Structural characterization of unsaturated phosphatidylcholines using traveling wave ion mobility spectrometry

Analytical Chemistry

Volumn 81, Issue 20, 2009, Pages 8289-8297

  Kim, Hugh I ^a   Kim, Hyungjun ^b   Pang, Eric S ^c   Ryu, Ernest K ^a   Beegle, Luther W ^a   Loo, Joseph A ^c   Goddard, William A ^b   Kanik, Isik ^a  

^a CALIFORNIA INSTITUTE OF TECHNOLOGY   (United States)

^b CALIFORNIA INSTITUTE OF TECHNOLOGY   (United States)

^c UNIVERSITY OF CALIFORNIA   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ACYL CHAIN; CALIBRATION METHOD; COLLISION CROSS SECTIONS; COMPUTATIONAL ANALYSIS; DOUBLE BONDS; DRIFT GAS; DRIFT TIME; ELECTROSPRAY IONIZATION MASS SPECTROMETRY; ION GUIDE; ION MOBILITY SPECTROMETRY; MOLECULAR DYNAMIC SIMULATIONS; NON-SPHERICAL; PHOSPHATIDYLCHOLINE; STRUCTURAL CHARACTERIZATION; STRUCTURAL RIGIDITY; TRAVELING WAVE;

COMPUTER SIMULATION; ELECTROSPRAY IONIZATION; IONIZATION OF GASES; MASS SPECTROMETRY; MOLECULAR DYNAMICS;

POSITIVE IONS;

PHOSPHATIDYLCHOLINE;

ARTICLE; CHEMICAL BOND; CHEMICAL STRUCTURE; CONTROLLED STUDY; ELECTROSPRAY MASS SPECTROMETRY; ION MOBILITY SPECTROMETRY; MOLECULAR DYNAMICS;

CALIBRATION; FATS, UNSATURATED; MASS SPECTROMETRY; MOLECULAR WEIGHT; MOTION; PHOSPHATIDYLCHOLINES; TIME FACTORS;

EID: 70450032513     PISSN: 00032700     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ac900672a     Document Type: Article

References (48)

1. Gurr, M. I.; Hardwood, J. L. Lipid Biochemistry, 4th ed.; Chapman and Hall: New York, 1991.
2. Simoneit, B. R. T.; Summons, R. E.; Jahnke, L. L. Origin Life Evol. Biosphere 1998, 28, 475-483.
3. Hemming, F. W.; Hawthorne, J. N. Lipid Analysis; BIOS Scientific: Oxford, 1996.
4. Woods, A. S.; Ugarov, M.; Egan, T.; Koomen, J.; Gillig, K. J.; Fuhrer, K.; Gonin, M.; Schultz, J. A. Anal. Chem. 2004, 76, 2187-2195.
5. Jackson, S. N.; Ugarov, M.; Egan, T.; Post, J. D.; Langlais, D.; Schultz, J. A.; Woods, A. S. J. Mass Spectrom. 2007, 42, 1093-1098.
6. Jackson, S. N.; Ugarov, M.; Post, J. D.; Egan, T.; Langlais, D.; Schultz, J. A.; Woods, A. S. J. Am. Soc. Mass Spectrom. 2008, 19, 1655-1662.
7. McLean, J. A.; Ridenour, W. B.; Caprioli, R. M. J. Mass Spectrom. 2007, 42, 1099-1105.
8. Fenn, L. S.; McLean, J. A. Anal. Bioanal. Chem. 2008, 391, 905-909.
9. Fenn, L. S.; Kliman, M.; Mahsut, A.; Zhao, S. R.; McLean, J. A. Anal. Bioanal. Chem. 2009, 394, 235-244.
10. Gidden, J.; Bowers, M. T. J. Am. Soc. Mass Spectrom. 2003, 14, 161-170.
11. Fenn, L. S.; McLean, J. A. Chem. Commun. 2008, 5505-5507.
12. Jarrold, M. F. Annu. Rev. Phys. Chem. 2000, 51, 179-207.
13. Griffin, G. W.; Dzidic, I.; Carroll, D. I.; Stillwel, R. N.; Horning, E. C. Anal. Chem. 1973, 45, 1204-1209.
14. Berant, Z.; Karpas, Z. J. Am. Chem. Soc. 1989, 111, 3819-3824.
15. Karpas, Z.; Berant, Z. J. Phys. Chem. 1989, 93, 3021-3025.
16. Valentine, S. J.; Counterman, A. E.; Clemmer, D. E. J. Am. Soc. Mass Spectrom. 1999, 10, 1188-1211.
17. Thalassinos, K.; Grabenauer, M.; Slade, S. E.; Hilton, G. R.; Bowers, M. T.; Scrivens, J. H. Anal. Chem. 2009, 81, 248-254.
18. Ruotolo, B. T.; Gillig, K. J.; Woods, A. S.; Egan, T. F.; Ugarov, M. V.; Schultz, J. A.; Russell, D. H. Anal. Chem. 2004, 76, 6727-6733.
19. Ruotolo, B. T.; Verbeck, G. F.; Thomson, L. M.; Woods, A. S.; Gillig, K. J.; Russell, D. H. J. Proteome Res. 2002, 1, 303-306.
20. Johnson, P. V.; Kim, H. I.; Beegle, L. W.; Kanik, I. J. Phys. Chem. A 2004, 108, 5785-5792.
21. Kim, H. I.; Johnson, P. V.; Beegle, L. W.; Beauchamp, J. L.; Kanik, I. J. Phys. Chem. A 2005, 109, 7888-7895.
22. Kim, H.; Kim, H. I.; Johnson, P. V.; Beegle, L. W.; Beauchamp, J. L.; Goddard, W. A.; Kanik, I. Anal. Chem. 2008, 80, 1928-1936.
23. Ruotolo, B. T.; Giles, K.; Campuzano, I.; Sandercock, A. M.; Bateman, R. H.; Robinson, C. V. Science 2005, 310, 1658-1661.
24. Ruotolo, B. T.; Hyung, S. J.; Robinson, P. M.; Giles, K.; Bateman, R. H.; Robinson, C. V. Angew. Chem., Int. Ed. 2007, 46, 8001-8004.
25. Smith, D. P.; Giles, K.; Bateman, R. H.; Radford, S. E.; Ashcroft, A. E. J. Am. Soc. Mass Spectrom. 2007, 18, 2180-2190.
26. Bagal, D.; Zhang, H.; Schnier, P. D. Anal. Chem. 2008, 80, 2408-2418.
27. Williams, J. P.; Scrivens, J. H. Rapid Commun. Mass Spectrom. 2008, 22, 187-196.
28. Ruotolo, B. T.; Benesch, J. L. P.; Sandercock, A. M.; Hyung, S. J.; Robinson, C. V. Nat. Protoc. 2008, 3, 1139-1152.
29. Shvartsburg, A. A.; Smith, R. D. Anal. Chem. 2008, 80, 9689-9699.
30. Mesleh, M. F.; Hunter, J. M.; Shvartsburg, A. A.; Schatz, G. C.; Jarrold, M. F. J. Phys. Chem. 1996, 100, 16082-16086.
31. Giles, K.; Pringle, S. D.; Worthington, K. R.; Little, D.; Wildgoose, J. L.; Bateman, R. H. Rapid Commun. Mass Spectrom. 2004, 18, 2401-2414.
32. Pringle, S. D.; Giles, K.; Wildgoose, J. L.; Williams, J. P.; Slade, S. E.; Thalassinos, K.; Bateman, R. H.; Bowers, M. T.; Scrivens, J. H. Int. J. Mass Spectrom. 2007, 261, 1-12.
33. MacKerell, A. D.; Bashford, D.; Bellott, M.; Dunbrack, R. L.; Evanseck, J. D.; Field, M. J.; Fischer, S.; Gao, J.; Guo, H.; Ha, S.; Joseph-McCarthy, D.; Kuchnir, L.; Kuczera, K.; Lau, F. T. K.; Mattos, C.; Michnick, S.; Ngo, T.; Nguyen, D. T.; Prodhom, B.; Reiher, W. E.; Roux, B.; Schlenkrich, M.; Smith, J. C.; Stote, R.; Straub, J.; Watanabe, M.; Wiorkiewicz-Kuczera, J.; Yin, D.; Karplus, M. J. Phys. Chem. B 1998, 102, 3586-3616.
34. Plimpton, S. J. Comput. Phys. 1995, 117, 1-19.
35. Feller, S. E.; Gawrisch, K.; MacKerell, A. D. J. Am. Chem. Soc. 2002, 124, 318-326.
36. Alberts, B.; Bray, D.; Hopkin, K.; Johnson, A.; Lewis, J.; Raff, M.; Roberts, K.; Walter, P. Essential Cell Biology, 2nd ed.; Garland Science: New York, 2004.
37. Kohtani, M.; Kinnear, B. S.; Jarrold, M. F. J. Am. Chem. Soc. 2000, 122, 12377-12378.
38. Wyttenbach, T.; Liu, D. F.; Bowers, M. T. J. Am. Chem. Soc. 2008, 130, 5993-6000.
39. Revercomb, H. E.; Mason, E. A. Anal. Chem. 1975, 47, 970-983.
40. Eiceman, G. A.; Karpas, Z. Ion Mobility Spectrometry; CRC Press: Boca Raton, FL, 1994.
41. Mason, E. A.; O'hara, H.; Smith, F. J. J. Phys. B: At. Mol. Opt. Phys. 1972, 5, 169-176.
42. Scarff, C. A.; Thalassinos, K.; Hilton, G. R.; Scrivens, J. H. Rapid Commun. Mass Spectrom. 2008, 22, 3297-3304.
43. Beegle, L. W.; Kanik, I.; Matz, L.; Hill, H. H. Int. J. Mass Spectrom. 2002, 216, 257-268.
44. Matz, L. M.; Hill, H. H.; Beegle, L. W.; Kanik, I. J. Am. Soc. Mass Spectrom. 2002, 13, 300-307.
45. Connolly, M. L. J. Am. Chem. Soc. 1985, 107, 1118-1124.
46. Sanner, M. F.; Olson, A. J.; Spehner, J. C. Biopolymers 1996, 38, 305-320.
47. Mason, E. A. In Plasma Chromatography; Carr, T. W., Ed.; Plenum Press: New York, 1984; pp 43-93.
48. Wannier, G. H. Bell Syst. Tech. J. 1953, 32, 170-254.