Direct analysis of in vitro grown microorganisms and mammalian cells by ambient mass spectrometry

RSC Advances

Volumn 4, Issue 11, 2014, Pages 5768-5781

  Chingin, Konstantin ^a   Liang, Juchao ^a   Chen, Huanwen ^a  

^a EAST CHINA UNIVERSITY OF TECHNOLOGY   (China)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

AMBIENT MASS SPECTROMETRIES; ELECTRON-IMPACT IONIZATION; ELECTROSPRAY IONIZATION (ESI); EXPERIMENTAL EVIDENCE; IONIZATION TECHNIQUES; MASS SPECTROMETRIC ANALYSIS; MATRIX ASSISTED LASER DESORPTION/IONIZATION; PATHOGENIC BACTERIUM;

CELL CULTURE; CELLS; DIAGNOSIS; ELECTROSPRAY IONIZATION; IMPACT IONIZATION; MASS SPECTROMETRY; MICROORGANISMS;

CHEMICAL ANALYSIS;

EID: 84892171406     PISSN: None     EISSN: 20462069     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/c3ra46327c     Document Type: Review

References (143)

1. E. De Clercq Curr. Opin. Microbiol. 2005 8 552 560
2. B. Stansley J. Post K. Hensley J. Neuroinflammation 2012 9 1742 2094
3. M. T. Donato A. Lahoz J. V. Castell M. J. Gomez-Lechon Curr. Drug Metab. 2008 9 1 11
4. R. M. Nardone BioTechniques 2008 45 221
5. D. W. Bates L. Goldman T. H. Lee JAMA, J. Am. Med. Assoc. 1991 265 365 369
6. I. Giaever C. R. Keese Nature 1993 366 591 592
7. A. Bartolazzi M. Santonico G. Pennazza E. Martinelli R. Paolesse A. D'Amico C. Di Natale Sens. Actuators, B 2010 146 483 488
8. K. B. Gendron N. G. Hockstein E. R. Thaler A. Vachani C. W. Hanson Otolaryngol.-Head Neck Surg. 2007 137 269 273
9. O. Canhoto N. Magan Sens. Actuators, B 2005 106 3 6
10. J. R. Carey K. S. Susick K. I. Hulkower J. A. Imlay K. R. C. Imlay C. K. Ingison J. B. Ponder A. Sen A. E. Wittrig J. Am. Chem. Soc. 2011 133 7571 7576
11. K. Kreij C. F. Mandenius J. J. Clemente A. E. Cunha S. M. S. Monteiro M. J. T. Carrondo F. Hesse M. Molinas R. Wagner O. W. Merten C. Geny-Katinger P. Martensson T. Bachinger J. Mitrovics Cytotechnology 2005 48 41 58
12. C. Mowry, C. Morgan, Q. Baca, R. Manginell, R. Kottenstette, P. Lewis and G. Frye-Mason, in Chemical and Biological Early Warning Monitoring for Water, Food and Ground, ed., J. L. Jensen, and, L. W. Burggraf, 2002, vol. 4575, pp. 83-90
13. J. Wegener C. R. Keese I. Giaever Exp. Cell Res. 2000 259 158 166
14. P. Picotti R. Aebersold Nat. Methods 2012 9 555 566
15. W. Zhang F. Li L. Nie Microbiology-SGM 2010 156 287 301
16. F. Schmidt U. Voelker Proteomics 2011 11 3203 3211
17. W. Zhou L. A. Liotta E. F. Petricoin Cancer Genomics Proteomics 2012 9 373 381
18. E. Y. Xu W. H. Schaefer Q. Xu Curr. Opin. Drug Discovery Dev. 2009 12 40 52
19. N. Vinayavekhin E. A. Homan A. Saghatelian ACS Chem. Biol. 2010 5 91 103
20. L. Krásný R. Hynek I. Hochel Int. J. Mass Spectrom. 2013 353 67 79
21. P. A. C. Braga A. Tata V. Goncalves dos Santos J. R. Barreiro N. V. Schwab M. Veiga dos Santos M. N. Eberlin C. R. Ferreira RSC Adv. 2013 3 994 1008
22. Y. P. Ho P. M. Reddy Mass Spectrom. Rev. 2011 30 1203 1224
23. T. R. Sandrin J. E. Goldstein S. Schumaker Mass Spectrom. Rev. 2013 32 188 217
24. V. Havlicek K. Lemr K. A. Schug Anal. Chem. 2013 85 790 797
25. P. R. Murray J. Mol. Diagn. 2012 14 419 423
26. R. G. Cooks Z. Ouyang Z. Takats J. M. Wiseman Science 2006 311 1566 1570
27. M.-Z. Huang C.-H. Yuan S.-C. Cheng Y.-T. Cho J. Shiea Annu. Rev. Anal. Chem. 2010 3 43 65
28. R. M. Alberici R. C. Simas G. B. Sanvido W. Romao P. M. Lalli M. Benassi I. B. S. Cunha M. N. Eberlin Anal. Bioanal. Chem. 2010 398 265 294
29. G. A. Harris A. S. Galhena F. M. Fernandez Anal. Chem. 2011 83 4508 4538
30. M. Z. Huang S. C. Cheng Y. T. Cho J. Shiea Anal. Chim. Acta 2011 702 1 15
31. M. E. Monge G. A. Harris P. Dwivedi F. M. Fernandez Chem. Rev. 2013 113 2269 2308
32. M. Careri A. Mangia Anal. Bioanal. Chem. 2011 399 2585 2595
33. H. W. Gu N. Xu H. W. Chen Anal. Bioanal. Chem. 2012 403 2145 2153
34. R. V. Bennet C. M. Gamage F. M. Fernandez J. Visualized Exp. 2013 e50575
35. C. Wu A. L. Dill L. S. Eberlin R. G. Cooks D. R. Ifa Mass Spectrom. Rev. 2013 32 218 243
36. P. Nemes A. A. Barton A. Vertes Anal. Chem. 2009 81 6668 6675
37. H. W. Chen A. Wortmann R. Zenobi J. Mass Spectrom. 2007 42 1123 1135
38. Y. Song N. Talaty K. Datsenko B. L. Wanner R. G. Cooks Analyst 2009 134 838 841
39. P. Nemes A. Vertes J. Visualized Exp. 2010 e2097
40. Z. Yu L. C. Chen H. Suzuki O. Ariyada R. Erra-Balsells H. Nonami K. Hiraoka J. Am. Soc. Mass Spectrom. 2009 20 2304 2311
41. B. Hu L. Wang W. C. Ye Z. P. Yao Sci. Rep. 2013 3 2104
42. P. Nemes A. Vertes Anal. Chem. 2007 79 8098 8106
43. J. Y. Yew R. B. Cody E. A. Kravitz Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2008 105 7135 7140
44. K. Yoshimura L. C. Chen Z. Yu K. Hiraoka S. Takeda Anal. Biochem. 2011 417 195 201
45. H. W. Chen A. Wortmann W. H. Zhang R. Zenobi Angew. Chem., Int. Ed. 2007 46 580 583
46. P. Martinez-Lozano J. F. de la Mora J. Am. Soc. Mass Spectrom. 2009 20 1060 1063
47. J. D. Harper N. A. Charipar C. C. Mulligan X. Zhang R. G. Cooks Z. Ouyang Anal. Chem. 2008 80 9097 9104
48. L. S. Eberlin I. Norton D. Orringer I. F. Dunn X. Liu J. L. Ide A. K. Jarmusch K. L. Ligon F. A. Jolesz A. J. Golby S. Santagata N. Y. R. Agar R. G. Cooks Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2013 110 1611 1616
49. J. Balog L. Sasi-Szabó J. Kinross M. R. Lewis L. J. Muirhead K. Veselkov R. Mirnezami B. Dezso L. Damjanovich A. Darzi J. K. Nicholson Z. Takáts Sci. Transl. Med. 2013 5 194ra193
50. J. Balog T. Szaniszlo K. C. Schaefer J. Denes A. Lopata L. Godorhazy D. Szalay L. Balogh L. Sasi-Szabo M. Toth Z. Takats Anal. Chem. 2010 82 7343 7350
51. P. Nemes A. Vertes TrAC-Trends Anal. Chem. 2012 34 22 34
52. P.-K. So B. Hu Z.-P. Yao Mol. BioSyst. 2013 9 915 929
53. S. Schulz J. S. Dickschat Nat. Prod. Rep. 2007 24 814 842
54. D. Pickel G. P. Manucy D. B. Walker S. B. Hall J. C. Walker Appl. Anim. Behav. Sci. 2004 89 107 116
55. M. Shirasu K. Touhara J. Biochem. 2011 150 257 266
56. R. P. M. Wong G. R. Flematti T. M. E. Davis Malar. J. 2012 11 314
57. X. Chen F. J. Xu Y. Wang Y. F. Pan D. J. Lu P. Wang K. J. Ying E. G. Chen W. M. Zhang Cancer 2007 110 835 844
58. A. Sponring W. Filipiak T. Mikoviny C. Ager J. Schubert W. Miekisch A. Amann J. Troppmair Anticancer Res. 2009 29 419 426
59. A. Sponring W. Filipiak C. Ager J. Schubert W. Miekisch A. Amann J. Troppmair Cancer Biomarkers 2010 7 153 161
60. J. Kuzma M. Nemecekmarshall W. H. Pollock R. Fall Curr. Microbiol. 1995 30 97 103
61. M. Bunge N. Araghipour T. Mikoviny J. Dunkl R. Schnitzhofer A. Hansel F. Schinner A. Wisthaler R. Margesin T. D. Mark Appl. Environ. Microbiol. 2008 74 2179 2186
62. C. Scholler S. Molin K. Wilkins Chemosphere 1997 35 1487 1495
63. J. J. Zhu H. D. Bean Y. M. Kuo J. E. Hill J. Clin. Microbiol. 2010 48 4426 4431
64. M. E. Dolch C. Hornuss C. Klocke S. Praun J. Villinger W. Denzer G. Schelling S. Schubert Eur. J. Clin. Microbiol. Infect. Dis. 2012 31 3007 3013
65. T. W. E. Chippendale B. Hu A. J. El Haj D. Smith Analyst 2012 137 4677 4685
66. M. O'Hara C. A. Mayhew J. Breath Res. 2009 3 027001
67. M. E. Dolch C. Hornuss C. Klocke S. Praun J. Villinger W. Denzer G. Schelling S. Schubert J. Appl. Microbiol. 2012 113 1097 1105
68. R. A. Allardyce V. S. Langford A. L. Hill D. R. Murdoch J. Microbiol. Methods 2006 65 361 365
69. W. Carroll W. Lenney T. S. Wang P. Spanel A. Alcock D. Smith Pediatr. Pulmonol. 2005 39 452 456
70. V. Shestivska A. Nemec P. Drevinek K. Sovova K. Dryahina P. Spanel Rapid Commun. Mass Spectrom. 2011 25 2459 2467
71. A. D. Wilson M. Baietto Sensors 2011 11 1105 1176
72. J. E. Graham, in Advances in Applied Microbiology, ed., S. Sariaslani, and, G. M. Gadd, 2013, vol. 82, pp. 29-52
73. D. Kirkland S. Pfuhler D. Tweats M. Aardema R. Corvi F. Darroudi A. Elhajouji H. Glatt P. Hastwell M. Hayashi P. Kasper S. Kirchner A. Lynch D. Marzin D. Maurici J. R. Meunier L. Muller G. Nohynek J. Parry E. Parry V. Thybaud R. Tice J. van Benthem P. Vanparys P. White Mutat. Res., Genet. Toxicol. Environ. Mutagen. 2007 628 31 55
74. D. I. Ellis W. B. Dunn J. L. Griffin J. W. Allwood R. Goodacre Pharmacogenomics 2007 8 1243 1266
75. E. Crespo S. M. Cristescu H. de Ronde S. Kuijper A. H. J. Kolk R. M. Anthony F. J. M. Harren J. Microbiol. Methods 2011 86 8 15
76. S. Kameyama H. Tanimoto S. Inomata K. Suzuki D. D. Komatsu A. Hirota U. Konno U. Tsunogai Geochem. J. 2011 45 355 363
77. K. Sovova J. Cepl A. Markos P. Spanel Analyst 2013 138 4795 4801
78. C. Brunner W. Szymczak W. Li C. Hoeschen S. Mortl F. Eckardt-Schupp U. Oeh Radiat. Environ. Biophys. 2011 50 209 217
79. M. Syhre S. T. Chambers Tuberculosis 2008 88 317 323
80. M. Syhre L. Manning S. Phuanukoonnon P. Harino S. T. Chambers Tuberculosis 2009 89 263 266
81. A. J. Scott-Thomas M. Syhre P. K. Pattemore M. Epton R. Laing J. Pearson S. T. Chambers BMC Pulm. Med. 2010 10 56
82. J. J. Zhu H. D. Bean M. J. Wargo L. W. Leclair J. E. Hill J. Breath Res. 2013 7 016003
83. N. A. Rakow K. S. Suslick Nature 2000 406 710 713
84. R. Fend A. H. J. Kolk C. Bessant P. Buijtels P. R. Klatser A. C. Woodman J. Clin. Microbiol. 2006 44 2039 2045
85. M. Bruins A. Bos P. L. C. Petit K. Eadie A. Rog R. Bos G. H. van Ramshorst A. van Belkum Eur. J. Clin. Microbiol. Infect. Dis. 2009 28 775 780
86. J. N. Labows K. J. McGinley G. F. Webster J. J. Leyden J. Clin. Microbiol. 1980 12 521 526
87. J. Julak E. Stranska E. Prochazkova-Francisci V. Rosova Med. Sci. Monit. 2000 6 605 610
88. D. Smith P. Spanel Analyst 2011 136 2009 2032
89. D. Smith P. Spanel Mass Spectrom. Rev. 2005 24 661 700
90. P. Spanel D. Smith Mass Spectrom. Rev. 2011 30 236 267
91. R. S. Blake P. S. Monks A. M. Ellis Chem. Rev. 2009 109 861 896
92. J. de Gouw C. Warneke Mass Spectrom. Rev. 2007 26 223 257
93. M. Luchner R. Gutmann K. Bayer J. Dunkl A. Hansel J. Herbig W. Singer F. Strobl K. Winkler G. Striedner Biotechnol. Bioeng. 2012 109 3059 3069
94. D. Smith P. Španěl TrAC, Trends Anal. Chem. 2011 30 945 959
95. D. Bassi P. Tosi R. Schlogl J. Vac. Sci. Technol., A 1998 16 114 122
96. C. Hornuss S. Praun J. Villinger A. Dornauer P. Moehnle M. Dolch E. Weninger A. Chouker C. Feil J. Briegel M. Thiel G. Schelling Anesthesiology 2007 106 665 674
97. C. Wu W. F. Siems H. H. Hill Anal. Chem. 2000 72 396 403
98. T. S. Wang D. Smith P. Spanel Int. J. Mass Spectrom. 2004 233 245 251
99. T. W. E. Chippendale P. Spanel D. Smith Rapid Commun. Mass Spectrom. 2011 25 2163 2172
100. R. M. Thorn D. M. Reynolds J. Greenman J. Microbiol. Methods 2011 84 258 264
101. F. J. Gilchrist A. Alcock J. Belcher M. Brady A. Jones D. Smith P. Spanel K. Webb W. Lenney Eur. Respir. J. 2011 38 409 414
102. B. Enderby D. Smith W. Carroll W. Lenney Pediatr. Pulmonol. 2009 44 142 147
103. F. J. Gilchrist C. Razavi A. K. Webb A. M. Jones P. Spanel D. Smith W. Lenney J. Breath Res. 2012 6 036004
104. F. J. Gilchrist R. J. Bright-Thomas A. M. Jones D. Smith P. Spanel A. K. Webb W. Lenney J. Breath Res. 2013 7 026010
105. D. Smith P. Španěl F. J. Gilchrist W. Lenney J. Breath Res. 2013 7 044001
106. V. Shestivska P. Spanel K. Dryahina K. Sovova D. Smith M. Musilek A. Nemec J. Appl. Microbiol. 2012 113 701 713
107. L. Bennett L. Ciaffoni W. Denzer G. Hancock A. D. Lunn R. Peverall S. Praun G. A. Ritchie J. Breath Res. 2009 3 1752 7155
108. M. E. Dolch L. Frey C. Hornuss M. Schmoelz S. Praun J. Villinger G. Schelling J. Breath Res. 2008 2 1752 7155
109. J. J. Zhu J. E. Hill Food Microbiol. 2013 34 412 417
110. D. Smith T. Wang J. Sule-Suso P. Spanel A. El Haj Rapid Commun. Mass Spectrom. 2003 17 845 850
111. J. Sule-Suso A. Pysanenko P. Spanel D. Smith Analyst 2009 134 2419 2425
112. A. V. Rutter T. W. E. Chippendale Y. Yang P. Spanel D. Smith J. Sule-Suso Analyst 2013 138 91 95
113. C. Brunner W. Szymczak V. Hollriegl S. Mortl H. Oelmez A. Bergner R. M. Huber C. Hoeschen U. Oeh Anal. Bioanal. Chem. 2010 397 2315 2324
114. A. U. Jackson N. Talaty R. G. Cooks G. J. Van Berkel J. Am. Soc. Mass Spectrom. 2007 18 2218 2225
115. I. Lanekoff O. Geydebrekht G. E. Pinchuk A. E. Konopka J. Laskin Analyst 2013 138 1971 1978
116. N. Strittmatter E. A. Jones K. A. Veselkov M. Rebec J. G. Bundy Z. Takats Chem. Commun. 2013 49 6188 6190
117. J. I. Zhang A. B. Costa W. A. Tao R. G. Cooks Analyst 2011 136 3091 3097
118. J. I. Zhang N. Talaty A. B. Costa Y. Xia W. A. Tao R. Bell J. H. Callahan R. G. Cooks Int. J. Mass Spectrom. 2011 301 37 44
119. M. A. Meetani Y.-S. Shin S. Zhang R. Mayer F. Basile J. Mass Spectrom. 2007 42 1186 1193
120. B. Shrestha P. Sripadi C. M. Walsh T. T. Razunguzwa M. J. Powell K. Kehn-Hall F. Kashanchi A. Vertes Chem. Commun. 2012 48 3700 3702
121. K. R. Watts S. T. Loveridge K. Tenney J. Media F. A. Valeriote P. Crews J. Org. Chem. 2011 76 6201 6208
122. G. Parsiegla B. Shrestha F. Carriere A. Vertes Anal. Chem. 2012 84 34 38
123. Z. Takats J. M. Wiseman B. Gologan R. G. Cooks Science 2004 306 471 473
124. D. I. Campbell C. R. Ferreira L. S. Eberlin R. G. Cooks Anal. Bioanal. Chem. 2012 404 389 398
125. R. B. Cody J. A. Laramee H. D. Durst Anal. Chem. 2005 77 2297 2302
126. J. A. Stolee B. Shrestha G. Mengistu A. Vertes Angew. Chem., Int. Ed. 2012 51 10386 10389
127. B. Shrestha J. M. Patt A. Vertes Anal. Chem. 2011 83 2947 2955
128. J. A. Stolee A. Vertes Anal. Chem. 2013 85 3592 3598
129. Z. Takats J. M. Wiseman R. G. Cooks J. Mass Spectrom. 2005 40 1261 1275
130. Y. Song N. Talaty W. A. Tao Z. Pan R. G. Cooks Chem. Commun. 2007 61 63
131. P. J. Roach J. Laskin A. Laskin Analyst 2010 135 2233 2236
132. C. Y. Pierce J. R. Barr R. B. Cody R. F. Massung A. R. Woolfitt H. Moura H. A. Thompson F. M. Fernandez Chem. Commun. 2007 807 809
133. P. Sripadi B. Shrestha R. L. Easley L. Carpio K. Kehn-Hall S. Chevalier R. Mahieux F. Kashanchi A. Vertes PLoS One 2010 5 e12590
134. R. Trouillon M. K. Passarelli J. Wang M. E. Kurczy A. G. Ewing Anal. Chem. 2012 85 522 542
135. N. M. Griffin J. E. Schnitzer Mol. Cell. Proteomics 2011 10 14
136. A. SvatoŠ Anal. Chem. 2011 83 5037 5044
137. N. Tsuyama H. Mizuno T. Masujima Biol. Pharm. Bull. 2012 35 1425 1431
138. C. R. Ferreira V. Pirro L. S. Eberlin J. E. Hallett R. G. Cooks Anal. Bioanal. Chem. 2012 404 2915 2926
139. A. F. González-Serrano V. Pirro C. R. Ferreira P. Oliveri L. S. Eberlin J. Heinzmann A. Lucas-Hahn H. Niemann R. G. Cooks PLoS One 2013 8 e74981
140. S. Date H. Mizuno N. Tsuyama T. Harada T. Masujima Anal. Sci. 2012 28 201 203
141. M. Lorenzo Tejedor H. Mizuno N. Tsuyama T. Harada T. Masujima Anal. Chem. 2012 84 5221 5228
142. T. Masujima Anal. Sci. 2009 25 953 960
143. Y. Gholipour R. Erra-Balsells K. Hiraoka H. Nonami Anal. Biochem. 2013 433 70 78