Advantages of extended bottom-up proteomics using Sap9 for analysis of monoclonal antibodies

Analytical Chemistry

Volumn 86, Issue 19, 2014, Pages 9945-9953

  Srzentić, Kristina ^a   Fornelli, Luca ^a   Laskay, Uìnige A ^a   Monod, Michel ^b   Beck, Alain ^c   Ayoub, Daniel ^a   Tsybin, Yury O ^a  

^a EPFL   (Switzerland)

^b LAUSANNE UNIVERSITY HOSPITAL   (Switzerland)

^c Centre d'Immunologie Pierre Fabre   (France)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

PROTEOMICS;

EID: 84907886120     PISSN: 00032700     EISSN: 15206882     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ac502766n     Document Type: Article

References (30)

1. Walsh, G. Nat. Biotechnol. 2010, 28, 917-924
2. Beck, A.; Wagner-Rousset, E.; Ayoub, D.; Van Dorsselaer, A.; Sanglier-Cianferani, S. Anal. Chem. 2013, 85, 715-736
3. Diepold, K.; Bomans, K.; Wiedmann, M.; Zimmermann, B.; Petzold, A.; Schlothauer, T.; Mueller, R.; Moritz, B.; Stracke, J. O.; Molhoj, M.; Reusch, D.; Bulau, P. PLoS One 2012, 7, e30295
4. Kroon, D. J.; Baldwinferro, A.; Lalan, P. Pharm. Res. 1992, 9, 1386-1393
5. Harris, R. J.; Murnane, A. A.; Utter, S. L.; Wagner, K. L.; Cox, E. T.; Polastri, G. D.; Helder, J. C.; Sliwkowski, M. B. Biotechnology 1993, 11, 1293-1297
6. Fornelli, L.; Damoc, E.; Thomas, P. M.; Kelleher, N. L.; Aizikov, K.; Denisov, E.; Makarov, A.; Tsybin, Y. O. Mol. Cell. Proteomics 2012, 11, 1758-1767
7. Tsybin, Y. O.; Fornelli, L.; Stoermer, C.; Luebeck, M.; Parra, J.; Nallet, S.; Wurm, F. M.; Hartmer, R. Anal. Chem. 2011, 83, 8919-8927
8. Mao, Y.; Valeja, S. G.; Rouse, J. C.; Hendrickson, C. L.; Marshall, A. G. Anal. Chem. 2013, 85, 4239-4246
9. Yang, H.; Zubarev, R. A. Electrophoresis 2010, 31, 1764-1772
10. OâConnor, P. B.; Cournoyer, J. J.; Pitteri, S. J.; Chrisman, P. A.; McLuckey, S. A. J. Am. Soc. Mass Spectrom. 2006, 17, 15-19
11. Harris, R. J.; Kabakoff, B.; Macchi, F. D.; Shen, F. J.; Kwong, M.; Andya, J. D.; Shire, S. J.; Bjork, N.; Totpal, K.; Chen, A. B. J. Chromatogr. B: Biomed. Sci. Appl. 2001, 752, 233-245
12. Yan, B. X.; Steen, S.; Hambly, D.; Valliere-Douglass, J.; Bos, T. V.; Smallwood, S.; Yates, Z.; Arroll, T.; Han, Y. H.; Gadgil, H.; Latypov, R. F.; Wallace, A.; Lim, A.; Kleemann, G. R.; Wang, W. C.; Balland, A. J. Pharm. Sci. 2009, 98, 3509-3521
13. Zhurov, K. O.; Fornelli, L.; Wodrich, M. D.; Laskay, U. A.; Tsybin, Y. O. Chem. Soc. Rev. 2013, 42, 5014-5030
14. Zubarev, R. A.; Kelleher, N. L.; McLafferty, F. W. J. Am. Chem. Soc. 1998, 120, 3265-3266
15. Syka, J. E. P.; Coon, J. J.; Schroeder, M. J.; Shabanowitz, J.; Hunt, D. F. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2004, 101, 9528-9533
16. Cournoyer, J. J.; Pittman, J. L.; Ivleva, V. B.; Fallows, E.; Waskell, L.; Costello, C. E.; OâConnor, P. B. Protein Sci. 2005, 14, 452-463
17. Li, X.; Lin, C.; OâConnor, P. B. Anal. Chem. 2010, 82, 3606-3615
18. Yang, H.; Fung, E. Y.; Zubarev, A. R.; Zubarev, R. A. J. Proteome Res. 2009, 8, 4615-4621
19. Ayoub, D.; Jabs, W.; Resemann, A.; Evers, W.; Evans, C.; Main, L.; Baessmann, C.; Wagner-Rousset, E.; Suckau, D.; Beck, A. mAbs 2013, 5, 699-710
20. Fornelli, L.; Ayoub, D.; Aizikov, K.; Beck, A.; Tsybin, Y. O. Anal. Chem. 2014, 86, 3005-3012
21. Shaw, J. B.; Li, W.; Holden, D. D.; Zhang, Y.; Griep-Raming, J.; Fellers, R. T.; Early, B. P.; Thomas, P. M.; Kelleher, N. L.; Brodbelt, J. S. J. Am. Chem. Soc. 2013, 135, 12646-12651
22. Laskay, U. A.; Lobas, A. A.; Srzentic, K.; Gorshkov, M. V.; Tsybin, Y. O. J. Proteome Res. 2013, 12, 5558-5569
23. Laskay, U. A.; Srzentic, K.; Monod, M.; Tsybin, Y. O. J. Proteomics 2014, 110, 20-31
24. Albrecht, A.; Felk, A.; Pichova, I.; Naglik, J. R.; Schaller, M.; de Groot, P.; Maccallum, D.; Odds, F. C.; Schafer, W.; Klis, F.; Monod, M.; Hube, B. J. Biol. Chem. 2006, 281, 688-694
25. Shevchenko, A.; Wilm, M.; Vorm, O.; Mann, M. Anal. Chem. 1996, 68, 850-858
26. Laskay, U. A.; Srzentic, K.; Fornelli, L.; Upir, O.; Kozhinov, A. N.; Monod, M.; Tsybin, Y. O. Chimia 2013, 67, 244-249
27. Larsen, P. A.; Smith, T. P. BMC Immunol. 2012, 13, 52
28. Barrios, Y.; Jirholt, P.; Ohlin, M. J. Mol. Recognit. 2004, 17, 332-338
29. Frese, C. K.; Altelaar, A. F. M.; van den Toorn, H.; Nolting, D.; Griep-Raming, J.; Heck, A. J. R.; Mohammed, S. Anal. Chem. 2012, 84, 9668-9673
30. Logtenberg, T. Trends Biotechnol. 2007, 25, 390-394