Rapid detection of Fusarium wilt in basil (Ocimum sp.) leaves by desorption electrospray ionization mass spectrometry (DESI MS) imaging

RSC Advances

Volumn 5, Issue 62, 2015, Pages 50512-50522

  Hemalatha, R G ^a   Naik, Hemanta R ^a   Mariappa, Vasundhara ^b   Pradeep, T ^a  

^a INDIAN INSTITUTE OF TECHNOLOGY MADRAS   (India)

^b UNIVERSITY OF AGRICULTURAL SCIENCES   (India)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

BIOMOLECULES; CULTIVATION; DESORPTION; DIAGNOSIS; FUNGI; MASS SPECTROMETRY; METABOLITES; PATHOGENS; SPATIAL DISTRIBUTION; THIN LAYER CHROMATOGRAPHY;

DESORPTION ELECTROSPRAY IONIZATION MASS SPECTROMETRIES; FUSARIUM OXYSPORUMS; METABOLITE PROFILES; NATURAL CONDITIONS; PATHOGEN INFECTION; SCREENING PROGRAMS; TOXIC METABOLITES; TRANSIENT CHANGES;

ELECTROSPRAY IONIZATION;

EID: 84935848268     PISSN: None     EISSN: 20462069     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/c4ra16706f     Document Type: Article

References (66)

1. A. K. Jarmusch R. G. Cooks Nat. Prod. Rep. 2014 31 730 738
2. C. Wu A. L. Dill L. S. Eberlin R. G. Cooks D. R. Ifa Mass Spectrom. Rev. 2013 32 218 243
3. D. R. Ifa A. Srimany L. S. Eberlin H. R. Naik V. Bhat R. G. Cooks T. Pradeep Anal. Methods 2011 3 1910 1912
4. B. Li N. Bjarnholt S. H. Hansen C. Janfelt J. Mass Spectrom. 2011 46 1241 1246
5. J. I. Zhang X. Li Z. Ouyang R. G. Cooks Analyst 2012 137 3091 3098
6. J. Watrous P. Roach B. Heath T. Alexandrov J. Laskin P. C. Dorrestein Anal. Chem. 2013 85 10385 10391
7. K. Chingin J. Liang H. Chen RSC Adv. 2014 4 5768 5781
8. L.-J. Ma H. C. Van der Does K. A. Borkovich J. J. Coleman M.-J. Daboussi A. Di Pietro M. Dufresne M. Freitag M. Grabherr B. Henrissat P. M. Houterman S. Kang W.-B. Shim C. Woloshuk X. Xie J.-R. Xu J. Antoniw S. E. Baker B. H. Bluhm A. Breakspear D. W. Brown R. A. E. Butchko S. Chapman R. Coulson P. M. Coutinho E. G. J. Danchin A. Diener L. R. Gale D. M. Gardiner S. Goff K. E. Hammond-Kosack K. Hilburn A. Hua-Van W. Jonkers K. Kazan C. D. Kodira M. Koehrsen L. Kumar Y.-H. Lee L. Li J. M. Manners D. Miranda-Saavedra M. Mukherjee G. Park J. Park S.-Y. Park R. H. Proctor A. Regev M. C. Ruiz-Roldan D. Sain S. Sakthikumar S. Sykes D. C. Schwartz B. G. Turgeon I. Wapinski O. Yoder S. Young Q. Zeng S. Zhou J. Galagan C. A. Cuomo H. C. Kistler M. Rep Nature 2010 464 367 373
9. R. Hiltunen and Y. Holm, Basil: The Genus Ocimum, Taylor & Francis, 2003
10. R. S. Verma R. C. Padalia A. Chauhan S. T. Thul Ind. Crops Prod. 2013 45 7 19
11. R. M. Davis K. D. Marshall J. Valencia Plant Dis. 1993 77 537 537
12. L. E. Datnoff L. Z. Liang R. L. Wick Plant Dis. 1997 81 1214 1214
13. L. Swart J. M. Van Niekerk Australas. Plant Pathol. 2003 32 125 126
14. A. P. Keinath Plant Dis. 1994 78 1211 1215
15. A. M. Al-Hatmi A. Bonifaz G. de Hoog L. Vazquez-Maya K. Garcia-Carmona J. F. Meis A. D. Van Diepeningen BMC Infect. Dis. 2014 14 588
16. J. Evans D. Levesque A. de Lahunta H. E. Jensen Vet. Pathol. 2004 41 510 514
17. A. Chiocchetti S. Ghignone A. Minuto M. L. Gullino A. Garibaldi Q. Migheli Plant Dis. 1999 83 576 581
18. A. Chiocchetti L. Sciaudone F. Durando A. Garibaldi Q. Migheli Plant Dis. 2001 85 607 611
19. M. Pasquali P. Piatti M. L. Gullino A. Garibaldi J. Phytopathol. 2006 154 632 636
20. A. Reis L. S. Boiteux R. F. Vieira J. Gen. Plant Pathol. 2008 74 375 381
21. D. Chaimovitsh N. Dudai E. Putievsky A. Ashri Plant Dis. 2006 90 58 60
22. F. Garcia-Bastidas N. Ordonz J. Konkol M. Al-Qasim Z. Naser M. Abdelwali N. Salem C. Waalwijk R. C. Ploetz G. H. J. Kema Plant Dis. 2014 98 694
23. A. Gamliel T. Katan H. Yunis J. Katan Phytopathology 1996 86 56 62
24. S. Veillet V. Tomao F. Chemat Food Chem. 2010 123 905 911
25. R. G. Hemalatha T. Pradeep J. Agric. Food Chem. 2013 61 7477 7487
26. T. Pluskal S. Castillo A. Villar-Briones M. Oresic BMC Bioinf. 2010 11 395
27. P. R. N. Vieira S. M. de Morais F. H. Q. Bezerra P. A. Travassos Ferreira I. R. Oliveira M. G. V. Silva Ind. Crops Prod. 2014 55 267 271
28. X. Zhang H. Zhang J. Pu Y. Qi Q. Yu Y. Xie J. Peng PLoS One 2014 8 e82841
29. K. Carovic-Stanko A. Salinovic M. Grdisa Z. Liber I. Kolak Z. Satovic Plant Biosyst. 2011 145 298 305
30. M. Aghaei R. Darvishzadeh A. Hassani Rev. Cienc. Agron. 2012 43 312 320
31. S. Rastogi S. Meena A. Bhattacharya S. Ghosh R. K. Shukla N. S. Sangwan R. K. Lal M. M. Gupta U. C. Lavania V. Gupta D. A. Nagegowda A. K. Shasany BMC Genomics 2014 15 588
32. A. K. Badu-Tawiah L. S. Eberlin Z. Ouyang R. G. Cooks Annu. Rev. Phys. Chem. 2013 64 481 505
33. Z. Wang P. Chen L. Yu P. D. B. Harrington Anal. Chem. 2013 85 2945 2953
34. C. Jayasinghe N. Gotoh T. Aoki S. Wada J. Agric. Food Chem. 2003 51 4442 4449
35. A. I. Hussain F. Anwar S. T. Hussain Sherazi R. Przybylski Food Chem. 2008 108 986 995
36. S. Ekren C. Sonmez E. Ozcakal Y. S. K. Kurttas E. Bayram H. Gurgulu Agr. Water Manag. 2012 109 155 161
37. D. Sarkar A. Srimany T. Pradeep Analyst 2012 137 4559 4563
38. A. Ghasemi Pirbalouti E. Mahdad L. Craker Food Chem. 2013 141 2440 2449
39. R. Fischer N. Nitzan D. Chaimovitsh B. Rubin N. Dudai J. Agric. Food Chem. 2011 59 4913 4922
40. S. S. Chavan S. K. Prashanthi Indian Phytopathol. 2011 64 258 260
41. A. Bolwerk A. L. Lagopodi B. J. Lugtenberg G. V. Bloemberg Mol. Plant-Microbe Interact. 2005 18 710 721
42. K. J. Czymmek M. Fogg D. H. Powell J. Sweigard S.-Y. Park S. Kang Fungal Genet. Biol. 2007 44 1011 1023
43. Y. Iijima R. Davidovich-Rikanati E. Fridman D. R. Gang E. Bar E. Lewinsohn E. Pichersky Plant Physiol. 2004 136 3724 3736
44. F. Deguerry L. Pastore S. Wu A. Clark J. Chappell M. Schalk Arch. Biochem. Biophys. 2006 454 123 136
45. C. Deschamps and J. E. Simon, in Plant Secondary Metabolism Engineering, Springer, 2010, pp. 263-273
46. X. Dong N. Ling M. Wang Q. Shen S. Guo Plant Physiol. Biochem. 2012 60 171 179
47. X. Dong Y. Xiong N. Ling Q. Shen S. Guo World J. Microbiol. Biotechnol. 2014 30 1399 1408
48. K. Kostyn M. Czemplik A. Kulma M. Bortniczuk J. Skala J. Szopa Plant Sci. 2012 190 103 115
49. I. Morkunas M. Stobiecki L. Marczak J. Stachowiak D. Narozna D. Remlein-Starosta Physiol. Mol. Plant Pathol. 2010 75 46 55
50. A. H. Aly R. Edrada-Ebel I. D. Indriani V. Wray W. E. G. Muller F. Totzke U. Zirrgiebel C. Schachtele M. H. G. Kubbutat W. H. Lin J. Nat. Prod. 2008 71 972 980
51. G. Gilardi M. L. Gullino A. Garibaldi J. Plant Pathol. 2013 95 41 47
52. A. Poloni J. Schirawski Molecules 2014 19 9114 9133
53. M. Marchetti-Deschmann W. Winkler H. Dong H. Lohninger C. P. Kubicek G. Allmaier Food Technol. Biotechnol. 2012 50 334 342
54. P. M. Scott W. Zhao S. Feng B. P. Y. Lau Mycotoxin Res. 2012 28 261 266
55. W. Wojtasik A. Kulma K. Kostyn J. Szopa Plant Physiol. Biochem. 2011 49 862 872
56. A. Boba A. Kulma K. Kostyn M. Starzycki E. Starzycka J. Szopa Physiol. Mol. Plant Pathol. 2012 76 39 47
57. Z. Wang C. Jia J. Li S. Huang B. Xu Z. Jin Funct. Integr. Genomics 2014 1 16
58. H. D. Ardila A. M. Torres S. T. Martinez B. L. Higuera Physiol. Mol. Plant Pathol. 2014 85 42 52
59. T. Kashiwa K. Inami M. Fujinaga H. Ogiso T. Yoshida T. Teraoka T. Arie J. Gen. Plant Pathol. 2013 79 412 421
60. J. F. Leslie and B. A. Summerell, The Fusarium Laboratory Manual, Wiley Online Library, 2007
61. G. K. Kumaraswamy A. C. Kushalappa T. M. Choo Y. Dion S. Rioux Plant Pathol. 2012 61 509 521
62. C. Li C. Zuo G. Deng R. Kuang Q. Yang C. Hu O. Sheng S. Zhang L. Ma Y. Wei PLoS One 2013 8 e70226
63. T. El-Elimat M. Figueroa B. M. Ehrmann N. B. Cech C. J. Pearce N. H. Oberlies J. Nat. Prod. 2013 76 1709 1716
64. D. W. Brown R. A. E. Butchko M. Busman R. H. Proctor Fungal Genet. Biol. 2012 49 521 532
65. D. W. Brown R. A. Butchko S. E. Baker R. H. Proctor Fungal Biol. 2012 116 318 331
66. K. S. Kerian A. K. Jarmusch V. Pirro M. O. Koch T. A. Masterson L. Cheng R. G. Cooks Analyst 2014 140 1090 1098