Optical control of CRISPR/Cas9 gene editing

Journal of the American Chemical Society

Volumn 137, Issue 17, 2015, Pages 5642-5645

  Hemphill, James ^a   Borchardt, Erin K ^b   Brown, Kalyn ^a   Asokan, Aravind ^b   Deiters, Alexander ^a  

^a UNIVERSITY OF PITTSBURGH   (United States)

^b UNIVERSITY OF NORTH CAROLINA SCHOOL OF MEDICINE   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

AMINO ACIDS; GENES;

BIOMEDICAL RESEARCH; ENDOGENOUS GENES; GENOME ENGINEERING; LYSINE RESIDUES; OPTICAL ACTIVATION; OPTICAL CONTROL; SITE-SPECIFIC;

GENE THERAPY;

CAS9 PROTEIN; LYSINE; PROTEIN; UNCLASSIFIED DRUG;

ARTICLE; CLUSTERED REGULARLY INTERSPACED SHORT PALINDROMIC REPEAT; CONTROLLED STUDY; GENE FUNCTION; GENE SILENCING; HUMAN; HUMAN CELL; LIGHT; PROTEIN ENGINEERING; CHEMICAL STRUCTURE; CHEMISTRY; CRISPR CAS SYSTEM; GENETIC ENGINEERING; GENETICS; HEK293 CELL LINE; MOLECULAR MODEL; RNA EDITING;

CLUSTERED REGULARLY INTERSPACED SHORT PALINDROMIC REPEATS; CRISPR-CAS SYSTEMS; GENETIC ENGINEERING; HEK293 CELLS; HUMANS; LYSINE; MODELS, MOLECULAR; MOLECULAR STRUCTURE; RNA EDITING;

EID: 84928966540     PISSN: 00027863     EISSN: 15205126     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ja512664v     Document Type: Article

References (39)

1. Wiedenheft, B.; Sternberg, S. H.; Doudna, J. A. Nature 2012, 482 (7385) 331-338
2. Garneau, J. E.; Dupuis, M.; Villion, M.; Romero, D. A.; Barrangou, R.; Boyaval, P.; Fremaux, C.; Horvath, P.; Magadán, A. H.; Moineau, S. Nature 2010, 468 (7320) 67-71
3. Deltcheva, E.; Chylinski, K.; Sharma, C. M.; Gonzales, K.; Chao, Y.; Pirzada, Z. A.; Eckert, M. R.; Vogel, J.; Charpentier, E. Nature 2011, 471 (7340) 602-607
4. Jinek, M.; Chylinski, K.; Fonfara, I.; Hauer, M.; Doudna, J. A.; Charpentier, E. Science 2012, 337 (6096) 816-821
5. Hsu, P. D.; Scott, D. A.; Weinstein, J. A.; Ran, F. A.; Konermann, S.; Agarwala, V.; Li, Y.; Fine, E. J.; Wu, X.; Shalem, O.; Cradick, T. J.; Marraffini, L. A.; Bao, G.; Zhang, F. Nat. Biotechnol. 2013, 31 (9) 827-832
6. Ran, F. A.; Hsu, P. D.; Lin, C. Y.; Gootenberg, J. S.; Konermann, S.; Trevino, A. E.; Scott, D. A.; Inoue, A.; Matoba, S.; Zhang, Y.; Zhang, F. Cell 2013, 154 (6) 1380-1389
7. Mali, P.; Yang, L.; Esvelt, K. M.; Aach, J.; Guell, M.; DiCarlo, J. E.; Norville, J. E.; Church, G. M. Science 2013, 339 (6121) 823-826
8. Gratz, S. J.; Cummings, A. M.; Nguyen, J. N.; Hamm, D. C.; Donohue, L. K.; Harrison, M. M.; Wildonger, J.; OConnor-Giles, K. M. Genetics 2013, 194 (4) 1029-1035
9. Wang, H.; Yang, H.; Shivalila, C. S.; Dawlaty, M. M.; Cheng, A. W.; Zhang, F.; Jaenisch, R. Cell 2013, 153 (4) 910-918
10. Strauß, A.; Lahaye, T. Mol. Plant 2013, 6 (5) 1384-1387
11. Niu, J.; Zhang, B.; Chen, H. Mol. Biotechnol 2014, 56 (8) 681-688
12. Gilbert, L. A.; Larson, M. H.; Morsut, L.; Liu, Z.; Brar, G. A.; Torres, S. E.; Stern-Ginossar, N.; Brandman, O.; Whitehead, E. H.; Doudna, J. A.; Lim, W. A.; Weissman, J. S.; Qi, L. S. Cell 2013, 154 (2) 442-451
13. Lee, H. M.; Larson, D. R.; Lawrence, D. S. ACS Chem. Biol. 2009, 4 (6) 409-427
14. Riggsbee, C. W.; Deiters, A. Trends Biotechnol. 2010, 28 (9) 468-475
15. Baker, A. S.; Deiters, A. ACS Chem. Biol. 2014, 9 (7) 1398-1407
16. Gautier, A.; Gauron, C.; Volovitch, M.; Bensimon, D.; Jullien, L.; Vriz, S. Nat. Chem. Biol. 2014, 10 (7) 533-541
17. Edwards, W. F.; Young, D. D.; Deiters, A. ACS Chem. Biol. 2009, 4 (6) 441-445
18. Groff, D.; Chen, P. R.; Peters, F. B.; Schultz, P. G. ChemBioChem 2010, 11 (8) 1066-1068
19. Gautier, A.; Deiters, A.; Chin, J. W. J. Am. Chem. Soc. 2011, 133 (7) 2124-2127
20. Chou, C.; Deiters, A. Angew. Chem., Int. Ed. 2011, 50 (30) 6839-6842
21. Arbely, E.; Torres-Kolbus, J.; Deiters, A.; Chin, J. W. J. Am. Chem. Soc. 2012, 134 (29) 11912-11915
22. Hemphill, J.; Chou, C.; Chin, J. W.; Deiters, A. J. Am. Chem. Soc. 2013, 135 (36) 13433-13439
23. Kang, J. Y.; Kawaguchi, D.; Coin, I.; Xiang, Z.; OLeary, D. D.; Slesinger, P. A.; Wang, L. Neuron 2013, 80 (2) 358-370
24. Uprety, R.; Luo, J.; Liu, J.; Naro, Y.; Samanta, S.; Deiters, A. ChemBioChem 2014, 15 (12) 1793-1799
25. Luo, J.; Uprety, R.; Naro, Y.; Chou, C.; Nguyen, D. P.; Chin, J. W.; Deiters, A. J. Am. Chem. Soc. 2014, 136 (44) 15551-15558
26. Ren, W.; Ji, A.; Ai, H. W. J. Am. Chem. Soc. 2015, 137 (6) 2155-2158
27. Gautier, A.; Nguyen, D. P.; Lusic, H.; An, W.; Deiters, A.; Chin, J. W. J. Am. Chem. Soc. 2010, 132 (12) 4086-4088
28. Nishimasu, H.; Ran, F. A.; Hsu, P. D.; Konermann, S.; Shehata, S. I.; Dohmae, N.; Ishitani, R.; Zhang, F.; Nureki, O. Cell 2014, 156 (5) 935-949
29. Jinek, M.; Jiang, F.; Taylor, D. W.; Sternberg, S. H.; Kaya, E.; Ma, E.; Anders, C.; Hauer, M.; Zhou, K.; Lin, S.; Kaplan, M.; Iavarone, A. T.; Charpentier, E.; Nogales, E.; Doudna, J. A. Science 2014, 343 (6176 1247997
30. De Gasperi, R.; Rocher, A. B.; Sosa, M. A.; Wearne, S. L.; Perez, G. M.; Friedrich, V. L.; Hof, P. R.; Elder, G. A. Genesis 2008, 46 (6) 308-317
31. Verkhusha, V. V.; Kuznetsova, I. M.; Stepanenko, O. V.; Zaraisky, A. G.; Shavlovsky, M. M.; Turoverov, K. K.; Uversky, V. N. Biochemistry 2003, 42 (26) 7879-7884
32. Parenti, R.; Salvatorelli, L.; Magro, G. Int. J. Endocrinol. 2014, 2014 685396
33. Nihongaki, Y.; Yamamoto, S.; Kawano, F.; Suzuki, H.; Sato, M. Chem. Biol. 2015, 22 (2) 169-174
34. Polstein, L. R.; Gersbach, C. A. Nat. Chem. Biol. 2015, 11 (3) 198-200
35. Sander, J. D.; Joung, J. K. Nat. Biotechnol. 2014, 32 (4) 347-355
36. Greiss, S.; Chin, J. W. J. Am. Chem. Soc. 2011, 133 (36) 14196-14199
37. Bianco, A.; Townsley, F. M.; Greiss, S.; Lang, K.; Chin, J. W. Nat. Chem. Biol. 2012, 8 (9) 748-750
38. Fu, Y.; Foden, J. A.; Khayter, C.; Maeder, M. L.; Reyon, D.; Joung, J. K.; Sander, J. D. Nat. Biotechnol. 2013, 31 (9) 822-826
39. Lin, Y.; Cradick, T. J.; Brown, M. T.; Deshmukh, H.; Ranjan, P.; Sarode, N.; Wile, B. M.; Vertino, P. M.; Stewart, F. J.; Bao, G. Nucleic Acids Res. 2014, 42 (11) 7473-7485