Solid-phase extraction and nanoflow liquid chromatography-nanoelectrospray ionization mass spectrometry for improved global urine metabolomics

Analytical Chemistry

Volumn 87, Issue 2, 2015, Pages 1158-1165

  Chetwynd, Andrew J ^a   Abdul Sada, Alaa ^a   Hill, Elizabeth M ^a  

^a UNIVERSITY OF SUSSEX   (United Kingdom)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

BIOMARKERS; BIOMOLECULES; BODY FLUIDS; IONIZATION OF LIQUIDS; LIPIDS; LIQUID CHROMATOGRAPHY; MASS SPECTROMETRY; METABOLITES; MICROPROCESSOR CHIPS; PHASE SEPARATION;

BIO-MARKER DISCOVERY; COEFFICIENT OF VARIATION; HIGH-THROUGHPUT ANALYSIS; NANOELECTROSPRAY IONIZATION MASS SPECTROMETRY; NANOFLOW LIQUID CHROMATOGRAPHIES; NEUROTRANSMITTER METABOLITES; SIGNALING MOLECULES; SOLID-PHASE EXTRACTION;

EXTRACTION;

BIOLOGICAL MARKER;

ADULT; ELECTROSPRAY MASS SPECTROMETRY; FEMALE; HUMAN; LIQUID CHROMATOGRAPHY; MALE; METABOLOMICS; NANOTECHNOLOGY; NORMAL HUMAN; PROCEDURES; SOLID PHASE EXTRACTION; URINALYSIS; URINE; YOUNG ADULT;

ADULT; BIOLOGICAL MARKERS; CHROMATOGRAPHY, LIQUID; FEMALE; HEALTHY VOLUNTEERS; HUMANS; MALE; METABOLOMICS; NANOTECHNOLOGY; SOLID PHASE EXTRACTION; SPECTROMETRY, MASS, ELECTROSPRAY IONIZATION; URINALYSIS; YOUNG ADULT;

EID: 84922440744     PISSN: 00032700     EISSN: 15206882     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ac503769q     Document Type: Article

References (42)

1. Dunn, W. B.; Broadhurst, D. I.; Atherton, H. J.; Goodacre, R.; Griffin, J. L. Chem. Soc. Rev. 2011, 40, 387-426
2. Dettmer, K.; Aronov, P. A.; Hammock, B. D. Mass Spectrom. Rev. 2007, 26, 51-78
3. Gika, H. G.; Theodoridis, G. A.; Plumb, R. S.; Wilson, I. D. J. Pharm. Biomed. Anal. 2014, 87, 12-25
4. Mamas, M.; Dunn, W. B.; Neyses, L.; Goodacre, R. Arch. Toxicol. 2011, 85, 5-17
5. Al-Salhi, R.; Abdul-Sada, A.; Lange, A.; Tyler, C. R.; Hill, E. M. Environ. Sci. Technol. 2012, 46, 9080-9088
6. Llorach, R.; Garcia-Aloy, M.; Tulipani, S.; Vazquez-Fresno, R.; Andres-Lacueva, C. J. Agric. Food Chem. 2012, 60, 8797-808
7. Kell, D. B. Drug Discovery Today 2006, 11, 1085-1092
8. Lindon, J. C.; Holmes, E.; Nicholson, J. K. FEBS J. 2007, 274, 1140-1151
9. Bouatra, S.; Aziat, F.; Mandal, R.; Guo, A. C.; Wilson, M. R.; Knox, C.; Bjorndahl, T. C.; Krishnamurthy, R.; Saleem, F.; Liu, P.; Dame, Z. T.; Poelzer, J.; Huynh, J.; Yallou, F. S.; Psychogios, N.; Dong, E.; Bogumil, R.; Roehring, C.; Wishart, D. S. PLoS One 2013, 8, e73076
10. Johnson, C. H.; Patterson, A. D.; Idle, J. R.; Gonzalez, F. J. Annu. Rev. Pharmacol. Toxicol. 2012, 52, 37-56
11. Want, E. J.; Nordstrom, A.; Morita, H.; Siuzdak, G. J. Proteome Res. 2007, 6, 459-68
12. Gao, Y. H.; Lu, Y. H.; Huang, S. M.; Gao, L.; Liang, X. X.; Wu, Y. N.; Wang, J.; Huang, Q.; Tang, L. Y.; Wang, G. A.; Yang, F.; Hu, S. G.; Chen, Z. H.; Wang, P.; Jiang, O.; Huang, R.; Xu, Y. H.; Yang, X. F.; Ong, C. N. Environ. Sci. Technol. 2014, 48, 6409-6418
13. Pujos-Guillot, E.; Hubert, J.; Martin, J. F.; Lyan, B.; Quintana, M.; Claude, S.; Chabanas, B.; Rothwell, J. A.; Bennetau-Pelissero, C.; Scalbert, A.; Comte, B.; Hercberg, S.; Morand, C.; Galan, P.; Manach, C. J. Proteome Res. 2013, 12, 1645-1659
14. Zacharias, H. U.; Schley, G.; Hochrein, J.; Klein, M. S.; Koberle, C.; Eckardt, K. U.; Willam, C.; Oefner, P. J.; Gronwald, W. Metabolomics 2013, 9, 697-707
15. Cernei, N.; Heger, Z.; Gumulec, J.; Zitka, O.; Masarik, M.; Babula, P.; Eckschlager, T.; Stiborova, M.; Kizek, R.; Adam, V. Int. J. Mol. Sci. 2013, 14, 13893-13908
16. Theodoridis, G. A.; Gika, H. G.; Want, E. J.; Wilson, I. D. Anal. Chim. Acta 2012, 711, 7-16
17. Alvarez-Sanchez, B.; Priego-Capote, F.; de Castro, M. D. L. Trends Anal. Chem. 2010, 29, 120-127
18. Alvarez-Sanchez, B.; Priego-Capote, F.; de Castro, M. D. L. Trends Anal. Chem. 2010, 29, 111-119
19. Fernández-Peralbo, M. A.; Luque de Castro, M. D. Trends Anal. Chem. 2012, 41, 75-85
20. Want, E. J.; Wilson, I. D.; Gika, H.; Theodoridis, G.; Plumb, R. S.; Shockcor, J.; Holmes, E.; Nicholson, J. K. Nat. Protoc. 2010, 5, 1005-1018
21. Waybright, T. J.; Van, Q. N.; Muschik, G. M.; Conrads, T. P.; Veenstra, T. D.; Issaq, H. J. J. Liq. Chromatogr. Relat. Technol. 2006, 29, 2475-2497
22. Emmett, M. R.; Caprioli, R. M. J. Am. Soc. Mass Spectrom. 1994, 5, 605-613
23. Ono, M.; Shitashige, M.; Honda, K.; Isobe, T.; Kuwabara, H.; Matsuzuki, H.; Hirohashi, S.; Yamada, T. Mol. Cell. Proteomics 2006, 5, 1338-1347
24. Gama, M. R.; Collins, C. H.; Bottoli, C. B. G. J. Chromatogr. Sci. 2013, 51, 694-703
25. Edwards, J. L.; Edwards, R. L.; Reid, K. R.; Kennedy, R. T. J. Chromatogr. A 2007, 1172, 127-134
26. Metz, T. O.; Page, J. S.; Baker, E. S.; Tang, K. Q.; Ding, J.; Shen, Y. F.; Smith, R. D. Trends Anal. Chem. 2008, 27, 205-214
27. Wilm, M.; Mann, M. Anal. Chem. 1996, 68, 1-8
28. Juraschek, R.; Dulcks, T.; Karas, M. J. Am. Soc. Mass Spectrom. 1999, 10, 300-308
29. Carter, M. D.; Calcutt, M. W.; Malow, B. A.; Rose, K. L.; Hachey, D. L. J. Mass Spectrom. 2012, 47, 277-285
30. Liu, J. Z.; Zhao, Z. Y.; Teffera, Y. Rapid Commun. Mass Spectrom. 2012, 26, 320-326
31. Fischer, R.; Bowness, P.; Kessler, B. M. Proteomics 2013, 13, 3371-3386
32. Chetwynd, A. J.; David, A.; Hill, E. M.; Abdul-Sada, A. J. Mass Spectrom. 2014, 49, 1063-1069
33. Jones, D. R.; Wu, Z. P.; Chauhan, D.; Anderson, K. C.; Peng, J. M. Anal. Chem. 2014, 86, 3667-3675
34. Wiklund, S.; Johansson, E.; Sjostrom, L.; Mellerowicz, E. J.; Edlund, U.; Shockcor, J. P.; Gottfries, J.; Moritz, T.; Trygg, J. Anal. Chem. 2008, 80, 115-122
35. Tautenhahn, R.; Cho, K.; Uritboonthai, W.; Zhu, Z. J.; Patti, G. J.; Siuzdak, G. Nat. Biotechnol. 2012, 30, 826-828
36. Wishart, D. S.; Tzur, D.; Knox, C.; Eisner, R.; Guo, A. C.; Young, N.; Cheng, D.; Jewell, K.; Arndt, D.; Sawhney, S.; Fung, C.; Nikolai, L.; Lewis, M.; Coutouly, M. A.; Forsythe, I.; Tang, P.; Shrivastava, S.; Jeroncic, K.; Stothard, P.; Amegbey, G.; Block, D.; Hau, D. D.; Wagner, J.; Miniaci, J.; Clements, M.; Gebremedhin, M.; Guo, N.; Zhang, Y.; Duggan, G. E.; MacInnis, G. D.; Weljie, A. M.; Dowlatabadi, R.; Bamforth, F.; Clive, D.; Greiner, R.; Li, L.; Marrie, T.; Sykes, B. D.; Vogel, H. J.; Querengesser, L. Nucleic Acids Res. 2007, 35, D521-D526
37. Li, L.; Li, R.; Zhou, J.; Zuniga, A.; Stanislaus, A. E.; Wu, Y.; Huan, T.; Zheng, J.; Shi, Y.; Wishart, D. S.; Lin, G. Anal. Chem. 2013, 85, 3401-3408
38. Kumar, B. S.; Chung, B. C.; Kwon, O.-S.; Jung, B. H. J. Appl. Toxicol. 2012, 32, 505-520
39. Gangl, E. T.; Annan, M. M.; Spooner, N.; Vouros, P. Anal. Chem. 2001, 73, 5635-44
40. Singh, R. K.; Gupta, S.; Dastidar, S.; Ray, A. Pharmacology 2010, 85, 336-349
41. Gouveia, M. J.; Brindley, P. J.; Santos, L. L.; da Costa, J. M. C.; Gomes, P.; Vale, N. Metabolism 2013, 62, 1206-1217
42. Blask, D. E.; Hill, S. M.; Dauchy, R. T.; Xiang, S. L.; Yuan, L.; Duplessis, T.; Mao, L. L.; Dauchy, E.; Sauer, L. A. J. Pineal Res. 2011, 51, 259-269