Highly sensitive detection of CpG methylation in genomic DNA by AuNP-based colorimetric assay with ligase chain reaction

Chemical Communications

Volumn 51, Issue 16, 2015, Pages 3371-3374

  Su, Fengxia ^a   Wang, Limei ^a   Sun, Yueying ^a   Liu, Chenghui ^b   Duan, Xinrui ^b   Li, Zhengping ^a,b  

^a HEBEI UNIVERSITY   (China)

^b SHAANXI NORMAL UNIVERSITY   (China)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

GENOMIC DNA; GOLD NANOPARTICLE; DNA; GOLD; METAL NANOPARTICLE;

ABSORPTION SPECTROSCOPY; ARTICLE; COLOR; COLORIMETRY; CPG ISLAND; DNA METHYLATION; LIGASE CHAIN REACTION; LIMIT OF DETECTION; PRECIPITATION; CHEMISTRY; GENETICS; GENOME; PROCEDURES;

COLORIMETRY; CPG ISLANDS; DNA; DNA METHYLATION; GENOME; GOLD; LIGASE CHAIN REACTION; METAL NANOPARTICLES;

EID: 84922797011     PISSN: 13597345     EISSN: 1364548X     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/c4cc07688e     Document Type: Article

References (33)

1. J. Deng R. Shoemaker B. Xie et al. Nat. Biotechnol. 2009 27 353
2. K. E. Varley R. D. Mitra Genome Res. 2010 20 1279
3. P. W. Laird Nat. Rev. Genet. 2010 11 191
4. I. Hatada Y. Hayashizaki S. Hirotsune H. Komatsubara T. Mukai Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1991 88 9523
5. S. Nautiyal V. E. H. Carlton Y. Lu et al. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2010 107 12587
6. R. Lister J. R. Ecker Genome Res. 2009 19 959
7. J. G. Herman J. R. Graff S. Myöhänen B. D. Nelkin S. B. Baylin Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1996 93 9821
8. M. L. Gonzalgo P. A. Jones Nucleic Acids Res. 1997 25 2529
9. F. Feng H. Wang L. Han S. Wang J. Am. Chem. Soc. 2008 130 11338
10. M. W. Coolen A. L. Statham M. Gardiner-Garden S. J. Clark Nucleic Acids Res. 2007 35 e119
11. D. G. Burke K. Griffiths Z. Kassir K. Emslie Anal. Chem. 2009 81 7294
12. Z. Xiong P. W. Laird Nucleic Acids Res. 1997 25 2532
13. C. A. Eads K. D. Danenberg K. Kawakami L. B. Saltz C. Blake D. Shibata P. V. Danenberg P. W. Laird Nucleic Acids Res. 2000 28 e32
14. S. E. Cottrell J. Distler N. S. Goodman S. H. Mooney A. Kluth A. Olek I. Schwope R. Tetzner H. Ziebarth K. Berlin Nucleic Acids Res. 2004 32 e10
15. M. Zeschnigk S. Böhringer E. A. Price Z. Onadim L. Maβhöfer D. R. Lohmann Nucleic Acids Res. 2004 32 e125
16. L. G. Carrascosa A. A. I. Sina R. Palanisamy B. Sepulveda M. A. Otte S. Rauf M. J. A. Shiddiky M. Trau Chem. Commun. 2014 50 3585
17. H. Zhang M. Li M. Fan J. Gu P. Wu C. Cai Chem. Commun. 2014 50 2932
18. A. A. I. Sina S. Howell L. G. Carrascosa S. Rauf M. J. A. Shiddiky M. Trau Chem. Commun. 2014 50 13153
19. F. Barany Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1991 88 189
20. E. J. H. Wee M. J. A. Shiddiky M. A. Brown M. Trau Chem. Commun. 2012 48 12014
21. J. Yan Z. Li C. Liu Y. Cheng Chem. Commun. 2010 46 2432
22. P. Zhang J. zhang C. Wang C. Liu H. Wang Z. Li Anal. Chem. 2014 86 1076
23. Y. Hu H. Jia Y. Wang Y. Cheng Z. Li Chem. Commun. 2014 50 13093
24. E. J. H. Wee S. Rauf K. M. Koo M. J. A. Shiddiky M. Trau Lab Chip 2013 13 4385
25. K. M. Koo E. J. H. Wee S. Rauf M. J. A. Shiddiky M. Trau Biosens. Bioelectron. 2014 56 278
26. R. Elghanian J. J. Storhoff R. C. Mucic R. L. Letsinger C. A. Mirkin Science 1997 277 1078
27. N. L. Rosi C. A. Mirkin Chem. Rev. 2005 105 1547
28. T. Liu J. Zhao D. Zhang G. Li Anal. Chem. 2009 82 229
29. G. Song C. Chen J. Ren X. Qu ACS Nano 2009 3 1183
30. C. Ge Z. Fang J. Chen J. Liu X. Lu L. Zeng Analyst 2012 137 2032
31. K. E. Bachman J. G. Herman P. G. Corn A. Merlo J. F. Costello W. K. Cavenee S. B. Baylin J. R. Graff Cancer Res. 1999 59 798
32. J. J. Storhoff R. Elghanian R. C. Mucic C. A. Mirkin R. L. Letsinger J. Am. Chem. Soc. 1998 120 1959
33. R. A. Reynolds C. A. Mirkin R. L. Letsinger J. Am. Chem. Soc. 2000 122 3795