Fe (III) reduction strategies of dissimilatory iron reducing bacteria

Korean Journal of Chemical Engineering

Volumn 32, Issue 1, 2015, Pages 1-14

  Esther, Jacintha ^a,b   Sukla, Lala Behari ^a,b   Pradhan, Nilotpala ^a,b   Panda, Sandeep ^a  

^a CSIR INSTITUTE OF MINERALS AND MATERIALS TECHNOLOGY   (India)

^b ACADEMY OF SCIENTIFIC AND INNOVATIVE RESEARCH ACSIR   (India)

Author keywords

Applications; Dissimilatory Iron Reducing Bacteria; Geobacter; Metabolism; Shewanella

Indexed keywords

EID: 84922104329     PISSN: 02561115     EISSN: 19757220     Source Type: Journal    
DOI: 10.1007/s11814-014-0286-x     Document Type: Review

References (200)

1. K. A. Weber, L. A. Achenbach and J. D. Coates, Nat. Rev. Microbiol., 4, 752 (2006).
2. D. R. Lovley, E. J. P. Philips and D. J. Lonergan, Environ. Sci. Technol., 25, 1062 (1991).
3. K. H. Nealson and D. Saffarini, Annu. Rev. Microbiol., 48, 311 (1994).
4. C. Zhang, H. Vali, C. S. Romanek, T. J. Phelps and S. Liu. American Mineralogist, 83, 1409 (1998).
5. D. R. Lovley, S. J. Giovanmoni, D. C. White, J. Champine, E. J. P. Phillips, Y. A. Gorby and S. Goodwin, Arch. Microbiol., 159, 336 (1993).
6. J. K. Fredrickson, J.M. Zachara, D.W. Kennedy, H. Dong, T. C. Onstott, N.W. Hinman and S. Li, Geochim. Cosmochim. Acta, 62, 3239 (1998).
7. J.M. Zachara, R.K. Kukkadapu, J. K. Fredrickson, Y. A. Gorby and S. C. Smith, Geomicrobiol. J., 19, 179 (2002).
8. K. H. Nealson and C. R. Myers, American J. Sci., 220, 35 (1990).
9. D. Lovley and E. Phillips, Appl. Environ. Microbiol., 54, 1472 (1988).
10. J. A. Gralnick and D. K. Newman, Mol. Microbiol., 65, 1 (2007).
11. A. E. Franks, N. Malvankar and K. P. Nevin, Biofuels, 1, 589 (2010).
12. K.M. Thormann, R. M. Saville, S. Shukla, D. A. Pelletier and A.M. Spormann, J. Bacteriol., 186, 8096 (2004).
13. K. Richter, M. Schicklberger and J. Gescher, Appl. Environ. Microbiol., 78, 913 (2012).
14. D. L. Cologgi, S. Lampa-Pastirk, A. M. Speers, S. D. Kelly and G. Reguera, Proc. Natl. Acad Sci. USA, 108, 15248 (2011).
15. J.B. Rollefson, C. S. Stephen, M. Tien and D. R. Bond, J. Bacteriol., 193, 1023 (2011).
16. B. Cao, L. Shi, R. N. Brown, Y. Xiong, J. K. Fredrickson, M. F. Romine, M. J. Marshall, M. S. Lipton and H. Beyenal, Environ. Microbiol., 13, 1018 (2011).
17. E. D. Brutinel and J. A. Gralnick, Appl. Microbiol. Biotechnol., 93, 41 (2012).
18. K. Venkateswaran, D. P. Moser, M. E. Dollhopf, D. P. Lies, D. A. Saffarini, B. J. MacGregor, D.B. Ringelberg, D. C. White, M. Nishijima, H. Sano, J. Burghardt, E. Stackebrandt and K. H. Nealson, Int. J. Syst. Bacteriol., 49(Part 2), 705 (1999).
19. R. Mahadevan, B. Palsson and D.R. Lovley, Nat. Rev., 9, 39 (2011).
20. E. S. Shelobolina, K. P. Nevin, J. D. Blakeney-Hayward, C. V. Johnsen, T.W. Plaia, P. Krader, T. Woodard, D. E. Holmes, C.G. Vanpraagh and D.R. Lovley,. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 57, 126 (2007).
21. G. B. Slobodkina, T. V. Kolganova, J. Querellou, E. A. Bonch-Osmolovskaya and A. I. Slobodkin, Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 59, 2880 (2009).
22. J. D. Coates, D. J. Ellis, C.V. Gaw and D. R. Lovley, Int. J. Syst. Bacteriol., 49, 1615 (1999).
23. A. C. Greene, B. K. C. Patel and S. Yacob, Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 59, 781 (2009).
24. A. C. Greene, B. K. C. Patel and A. J. Sheehy, Int. J. Syst. Bacteriol., 47, 505 (1997).
25. S. Kanso, G, Anthony and P. C. Bharat, Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 52, 869 (2002).
26. K. Kusel, T. Dorsch, G. Acker and E. Stackebrandt, Appl. Environ. Microbiol., 65, 3633 (1999).
27. C. Ma, L. Zhuang, S.G. Zhou, G. Q. Yang, Y. Yuan and R. X. Xu, J. Appl. Microbiol., 112, 883 (2012).
28. K. Venkateswaran, M. E. Dollhopf, R. Aller, E. Stackebrandt and K. H. Nealson, Int. J. Syst. Bacteriol., 48, 965 (1998).
29. M. Hyun, B. Kim, I. Chang, H. Park, H. Kim, G. Kim, M. Kim and D. Park, J. Microbiol., 37, 206 (1999).
30. J. Lee, Y. Roh, K. Kim and H. Hur, Geomicrobiol. J., 24, 31 (2007).
31. Y. Roh, H. Gao, H. Vali, D.W. Kennedy, Z. K. Yang and W. Gao, Appl. Environ. Microbiol., 72, 3236 (2006).
32. R. D. Stapleton Jr., Z. L. Sabree, A.V. Palumbo, C. L. Moyer, A. H. Devol, Y. Roh and J. Zhou, Aquat. Microb. Ecol., 38, 81 (2005).
33. W. Wu, B. Li, J. Hu, J. Li, F. Wang and Y. Pan, J. Geophys Res., 116, G04034 (2011) DOI:10.1029/2011JG001728.
34. M. Xu, J. Guo, Y. Cen, X. Zhong, W. Cao and G. Sun, Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 55, 363 (2005).
35. J. P. Bowman, S.A. Mccammon, D. S. Nichols, J.H. Skerratt, S.M. Rea, P. D. Nichols and T. A. Mcmeekin, Int. J. Syst. Bacteriol., 47, 1040 (1997).
36. H. Gao, A. Obraztova, N. Stewart, R. Popa and J. K. Fredrickson, Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 56, 1911 (2006).
37. M. R. Leonardo, D. P. Moser, E. Barbieri, C. A. Brantner, B. J. MacGregor, B. J. Paster, E. Stackebrandt and K. H. Nealson, Int. J. Syst. Bacteriol., 49, 1341 (1999).
38. K. P. Nevin, D.E. Holmes, T. L. Woodard, E. S. Hinlein, D.W. Ostendorf and D.R. Lovley, Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 55, 1667 (2005).
39. K. L. Straub and B. E. E. Buchholz-Cleven, Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 51, 1805 (2001).
40. O. Prakash, T.M. Gihring, D. D. Dalton, K. Chin, S. J. Green, D.M. Akob, G. Wanger and J. E. Kostka, Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 60, 546 (2010).
41. Y. Sung, K. E. Fletcher, K.M. Ritalahti, R. P. Apkarian, N. Ramos-Hernández, R. A. Sanford, N. M. Mesbah and F. E. Loffler, Appl. Environ. Microbiol., 72, 2775 (2006).
42. S. Viulu, K. Nakamura, Y. Okada, S. Saitou and K. Takamizawa, Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 63, 442 (2013).
43. E. S. Shelobolina, M.V. Coppi, A. A. Korenevsky, L. N. Didonato, S. A. Sullivan, H. Konishi, H. Xu, C. Leang, J. E. Butler, B. C. Kim and D. R. Lovley, BMC Microbiol., 7, 16 (2007).
44. F. Caccavo Jr., D. J. Lonergan, D. R. Lovley, M. Davis, J. F. Stolz and M. J. Mcinerney, Appl. Environ. Microbiol., 60, 3752 (1994).
45. E. S. Shelobolina, H. A. Vrionis, R. H. Findlay and D. R. Lovley, Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 58, 1075 (2008).
46. K. H. Nealson and J. Scott, Ecophysiology of the genus Shewanella, In The Prokaryotes, Ed. M Dworkin, New York, Springer-Verlag (2005).
47. J. M. Tiedje, Nat. Biotechnol., 20, 1093 (2002).
48. S. Shirodkar, S. Reed, M. Romine and D. Saffarini, Environ. Microbiol., 13, 108 (2010).
49. C. Schwalb, S. K. Chapman and G. A. Reid, Biochem., 42, 9491 (2003).
50. J. F. Heidelberg, I. T. Paulsen, K. E. Nelson, E. J. Gaidos, W. C. Nelson, T. D. Read, J. A. Eisen, R. Seshadri, N. Ward, B. Methe, R. A. Clayton, T. Meyer, A. Tsapin, J. Scott, M. Beanan, L. Brinkac, S. Daugherty, R.T. DeBoy, R. J. Dodson, A. S. Durkin, D.H. Haft, J. F. Kolonay, R. Madupu, J. D. Peterson, L. A. Umayam, O. White, A.M. Wolf, J. Vamathevan, J. Weidman, M. Impraim, K. Lee, K. Berry, C. Lee, J. Mueller, H. Khouri, J. Gill, T.R. Utterback, L. A. McDonald, T.V. Feldblyum, H. O. Smith, J.C. Venter, K. H. Nealson and C.M. Fraser, Nat. Biotechnol., 20, 1118 (2002).
51. C. R. Myers and J. M. Myers, J. Bacteriol., 174, 3429 (1992).
52. C.R. Myers and J. M. Myers, FEMS Microbiol. Lett., 108, 15 (1993).
53. C. R. Myers and J.M. Myers, FEMS Microbiol. Lett., 114, 215 (1993).
54. C. R. Myers and J. M. Myers, Biochim. Biophys. Acta, 1326, 307 (1997).
55. L. Shi, T.C. Squier, J.M. Zachara and J.K. Fredrickson, Mol. Microbiol., 65, 12 (2007).
56. L. Shi, K. M. Rosso, T. A. Clarke, D. J. Richardson, J.M. Zachara and J. K. Fredrickson, Front Microbiol., 3, 50 (2012).
57. D. Coursolle, D. B. Baron, D. R. Bond and J. A. Gralnick, J. Bacteriol., 192, 467 (2010).
58. D. Coursolle and J. A. Gralnick, Mol. Microbiol., 77, 995 (2010).
59. C. R. Myers and J. M. Myers, J. Bacteriol., 179, 1143 (1997).
60. K. E. Pitts, P. S. Dobbin, F. Reyes-Ramirez, A. J. Thomson, D. J. Richardson and H. E. Seward, J. Biol. Chem., 278, 27758 (2003).
61. A. S. Beliaev, D. A. Saffarini, J. L. McLaughlin and D. Hunnicutt, Mol. Microbiol., 39, 722 (2001).
62. J.M. Myers and C. R. Myers, Appl. Environ. Microbiol., 67, 260 (2001).
63. A. S. Beliaev and D. A. Saffarini, J. Bacteriol., 180, 6292 (1998).
64. D. J. Richardson, J. N. Butt, J. K. Fredrickson, J.M. Zachara, L. Shi, M. J. Edwards, G. F. White, N. Baiden, A. J. Gates, S. Marritt and T. A. Clarke, Mol. Microbiol., 85, 201 (2012).
65. S. Bose, M. F. Hochella Jr,_Y. A. Gorby, D.W. Kennedy, D. E. McCready, A. S. Madden and B. H. Lower, Geochim. Cosmochim. Acta, 73, 962 (2009).
66. K. Zargar and C.W. Saltikov, Arch. Microbiol., 191, 797 (2009).
67. H. C. Gao, Z.K. Yang, S. Barua, S.B. Reed, M. F. Romine, K. H. Nealson, J. K. Fredrickson, J. M. Tiedje and J. Zhou, ISME J., 3, 966 (2009).
68. D.E. Ross, S. S. Ruebush, S. Brantley, R. S. Hartshorne, T.A. Clarke, D. J. Richardson and M. Tien, Appl. Environ. Microbiol., 73, 5797 (2007).
69. Y. Qian, C. M. Paquete, R. O. Louro, D. E. Ross, E. Labelle, D. R. Bond and M. Tien, Biochem., 50, 6217 (2011).
70. B. Schuetz, M. Schicklberger, J. Kuermann, A.M. Spormann and J. Gescher, Appl. Environ. Microbiol., 75, 7789 (2009).
71. B.M. Fonseca, C.M. Paquete, S. E. Neto, I. Pacheco, C. M. Soares and R. O. Louro, Biochem. J., 449, 101 (2013).
72. J.M. Myers and C. R. Myers, J. Bacteriol., 182, 67 (2000).
73. C. D. Cordova, M. F. R. Schicklberger, Y. Yu and A. M. Spormann, J. Bacteriol., 193, 2312 (2011).
74. R. S. Hartshorne, B. N. Jepson, T. A. Clarke, S. J. Field, J. Fredrickson, J. Zachara, L. Shi, J. N. Butt and D. J. Richardson, J. Biol. Inorg. Chem., 12, 1083 (2007).
75. M. Schicklberger, C. Bucking, B. Schuetz, H. Heide and J. Gescher, Appl. Environ. Microbiol., 77, 1520 (2011).
76. T.A. Clarke, M. J. Edwards, A. J. Gates, A. Hall, G. F. White, J. Bradley, C. L. Reardon, L. Shi, A. S. Beliaev, M. J. Marshall, Z. Wang, N. J. Watmough, J. K. Fredrickson, J. M. Zachara, J. N. Butt and D. J. Richardson, Proc. Natl. Acad Sci. USA, 108, 9384 (2011).
77. R. S. Hartshorne, C. L. Reardon, D. Ross, J. Nuester, T. A. Clarke, A. J. Gates, P. C. Mills, J. K. Fredrickson, J.M. Zachara, L. Shi, A. S. Beliaev, M. J. Marshall, M. Tien, S. Brantley, J.N. Butt and D. J. Richardson, Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 106, 22169 (2009).
78. Z. Wang, C. Liu, X. Wang, M. J. Marshall, J.M. Zachara, K.M. Rosso, M. Dupuis, J. K. Fredrickson, S.M. Heald and L. Shi, Appl. Environ. Microbiol., 74, 6746 (2008).
79. C. L. Reardon, A. C. Dohnalkova, P. Nachimuthu, D.W. Kennedy, D. A. Saffarini, B.W. Arey, L. Shi, Z. Wang, D. Moore, J. S. Mclean, D. Moyles, M. J. Marshall, J. M. Zachara, J. K. Fredrickson and A. S. Beliaev, Geobiol., 8, 56 (2010).
80. N. S. Wigginton, K.M. Rosso, B. H. Lower, L. Shi and M. F. Hochella, Geochim Cosmochim Acta, 71, 543 (2007).
81. B. H. Lower, L. Shi, R. Yongsunthon, T. C. Droubay, D. E. McCready and S. K. Lower, J. Bacteriol., 189, 4944 (2007).
82. Y. Xiong, L. Shi, B. Chen, M. U. Mayer, B. H. Lower, Y. Londer, S. Bose, M. F. Hochella, J. K. Fredickson and T. C. Squier, J. Am. Chem. Soc., 128, 13978 (2006).
83. B.H. Lower, R. D. Lins, Z. Oestreicher, T. P. Straatsma, M. F. Hochella Jr., L. Shi and S. K. Lower, Environ. Sci. Technol., 42, 3821 (2008).
84. S. K. Lower, M. F. Hochella Jr. and T. J. Beveridge, Science, 292, 1360 (2001).
85. C.M. Hansel, S.G. Benner, P. Nico and S. Fendorf, Geochim. Cosmochim. Acta, 68, 3217 (2004).
86. D. E. Ross, S. L. Brantley and M. Tien, Appl. Environ. Microbiol., 75, 5218 (2009).
87. K. Richter, M. Schicklberger and J. Gescher, Appl. Environ. Microbiol., 78, 913 (2012).
88. L. J. Bird, V. Bonnefoy and D. K. Newman, Trends Microbiol., 19, 330 (2011).
89. D. R. Lovley, D. E. Holmes and K. P. Nevin, Adv. Microb. Physiol., 49, 219 (2004).
90. A. J. Stams, F. A. de Bok, C.M. Plugge, M. H. van Eekert, J. Dolfing and G. Schraa, Environ. Microbiol., 8, 371 (2006).
91. E. Marsili, D.B. Baron, I. D. Shikhare, D. Coursolle, J. A. Gralnick and D. R. Bond, Proc. Natl. Acad Sci. USA, 105, 3968 (2008).
92. H. von Canstein, J. Ogawa, S. Shimizu and J. R. Lloyd, Appl. Environ. Microbiol., 74, 615 (2008).
93. E. D. Covington, C. B. Gelbmann, N. J. Kotloski and J. A. Gralnick, Mol. Microbiol., 78, 519 (2010).
94. M. Taillefert, J. S. Beckler, E. Carey, J. L. Burns, C. M. Fennessey and T. J. DiChristina, J. Inorg. Biochem., 101, 1760 (2007).
95. Y. A. Gorby, S. Yanina, J. S. McLean, K. M. Rosso, D. M. A. Dohnalkova,T. J. Beveridge, I. S. Chang, B. H. Kim, K. S. Kim, D. E. Culley, S.B. Reed, M. F. Romine, D. A. Saffarini, E. A. Hill, L. Shi, D. A. Elias, D.W. Kennedy, G. Pinchuk, K. Watanabe, S. Ishii, B. Logan, K. H. Nealson and J. K. Fredrickson, Proc. Natl. Acad Sci. USA, 103, 11358 (2006).
96. M. Y. El-Naggar, G. Wanger, K.M. Leung, T. D. Yuzvinsky, G. Southam, J. Yang, W. M. Lau, K. H. Nealson and Y. A. Gorby, Proc. Natl. Acad Sci. USA, 107, 18127 (2010).
97. L. A. Fitzgerald, E. R. Petersen, R. I. Ray, B. J. Little, C. J. Cooper, E.C. Howard, B. R. Ringeisen and J. C. Biffinger, Process Biochem., 47, 170 (2012).
98. D. R. Bond, D. E. Holmes, L. M. Tender and D. R. Lovley, Science, 295, 483 (2002).
99. B. A. Methe, K. E. Nelson, J. A. Eisen, I. T. Paulsen, W. Nelson, J. F. Heidelberg, D. Wu, M. Wu, N. Ward, M. J. Beanan, R. J. Dodson, R. Madupu, L.M. Brinkac, S. C. Daugherty, R. T. De Boy, A. S. Durkin, M. Gwinn, J. F. Kolonay, S. A. Sullivan, D. H. Haft, J. Selengut, T. M. Davidsen, N. Zafar, O. White, B. Tran, C. Romero, H. A. Forberger, J. Weidman, H. Khouri, T.V. Feldblyum, T. R. Utterback, S. E. Van Aken, D. R. Lovley and C.M. Fraser, Science, 302, 1967 (2003).
100. M.V. Coppi, C. Leang, S. J. Sandler and D.R. Lovley, Appl. Environ. Microbiol., 67, 3180 (2001).
101. D.R. Lovley, J.C. Woodward and F. H. Chapelle, Nature, 370, 128 (1994).
102. D.R. Lovley and J.C. Woodward, Chem. Geol., 132, 19 (1996).
103. K. P. Nevin and D.R. Lovley, Appl. Environ. Microbiol., 66, 2248 (2000).
104. S.E. Childers, S. Ciufo and D.R. Lovley, Nature, 416, 767 (2002).
105. T. S. Magnuson, N. Isoyama, A.L.H. Myerson, G. Davidson, M. J. Maroney, G.G. Geesey and D.R. Lovley, Biochem. J., 359, 147 (2001).
106. J. E. Champine, B. Underhill, J.M. Johnston, W.W. Lilly and S. Goodwin, Anaerobe, 6, 187 (2000).
107. G. Reguera, K.D. McCarthy, T. Mehta, J. S. Nicoll, M. T. Tuominen and D. R. Lovley, Nature, 435, 1098 (2005).
108. L. Morgado, M. Bruix, M. Pessanha, Y.Y. Londer and C. A. Salgueiro, Biophy. J., 99, 293 (2010).
109. M.D. Joana, L. Morgado, P.R. Pokkuluri, D. L. Turner and C. A. Salgueiro, Biochim. Biophys. Acta, 1827, 484 (2013).
110. C. Leang, X. Qian, T. Mester and D. R. Lovely, Appl. Environ. Microbiol., 76, 4080 (2010).
111. A. Esteve-Núñez, J. Sosnik, P. Visconti and D.R. Lovley, Environ. Microbiol., 10, 497 (2008).
112. K. Inoue, X. Qian, L. Morgado, B. Kim, T. Mester, M. Izallalen, C. A. Salgueiro and D. R. Lovely, Appl. Environ. Microbiol., 76, 3999 (2010).
113. K. P. Nevin, B. C. Kim, R. H. Glaven, J. P. Johnson, T. L. Woodard, B.A. Methe, R. J. Didonato, S. F. Covalla, A. E. Franks, A. Liu and D. R. Lovley, PLoS One., 4, e5628 (2009).
114. B. C. Kim, B. L. Postier, R. J. Didonato, S. K. Chaudhuri, K. P. Nevin and D. R. Lovley, Bioelectrochemistry, 73, 70 (2008).
115. D. R. Bond, S.M. Strycharz-Glaven, L.M. Tender and C. I. Torres, ChemSusChem., 5, 1099 (2012).
116. A. E. Franks, K. P. Nevin, H. Jia, M. Izallalen, T. L. Woodard and D. R. Lovley, Energy Environ. Sci., 2, 113 (2009).
117. E. Afkar, G. Reguera, M. Schiffer and D. R. Lovley, BMC Microbiol., 5, 41 (2005).
118. T. Mehta, S. E. Childers, R. Glaven, D. R. Lovley and T. Mester, Microbiol., 152, 2257 (2006).
119. D.E. Holmes, T. Mester, R.A. O’Neil, L.A. Perpetua, M. J. Larrahondo, R. Glaven, M. L. Sharma, J. E. Ward, K. P. Nevin and D.R. Lovley, Microbiol., 154, 422 (2008).
120. X. Qian, G. Reguera, T. Mester and D.R. Lovley, FEMS Microbiol. Lett., 277, 21 (2007).
121. N.S. Malvankar and D.R. Lovley, ChemSusChem., 5, 1039 (2012).
122. P. Tremblay, M. Aklujkar, C. Leang, K. P. Nevin and D. Lovley, Environ. Microbiol. Rep., 4, 82 (2012).
123. K. P. Nevin, H. Richter, S. F. Covalla, J. P. Johnson, T. L. Woodard, A.L. Orloff, H. Jia, M. Zhang and D.R. Lovley, Environ. Microbiol., 10, 2505 (2008).
124. G. Reguera, K. P. Nevin, J. S. Nicoll, S. F. Covalla, T. L. Woodard and D. R. Lovley, Appl. Environ. Microbiol., 72, 7345 (2006).
125. H. Richter, K. P. Nevin, H. Jia, D.A. Lowy, D.R. Lovley and L.M. Tender, Energy Environ. Sci., 2, 506 (2009).
126. K.M. Leung, G. Wanger, M.Y. El-Naggar, Y. Gorby, G. Southam, W.M. Lau and J. Yang, Nano Lett., 13, 2407 (2013).
127. A. Klimes, A. E. Franks, R.H. Glaven, H. Tran, C. L. Barrett, Y. Qiu, K. Zengler and D.R. Lovley, FEMS Microbiol. Lett., 310, 62 (2010).
128. P.N. Reardon and K.T. Mueller, J. Biol. Chem., 288, 29260 (2013).
129. R.A. Malak, Z. Gao, J. F. Wishart and S. S. Isied, J. Am. Chem. Soc., 126, 13888 (2004).
130. M. Cordes, A. Kottgen, C. Jasper, O. Jacques, H. Boudebous and B. Giese, Angew Chem. Int. Ed. Eng., 47, 3461 (2008).
131. M. Vargas, N. S. Malvankar, P. Tremblay, C. Leang, J.A. Smith, P. Patel, O. Synoeyenbos-West, K. P. Nevin and D. R. Lovley, mBio, 4, 1 (2013).
132. N. S. Malvankar, M. Vargas, K. P. Nevin, A. E. Franks, C. Leang, B. C. Kim, K. Inoue, T. Mester, S. F. Covalla, J. P. Johnson, V. M. Rotello, M. T. Tuominen and D. R. Lovley, Nat. Nanotechnol., 6, 573 (2011).
133. L. V. Richter, Doctoral Dissertations Available from Proquest. Paper AAI3465075 (2011). http://scholarworks.umass.edu/dissertations/AAI3465075.
134. P.L. Tremblay, Z.M. Summers, R.H. Glaven, K. P. Nevin, K. Zengler, C. L. Barrett, Y. Qiu, B. O. Palsson and D. R. Lovley, Environ. Microbiol., 13, 13 (2011).
135. E. E. Roden and J.M. Zachara, Environ. Sci. Technol., 30, 1618 (1996).
136. R.G. Arnold, T. J. Di Christina and M.R. Hoffmann, Biotechnol. Bioeng., 32, 1081 (1988).
137. R.A. Royer, B.A. Dempsey, B.H. Jeon and W.D. Burgos, Environ. Sci. Technol., 38, 187 (2004).
138. M.M. Urrutia, E. E. Roden, J. K. Fredrickson and J.M. Zachara, Geomicrobiol. J., 15, 269 (1998).
139. M.M. Urrutia, E. E. Roden and J. M. Zachara, Environ. Sci. Technol., 33, 4022 (1999).
140. E. E. Roden and M.M. Urrutia, Environ. Sci. Technol., 33, 1847 (1999).
141. R.A. Royer, W.D. Burgos, A.S. Fisher, R. Unz and B.A. Dempsey, Environ. Sci. Technol., 36, 1939 (2002).
142. E.E. Roden, M.M. Urrutia and C. J. Mann, Appl. Environ. Microbiol., 66, 1062 (2000).
143. C.W. Parker, J.A. Wolf, A. S. Auler, H.A. Barton and J.M. Senko, Miner, 3, 395 (2013).
144. J.M. Zachara, J.K. Fredrickson, S. Li, D.W. Kennedy, S.C. Smith and P. L. Gassman, American Mineralogist, 83, 1426 (1998).
145. L.B. Sukla, J. Esther, S. Panda and N. Pradhan, Res. Rev.: J. Microbiol. Biotechnol., 3, (2014).
146. T.C. Eisele and K. L. Gabby, Miner. Process. Extr. Metall. Rev.: Inter. J., 35, 75 (2014).
147. N. Papassiopi, K. Vaxevanidou and I. Paspaliaris, Miner. Eng., 23, 25 (2010).
148. M. Guo, Y. Lin, X. Xu and Z. Chen, Applied Clay Science, 48, 379 (2010).
149. I. Styriakova, Nova Biotechnologica, 7, 11 (2007).
150. T.C. Eisele, “Direct biohydrometallurgical extraction of iron from ore.” US DOE, FG26-03NT41938, DOI:10.2172=877695 (2005).
151. N. Pradhan, R. R. Nayak, D. K. Mishra, E. Priyadarshini, L. B. Sukla and B. K. Mishra, World Environ., 2, 110 (2012).
152. J. Esther, S. Panda, S.K. Behera, L.B. Sukla, N. Pradhan and B.K. Mishra, Bioresour. Technol., 146, 762 (2013).
153. S. Panda, P.C. Rout, C. K. Sarangi, S. Mishra, N. Pradhan, U. B. Mohapatra, T. Subbaiah, L. B. Sukla and B.K. Mishra, Korean J. Chem. Eng., 31, 452 (2014).
154. S. Panda, C.K. Sarangi, N. Pradhan, T. Subbaiah, L.B. Sukla, B.K. Mishra, G. L. Bhatoa, M. S. R. Prasad and S. K. Ray, Korean J. Chem. Eng., 26, 781 (2012).
155. A. T. Heijne, F. Liu, R.V.D. Weijden, J. Weijma, C. J.N. Buisman and H.V.M. Hamelers, Environ. Sci. Technol., 44, 4376 (2010).
156. L. P. Huang, T.C. Li, C. Liu, X. Quan, L. J. Chen, A. J. Wang and G. H. Chen, Bioresour. Technol., 128, 539 (2013).
157. C. Abourached, T. Catal and H. Liu, Water Res., 51, 228 (2014).
158. B. Zhang, C. Feng, J. Ni, J. Zhang and W. Huang, J. Power Sources, 204, 34 (2012).
159. Singhvi and Chhabra, J. Bioremed Biodeg., 4, 5 (2013).
160. C. Choi and Y. Cui, Bioresour. Technol., 107, 522 (2012).
161. Z. Wang, B. Lim and C. Choi, Bioresour. Technol., 102, 6304 (2011).
162. B. S. Lim, H. Lu, C. Choi and Z.X. Liu, Desalination Water Treat., DOI:10.1080/19443994.2014.923191 (2014).
163. Y. Gorby, F. Caccavo Jr. and H. Bolton Jr., Environ. Sci. Technol., 32, 244 (1998).
164. D. Prakash, P. Gabani, A.K. Chandel, Z. Ronen and O.V. Singh, Microbial. Biotechnol., 6, 349 (2013).
165. R. E. Wildung, Y.A. Gorby, K.M. Krupka, N. J. Hess, S.W. Li, A. E. Plymale, J. P. McKinley and J. K. Fredrickson, Appl. Microbiol. Biotechnol., 66, 2451 (2000).
166. J.R. Lloyd, J. Chesnes, S. Glasauer, D. J. Bunker, F.R. Livens and D. R. Lovley, Geomicrobiol., 19, 103 (2002).
167. H. Boukhalfa, G.A. Icopini, S.D. Reilly and M. P. Neu, Appl. Environ. Microbiol., 73, 5897 (2007).
168. A. E. Plymale, V. L. Bailey, J. K. Fredrickson, S.M. Heald, E. C. Buck, L. Shi, Z. Wang, C. T. Resch, D.A. Moore and H. Bolton Jr., Environ. Sci. Technol., 46, 2132 (2012).
169. A.N. Payne and T. J. DiChristina FEMS Microbiol. Lett., 259, 282 (2006).
170. H.A. Wiatrowski, P. M. Ward and T. Barkay, Environ. Sci. Technol., 40, 6690 (2006).
171. T.L. Daulton, B. J. Little, J. Jones-Meehan, D.A. Blom, L.F. Allard, Geochim. Cosmochim. Acta, 71, 556 (2007).
172. J. S. Zhao, D. Manno, C. Beaulieu, L. Paquet and J. Hawari, Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 55, 1511 (2005).
173. G. Liu, J. Zhou, X. Meng, S.Q. Fu, J. Wang, R. Jin and H. Lv, Appl. Microbiol. Biotechnol., 97, 4187 (2013).
174. A.K. Mathur, C.B. Majumder, S. Chatterjee and P. Roy, J. Hazard. Mater., 157, 335 (2008).
175. A.K. Mathur and C.B. Majumder, J. Hazard. Mater., 152, 1027 (2008).
176. A.K. Suresh, D.A. Pelletier, W. Wang, M. L. Broich, J. Moon, G. Baohuagu, D. P. Allison, D.C. Joy, T. J. Phelps and M. J. Doktycz, Acta Biomater., 7, 2148 (2011).
177. W. D. Burgos, J. T. McDonough, J.M. Senko, G. Zhang, A. C. Dohnalkova, S. D. Kelly, Y. Gorby and K. M. Kemner, Geochim. Cosmochim. Acta, 72, 4901 (2008).
178. S. Jiang, J. Lee, M. Kim, N.V. Myung, J.K. Fredrickson, M. J. Sadowsky and H. Hur, Appl. Environ. Microbiol., 75, 6896 (2009).
179. T. Ogi, N. Saitoh, T. Nomura and Y. Konishi, J. Nanopart. Res., 12, 2531 (2010).
180. S. DeCorte, T. Hennebel, S. Verschuere, C. Cuvelier, W. Verstraetea and N. Boon, J. Chem. Technol. Biotechnol., 86, 547 (2011).
181. W. DeWindt, P. Aelterman and W. Verstraete, Environ. Microbiol., 7, 314 (2005).
182. K. Tam, C.T. Ho, J. Lee, M. Lai, C.H. Chang, Y. Rheem, W. Chen, H. Hur and N.V. Myung, Biosci. Biotechnol. Biochem., 74, 696 (2010).
183. C.T. Ho, J.W. Kim, W.B. Kim, K. Song, R.A. Kanaly, M. J. Sadowsky and H. Hur, J. Mater. Chem., 20, 5899 (2010).
184. F. Picardal, R. Arnold and B. Huey, Appl. Environ. Microbiol., 61, 8 (1995).
185. M. Ward, Q. Fu, K. Rhoads, C. Yeung, A. Spormann and C. S. Criddle, Appl. Microbiol. Biotechnol., 63, 571 (2004).
186. B. E. Logan and J.M. Regan, Trends Microbiol., 14, 512 (2006).
187. K. Zhuang, E. Ma, D.R. Lovley and R. Mahadevan, Biotechnol. Bioeng., 109, 2475 (2012).
188. I. Ortiz-Bernad, R. T. Anderson, H. A. Vrionis and D. R. Lovley, Appl. Environ. Microbiol., 70, 3091 (2004).
189. K. H. Williams, M. J. Wilkins, A. L. N’Guessan, B. Arey, E. Dodova, A. Dohnalkova, D. Holmes, D.R. Lovley and P. E. Long, Environ. Microbiol. Rep., 5, 444 (2013).
190. D. R. Lovley, Nat. Rev. Microbiol., 4, 497 (2006).
191. D. R. Lovley, Curr. Opin. Biotechnol., 19, 564 (2008).
192. D.E. Holmes, D.R. Bond, R.A. O’Neil, C.E. Reimers, L.R. Tender and D. R. Lovley, Microb. Ecol., 48, 178 (2004).
193. L.M. Tender, C. E. Reimers, H.A. Stecher, D. E. Holmes, D.R. Bond, D. A. Lowy, K. Pilobello, S. J. Fertig and D. R. Lovley, Nat. Biotechnol., 20, 821 (2002).
194. thAmerican Society for Microbiology General Meeting, Atlanta, GA, USA. (2005)
195. T. Zhang, S.M. Gannon, K. P. Nevin, A. E. Franks and D. R. Lovley, Environ. Microbiol., 12, 1011 (2010).
196. T. Zhang, T. S. Bain, K. P. Nevin, M.A. Barlett and D. R. Lovley, Appl. Environ. Microbiol., 78, 8304 (2012).
197. K.M. Schleinitz, S. Schmeling, N. Jehmlich, M. von Bergen, H. Harms, S. Kleinsteuber, C. Voqt and G. Fuchs, Appl. Environ. Microbiol., 75, 3912 (2009).
198. H. Yi, K. P. Nevin, B.C. Kim, A.E. Franks, A. Klimes, L.M. Tender and D. R. Lovley, Biosens. Bioelectron., 24, 3498 (2009).
199. L. Mao and W. S. Verwoerd, J. Biol. Eng., 7, 14 (2013).
200. B.K. Parida, S. Panda, N. Misra, P.K. Panda and B.K. Mishra, Geomicrobiol. J., 31, 299 (2014).