Studying the active-site loop movement of the São Paolo metallo-β-lactamase-1

Chemical Science

Volumn 6, Issue 2, 2015, Pages 956-963

  Brem, Jürgen ^a   Struwe, Weston B ^a   Rydzik, Anna M ^a   Tarhonskaya, Hanna ^a   Pfeffer, Inga ^a   Flashman, Emily ^a   Van Berkel, Sander S ^a   Spencer, James ^b   Claridge, Timothy D W ^a   McDonough, Michael A ^a   Benesch, Justin L P ^a   Schofield, Christopher J ^a  

^a UNIVERSITY OF OXFORD   (United Kingdom)

^b UNIVERSITY OF BRISTOL   (United Kingdom)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

FLUORINE; MASS SPECTROMETRY; ZINC; ZINC COMPOUNDS;

BETA-LACTAMS; BIOPHYSICAL ANALYSIS; INHIBITOR DESIGN; INHIBITOR SELECTIVITY; ION MOBILITY-MASS SPECTROMETRY; KINETIC STUDY; LOOP MOVEMENT; MOBILE ELEMENTS;

ANTIBIOTICS;

EID: 84922239918     PISSN: 20416520     EISSN: 20416539     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/c4sc01752h     Document Type: Article

References (39)

1. W. Lee, M. A. McDonough, L. Kotra, Z. H. Li, N. R. Silvaggi, Y. Takeda, J. A. Kelly and S. Mobashery, Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A., 2001, 98, 1427-1431.
2. T. R. Walsh, M. A. Toleman, L. Poirel and P. Nordmann, Clin. Microbiol. Rev., 2005, 18, 306-325.
3. K. Bush and G. A. Jacoby, Antimicrob. Agents Chemother., 2010, 54, 969-976.
4. L. N. Andrade, N. Woodford and A. L. Darini, Int. J. Antimicrob. Agents, 2014, 43, 196-197.
5. A. E. Salabi, M. A. Toleman, J. Weeks, T. Bruderer, R. Frei and T. R. Walsh, Antimicrob. Agents Chemother., 2010, 54, 582.
6. G. Cornaglia, H. Giamarellou and G. M. Rossolini, Lancet Infect. Dis., 2011, 11, 381-393.
7. M. Galleni, J. Lamotte-Brasseur, G. M. Rossolini, J. Spencer, O. Dideberg and J. M. Frere, Antimicrob. Agents Chemother., 2001, 45, 660-663.
8. A. I. Karsisiotis, C. F. Damblon and G. C. K. Roberts, Metallomics, 2014, 6, 1881-1197.
9. M. A. Toleman, A. M. Simm, T. A. Murphy, A. C. Gales, D. J. Biedenbach, R. N. Jones and T. R. Walsh, J. Antimicrob. Chemother., 2002, 50, 673-679.
10. M. Polotto, T. Casella, M. G. de Lucca Oliveira, F. G. Rubio, M. L. Nogueira, M. T. de Almeida and M. C. Nogueira, BMC Infect. Dis., 2012, 12, 176.
11. M. A. Toleman and T. R. Walsh, FEMS Microbiol. Rev., 2011, 35, 912-935.
12. A. P. Zavascki, P. B. Gaspareto, A. F. Martins, A. L. Goncalves and A. L. Barth, J. Antimicrob. Chemother., 2005, 56, 1148-1151.
13. T. A. Murphy, A. M. Simm, M. A. Toleman, R. N. Jones and T. R. Walsh, Antimicrob. Agents Chemother., 2003, 47, 582-587.
14. T. A. Murphy, L. E. Catto, S. E. Halford, A. T. Hadfield, W. Minor, T. R. Walsh and J. Spencer, J. Mol. Biol., 2006, 357, 890-903.
15. C. Moali, C. Anne, J. Lamotte-Brasseur, S. Groslambert, B. Devreese, J. Van Beeumen, M. Galleni and J.-M. Frère, Chem. Biol., 2003, 10, 319-329.
16. H. Zhang and Q. Hao, FASEB J., 2011, 25, 2574-2582.
17. G. Garau, C. Bebrone, C. Anne, M. Galleni, J. M. Frere and O. Dideberg, J. Mol. Biol., 2005, 345, 785-795.
18. C. Bebrone, C. Anne, F. Kerff, G. Garau, K. De Vriendt, R. Lantin, B. Devreese, J. Van Beeumen, O. Dideberg, J. M. Frere and M. Galleni, Biochem. J., 2008, 414, 151-159.
19. N. Sharma, Z. Hu, M. W. Crowder and B. Bennett, J. Am. Chem. Soc., 2008, 130, 8215-8222.
20. J. H. Toney, G. G. Hammond, P. M. Fitzgerald, N. Sharma, J. M. Balkovec, G. P. Rouen, S. H. Olson, M. L. Hammond, M. L. Greenlee and Y. D. Gao, J. Biol. Chem., 2001, 276, 31913-31918.
21. C. Bebrone, Biochem. Pharmacol., 2007, 74, 1686-1701.
22. A. M. Davies, R. M. Rasia, A. J. Vila, B. J. Sutton and S. M. Fabiane, Biochemistry, 2005, 44, 4841-4849.
23. J. L. Benesch and B. T. Ruotolo, Curr. Opin. Struct. Biol., 2011, 21, 641-649.
24. J. L. Benesch and C. V. Robinson, Curr. Opin. Struct. Biol., 2006, 16, 245-251.
25. A. M. Rydzik, J. Brem, S. S. van Berkel, I. Pfeffer, A. Makena, T. D. W. Claridge and C. J. Schofield, Angew. Chem., Int. Ed., 2014, 53, 3129-3133.
26. A. D. Bain, Prog. Nucl. Magn. Reson. Spectrosc., 2003, 43, 63-103.
27. A. D. Bain, Ann. Rep. NMR Spectrosc., 2008, 63, 23-48.
28. A. D. Bain and J. A. Cramer, J. Magn. Reson., Ser. A, 1993, 103, 217-222.
29. U. Heinz, R. Bauer, S. Wommer, W. Meyer-Klaucke, C. Papamichaels, J. Bateson and H. W. Adolph, J. Biol. Chem., 2003, 278, 20659-20666.
30. B. M. Lienard, G. Garau, L. Horsfall, A. I. Karsisiotis, C. Damblon, P. Lassaux, C. Papamicael, G. C. Roberts, M. Galleni, O. Dideberg, J. M. Frere and C. J. Schofield, Org. Biomol. Chem., 2008, 6, 2282-2294.
31. A. Makena, S. S. van Berkel, C. Lejeune, R. J. Owens, A. Verma, R. Salimraj, J. Spencer, J. Brem and C. J. Schofield, ChemMedChem, 2013, 8, 1923-1929.
32. S. S. van Berkel, J. Brem, A. M. Rydzik, R. Salimraj, R. Cain, A. Verma, R. J. Owens, C. W. G. Fishwick, J. Spencer and C. J. Schofield, J. Med. Chem., 2013, 56, 6945-6953.
33. E. G. Orellano, J. E. Girardini, J. A. Cricco, E. A. Ceccarelli and A. J. Vila, Biochemistry, 1998, 37, 10173-10180.
34. M. F. Tioni, L. I. Llarrull, A. A. Poeylaut-Palena, M. A. Marti, M. Saggu, G. R. Periyannan, E. G. Mata, B. Bennett, D. H. Murgida and A. J. Vila, J. Am. Chem. Soc., 2008, 130, 15852-15863.
35. P. A. Crawford, K. W. Yang, N. Sharma, B. Bennett and M. W. Crowder, Biochemistry, 2005, 44, 5168-5176.
36. R. Bicknell, E. L. Emanuel, J. Gagnon and S. G. Waley, Biochem. J., 1985, 229, 791-797.
37. N. P. Sharma, C. Hajdin, S. Chandrasekar, B. Bennett, K. W. Yang and M. W. Crowder, Biochemistry, 2006, 45, 10729-10738.
38. A. L. Stamp, P. Owen, K. El Omari, C. E. Nichols, M. Lockyer, H. K. Lamb, I. G. Charles, A. R. Hawkins and D. K. Stammers, Protein Sci., 2010, 19, 1897-1905.
39. A. Yamamura, A. Okada, Y. Kameda, J. Ohtsuka, N. Nakagawa, A. Ebihara, K. Nagata and M. Tanokura, Acta Crystallogr., Sect. F: Struct. Biol. Cryst. Commun., 2009, 65, 455-459.