Applications of shapes screening in drug discovery

Combinatorial Chemistry and High Throughput Screening

Volumn 5, Issue 8, 2002, Pages 583-590

  Lepre, Christopher A ^a   Peng, Jeffrey ^a   Fejzo, Jasna ^a   Abdul Manan, Norzehan ^a   Pocas, Jennifer ^a   Jacobs, Marc ^a   Xie, Xiaoling ^a   Moore, Jonathan M ^a  

^a VERTEX PHARMACEUTICALS   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

MITOGEN ACTIVATED PROTEIN KINASE;

ARTICLE; CHEMICAL STRUCTURE; COMPUTER ANALYSIS; DRUG RESEARCH; DRUG SCREENING; LIGAND BINDING; MOLECULAR MODEL; NUCLEAR MAGNETIC RESONANCE SPECTROSCOPY; PRIORITY JOURNAL; X RAY CRYSTALLOGRAPHY;

EID: 0036892232     PISSN: 13862073     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.2174/1386207023329950     Document Type: Article

References (39)

1. Fejzo, J.; Lepre, C. A.; Peng, J. W.; Bemis, G. W.; Ajay, Murcko, M. A.; Moore, J. M. Chem. Biol. 1999, 6, 755-769.
2. Peng, J. W.; Lepre, C. A.; Fejzo, J.; Abdul-Manan, N.; Moore, J. M. Methods Enzymol. 2001, 338, 202-230.
3. Lepre, C. A. Drug Discovery Today 2001, 6, 133-140.
4. Lepre, C. A. Strategies for NMR Screening and Library Design; Zerbe, O. Ed.; Wiley-VCH: Weinheim, 2002, pp 1349-1364.
5. Fejzo, J.; Lepre, C.; Xie, X. Current Topics in Medicinal Chemistry 2002, 2, 1349-1364.
6. Hajduk, P. J.; Meadows, R. P.; Fesik, S. J. Quarterly Rev. Biophys. 1999, 32, 211-240.
7. van Dongen, M.; Weigelt, J.; Uppenberg, J.; Schultz, J.; Wikstrom, M. Drug Discov. Today 2002, 7, 471-478.
8. Wyss, D. F.; McCoy, M. A.; Senior, M. M. Curr. Opin. Drug Discov. Devel. 2002, 5, 630-647.
9. Bemis, G. W.; Murcko, M. A. J. Med. Chem. 1996, 39, 2887-2893.
10. Bemis, G. W.; Murcko, M. A. J. Med. Chem. 1999, 42, 5095-5099.
11. Teague, S. J.; Davis, A. M.; Leeson, P. D.; Oprea, T. Angew. Chem. Int. Ed. 1999, 38, 3743-3747.
12. Lipinski, C. A.; Lombardo, F.; Dominy, B. W.; Feeny, P. J. Adv. Drug Del. Rev. 1997, 23, 3-25.
13. Walters, W. P.; Stahl, M. T.; Murcko, M. A. Drug. Discov. Today 1998, 3, 160-178.
14. Walters, W. P.; Murcko, M. A. Library Filtering Systems and Prediction of Drug-Like Properties; Böhm, H.-J. and Schneider, G. Ed.; Wiley-VCH: New York, 2000; Vol. 10, pp 15-32.
15. Jarvis, R. A.; Patrick, E. A. IEEE Transact. Comput. 1973, C-22, 1025-1034.
16. Dalvit, C.; Flocco, M.; Knapp, S.; Mostardini, M.; Perego, R.; Stockman, B. J.; Veronesi, M.; Varasi, M. J. Am. Chem. Soc. 2002, 124, 7702-7709.
17. Dalvit, C.; Fasolini, M.; Flocco, M.; Knapp, S.; Pevarello, P.; Veronesi, M. J. Med. Chem. 2002, 45, 2610-2614.
18. Shuker, S. B.; Hajduk, P. J.; Meadows, R. P.; Fesik, S. W. Science 1996, 274, 1531-1534.
19. Pellecchia, M.; Meininger, D.; Dong, Q.; Chang, E.; Jack, R.; Sem, D. S. J. Biomol. NMR 2002, 22, 165-173.
20. Mayer, M.; Meyer, B. Angew. Chem. Int. Ed. 1999, 38, 1784-1788.
21. Davis, R. J. Cell 2000, 103, 239-252.
22. Xia, X. G.; Harding, T.; Weller, M.; Bieneman, A.; Uney, J. B.; Schulz, J. B. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2001, 98, 10433-10438.
23. Bruckner, S. R.; Tammariello, S. P.; Kuan, C. Y.; Flavell, R. A.; Rakic, P.; Estus, S. J. Neurochem. 2001, 78, 298-303.
24. Charifson, P. S.; Corkery, J. J.; Murcko, M. A.; Walters, W. P. J. Med. Chem. 1999, 42, 5100-5109.
25. Hotamisligil, G. S.; Johnson, R. S.; Distel, R. J.; Ellis, R.; Papaioannou, V. E.; Spiegelman, B. M. Science 1996, 274, 1377-1379.
26. Scheja, L.; Makowski, L.; Uysal, K. T.; Wiesbrock, S. M.; Shimshek, D. R.; Meyers, D. S.; Morgan, M.; Parker, R. A.; Hotamisligil, G. S. Diabetes 1999, 48, 1987-1994.
27. Uysal, K. T.; Scheja, L.; Wiesbrock, S. M.; Bonner-Weir, S.; Hotamisligil, G. S. Endocrinology 2000, 141, 3388-96.
28. Layne, M. D.; Patel, A.; Chen, Y. H.; Rebel, V. I.; Carvajal, I. M.; Pellacani, A.; 1th, B.; Zhao, D.; Schreiber, B. M.; Yet, S. F.; Lee, M. E.; Storch, J.; Perrella, M. A. FASEB J. 2001, 15, 2733-2735.
29. Makowski, L.; Boord, J. B.; Maeda, K.; Babaev, V. R.; Uysal, K. T.; Morgan, M. A.; Parker, R. A.; Suttles, J.; Fazio, S.; Hotamisligil, G. S.; Linton, M. F. Nat. Med. 2001, 7, 699-705.
30. Kane, C. D.; Bernlohr, D. A. Anal. Biochem. 1996, 233, 197-204.
31. Lukavsky, P. J.; Otto, G. A.; Lancaster, A. M.; Sarnow, P.; Puglisi, J. D. Nat. Struct. Biol. 2000, 7, 1105-1110.
32. Fourmy, D.; Recht, M. I.; Blanchard, S. C.; Puglisi, J. D. Science 1996, 274, 1367-1371.
33. Mori, S.; Berg, J. M.; van Zijl, P. C. J. Biomol. NMR 1996, 7, 77-82.
34. Mori, S.; Abeygunawardana, C; van Zijl, P. C.; Berg, J. M. J. Magn. Reson. B 1996, 110, 96-101.
35. Dalvit, C.; Pevarello, P.; Tato, M.; Veronesi, M.; Vulpetti, A.; Sundstrom, M. J. Biomol. NMR 2000, 18, 65-68.
36. Dalvit, C.; Fogliatto, G.; Stewart, A.; Veronesi, M.; Stockman, B. J. Biomol. NMR 2001, 21, 349-359.
37. Cate, J. H.; Gooding, A. R.; Podell, E.; Zhou, K.; Golden, B. L.; Kundrot, C. E.; Cech, T. R.; Doudna, J. A. Science 1996, 273, 1678-1685.
38. Mayer, M.; Meyer, B., J. Am. Chem. Soc. 2001, 1]23, 6108-6117.
39. LaLonde, J. M.; Bernlohr, D. A.; Banaszak, L. J. Biochemistry 1994, 33, 4885-4895.