Constant-distance mode nanospray desorption electrospray ionization mass spectrometry imaging of biological samples with complex topography

Analytical Chemistry

Volumn 89, Issue 2, 2017, Pages 1131-1137

  Nguyen, Son N ^a   Liyu, Andrey V ^a   Chu, Rosalie K ^a   Anderton, Christopher R ^a   Laskin, Julia ^a  

^a PACIFIC NORTHWEST NATIONAL LABORATORY   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ALGAE; BACTERIOLOGY; DESORPTION; MASS SPECTROMETRY; METABOLITES; POLYSACCHARIDES; PROBES; TOPOGRAPHY;

CLOSED FEEDBACK LOOP; COMPLEX TOPOGRAPHIES; CONSTANT-DISTANCE MODES; DESORPTION ELECTROSPRAY IONIZATION; DESORPTION ELECTROSPRAY IONIZATION MASS SPECTROMETRIES; MASS SPECTROMETRY IMAGING (MSI); NONRIBOSOMAL PEPTIDE; RESONANT OSCILLATION;

ELECTROSPRAY IONIZATION;

EID: 85029171356     PISSN: 00032700     EISSN: 15206882     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/acs.analchem.6b03293     Document Type: Article

References (54)

1. Anhalt, J.; Fenselau, C. Anal. Chem. 1975, 47 (2), 219-225.
2. Seng, P.; Drancourt, M.; Gouriet, F.; La Scola, B.; Fournier, P.-E.; Rolain, J. M.; Raoult, D. Clin. Infect. Dis. 2009, 49 (4), 543-551.
3. Bizzini, A.; Durussel, C.; Bille, J.; Greub, G.; Prod'hom, G. J. Clin. Microbiol. 2010, 48 (5), 1549-1554.
4. Liu, W.-T.; Yang, Y.-L.; Xu, Y.; Lamsa, A.; Haste, N. M.; Yang, J. Y.; Ng, J.; Gonzalez, D.; Ellermeier, C. D.; Straight, P. D.; Pevzner, P. A.; Pogliano, J.; Nizet, V.; Pogliano, K.; Dorrestein, P. C. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2010, 107 (37), 16286-16290.
5. Watrous, J. D.; Dorrestein, P. C. Nat. Rev. Microbiol. 2011, 9 (9), 683-694.
6. Moree, W. J.; Phelan, V. V.; Wu, C.-H.; Bandeira, N.; Cornett, D. S.; Duggan, B. M.; Dorrestein, P. C. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2012, 109 (34), 13811-13816.
7. Yang, J. Y.; Phelan, V. V.; Simkovsky, R.; Watrous, J. D.; Trial, R. M.; Fleming, T. C.; Wenter, R.; Moore, B. S.; Golden, S. S.; Pogliano, K.; Dorrestein, P. C. J. Bacteriol. 2012, 194 (22), 6023-6028.
8. Takats, Z.; Wiseman, J. M.; Gologan, B.; Cooks, R. G. Science 2004, 306 (5695), 471-473.
9. Roach, P. J.; Laskin, J.; Laskin, A. Analyst 2010, 135 (9), 2233-2236.
10. Venter, A. R.; Douglass, K. A.; Shelley, J. T.; Hasman, G.; Honarvar, E. Anal. Chem. 2014, 86 (1), 233-249.
11. Badu-Tawiah, A. K.; Eberlin, L. S.; Ouyang, Z.; Cooks, R. G. Annu. Rev. Phys. Chem. 2013, 64 (1), 481-505.
12. Espy, R. D.; Teunissen, S. F.; Manicke, N. E.; Ren, Y.; Ouyang, Z.; van Asten, A.; Cooks, R. G. Anal. Chem. 2014, 86 (15), 7712-7718.
13. Song, Y.; Talaty, N.; Datsenko, K.; Wanner, B. L.; Cooks, R. G. Analyst 2009, 134 (5), 838-841.
14. Watrous, J.; Hendricks, N.; Meehan, M.; Dorrestein, P. C. Anal. Chem. 2010, 82 (5), 1598-1600.
15. Laskin, J.; Lanekoff, I. Anal. Chem. 2016, 88 (1), 52-73.
16. Watrous, J.; Roach, P.; Alexandrov, T.; Heath, B. S.; Yang, J. Y.; Kersten, R. D.; van der Voort, M.; Pogliano, K.; Gross, H.; Raaijmakers, J. M.; Moore, B. S.; Laskin, J.; Bandeira, N.; Dorrestein, P. C. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2012, 109 (26), E1743-E1752.
17. Watrous, J.; Roach, P. J.; Heath, B. S.; Alexandrov, T.; Laskin, J.; Dorrestein, P. C. Anal. Chem. 2013, 85 (21), 10385-10391.
18. Lanekoff, I.; Geydebrekht, O.; Pinchuk, G. E.; Konopka, A. E.; Laskin, J. Analyst 2013, 138 (7), 1971-1978.
19. Traxler, M. F.; Watrous, J. D.; Alexandrov, T.; Dorrestein, P. C.; Kolter, R. mBio 2013, 4 (4), 1-12.
20. Nguyen, D. D.; Wu, C.-H.; Moree, W. J.; Lamsa, A.; Medema, M. H.; Zhao, X.; Gavilan, R. G.; Aparicio, M.; Atencio, L.; Jackson, C.; Ballesteros, J.; Sanchez, J.; Watrous, J. D.; Phelan, V. V.; van de Wiel, C.; Kersten, R. D.; Mehnaz, S.; De Mot, R.; Shank, E. A.; Charusanti, P.; Nagarajan, H.; Duggan, B. M.; Moore, B. S.; Bandeira, N.; Palsson, B. Ø.; Pogliano, K.; Gutierrez, M.; Dorrestein, P. C. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2013, 110 (28), E2611-E2620.
21. Shih, C.-J.; Chen, P.-Y.; Liaw, C.-C.; Lai, Y.-M.; Yang, Y.-L. Nat. Prod. Rep. 2014, 31 (6), 739-755.
22. Lanekoff, I.; Heath, B. S.; Liyu, A.; Thomas, M.; Carson, J. P.; Laskin, J. Anal. Chem. 2012, 84 (19), 8351-8356.
23. Kertesz, V.; Ford, M. J.; Van Berkel, G. J. Anal. Chem. 2005, 77 (22), 7183-7189.
24. Ovchinnikova, O. S.; Kjoller, K.; Hurst, G. B.; Pelletier, D. A.; Van Berkel, G. J. Anal. Chem. 2014, 86 (2), 1083-1090.
25. Ovchinnikova, O. S.; Tai, T.; Bocharova, V.; Okatan, M. B.; Belianinov, A.; Kertesz, V.; Jesse, S.; Van Berkel, G. J. ACS Nano 2015, 9 (4), 4260-4269.
26. Nudnova, M. M.; Sigg, J.; Wallimann, P.; Zenobi, R. Anal. Chem. 2015, 87 (2), 1323-1329.
27. Schmitz, T. A.; Gamez, G.; Setz, P. D.; Zhu, L.; Zenobi, R. Anal. Chem. 2008, 80 (17), 6537-6544.
28. Ovchinnikova, O. S.; Nikiforov, M. P.; Bradshaw, J. A.; Jesse, S.; Van Berkel, G. J. ACS Nano 2011, 5 (7), 5526-5531.
29. Brunner, R.; Bietsch, a.; Hollricher, O.; Marti, O. Rev. Sci. Instrum. 1997, 68 (4), 1769-1772.
30. Ballesteros Katemann, B.; Schulte, A.; Schuhmann, W. Chem. - Eur. J. 2003, 9 (9), 2025-2033.
31. Lanekoff, I.; Thomas, M.; Laskin, J. Anal. Chem. 2014, 86 (3), 1872-1880.
32. Laskin, J.; Heath, B. S.; Roach, P. J.; Cazares, L.; Semmes, O. J. Anal. Chem. 2012, 84 (1), 141-148.
33. Sonenshein, A. L.; Hoch, J. A.; Losick, R. Bacillus Subtilis and Other Gram-Positive Bacteria: Biochemistry, Physiology, and Molecular Genetics; American Society Mic Series; American Society for Microbiology, 1993.
34. Meima, R.; van Dijl, J. M.; Holsappel, S. In Protein Expression Technologies: Current Status and Future Trends; Baneyx, F., Ed.; Horizon Bioscience, 2004; pp 199-252.
35. Perkins, J. B.; Markus Wyss, H.-P. H. In The Metabolic Pathway Engineering Handbook: Fundamentals; Smolke, C., Ed.; CRC Press, 2009; Vol. 1, pp 1-23.
36. Schallmey, M.; Singh, A.; Ward, O. P. Can. J. Microbiol. 2004, 50 (1), 1-17.
37. Errington, J. Nat. Rev. Microbiol. 2003, 1 (2), 117-126.
38. Piggot, P. J.; Hilbert, D. W. Curr. Opin. Microbiol. 2004, 7 (6), 579-586.
39. Stragier, P.; Losick, R. Annu. Rev. Genet. 1996, 30, 297-41.
40. Gonzalez, D. J.; Haste, N. M.; Hollands, A.; Fleming, T. C.; Hamby, M.; Pogliano, K.; Nizet, V.; Dorrestein, P. C. Microbiology 2011, 157 (9), 2485-2492.
41. Watrous, J. D.; Phelan, V. V.; Hsu, C.-C.; Moree, W. J.; Duggan, B. M.; Alexandrov, T.; Dorrestein, P. C. ISME J. 2013, 7 (4), 770-780.
42. Hsu, C. C.; Elnaggar, M. S.; Peng, Y.; Fang, J.; Sanchez, L. M.; Mascuch, S. J.; Muller, K. A.; Alazzeh, E. K.; Pikula, J.; Quinn, R. A.; Zeng, Y.; Wolfe, B. E.; Dutton, R. J.; Gerwick, L.; Zhang, L.; Liu, X.; Mansson, M.; Dorrestein, P. C. Anal. Chem. 2013, 85 (15), 7014-7018.
43. Yang, Y.-L.; Xu, Y.; Straight, P.; Dorrestein, P. C. Nat. Chem. Biol. 2009, 5 (12), 885-887.
44. Yang, Y. L.; Xu, Y.; Kersten, R. D.; Liu, W. T.; Meehan, M. J.; Moore, B. S.; Bandeira, N.; Dorrestein, P. C. Angew. Chem., Int. Ed. 2011, 50 (26), 5839-5842.
45. Debois, D.; Hamze, K.; Guerineau, V.; Le Caer, J. P.; Holland, I. B.; Lopes, P.; Ouazzani, J.; Seror, S. J.; Brunelle, A.; Laprevote, O. Proteomics 2008, 8 (18), 3682-3691.
46. Asally, M.; Kittisopikul, M.; Rue, P.; Du, Y.; Hu, Z.; Cagatay, T.; Robinson, A. B.; Lu, H.; Garcia-Ojalvo, J.; Suel, G. M. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2012, 109 (46), 18891-18896.
47. Branda, S. S.; Vik, Ashild; Friedman, L.; Kolter, R. Trends Microbiol. 2005, 13 (1), 20-26.
48. Marvasi, M.; Visscher, P. T.; Casillas Martinez, L. FEMS Microbiol. Lett. 2010, 313 (1), 1-9.
49. Pathak, K. V.; Keharia, H. 3 Biotech 2014, 4 (3), 283-295.
50. Peypoux, F.; Bonmatin, J. M.; Wallach, J. Appl. Microbiol. Biotechnol. 1999, 51 (5), 553-563.
51. Angelini, T. E.; Roper, M.; Kolter, R.; Weitz, D. a; Brenner, M. P. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2009, 106 (43), 18109-18113.
52. Straight, P. D.; Willey, J. M.; Kolter, R. J. Bacteriol. 2006, 188 (13), 4918-4925.
53. Branda, S. S.; Gonzalez-Pastor, J. E.; Ben-Yehuda, S.; Losick, R.; Kolter, R. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2001, 98 (20), 11621-11626.
54. Branda, S. S.; Gonzalez-Pastor, J. E.; Ben-Yehuda, S.; Losick, R.; Kolter, R. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2001, 98 (20), 11621-11626.