clemmer, D. E. Int. J. Mass Spectrom. 1999, 187, 37-47.
46. Mohimen, A.; Dobo, A.; Hoerner, J. K.; Kaltashov, I. A. Anal. Chem. 2003, 75, 4139-4147.