-
1
-
-
84949116890
-
-
Gao, J.; Truhlar, D. G.; Wang, Y.; Mazack, M. J. M.; Löffler, P.; Provorse, M. R.; Rehak, P. Acc. Chem. Res. 2014, 47, 2837-2845
-
(2014)
Acc. Chem. Res.
, vol.47
, pp. 2837-2845
-
-
Gao, J.1
Truhlar, D.G.2
Wang, Y.3
Mazack, M.J.M.4
Löffler, P.5
Provorse, M.R.6
Rehak, P.7
-
2
-
-
84949115966
-
-
Giese, T. J.; Huang, M.; Chen, H.; York, D. M. Acc. Chem. Res. 2014, 47, 2812-2820
-
(2014)
Acc. Chem. Res.
, vol.47
, pp. 2812-2820
-
-
Giese, T.J.1
Huang, M.2
Chen, H.3
York, D.M.4
-
3
-
-
84857975912
-
-
Han, J.; Truhlar, D. G.; Gao, J. Theor. Chem. Acc. 2012, 131, 1161-1161
-
(2012)
Theor. Chem. Acc.
, vol.131
, pp. 1161-1161
-
-
Han, J.1
Truhlar, D.G.2
Gao, J.3
-
4
-
-
84882236723
-
-
Han, J.; Mazack, M. J. M.; Zhang, P.; Truhlar, D. G.; Gao, J. J. Chem. Phys. 2013, 139, 054503
-
(2013)
J. Chem. Phys.
, vol.139
, pp. 054503
-
-
Han, J.1
Mazack, M.J.M.2
Zhang, P.3
Truhlar, D.G.4
Gao, J.5
-
5
-
-
84874846660
-
-
Giese, T. J.; Chen, H.; Dissanayake, T.; Giambaşu, G. M.; Heldenbrand, H.; Huang, M.; Kuechler, E. R.; Lee, T.-S.; Panteva, M. T.; Radak, B. K.; York, D. M. J. Chem. Theory Comput. 2013, 9, 1417-1427
-
(2013)
J. Chem. Theory Comput.
, vol.9
, pp. 1417-1427
-
-
Giese, T.J.1
Chen, H.2
Dissanayake, T.3
Giambaşu, G.M.4
Heldenbrand, H.5
Huang, M.6
Kuechler, E.R.7
Lee, T.-S.8
Panteva, M.T.9
Radak, B.K.10
York, D.M.11
-
6
-
-
84861136242
-
-
Zhang, P.; Truhlar, D. G.; Gao, J. Phys. Chem. Chem. Phys. 2012, 14, 7821-7829
-
(2012)
Phys. Chem. Chem. Phys.
, vol.14
, pp. 7821-7829
-
-
Zhang, P.1
Truhlar, D.G.2
Gao, J.3
-
8
-
-
84896265498
-
-
Giese, T. J.; Chen, H.; Huang, M.; York, D. M. J. Chem. Theory Comput. 2014, 10, 1086-1098
-
(2014)
J. Chem. Theory Comput.
, vol.10
, pp. 1086-1098
-
-
Giese, T.J.1
Chen, H.2
Huang, M.3
York, D.M.4
-
9
-
-
84897518574
-
-
Kapustin, E. A.; Minkov, V. S.; Stare, J.; Boldyreva, E. V. Cryst. Growth Des. 2014, 14, 1851-1864
-
(2014)
Cryst. Growth Des.
, vol.14
, pp. 1851-1864
-
-
Kapustin, E.A.1
Minkov, V.S.2
Stare, J.3
Boldyreva, E.V.4
-
10
-
-
2942532422
-
-
Wang, J.; Wolf, R. M.; Caldwell, J.; Kollman, P. A.; Case, D. A. J. Comput. Chem. 2004, 25, 1157-1174
-
(2004)
J. Comput. Chem.
, vol.25
, pp. 1157-1174
-
-
Wang, J.1
Wolf, R.M.2
Caldwell, J.3
Kollman, P.A.4
Case, D.A.5
-
11
-
-
70350378454
-
-
Song, L.; Han, J.; lin Lin, Y.; Xie, W.; Gao, J. J. Phys. Chem. A 2009, 113, 11656-11664
-
(2009)
J. Phys. Chem. A
, vol.113
, pp. 11656-11664
-
-
Song, L.1
Han, J.2
Lin Lin, Y.3
Xie, W.4
Gao, J.5
-
12
-
-
65249108161
-
-
Xie, W.; Orozco, M.; Truhlar, D. G.; Gao, J. J. Chem. Theory Comput. 2009, 5, 459-467
-
(2009)
J. Chem. Theory Comput.
, vol.5
, pp. 459-467
-
-
Xie, W.1
Orozco, M.2
Truhlar, D.G.3
Gao, J.4
-
13
-
-
47249085107
-
-
Xie, W.; Song, L.; Truhlar, D. G.; Gao, J. J. Chem. Phys. 2008, 128, 234108
-
(2008)
J. Chem. Phys.
, vol.128
, pp. 234108
-
-
Xie, W.1
Song, L.2
Truhlar, D.G.3
Gao, J.4
-
17
-
-
84984548611
-
-
Cembran, A.; Bao, P.; Wang, Y.; Song, L.; Truhlar, D. G.; Gao, J. J. Chem. Theory Comput. 2010, 6, 2469-2476
-
(2010)
J. Chem. Theory Comput.
, vol.6
, pp. 2469-2476
-
-
Cembran, A.1
Bao, P.2
Wang, Y.3
Song, L.4
Truhlar, D.G.5
Gao, J.6
-
19
-
-
77955568352
-
-
Gao, J.; Cembran, A.; Mo, Y. J. Chem. Theory Comput. 2010, 6, 2402-2410
-
(2010)
J. Chem. Theory Comput.
, vol.6
, pp. 2402-2410
-
-
Gao, J.1
Cembran, A.2
Mo, Y.3
-
20
-
-
84872145856
-
-
Gaus, M.; Goez, A.; Elstner, M. J. Chem. Theory Comput. 2013, 9, 338-354
-
(2013)
J. Chem. Theory Comput.
, vol.9
, pp. 338-354
-
-
Gaus, M.1
Goez, A.2
Elstner, M.3
-
21
-
-
84949115966
-
-
Giese, T. J.; Huang, M.; Chen, H.; York, D. M. Acc. Chem. Res. 2014, 47, 2812-20
-
(2014)
Acc. Chem. Res.
, vol.47
, pp. 2812-2820
-
-
Giese, T.J.1
Huang, M.2
Chen, H.3
York, D.M.4
-
22
-
-
0004016501
-
-
Jorgensen, W. L.; Chandrasekhar, J.; Madura, J. D.; Impey, R. W.; Klein, M. L. J. Chem. Phys. 1983, 79, 926-935
-
(1983)
J. Chem. Phys.
, vol.79
, pp. 926-935
-
-
Jorgensen, W.L.1
Chandrasekhar, J.2
Madura, J.D.3
Impey, R.W.4
Klein, M.L.5
-
23
-
-
2942622288
-
-
Horn, H. W.; Swope, W. C.; Pitera, J. W.; Madura, J. D.; Dick, T. J.; Hura, G. L.; Head-Gordon, T. J. Chem. Phys. 2004, 120, 9665-9678
-
(2004)
J. Chem. Phys.
, vol.120
, pp. 9665-9678
-
-
Horn, H.W.1
Swope, W.C.2
Pitera, J.W.3
Madura, J.D.4
Dick, T.J.5
Hura, G.L.6
Head-Gordon, T.7
-
24
-
-
80055042187
-
-
Temelso, B.; Archer, K. A.; Shields, G. C. J. Phys. Chem. A 2011, 115, 12034-12046
-
(2011)
J. Phys. Chem. A
, vol.115
, pp. 12034-12046
-
-
Temelso, B.1
Archer, K.A.2
Shields, G.C.3
-
25
-
-
84904760980
-
-
University of California: San Francisco, CA.
-
Case, D. A.; Babin, V.; Berryman, J. T.; Betz, R. M.; Cai, Q.; Cerutti, D. S.; Cheatham, III, T. E.; Darden, T. A.; Duke, R. E.; Gohlke, H.; Goetz, A. W.; Gusarov, S.; Homeyer, N.; Janowski, P.; Kaus, J.; Kolossváry, I.; Kovalenko, A.; Lee, T. S.; LeGrand, S.; Luchko, T.; Luo, R.; Madej, B.; Merz, K. M.; Paesani, F.; Roe, D. R.; Roitberg, A.; Sagui, C.; Salomon-Ferrer, R.; Seabra, G.; Simmerling, C. L.; Smith, W.; Swails, J.; Walker, R. C.; Wang, J.; Wolf, R. M.; Wu, X.; Kollman, P. A. AMBER 14; University of California: San Francisco, CA, 2014.
-
(2014)
AMBER 14
-
-
Case, D.A.1
Babin, V.2
Berryman, J.T.3
Betz, R.M.4
Cai, Q.5
Cerutti, D.S.6
Cheatham, T.E.7
Darden, T.A.8
Duke, R.E.9
Gohlke, H.10
Goetz, A.W.11
Gusarov, S.12
Homeyer, N.13
Janowski, P.14
Kaus, J.15
Kolossváry, I.16
Kovalenko, A.17
Lee, T.S.18
Legrand, S.19
Luchko, T.20
Luo, R.21
Madej, B.22
Merz, K.M.23
Paesani, F.24
Roe, D.R.25
Roitberg, A.26
Sagui, C.27
Salomon-Ferrer, R.28
Seabra, G.29
Simmerling, C.L.30
Smith, W.31
Swails, J.32
Walker, R.C.33
Wang, J.34
Wolf, R.M.35
Wu, X.36
Kollman, P.A.37
more..
-
27
-
-
33846823909
-
-
Darden, T.; York, D.; Pedersen, L. J. Chem. Phys. 1993, 98, 10089-10092
-
(1993)
J. Chem. Phys.
, vol.98
, pp. 10089-10092
-
-
Darden, T.1
York, D.2
Pedersen, L.3
-
28
-
-
33645961739
-
-
Essmann, U.; Perera, L.; Berkowitz, M. L.; Darden, T.; Hsing, L.; Pedersen, L. G. J. Chem. Phys. 1995, 103, 8577-8593
-
(1995)
J. Chem. Phys.
, vol.103
, pp. 8577-8593
-
-
Essmann, U.1
Perera, L.2
Berkowitz, M.L.3
Darden, T.4
Hsing, L.5
Pedersen, L.G.6
-
30
-
-
33646940952
-
-
Ryckaert, J. P.; Ciccotti, G.; Berendsen, H. J. C. J. Comput. Phys. 1977, 23, 327-341
-
(1977)
J. Comput. Phys.
, vol.23
, pp. 327-341
-
-
Ryckaert, J.P.1
Ciccotti, G.2
Berendsen, H.J.C.3
-
34
-
-
33750587438
-
-
Berendsen, H. J. C.; Postma, J. P. M.; van Gunsteren, W. F.; Dinola, A.; Haak, J. R. J. Chem. Phys. 1984, 81, 3684-3690
-
(1984)
J. Chem. Phys.
, vol.81
, pp. 3684-3690
-
-
Berendsen, H.J.C.1
Postma, J.P.M.2
Van Gunsteren, W.F.3
Dinola, A.4
Haak, J.R.5
-
37
-
-
18744375794
-
-
Vega, C.; Sanz, E.; Abascal, J. L. F. J. Chem. Phys. 2005, 122, 114507
-
(2005)
J. Chem. Phys.
, vol.122
, pp. 114507
-
-
Vega, C.1
Sanz, E.2
Abascal, J.L.F.3
-
38
-
-
84892587393
-
-
Lee, T.-S.; Radak, B. K.; Huang, M.; Wong, K.-Y.; York, D. M. J. Chem. Theory Comput. 2014, 10, 24-34
-
(2014)
J. Chem. Theory Comput.
, vol.10
, pp. 24-34
-
-
Lee, T.-S.1
Radak, B.K.2
Huang, M.3
Wong, K.-Y.4
York, D.M.5
-
39
-
-
0034339289
-
-
Frauenheim, T.; Seifert, G.; Elstner, M.; Hajnal, Z.; Jungnickel, G.; Porezag, D.; Suhai, S.; Scholz, R. Phys. Status Solidi B 2000, 217, 41-62
-
(2000)
Phys. Status Solidi B
, vol.217
, pp. 41-62
-
-
Frauenheim, T.1
Seifert, G.2
Elstner, M.3
Hajnal, Z.4
Jungnickel, G.5
Porezag, D.6
Suhai, S.7
Scholz, R.8
-
40
-
-
0033633272
-
-
Elstner, M.; Frauenheim, T.; Kaxiras, E.; Seifert, G.; Suhai, S. Phys. Status Solidi B 2000, 217, 357-376
-
(2000)
Phys. Status Solidi B
, vol.217
, pp. 357-376
-
-
Elstner, M.1
Frauenheim, T.2
Kaxiras, E.3
Seifert, G.4
Suhai, S.5
-
41
-
-
1542779956
-
-
Elstner, M.; Porezag, D.; Jungnickel, G.; Elsner, J.; Haugk, M.; Frauenheim, T.; Suhai, S.; Seifert, G. Phys. Rev. B 1998, 58, 7260-7268
-
(1998)
Phys. Rev. B
, vol.58
, pp. 7260-7268
-
-
Elstner, M.1
Porezag, D.2
Jungnickel, G.3
Elsner, J.4
Haugk, M.5
Frauenheim, T.6
Suhai, S.7
Seifert, G.8
-
42
-
-
34547625687
-
-
Nam, K.; Cui, Q.; Gao, J.; York, D. M. J. Chem. Theory Comput. 2007, 3, 486-504
-
(2007)
J. Chem. Theory Comput.
, vol.3
, pp. 486-504
-
-
Nam, K.1
Cui, Q.2
Gao, J.3
York, D.M.4
-
43
-
-
84898462014
-
-
Gaus, M.; Lu, X.; Elstner, M.; Cui, Q. J. Chem. Theory Comput. 2014, 10, 1518-1537
-
(2014)
J. Chem. Theory Comput.
, vol.10
, pp. 1518-1537
-
-
Gaus, M.1
Lu, X.2
Elstner, M.3
Cui, Q.4
-
44
-
-
84872142162
-
-
Wang, L.-P.; Chen, J.; Voorhis, T. V. J. Chem. Theory Comput. 2013, 9, 452-460
-
(2013)
J. Chem. Theory Comput.
, vol.9
, pp. 452-460
-
-
Wang, L.-P.1
Chen, J.2
Voorhis, T.V.3
-
45
-
-
84883348838
-
-
Wang, L.-P.; Head-Gordon, T.; Ponder, J. W.; Ren, P.; Chodera, J. D.; Eastman, P. K.; Martinez, T. J.; Pande, V. S. J. Phys. Chem. B 2013, 117, 9956-9972
-
(2013)
J. Phys. Chem. B
, vol.117
, pp. 9956-9972
-
-
Wang, L.-P.1
Head-Gordon, T.2
Ponder, J.W.3
Ren, P.4
Chodera, J.D.5
Eastman, P.K.6
Martinez, T.J.7
Pande, V.S.8
-
49
-
-
84871544678
-
-
Vanommeslaeghe, K.; Raman, E. P.; MacKerell, A. D. J. Chem. Inf. Model. 2012, 52, 3155-3168
-
(2012)
J. Chem. Inf. Model.
, vol.52
, pp. 3155-3168
-
-
Vanommeslaeghe, K.1
Raman, E.P.2
Mackerell, A.D.3
-
50
-
-
23344446773
-
-
Abascal, J. L. F.; Sanz, E.; Fernández, R. G.; Vega, C. J. Chem. Phys. 2005, 122, 234511
-
(2005)
J. Chem. Phys.
, vol.122
, pp. 234511
-
-
Abascal, J.L.F.1
Sanz, E.2
Fernández, R.G.3
Vega, C.4
-
55
-
-
33751004157
-
-
Paesani, F.; Zhang, W.; Case, D. A.; Cheatham, T. E., III; Voth, G. A. J. Chem. Phys. 2006, 125, 184507
-
(2006)
J. Chem. Phys.
, vol.125
, pp. 184507
-
-
Paesani, F.1
Zhang, W.2
Case, D.A.3
Cheatham, T.E.4
Voth, G.A.5
-
56
-
-
34548101455
-
-
Paesani, F.; Iuchi, S.; Voth, G. A. J. Chem. Phys. 2007, 127, 074506
-
(2007)
J. Chem. Phys.
, vol.127
, pp. 074506
-
-
Paesani, F.1
Iuchi, S.2
Voth, G.A.3
-
57
-
-
84906239013
-
-
Medders, G. R.; Babin, V.; Paesani, F. J. Chem. Theory Comput. 2014, 10, 2906-2910
-
(2014)
J. Chem. Theory Comput.
, vol.10
, pp. 2906-2910
-
-
Medders, G.R.1
Babin, V.2
Paesani, F.3
-
58
-
-
84860767348
-
-
Goetz, A. W.; Williamson, M. J.; Xu, D.; Poole, D.; Le Grand, S.; Walker, R. C. J. Chem. Theory Comput. 2012, 8, 1542-1555
-
(2012)
J. Chem. Theory Comput.
, vol.8
, pp. 1542-1555
-
-
Goetz, A.W.1
Williamson, M.J.2
Xu, D.3
Poole, D.4
Le Grand, S.5
Walker, R.C.6
-
59
-
-
84868214675
-
-
Le Grand, S.; Goetz, A. W.; Walker, R. C. Comput. Phys. Commun. 2013, 184, 374-380
-
(2013)
Comput. Phys. Commun.
, vol.184
, pp. 374-380
-
-
Le Grand, S.1
Goetz, A.W.2
Walker, R.C.3
-
60
-
-
84884192184
-
-
Salomon-Ferrer, R.; Goetz, A. W.; Poole, D.; Le Grand, S.; Walker, R. C. J. Chem. Theory Comput. 2013, 9, 3878-3888
-
(2013)
J. Chem. Theory Comput.
, vol.9
, pp. 3878-3888
-
-
Salomon-Ferrer, R.1
Goetz, A.W.2
Poole, D.3
Le Grand, S.4
Walker, R.C.5
-
61
-
-
84949117077
-
-
Gao, J.; Zhang, J. Z. H.; Houk, K. N. Acc. Chem. Res. 2014, 47, 2711-2711
-
(2014)
Acc. Chem. Res.
, vol.47
, pp. 2711-2711
-
-
Gao, J.1
Zhang, J.Z.H.2
Houk, K.N.3
-
64
-
-
84915786281
-
-
Chen, H.; Giese, T. J.; Huang, M.; Wong, K.-Y.; Harris, M. E.; York, D. M. Chem.-Eur. J. 2014, 20, 14336-14343
-
(2014)
Chem.-Eur. J.
, vol.20
, pp. 14336-14343
-
-
Chen, H.1
Giese, T.J.2
Huang, M.3
Wong, K.-Y.4
Harris, M.E.5
York, D.M.6
-
66
-
-
84961980477
-
-
Tomasi, J.; Mennucci, B.; Cammi, R. Chem. Rev. 2005, 105, 2999-3093
-
(2005)
Chem. Rev.
, vol.105
, pp. 2999-3093
-
-
Tomasi, J.1
Mennucci, B.2
Cammi, R.3
-
68
-
-
84961981991
-
-
Barone, V.; Cossi, M.; Tomasi, J. J. Chem. Phys. 1997, 107, 3210-3221
-
(1997)
J. Chem. Phys.
, vol.107
, pp. 3210-3221
-
-
Barone, V.1
Cossi, M.2
Tomasi, J.3
-
69
-
-
78549236130
-
-
Moser, A.; Range, K.; York, D. M. J. Phys. Chem. B 2010, 114, 13911-13921
-
(2010)
J. Phys. Chem. B
, vol.114
, pp. 13911-13921
-
-
Moser, A.1
Range, K.2
York, D.M.3
-
70
-
-
34249318721
-
-
Zhang, L.; Xie, D.; Xu, D.; Guo, H. Chem. Commun. 2007, 16, 1638-1640
-
(2007)
Chem. Commun.
, vol.16
, pp. 1638-1640
-
-
Zhang, L.1
Xie, D.2
Xu, D.3
Guo, H.4
-
71
-
-
79954547473
-
-
Gaus, M.; Cui, Q.; Elstner, M. J. Chem. Theory Comput. 2011, 7, 931-948
-
(2011)
J. Chem. Theory Comput.
, vol.7
, pp. 931-948
-
-
Gaus, M.1
Cui, Q.2
Elstner, M.3
-
74
-
-
33645371510
-
-
Vishweshwar, P.; McMahon, J. A.; Bis, J. A.; Zaworotko, M. J. J. Pharm. Sci. 2006, 95, 499-516
-
(2006)
J. Pharm. Sci.
, vol.95
, pp. 499-516
-
-
Vishweshwar, P.1
McMahon, J.A.2
Bis, J.A.3
Zaworotko, M.J.4
-
76
-
-
79954536541
-
-
Schnieders, M. J.; Fenn, T. D.; Pande, V. S. J. Chem. Theory Comput. 2011, 7, 1141-1156
-
(2011)
J. Chem. Theory Comput.
, vol.7
, pp. 1141-1156
-
-
Schnieders, M.J.1
Fenn, T.D.2
Pande, V.S.3
-
77
-
-
84860709721
-
-
Schnieders, M. J.; Baltrusaitis, J.; Shi, Y.; Chattree, G.; Zheng, L.; Yang, W.; Ren, P. J. Chem. Theory Comput. 2012, 8, 1721-1736
-
(2012)
J. Chem. Theory Comput.
, vol.8
, pp. 1721-1736
-
-
Schnieders, M.J.1
Baltrusaitis, J.2
Shi, Y.3
Chattree, G.4
Zheng, L.5
Yang, W.6
Ren, P.7
-
78
-
-
84904111971
-
-
Park, J.; Nessler, I.; McClain, B.; Macikenus, D.; Baltrusaitis, J.; Schnieders, M. J. J. Chem. Theory Comput. 2014, 10, 2781-2791
-
(2014)
J. Chem. Theory Comput.
, vol.10
, pp. 2781-2791
-
-
Park, J.1
Nessler, I.2
McClain, B.3
Macikenus, D.4
Baltrusaitis, J.5
Schnieders, M.J.6
-
82
-
-
84953658885
-
-
Fernández, D. P.; Mulev, Y.; Goodwin, A. R. H.; Levelt Sengers, J. M. H. J. Phys. Chem. Ref. Data 1995, 24, 33-70
-
(1995)
J. Phys. Chem. Ref. Data
, vol.24
, pp. 33-70
-
-
Fernández, D.P.1
Mulev, Y.2
Goodwin, A.R.H.3
Levelt Sengers, J.M.H.4
-
84
-
-
84874550050
-
-
Skinner, L. B.; Huang, C.; Schlesinger, D.; Pettersson, L. G. M.; Nilsson, A.; Benmore, C. J. J. Chem. Phys. 2013, 138, 074506
-
(2013)
J. Chem. Phys.
, vol.138
, pp. 074506
-
-
Skinner, L.B.1
Huang, C.2
Schlesinger, D.3
Pettersson, L.G.M.4
Nilsson, A.5
Benmore, C.J.6
|