A Grand Challenge. 2. Phenotypic Profiling of a Natural Product Library on Parkinson's Patient-Derived Cells

Journal of Natural Products

Volumn 79, Issue 8, 2016, Pages 1982-1989

  Vial, Marie Laure ^a   Zencak, Dusan ^a   Grkovic, Tanja ^a   Gorse, Alain Dominique ^b   Mackay Sim, Alan ^a   Mellick, George D ^a   Wood, Stephen A ^a   Quinn, Ronald J ^a  

^a GRIFFITH UNIVERSITY   (Australia)

^b UNIVERSITY OF QUEENSLAND   (Australia)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

AJMALINE; GITOXIGENIN; NATURAL PRODUCT; PROTOPINE; TOMATIDINE; UNCLASSIFIED DRUG; BIOLOGICAL PRODUCT; MOLECULAR LIBRARY;

APOPTOSIS; ARTICLE; AUTOPHAGY; CELL ORGANELLE; CLUSTER ANALYSIS; CONTROLLED STUDY; DRUG SCREENING; ENDOSOME; HUMAN; HUMAN CELL; LYSOSOME; MITOCHONDRION; PARKINSON DISEASE; PHENOTYPE; CHEMICAL STRUCTURE; DRUG EFFECTS; MOLECULAR LIBRARY;

APOPTOSIS; BIOLOGICAL PRODUCTS; HUMANS; MOLECULAR STRUCTURE; PARKINSON DISEASE; SMALL MOLECULE LIBRARIES;

EID: 84984670371     PISSN: 01633864     EISSN: 15206025     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/acs.jnatprod.6b00258     Document Type: Article

References (38)

1. Koch, M. A.; Waldmann, H. Drug Discovery Today 2005, 10, 471-483 10.1016/S1359-6446(05)03419-7
2. Koch, M. A.; Wittenberg, L. O.; Basu, S.; Jeyaraj, D. A.; Gourzoulidou, E.; Reinecke, K.; Odermatt, A.; Waldmann, H. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2004, 101, 16721-16726 10.1073/pnas.0404719101
3. Breinbauer, R.; Vetter, I. R.; Waldmann, H. Angew. Chem., Int. Ed. 2002, 41, 2878-2890 10.1002/1521-3773(20020816)41:16<2878::AID-ANIE2878>3.0.CO;2-B
4. Dobson, C. M. Nature 2004, 432, 824-828 10.1038/nature03192
5. Harvey, A. L.; Edrada-Ebel, R.; Quinn, R. J. Nat. Rev. Drug Discovery 2015, 14, 111-129 10.1038/nrd4510
6. Koehn, F. E.; Carter, G. T. Nat. Rev. Drug Discovery 2005, 4, 206-220 10.1038/nrd1657
7. Kurita, K. L.; Linington, R. G. J. Nat. Prod. 2015, 78, 587-596 10.1021/acs.jnatprod.5b00017
8. Schulze, C. J.; Bray, W. M.; Woerhmann, M. H.; Stuart, J.; Lokey, R. S.; Linington, R. G. Chem. Biol. 2013, 20, 285-295 10.1016/j.chembiol.2012.12.007
9. Perlman, Z. E.; Slack, M. D.; Feng, Y.; Mitchison, T. J.; Wu, L. F.; Altschuler, S. J. Science 2004, 306, 1194-1198 10.1126/science.1100709
10. Gustafsdottir, S. M.; Ljosa, V.; Sokolnicki, K. L.; Anthony Wilson, J.; Walpita, D.; Kemp, M. M.; Petri Seiler, K.; Carrel, H. A.; Golub, T. R.; Schreiber, S. L.; Clemons, P. A.; Carpenter, A. E.; Shamji, A. F. PLoS One 2013, 8, e80999 10.1371/journal.pone.0080999
11. Tanaka, M.; Bateman, R.; Rauh, D.; Vaisberg, E.; Ramachandani, S.; Zhang, C.; Hansen, K. C.; Burlingame, A. L.; Trautman, J. K.; Shokat, K. M.; Adams, C. L. PLoS Biol. 2005, 3, e128 10.1371/journal.pbio.0030128
12. Matigian, N.; Abrahamsen, G.; Sutharsan, R.; Cook, A. L.; Vitale, A. M.; Nouwens, A.; Bellette, B.; An, J.; Anderson, M.; Beckhouse, A. G.; Bennebroek, M.; Cecil, R.; Chalk, A. M.; Cochrane, J.; Fan, Y.; Feron, F.; McCurdy, R.; McGrath, J. J.; Murrell, W.; Perry, C.; Raju, J.; Ravishankar, S.; Silburn, P. A.; Sutherland, G. T.; Mahler, S.; Mellick, G. D.; Wood, S. A.; Sue, C. M.; Wells, C. A.; Mackay-Sim, A. Dis. Models & Mech. 2010, 3, 785-798 10.1242/dmm.005447
13. Cook, A. L.; Vitale, A. M.; Ravishankar, S.; Matigian, N.; Sutherland, G. T.; Shan, J.; Sutharsan, R.; Perry, C.; Silburn, P. A.; Mellick, G. D.; Whitelaw, M. L.; Wells, C. A.; Mackay-Sim, A.; Wood, S. A. PLoS One 2011, 6, e21907 10.1371/journal.pone.0021907
14. Grkovic, T.; Pouwer, R. H.; Vial, M. L.; Gambini, L.; Noél, A.; Hooper, J. N.; Wood, S. A.; Mellick, G. D.; Quinn, R. J. Angew. Chem., Int. Ed. 2014, 53, 6070-6074 10.1002/anie.201402239
15. Wang, D.; Feng, Y.; Murtaza, M.; Wood, S.; Mellick, G.; Hooper, J. N. A.; Quinn, R. J. J. Nat. Prod. 2016, 79, 353 10.1021/acs.jnatprod.5b00987
16. Zhu, X.; Bidlingmaier, S.; Hashizume, R.; James, C. D.; Berger, M. S.; Liu, B. Mol. Cancer Ther. 2010, 9, 2131-2141 10.1158/1535-7163.MCT-09-1059
17. Stenmark, H.; Aasland, R.; Toh, B. H.; DArrigo, A. J. Biol. Chem. 1996, 271, 24048-24054 10.1074/jbc.271.39.24048
18. Lone, M.; Kungl, T.; Koper, A.; Bottenberg, W.; Kammerer, R.; Klein, M.; Sweeney, S. T.; Auburn, R. P.; O'Kane, C. J.; Prokop, A. J. Cell Sci. 2010, 123, 2369-2374 10.1242/jcs.060582
19. Peshenko, I. V.; Olshevskaya, E. V.; Dizhoor, A. M. J. Biol. Chem. 2008, 283, 21747-21757 10.1074/jbc.M801899200
20. Giuliano, K. A. J. Biomol. Screening 2003, 8, 125-135 10.1177/1087057103252616
21. Russell, J. W.; Golovoy, D.; Vincent, A. M.; Mahendru, P.; Olzmann, J. A.; Mentzer, A.; Feldman, E. L. FASEB J. 2002, 16, 1738-1748 10.1096/fj.01-1027com
22. Carpenter, J. E.; Jackson, W.; Benetti, L.; Grose, C. J. Virol. 2011, 85, 9414-9424 10.1128/JVI.00281-11
23. Farshori, P. Q.; Goode, D. J. Submicrosc. Cytol. Pathol. 1994, 26, 137-146
24. Michihara, A.; Toda, K.; Kubo, T.; Fujiwara, Y.; Akasaki, K.; Tsuji, H. Biol. Pharm. Bull. 2005, 28, 947-951 10.1248/bpb.28.947
25. Li, N.; Ragheb, K.; Lawler, G.; Sturgis, J.; Rajwa, B.; Melendez, J. A.; Robinson, J. P. J. Biol. Chem. 2003, 278, 8516-8525 10.1074/jbc.M210432200
26. Camp, D.; Davis, R. A.; Campitelli, M.; Ebdon, J.; Quinn, R. J. J. Nat. Prod. 2012, 75, 72-81 10.1021/np200687v
27. Baldi, P.; Nasr, R. J. Chem. Inf. Model. 2010, 50, 1205-1222 10.1021/ci100010v
28. Vogl, A. W.; Linck, R. W.; Dym, M. Am. J. Anat. 1983, 168, 99-108 10.1002/aja.1001680110
29. Schliwa, M. J. Cell Biol. 1982, 92, 79-91 10.1083/jcb.92.1.79
30. Arnal, I.; Wade, R. H. Curr. Biol. 1995, 5, 900-908 10.1016/S0960-9822(95)00180-1
31. Su, Y. F.; Li, S. K.; Li, N.; Chen, L. L.; Zhang, J. W.; Wang, J. R. J. Med. Plants Res. 2011, 5, 5428-5432
32. Koppel, C.; Wagemann, A.; Martens, F. Eur. J. Drug Metab. Pharmacokinet. 1989, 14, 161-167 10.1007/BF03190857
33. Lopez-Lazaro, M.; Palma; De La Pena, N.; Pastor, N.; Martin-Cordero, C.; Navarro, E.; Cortes, F.; Ayuso, M. J.; Toro, M. V. Planta Med. 2003, 69, 701-704 10.1055/s-2003-42789
34. Harikumar, P.; Reeves, J. P. J. Biol. Chem. 1983, 258, 10403-10410
35. Ohsaki, Y.; Suzuki, M.; Shinohara, Y.; Fujimoto, T. Histochem. Cell Biol. 2010, 134, 537-544 10.1007/s00418-010-0759-x
36. Vilarino-Guell, C.; Wider, C.; Ross, O. A.; Dachsel, J. C.; Kachergus, J. M.; Lincoln, S. J.; Soto-Ortolaza, A. I.; Cobb, S. A.; Wilhoite, G. J.; Bacon, J. A.; Behrouz, B.; Melrose, H. L.; Hentati, E.; Puschmann, A.; Evans, D. M.; Conibear, E.; Wasserman, W. W.; Aasly, J. O.; Burkhard, P. R.; Djaldetti, R.; Ghika, J.; Hentati, F.; Krygowska-Wajs, A.; Lynch, T.; Melamed, E.; Rajput, A.; Rajput, A. H.; Solida, A.; Wu, R. M.; Uitti, R. J.; Wszolek, Z. K.; Vingerhoets, F.; Farrer, M. J. Am. J. Hum. Genet. 2011, 89, 162-167 10.1016/j.ajhg.2011.06.001
37. Follett, J.; Norwood, S. J.; Hamilton, N. A.; Mohan, M.; Kovtun, O.; Tay, S.; Zhe, Y.; Wood, S. A.; Mellick, G. D.; Silburn, P. A.; Collins, B. M.; Bugarcic, A.; Teasdale, R. D. Traffic 2014, 15, 230-244 10.1111/tra.12136
38. Stefanis, L. Cold Spring Harbor Perspect. Med. 2012, 2, a009399 10.1101/cshperspect.a009399