Evaluation of Collision Cross Section Calibrants for Structural Analysis of Lipids by Traveling Wave Ion Mobility-Mass Spectrometry

Analytical Chemistry

Volumn 88, Issue 14, 2016, Pages 7329-7336

  Hines, Kelly M ^a   May, Jody C ^b   McLean, John A ^b   Xu, Libin ^a  

^a UNIVERSITY OF WASHINGTON   (United States)

^b VANDERBILT UNIVERSITY SCHOOL OF MEDICINE   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

CALIBRATION; ERRORS; ION MOBILITY SPECTROMETERS; IONS; MASS SPECTROMETRY; PHOSPHOLIPIDS; SPECTROMETRY;

CALIBRATION ERROR; COLLISION CROSS SECTIONS; GAS PHASE CONFORMATIONS; PHOSPHATIDYL CHOLINE; STRUCTURAL STUDIES; TETRAALKYLAMMONIUM; TRAVELING WAVE ION MOBILITIES; TRAVELING WAVE PARAMETERS;

LIPIDS;

ION; NITROGEN; PEPTIDE; PHOSPHATIDYLCHOLINE; PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE; POLYALANINE;

CALIBRATION; CHEMISTRY; ELECTROSPRAY MASS SPECTROMETRY; PROCEDURES; STANDARDS;

CALIBRATION; IONS; NITROGEN; PEPTIDES; PHOSPHATIDYLCHOLINES; PHOSPHATIDYLETHANOLAMINES; SPECTROMETRY, MASS, ELECTROSPRAY IONIZATION;

EID: 84978923122     PISSN: 00032700     EISSN: 15206882     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/acs.analchem.6b01728     Document Type: Article

References (52)

1. Yeagle, P. L. FASEB J. 1989, 3, 1833
2. Wymann, M. P.; Schneiter, R. Nat. Rev. Mol. Cell Biol. 2008, 9, 162 10.1038/nrm2335
3. Berliner, J. A.; Leitinger, N.; Tsimikas, S. J. Lipid Res. 2008, 50, S207 10.1194/jlr.R800074-JLR200
4. Santos, C. R.; Schulze, A. FEBS J. 2012, 279, 2610 10.1111/j.1742-4658.2012.08644.x
5. Sounni, N. E.; Cimino, J.; Blacher, S.; Primac, I.; Truong, A.; Mazzucchelli, G.; Paye, A.; Calligaris, D.; Debois, D.; De Tullio, P.; Mari, B.; De Pauw, E.; Noel, A. Cell Metab. 2014, 20, 280 10.1016/j.cmet.2014.05.022
6. Gross, R. W.; Han, X. Methods Enzymol. 2007, 433, 73 10.1016/S0076-6879(07)33004-8
7. Schmelzer, K.; Fahy, E.; Subramaniam, S.; Dennis, E. A. Methods Enzymol. 2007, 432, 171 10.1016/S0076-6879(07)32007-7
8. Quehenberger, O. et al. J. Lipid Res. 2010, 51, 3299 10.1194/jlr.M009449
9. Dennis, E. A.; Deems, R. A.; Harkewicz, R.; Quehenberger, O.; Brown, H. A.; Milne, S. B.; Myers, D. S.; Glass, C. K.; Hardiman, G.; Reichart, D.; Merrill, A. H., Jr.; Sullards, M. C.; Wang, E.; Murphy, R. C.; Raetz, C. R.; Garrett, T. A.; Guan, Z.; Ryan, A. C.; Russell, D. W.; McDonald, J. G.; Thompson, B. M.; Shaw, W. A.; Sud, M.; Zhao, Y.; Gupta, S.; Maurya, M. R.; Fahy, E.; Subramaniam, S. J. Biol. Chem. 2010, 285, 39976 10.1074/jbc.M110.182915
10. Quehenberger, O.; Dennis, E. A. N. Engl. J. Med. 2011, 365, 1812 10.1056/NEJMra1104901
11. Han, X.; Gross, R. W. Mass Spectrom. Rev. 2005, 24, 367 10.1002/mas.20023
12. Schwudke, D.; Liebisch, G.; Herzog, R.; Schmitz, G.; Shevchenko, A. Methods Enzymol. 2007, 433, 175 10.1016/S0076-6879(07)33010-3
13. Merrill, A. H., Jr.; Sullards, M. C.; Allegood, J. C.; Kelly, S.; Wang, E. Methods 2005, 36, 207 10.1016/j.ymeth.2005.01.009
14. Ivanova, P. T.; Milne, S. B.; Byrne, M. O.; Xiang, Y.; Brown, H. A. Methods Enzymol. 2007, 432, 21 10.1016/S0076-6879(07)32002-8
15. Clemmer, D. E.; Hudgins, R. R.; Jarrold, M. F. J. Am. Chem. Soc. 1995, 117, 10141 10.1021/ja00145a037
16. von Helden, G.; Wyttenbach, T.; Bowers, M. T. Science 1995, 267, 1483 10.1126/science.267.5203.1483
17. McLean, J. A.; Ruotolo, B. T.; Gillig, K. J.; Russell, D. H. Int. J. Mass Spectrom. 2005, 240, 301 10.1016/j.ijms.2004.10.003
18. Kanu, A. B.; Dwivedi, P.; Tam, M.; Matz, L.; Hill, H. H., Jr. J. Mass Spectrom. 2008, 43, 1 10.1002/jms.1383
19. May, J. C.; McLean, J. A. Anal. Chem. 2015, 87, 1422 10.1021/ac504720m
20. Jackson, S. N.; Wang, H. Y.; Woods, A. S.; Ugarov, M.; Egan, T.; Schultz, J. A. J. Am. Soc. Mass Spectrom. 2005, 16, 133 10.1016/j.jasms.2004.10.002
21. Jackson, S. N.; Ugarov, M.; Post, J. D.; Egan, T.; Langlais, D.; Schultz, J. A.; Woods, A. S. J. Am. Soc. Mass Spectrom. 2008, 19, 1655 10.1016/j.jasms.2008.07.005
22. Fenn, L. S.; McLean, J. A. Anal. Bioanal. Chem. 2008, 391, 905 10.1007/s00216-008-1951-x
23. Fenn, L. S.; Kliman, M.; Mahsut, A.; Zhao, S. R.; McLean, J. A. Anal. Bioanal. Chem. 2009, 394, 235 10.1007/s00216-009-2666-3
24. Paglia, G.; Angel, P.; Williams, J. P.; Richardson, K.; Olivos, H. J.; Thompson, J. W.; Menikarachchi, L.; Lai, S.; Walsh, C.; Moseley, A.; Plumb, R. S.; Grant, D. F.; Palsson, B. O.; Langridge, J.; Geromanos, S.; Astarita, G. Anal. Chem. 2015, 87, 1137 10.1021/ac503715v
25. Groessl, M.; Graf, S.; Knochenmuss, R. Analyst 2015, 140, 6904 10.1039/C5AN00838G
26. May, J. C.; Goodwin, C. R.; Lareau, N. M.; Leaptrot, K. L.; Morris, C. B.; Kurulugama, R. T.; Mordehai, A.; Klein, C.; Barry, W.; Darland, E.; Overney, G.; Imatani, K.; Stafford, G. C.; Fjeldsted, J. C.; McLean, J. A. Anal. Chem. 2014, 86, 2107 10.1021/ac4038448
27. Kliman, M.; May, J. C.; McLean, J. A. Biochim. Biophys. Acta, Mol. Cell Biol. Lipids 2011, 1811, 935 10.1016/j.bbalip.2011.05.016
28. Giles, K.; Pringle, S. D.; Worthington, K. R.; Little, D.; Wildgoose, J. L.; Bateman, R. H. Rapid Commun. Mass Spectrom. 2004, 18, 2401 10.1002/rcm.1641
29. Pringle, S. D.; Giles, K.; Wildgoose, J. L.; Williams, J. P.; Slade, S. E.; Thalassinos, K.; Bateman, R. H.; Bowers, M. T.; Scrivens, J. H. Int. J. Mass Spectrom. 2007, 261, 1 10.1016/j.ijms.2006.07.021
30. Ridenour, W. B.; Kliman, M.; McLean, J. A.; Caprioli, R. M. Anal. Chem. 2010, 82, 1881 10.1021/ac9026115
31. Kyle, J. E.; Zhang, X.; Weitz, K. K.; Monroe, M. E.; Ibrahim, Y. M.; Moore, R. J.; Cha, J.; Sun, X.; Lovelace, E. S.; Wagoner, J.; Polyak, S. J.; Metz, T. O.; Dey, S. K.; Smith, R. D.; Burnum-Johnson, K. E.; Baker, E. S. Analyst 2016, 141, 1649 10.1039/C5AN02062J
32. Mason, E. A.; Schamp, H. W., Jr Ann. Phys. 1958, 4, 233 10.1016/0003-4916(58)90049-6
33. Mason, E. A.; McDaniel, E. W. Transport Properties of Ions in Gases; Wiley: New York, 1988.
34. Shvartsburg, A. A.; Smith, R. D. Anal. Chem. 2008, 80, 9689 10.1021/ac8016295
35. Giles, K.; Wildgoose, J. L.; Langridge, D. J.; Campuzano, I. Int. J. Mass Spectrom. 2010, 298, 10 10.1016/j.ijms.2009.10.008
36. May, J. C.; McLean, J. A. Int. J. Ion Mobility Spectrom. 2013, 16, 85 10.1007/s12127-013-0123-7
37. Scarff, C. A.; Thalassinos, K.; Hilton, G. R.; Scrivens, J. H. Rapid Commun. Mass Spectrom. 2008, 22, 3297 10.1002/rcm.3737
38. Ruotolo, B. T.; Benesch, J. L.; Sandercock, A. M.; Hyung, S. J.; Robinson, C. V. Nat. Protoc. 2008, 3, 1139 10.1038/nprot.2008.78
39. Kim, H. I.; Kim, H.; Pang, E. S.; Ryu, E. K.; Beegle, L. W.; Loo, J. A.; Goddard, W. A.; Kanik, I. Anal. Chem. 2009, 81, 8289 10.1021/ac900672a
40. Smith, D. P.; Knapman, T. W.; Campuzano, I.; Malham, R. W.; Berryman, J. T.; Radford, S. E.; Ashcroft, A. E. Eur. Mass Spectrom. 2009, 15, 113 10.1255/ejms.947
41. Bush, M. F.; Campuzano, I. D.; Robinson, C. V. Anal. Chem. 2012, 84, 7124 10.1021/ac3014498
42. Forsythe, J. G.; Petrov, A. S.; Walker, C. A.; Allen, S. J.; Pellissier, J. S.; Bush, M. F.; Hud, N. V.; Fernandez, F. M. Analyst 2015, 140, 6853 10.1039/C5AN00946D
43. Thalassinos, K.; Grabenauer, M.; Slade, S. E.; Hilton, G. R.; Bowers, M. T.; Scrivens, J. H. Anal. Chem. 2009, 81, 248 10.1021/ac801916h
44. Bush, M. F.; Hall, Z.; Giles, K.; Hoyes, J.; Robinson, C. V.; Ruotolo, B. T. Anal. Chem. 2010, 82, 9557 10.1021/ac1022953
45. Campuzano, I.; Bush, M. F.; Robinson, C. V.; Beaumont, C.; Richardson, K.; Kim, H.; Kim, H. I. Anal. Chem. 2012, 84, 1026 10.1021/ac202625t
46. Paglia, G.; Williams, J. P.; Menikarachchi, L.; Thompson, J. W.; Tyldesley-Worster, R.; Halldorsson, S.; Rolfsson, O.; Moseley, A.; Grant, D.; Langridge, J.; Palsson, B. O.; Astarita, G. Anal. Chem. 2014, 86, 3985 10.1021/ac500405x
47. Zhang, L.; Vertes, A. Anal. Chem. 2015, 87, 10397 10.1021/acs.analchem.5b02502
48. Beegle, L. W.; Kanik, I.; Matz, L.; Hill, H. H. Int. J. Mass Spectrom. 2002, 216, 257 10.1016/S1387-3806(02)00626-7
49. Matz, L. M.; Hill, H. H., Jr.; Beegle, L. W.; Kanik, I. J. Am. Soc. Mass Spectrom. 2002, 13, 300 10.1016/S1044-0305(01)00366-X
50. Gelb, A. S.; Jarratt, R. E.; Huang, Y.; Dodds, E. D. Anal. Chem. 2014, 86, 11396 10.1021/ac503379e
51. May, J. C.; Dodds, J. N.; Kurulugama, R. T.; Stafford, G. C.; Fjeldsted, J. C.; McLean, J. A. Analyst 2015, 140, 6824 10.1039/C5AN00923E
52. Leaptrot, K. L.; May, J. C.; Dodds, J. N.; McLean, J. A. (2016, in preparation.