Protein conformational stability probed by fourier transform ion cyclotron resonance mass spectrometry

Journal of the American Chemical Society

Volumn 122, Issue 3, 2000, Pages 495-500

  Eyles, Stephen J ^a   Speir, J Paul ^b   Kruppa, Gary H ^b   Gierasch, Lila M ^a   Kaltashov, Igor A ^a  

^a UNIVERSITY OF MASSACHUSETTS   (United States)

^b BRUKER DALTONIK GMBH   (Germany)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

RETINOIC ACID BINDING PROTEIN;

ARTICLE; CONFORMATIONAL TRANSITION; FOURIER TRANSFORMATION; MASS SPECTROMETRY; PROTEIN STABILITY;

EID: 0034716309     PISSN: 00027863     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ja991149h     Document Type: Article

References (48)

1. Clarke, J.; Itzhaki, L. S. Curr. Opin. Struct. Biol. 1998, 8, 112-118.
2. Miranker, A. D.; Robinson, C. V.; Radford, S. E.; Dobson, C. M. FASEB J. 1996, 10, 93-101.
3. Smith, D. L.; Deng, Y.; Zhang, Z. J. Mass Spectrom. 1997, 32, 135-146.
4. Woodward, C. J. Am. Soc. Mass Spectrom. 1999, 10, 672-674.
5. Hooke, S. D.; Eyles, S. J.; Miranker, A.; Radford, S. E.; Robinson, C. V.; Dobson, C. M. J. Am. Chem. Soc. 1995, 117, 7548-7549.
6. Miranker, A. D.; Robinson, C. V.; Radford, S. E.; Aplin, R. T.; Dobson, C. M. Science 1993, 262, 896-900.
7. Dill, K. A.; Chan, H. S. Nat. Struct. Biol. 1997, 4, 10-19.
8. Yang, H.; Smith, D. L. Biochemistry 1997, 36, 14992-14999.
9. Wang, F.; Blanchard, J. S.; Tang, X. Biochemistry 1997, 36, 3755-3759.
10. Engen, J. R.; Smithgall, T. E.; Gmeiner, W. H.; Smith, D. L. Biochemistry 1997, 36, 14384-14391.
11. Deng, Y.; Smith, D. L. Biochemistry 1998, 37, 6256-6262.
12. Deng, Y.; Pan, H.; Smith, D. L. J. Am. Chem. Soc. 1999, 121, 1966-1967.
13. Engen, J. R.; Gmeiner, W. H.; Smithgall, T. E.; Smith, D. L. Biochemistry 1999, in press.
14. Deng, Y.; Zhang, Z.; Smith, D. L. J. Am. Soc. Mass Spectrom. 1999, 10, 675-684.
15. McLafferty, F. W.; Kelleher, N. L.; Begley, T. P.; Fridriksson, E. K.; Zubarev, R. A.; Horn, D. M. Curr. Opin. Chem. Biol. 1998, 2, 571-578.
16. Marshall, A. G.; Senko, M. W.; Li, W.; Li, M.; Dillon, S.; Guan, S.; Logan, T. M. J. Am. Chem. Soc. 1997, 119, 433-434.
17. Bai, Y.; Milne, J. S.; Mayne, L.; Englander, S. W. Proteins: Struct., Funct., Genet. 1994, 20, 4-14.
18. Bai, Y.; Sosnick, T. R.; Mayne, L.; Englander, S. W. Science 1995, 269, 192-196.
19. Chamberlain, A. K.; Handel, T. M.; Marqusee, S. Nat. Struct. Biol. 1996, 3, 782-787.
20. Clark, P. L.; Weston, B. F.; Gierasch, L. M. Folding Des. 1998, 3, 401-412.
21. Zhang, J.; Liu, Z.-P.; Jones, T. A.; Gierasch, L. M.; Sambrook, J. F. Proteins: Struct., Funct., Genet. 1992, 13, 87-99.
22. Eyles, S. J.; Kaltashov, I. A.; Gierash, L. M. Proc. Am. Soc. Mass Spectrom. Conf. Mass Spectrom. Allied Top. 1998, 380.
23. Eyles, S. J.; Dresch, T.; Gierasch, L. M.; Kaltashov, I. A. J. Mass Spectrom. 1999, 34, 1289-1295.
24. Light-Wahl, K. J.; Loo, J. A.; Edmonds, C. G.; Smith, R. D.; Witkowska, H. E.; Shackleton, C. H.; Wu, C. S. Biol. Mass Spectrom. 1993, 22, 112-120.
25. Loo, J. A.; Edmonds, C. G.; Smith, R. D. Anal. Chem. 1993, 65, 425-438.
26. Senko, M. W.; Beu, S. C.; McLafferty, F. W. Anal. Chem. 1994, 66, 415-417.
27. Senko, M. W.; Speir, J. P.; McLafferty, F. W. Anal. Chem. 1994, 66, 2801-2808.
28. Little, D. P.; Speir, J. P.; Senko, M. W.; O'Connor, P.; McLafferty, F. W. Anal. Chem. 1994, 66, 2809-2815.
29. Wu, Q.; van Orden, S.; Cheng, X.; Bakhtiar, R.; Smith, R. D. Anal. Chem. 1995, 67, 2498-2509.
30. Mortz, E.; O'Connor, P. B.; Roepstorff, P.; Kelleher, N. L.; Wood, T. D.; McLafferty, F. W.; Mann, M. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1996, 93, 8264-8267.
31. Kelleher, N. L.; Nicewonger, R. B.; Begley, T. P.; McLafferty, F. W. J. Biol. Chem. 1997, 272, 32215-32220.
32. Miranker, A. D.; Kruppa, G. H.; Robinson, C. V.; Aplin, R. T.; Dobson, C. M. J. Am. Chem. Soc. 1996, 118, 7402-7403.
33. Heck, A. J. R.; Derrick, P. J. Eur. Mass Spectrom. 1998, 4, 181-188.
34. Biemann, K. Biomed. Environ. Mass Spectrom. 1988, 16, 99-111.
35. Complete exchange in this case means 98% incorporation of protium, allowing for the H/D ratio in the exchange bulk solvent.
36. Rizo, J.; Liu, Z.-P.; Gierasch, L. M. J. Biomol. NMR 1994, 4, 741-760.
37. Kaltashov, I. A.; Fenselau, C. Proteins: Struct., Funct., Genet. 1997, 27, 165-170.
38. Li, A.; Fenselau, C.; Kaltashov, I. A. Proteins: Struct., Funct., Genet. 1998, Suppl. 2, 22-27.
39. McLafferty, F. W.; Guan, Z.; Haupts, U.; Wood, T. D.; Kelleher, N. L. J. Am. Chem. Soc. 1998, 120, 4732-4740.
40. Anderegg, R. J.; Wagner, D. S.; Stevenson, C. L.; Borchardt, R. T. J. Am. Soc. Mass Spectrom. 1994, 5, 425-433.
41. Waring, A. J.; Mobley, P. W.; Gordon, L. M. Proteins: Struct., Funct., Genet. 1998, Suppl. 2, 38-49.
42. Ranasinghe, A.; Cooks, R. G.; Sethi, S. K. Org. Mass. Spectrom. 1992, 27, 77-88.
43. Cheng, X.; Fenselau, C. Int. J. Mass Spectrom. Ion Processes 1992, 122, 109-119.
44. Kaltashov, I. A.; Doroshenko, V. M.; Cotter, R. J. Proteins: Struct., Funct., Genet. 1997, 28, 53-58.
45. McLuckey, S. A.; Goeringer, D. E. J. Mass Spectrom. 1997, 32, 461-474.
46. Marshall, A. G.; Hendrickson, C. L.; Jackson, G. S. Mass Spectrom. Rev. 1998, 17, 1-35.
47. Sannes-Lowery, K.; Griffey, R. H.; Kruppa, G. H.; Speir, J. P.; Hofstadler, S. A. Rapid Commun. Mass Spectrum. 1998, 12, 1957-1961.
48. Zubarev, R. A.; Kelleher, N. L.; McLafferty, F. W. J. Am. Chem. Soc. 1998, 120, 3265-3266.