Detection of Salmonella spp. using microsphere-based, fiber-optic DNA microarrays

Analytical Chemistry

Volumn 77, Issue 15, 2005, Pages 5041-5047

  Ahn, Soohyoun ^a   Walt, David R ^a  

^a TUFTS UNIVERSITY   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

FOOD PATHOGENS; FOOD POISONING; HYBRIDIZATION; SALMONELLA SPP.;

ASSAYS; CONTAMINATION; DNA; ETCHING; FOOD PRESERVATION; HEALTH CARE; MEATS; OPTICAL FIBERS; SENSITIVITY ANALYSIS;

MICROORGANISMS;

MICROSPHERE;

ARTICLE; BACTERIAL GENE; BACTERIUM DETECTION; DNA MICROARRAY; DNA PROBE; ESCHERICHIA COLI; FIBER OPTICS; FOOD CONTAMINATION; FOOD POISONING; FOOD SAFETY; HYBRIDIZATION; INVA GENE; NONHUMAN; SPVB GENE; YERSINIA ENTEROCOLITICA;

BACTERIAL PROTEINS; DNA PROBES; FIBER OPTIC TECHNOLOGY; FIBER OPTICS; FOOD MICROBIOLOGY; MICROSPHERES; OLIGONUCLEOTIDE ARRAY SEQUENCE ANALYSIS; OPTICAL FIBERS; SALMONELLA; VIRULENCE FACTORS;

EID: 23044488678     PISSN: 00032700     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ac0505270     Document Type: Article

References (49)

1. Todd, E. C. D. J. Food Prot. 1989, 52, 595-601.
2. Mead, P. S.; Slutsker, L.; Dietz, V.; McCaig, L. F.; Bresee, J. S.; Shapiro, C.; Griffin, P. M.; Tauxe, R. V. Emerging Infect. Dis. 1999, 5, 607-625.
3. Lammerding, A. M.; Fazil, A. Int. J. Food Microbiol. 2000, 58, 147-157.
4. Hill, W. E. Crit. Rev. Food Sci. Nutr. 1996, 36, 123-173.
5. Harvey, R. W.; Price, T. H. J. Appl. Bacteriol. 1979, 46, 27-56.
6. Perales, I.; Audicana, A. Appl. Environ. Microbiol. 1989, 55, 3032-3033.
7. Rajashekara, G.; Wanduragala, D.; Halvorson, D. A.; Nagaraja, K. V. Int. J. Food Microbiol. 1999, 53, 53-60.
8. Mansfield, L. P.; Forsythe, S. J. Lett. Appl. Microbiol. 2000, 31, 279-283.
9. Valdivieso-Garcia, A.; Riche, E.; Abubakar, O.; Waddell, T. E.; Brooks, B. W. J. Food Prot. 2001, 64, 1166-1171.
10. Burtscher, C.; Fall, P. A.; Wilderer, P. A.; Wuertz, S. Appl. Environ. Microbiol. 1999, 65, 2235-2237.
11. Waage, A. S.; Vardund, T.; Lund, V.; Kapperud, G. J. Appl. Microbiol. 1999, 87, 418-428.
12. Agarwal, A.; Makker, A.; Goel, S. K. Mol. Cell Probes 2002, 16, 243-50.
13. Gehring, A. G.; Crawford, C. G.; Mazenko, R. S.; van Houten, L. J.; Brewster, J. D. J. Immunol. Methods 1996, 195, 15-25.
14. Che, Y. H.; Li, Y.; Slavik, M.; Paul, D. J. Food Prot. 2000, 63, 1043-1048.
15. Zhou, C.; Pivarnik, P.; Rand, A. G.; Letcher, S. V. Biosens. Bioelectron. 1998, 13, 495-500.
16. Seo, K. H.; Brackett, R. E.; Hartman, N. F.; Campbell, D. P. J. Food Prot. 1999, 62, 431-437.
17. Holmstrom, K.; Rossen, L.; Rasmussen, O. F. Anal. Biochem. 1993, 209, 278-283.
18. Iijima, Y.; Asako, N. T.; Aihara, M.; Hayashi, K. J. Med. Microbiol. 2004, 53, 617-622.
19. Rousselon, N.; Delgenes, J. P.; Godon, J. J. J. Microbiol. Methods 2004, 59, 15-22.
20. Seo, K. H.; Valentin-Bon, I. E.; Brackett, R. E.; Holt, P. S. J. Food Prot. 2004, 67, 864-869.
21. Macgregor, P. F.; Squire, J. A. Clin. Chem. 2002, 48, 1170-1177.
22. Gershon, D. Nature 2002, 416, 885-891.
23. Fodor, S. P.; Read, J. L.; Pirrung, M. C.; Stryer, L.; Lu, A. T.; Solas, D. Science 1991, 251, 767-773.
24. Pease, A. C.; Solas, D.; Sullivan, E. J.; Cronin, M. T.; Holmes, C. P.; Fodor, S. P. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1994, 91, 5022-5026.
25. Lemmo, A. V.; Fisher, J. T.; Geysen, H. M.; Rose, D. J. Anal. Chem. 1997, 69, 543-551.
26. Marshall, A.; Hodgson, J. Nat. Biotechnol. 1998, 16, 27-31.
27. Shena, M.; Shalon, D.; Heller, R.; Chai, A.; Brown, P. O.; Davis, R. W. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1996, 93, 10614-10619.
28. DeRisi, J. L.; Iyer, V. R.; Brown, P. O. Science 1997, 278, 680-686.
29. Fulton, R. J.; McDade, R. L.; Smith, P. L.; Kienker, L. J.; Kettman, J. R., Jr. Clin. Chem. 1997, 43, 1749-1756.
30. Smith, P. L.; WalkerPeach, C. R.; Fulton, R. J.; DuBois, D. B. Clin. Chem. 1998, 44, 2054-2056.
31. Chen, J.; Iannone, M. A.; Li, M. S.; Taylor, J. D.; Rivers, P.; Nelson, A. J.; Slentz-Kesler, K. A.; Roses, A.; Weiner, M. P. Genome Res. 2000, 10, 549-557.
32. Ferguson, J. A.; Steemers, F. J.; Walt, D. R. Anal. Chem. 2000, 72, 5618-5624.
33. Epstein, J. R.; Lee, M.; Walt, D. R. Anal. Chem. 2002, 74, 1836-1840.
34. Walt, D. R. Curr. Opin. Chem. Biol. 2002, 6, 689-695.
35. Epstein, J. R.; Leung, A. P.; Lee, K. H.; Walt, D. R. Biosens. Bioelectron. 2003, 18, 541-546.
36. Epstein, J. R.; Ferguson, J. A.; Lee, K. H.; Walt, D. R. J. Am. Chem. Soc. 2003, 125, 13753-13759.
37. Brasher, C. W.; DePaola, A.; Jones, D. D.; Bej, A. K. Curr. Microbiol. 1998, 37, 101-107.
38. Manzano, M.; Cocolin, L.; Astori, G.; Pipan, C.; Botta, G. A.; Cantoni, C.; Comi, G. Mol. Cell. Probes 1998, 12, 227-234.
39. Lee, C. Y.; Panicker, G.; Bej, A. K. J. Microbiol. Methods 2003, 53, 199-209.
40. Eyigor, A.; Carli, K. T. Avian Dis. 2003, 47, 380-386.
41. Relogio, A.; Schwager, C.; Richter, A.; Ansorge, W.; Valcarcel, J. Nucleic Acids Res. 2002, 30, e51.
42. Ranki, M.; Palva, A.; Virtanen, M.; Laaksonen, M.; Soderlund, H. Gene 1983, 21, 77-85.
43. Nicholls, P. J.; Malcolm, A. D. B. J. Clin. Lab. Anal. 1989, 3, 122-135.
44. Chen, X.; Zhang, X. E.; Chai, Y. Q.; Hu, W. P.; Zhang, Z. P.; Zhang, X. M.; Cass, A. E. Biosens. Bioelectron. 1998, 13, 451-458.
45. Rautio, J.; Barken, K. B.; Lahdenpera, J.; Breitenstein, A.; Molin, S.; Neubauer, P. Microb. Cell Factors 2003, 2, 4.
46. Baeumner, A. J.; Jones, C.; Wong, C. Y.; Price, A. Anal. Bioanal. Chem. 2004, 378, 1587-1593.
47. Nielsen, U. B.; Geierstanger, B. H. J. Immunol. Methods 2004, 290, 107-120.
48. Boyd, E. F.; Li, J.; Ochman, H.; Selander, R. K. J. Bacteriol. 1997, 179, 1985-1991.
49. Hong, B. X.; Jiang, L. F.; Hu, Y. S.; Fang, D. Y.; Guo, H. Y. J. Microbiol. Methods 2004, 58, 403-411.