Aptamer/ISET-MS: A new affinity-based MALDI technique for improved detection of biomarkers

Analytical Chemistry

Volumn 86, Issue 15, 2014, Pages 7627-7634

  Lee, Su Jin ^a   Adler, Belinda ^a   Ekström, Simon ^a   Rezeli, Melinda ^a   Végvári, Ákos ^a   Park, Jee Woong ^a   Malm, Johan ^a   Laurell, Thomas ^a,b  

^a LUND UNIVERSITY   (Sweden)

^b Dongguk University   (South Korea)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ANTIBODIES; BIOMARKERS; ENZYMES; LIGANDS; MASS SPECTROMETRY; MULTIPLEXING;

BACKGROUND COMPONENTS; CLINICAL BIOMARKERS; DETECTION SENSITIVITY; IMMUNOAFFINITY EXTRACTIONS; LIMIT OF DETECTION; MATRIX-ASSISTED LASER DESORPTION/IONIZATION MASS SPECTROMETRY; MS/MS FRAGMENTATION; SELECTIVE ENRICHMENT;

CHEMICAL DETECTION;

EID: 84905695347     PISSN: 00032700     EISSN: 15206882     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ac501488b     Document Type: Article

References (53)

1. Celis, J. E.; Moreira, J. M. A. Mol. Cell. Proteomics 2008, 7, 1779
2. Frantzi, M.; Bhat, A.; Latosinska, A. Clin. Transl. Med. 2014, 3, 7
3. Hortin, G. L.; Carr, S. A.; Anderson, N. L. Clin. Chem. 2010, 56, 149-151
4. Bennike, T.; Birkelund, S.; Stensballe, A.; Andersen, V. World J. Gastroenterol. 2014, 20, 3231-3244
5. Lee, H.-J.; Lee, E.-Y.; Kwon, M.-S.; Paik, Y.-K. Curr. Opin. Chem. Biol. 2006, 10, 42-49
6. Nanjappa, V.; Thomas, J. K.; Marimuthu, A.; Muthusamy, B.; Radhakrishnan, A.; Sharma, R.; Ahmad Khan, A.; Balakrishnan, L.; Sahasrabuddhe, N. A.; Kumar, S.; Jhaveri, B. N.; Sheth, K. V.; Kumar Khatana, R.; Shaw, P. G.; Srikanth, S. M.; Mathur, P. P.; Shankar, S.; Nagaraja, D.; Christopher, R.; Mathivanan, S.; Raju, R.; Sirdeshmukh, R.; Chatterjee, A.; Simpson, R. J.; Harsha, H. C.; Pandey, A.; Prasad, T. S. K. Nucleic Acids Res. 2014, 42, D959-D965
7. Anderson, N. L. Mol. Cell. Proteomics 2002, 1, 845-867
8. Dave, K. A.; Headlam, M. J.; Wallis, T. P.; Gorman, J. J. Curr. Protoc. Protein Sci. 2011, 10.1002/0471140864.ps1613s63
9. Webster, J.; Oxley, D. Methods Mol. Biol. 2012, 800, 227-240
10. Yu, W.; Wu, B.; Liu, J.; Li, X.; Stone, K.; Williams, K. R.; Zhao, H. Methods Mol. Biol. 2006, 328, 199-216
11. Zhang, X.; Yuan, Z.; Shen, B.; Zhu, M.; Liu, C.; Xu, W. Clin. Exp. Med. 2012, 12, 145-151
12. Tang, H.-Y.; Beer, L. A.; Speicher, D. W. Methods Mol. Biol. 2011, 728, 47-67
13. Rodthongkum, N.; Ramireddy, R.; Thayumanavan, S.; Richard, W. V. Analyst 2012, 137, 1024-1030
14. Li, W. W.; Nemirovskiy, O.; Fountain, S.; Rodney Mathews, W.; Szekely-Klepser, G. Anal. Biochem. 2007, 369, 41-53
15. Nemirovskiy, O.; Li, W. W.; Szekely-Klepser, G. Methods Mol. Biol. 2010, 641, 253-270
16. Anderson, N. L.; Anderson, N. G.; Haines, L. R.; Hardie, D. B.; Olafson, R. W.; Pearson, T. W. J. Proteome Res. 2004, 3, 235-244
17. Sparbier, K.; Wenzel, T.; Dihazi, H.; Blaschke, S.; Müller, G.-A.; Deelder, A.; Flad, T.; Kostrzewa, M. Proteomics 2009, 9, 1442-1450
18. Madian, A. G.; Rochelle, N. S.; Regnier, F. E. Anal. Chem. 2013, 85, 737-748
19. Trenchevska, O.; Kamcheva, E.; Nedelkov, D. J. Proteome Res. 2010, 9, 5969-5973
20. Rouleau, A.; El Osta, M.; Lucchi, G.; Ducoroy, P.; Boireau, W. Sensors (Basel) 2012, 12, 15119-15132
21. Lund, H.; Løvsletten, K.; Paus, E.; Halvorsen, T. G.; Reubsaet, L. Anal. Chem. 2012, 84, 7926-7932
22. Ahmad-Tajudin, A.; Adler, B.; Ekström, S.; Marko-Varga, G.; Malm, J.; Lilja, H.; Laurell, T. Anal. Chim. Acta 2014, 807, 1-8
23. Medina-Casanellas, S.; Benavente, F.; Barbosa, J.; Sanz-Nebot, V. Anal. Chim. Acta 2013, 789, 91-99
24. Zhu, G.-T.; He, X.-M.; Li, X.-S.; Wang, S.-T.; Luo, Y.-B.; Yuan, B.-F.; Feng, Y.-Q. J. Chromatogr. A 2013, 1316, 23-28
25. Ekström, S.; Wallman, L.; Malm, J.; Becker, C.; Lilja, H.; Laurell, T.; Marko-Varga, G. Electrophoresis 2004, 25, 3769-3777
26. Ekström, S.; Wallman, L.; Hök, D.; Marko-Varga, G.; Laurell, T. J. Proteome Res. 2006, 5, 1071-1081
27. Adler, B.; Laurell, T.; Ekström, S. Electrophoresis 2012, 33, 3143-3150
28. Yan, H.; Ahmad-Tajudin, A.; Bengtsson, M.; Xiao, S.; Laurell, T.; Ekström, S. Anal. Chem. 2011, 83, 4942-4948
29. Adler, B.; Boström, T.; Ekström, S.; Hober, S.; Laurell, T. Anal. Chem. 2012, 84, 8663-8669
30. Cole, J. R.; Dick, L. W.; Morgan, E. J.; McGown, L. B. Anal. Chem. 2007, 79, 273-279
31. Ni, X.; Castanares, M.; Mukherjee, A.; Lupold, S. E. Curr. Med. Chem. 2011, 18, 4206-4214
32. Stoltenburg, R.; Reinemann, C.; Strehlitz, B. Anal. Bioanal. Chem. 2005, 383, 83-91
33. Willner, I.; Zayats, M. Angew. Chem., Int. Ed. 2007, 46, 6408-6418
34. Xiao, Y.; Lubin, A. A.; Heeger, A. J.; Plaxco, K. W. Angew. Chem., Int. Ed. 2005, 44, 5456-5459
35. Ueyama, H.; Takagi, M.; Takenaka, S. J. Am. Chem. Soc. 2002, 124, 14286-14287
36. Park, J.-W.; Tatavarty, R.; Kim, D. W.; Jung, H.-T.; Gu, M. B. Chem. Commun. (Camb.) 2012, 48, 2071-2073
37. Lee, S. J.; Kwon, Y. S.; Lee, J.; Choi, E.-J.; Lee, C.-H.; Song, J.-Y.; Gu, M. B. Anal. Chem. 2013, 85, 66-74
38. Zhu, G.; Ye, M.; Donovan, M. J.; Song, E.; Zhao, Z.; Tan, W. Chem. Commun. (Camb). 2012, 48, 10472-10480
39. Lee, S. J.; Youn, B.-S.; Park, J. W.; Niazi, J. H.; Kim, Y. S.; Gu, M. B. Anal. Chem. 2008, 80, 2867-2873
40. Lee, M.; Walt, D. R. Anal. Biochem. 2000, 282, 142-146
41. Wengerter, B. C.; Katakowski, J. A.; Rosenberg, J.; Park, C. G.; Almo, S. C.; Palliser, D.; Levy, M. Mol. Ther. 2014, 22, 1375-1387
42. Lee, S. J.; Tatavarty, R.; Gu, M. B. Biosens. Bioelectron. 2012, 38, 302-307
43. Wang, Y.; Bao, L.; Liu, Z.; Pang, D.-W. Anal. Chem. 2011, 83, 8130-8137
44. Kang, Y.; Feng, K.-J.; Chen, J.-W.; Jiang, J.-H.; Shen, G.-L.; Yu, R.-Q. Bioelectrochemistry 2008, 73, 76-81
45. Tasset, D. M.; Kubik, M. F.; Steiner, W. J. Mol. Biol. 1997, 272, 688-698
46. Zhang, H.; Li, X.-F.; Le, X. C. Anal. Chem. 2009, 81, 7795-7800
47. Dick, L. W.; McGown, L. B. Anal. Chem. 2004, 76, 3037-3041
48. Connor, A. C.; McGown, L. B. J. Chromatogr. A 2006, 1111, 115-119
49. Zhang, X.; Zhu, S.; Deng, C.; Zhang, X. Talanta 2012, 88, 295-302
50. Zhang, X.; Zhu, S.; Xiong, Y.; Deng, C.; Zhang, X. Angew. Chem., Int. Ed. 2013, 52, 6055-6058
51. Song, M.; Zhang, Y.; Li, T.; Wang, Z.; Yin, J.; Wang, H. J. Chromatogr. A 2009, 1216, 873-878
52. Davalos, D.; Baeten, K. M.; Whitney, M. A.; Mullins, E. S.; Friedman, B.; Olson, E. S.; Ryu, J. K.; Smirnoff, D. S.; Petersen, M. A.; Bedard, C.; Degen, J. L.; Tsien, R. Y.; Akassoglou, K. Ann. Neurol. 2014, n/a-n/a
53. Randall, D. R.; Colobong, K. E.; Hemmelgarn, H.; Sinclair, G. B.; Hetty, E.; Thomas, A.; Bodamer, O. A.; Volkmar, B.; Fernhoff, P. M.; Casey, R.; Chan, A. K.; Mitchell, G.; Stockler, S.; Melancon, S.; Rupar, T.; Clarke, L. A. Mol. Genet. Metab. 2008, 94, 456-461