Crystal structure, stability and Ago2 affinity of phosphorodithioate-modified RNAs

RSC Advances

Volumn 4, Issue 110, 2014, Pages 64901-64904

  Pallan, Pradeep S ^a   Yang, Xianbin ^b   Sierant, Malgorzata ^c   Abeydeera, N Dinuka ^b   Hassell, Tom ^d   Martinez, Carlos ^d   Janicka, Magdalena ^c   Nawrot, Barbara ^c   Egli, Martin ^a  

^a VANDERBILT UNIVERSITY SCHOOL OF MEDICINE   (United States)

^b AM Biotechnologies   (United States)

^c CENTRE OF MOLECULAR AND MACROMOLECULAR STUDIES   (Poland)

^d Sigma Life Science   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

HYDROPHOBICITY; NUCLEIC ACIDS; RNA;

DOMAIN COMPLEXES; HYDROPHOBIC EFFECT; IN-VITRO; SMALL INTERFERING RNA;

CRYSTAL STRUCTURE;

EID: 84927740468     PISSN: None     EISSN: 20462069     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/c4ra10986d     Document Type: Article

References (21)

1. M. E. Davis J. E. Zuckerman C. H. J. Choi D. Seligson A. Tolcher C. A. Alabi Y. Yen J. D. Heidel A. Ribas Nature 2010 464 1067 1070
2. C. Pecot G. Calin R. Coleman G. Lopez-Berestein A. Sood Nat. Rev. Cancer 2011 11 59 67
3. J. C. Burnett J. J. Rossi K. Tiemann Biotechnol. J. 2011 6 1130 1146
4. J. Tabernero G. I. Shapiro P. M. LoRusso A. Cervantes G. K. Schwartz G. J. Weiss L. Paz-Ares D. C. Cho J. R. Infante M. Alsina M. M. Gounder R. Falzone J. Harrop A. C. White I. Toudjarska D. Bumcrot R. E. Meyers G. Hinkle N. Svrzikapa R. M. Hutabarat V. A. Clausen J. Cehelsky S. V. Nochur C. Gamba-Vitalo A. K. Vaishnaw D. W. Sah J. A. Gollob H. A. Burris III Cancer Discovery 2013 3 406 417
5. S. Choung Y. Kim S. Kim H. Park Y. Choi Biochem. Biophys. Res. Commun. 2006 342 919 927
6. D. Bumcrot M. Manoharan V. Koteliansky D. W. Y. Sah Nat. Chem. Biol. 2006 2 711 719
7. S. Shukla C. S. Sumaria P. I. Pradeepkumar ChemMedChem 2009 5 328 349
8. M. Manoharan A. Akinc R. K. Pandey J. Qin P. Hadwiger M. John K. Mills K. Charisse M. A. Maier L. Nechev E. M. Greene P. S. Pallan E. Rozners K. G. Rajeev M. Egli Angew. Chem., Int. Ed. 2011 50 2284 2288
9. D. M. Kenski G. Butora A. T. Willingham A. J. Cooper W. Fu N. Qi F. Soriano I. W. Davies W. M. Flanagan Mol. Ther.-Nucleic Acids 2012 1 e5
10. X. Yang M. Sierant M. Janicka L. Peczek C. Martinez T. Hassell N. Li X. Li T. Wang B. Nawrot ACS Chem. Biol. 2012 7 1214 1220
11. A. V. Lebedev E. Wickstrom Perspect. Drug Discovery Des. 1996 4 17 40
12. W. S. Marshall M. H. Caruthers Science 1993 259 1564 1570
13. A. Detzer M. Overhoff A. Mescalchin M. Rompf G. Sczakiel Curr. Pharm. Des. 2008 14 3666 3673
14. D. A. Braasch Z. Paroo A. Constantinescu G. Ren O. K. Öz R. P. Mason D. R. Corey Bioorg. Med. Chem. Lett. 2004 14 1139 1143
15. S. Y. Wu X. Yang K. Gharpure H. Hatakeyama M. Egli M. McGuire A. S. Nagaraja T. Miyake R. Rupaimoole C. V. Pecot M. Taylor S. Pradeep M. Sierant C. Rodriguez-Aguayo H. J. Choi R. A. Previs G. N. Armaiz-Pena L. Huang C. Martinez T. Hassell C. Ivan V. Sehgal R. Singhania H.-D. Han C. Su J.-H. Kim H. Dalton C. Kowali K. Keyomarsi N. A. J. McMillan W. W. Overwijk J. Liu J.-S. Lee K. Baggerly G. Lopez-Berestein P. Ram B. Nawrot A. K. Sood Nat. Commun. 2014 5 3459
16. F. Li P. S. Pallan M. A. Maier K. G. Rajeev S. L. Mathieu C. Kreutz Y. Fan J. Sanghvi R. Micura E. Rozners M. Manoharan M. Egli Nucleic Acids Res. 2007 35 6424 6438
17. P. Lubini W. Zürcher M. Egli Chem. Biol. 1994 1 39 45
18. M. Egli G. Minasov V. Tereshko P. S. Pallan M. Teplova G. B. Inamati E. A. Lesnik S. R. Owens B. S. Ross T. P. Prakash M. Manoharan Biochemistry 2005 44 9045 9057
19. J.-B. Ma K. Ye D. J. Patel Nature 2004 429 318 322
20. M. Teplova S. T. Wallace G. Minasov V. Tereshko A. Symons P. D. Cook M. Manoharan M. Egli Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1999 96 14240 14245
21. C. A. Brautigam S. Sun J. A. Piccirilli T. A. Steitz Biochemistry 1999 38 696 704