A modular approach for assembling aldehyde-tagged proteins on DNA scaffolds

Journal of the American Chemical Society

Volumn 136, Issue 31, 2014, Pages 10850-10853

  Liang, Samantha I ^a   McFarland, Jesse M ^b   Rabuka, David ^b   Gartner, Zev J ^a  

^a UNIVERSITY OF CALIFORNIA   (United States)

^b Redwood Bioscience Inc   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ALDEHYDES; ANTIBODIES; DNA; OLIGONUCLEOTIDES; PROBES;

ANTIBODY FRAGMENT; BIOACTIVE PROTEINS; INTERNAL LOOPS; LIVE CELL; MODULAR APPROACH; SITE-SPECIFIC; SPATIAL RESOLUTION; SYSTEMATIC EXPLORATION;

SCAFFOLDS (BIOLOGY);

ALDEHYDE; DNA; OLIGODEOXYRIBONUCLEOTIDE; PROTEIN;

BINDING SITE; CHEMISTRY; ENZYME SPECIFICITY; HUMAN; METABOLISM; TUMOR CELL LINE;

ALDEHYDES; BINDING SITES; CELL LINE, TUMOR; DNA; HUMANS; OLIGODEOXYRIBONUCLEOTIDES; PROTEINS; SUBSTRATE SPECIFICITY;

EID: 84905695320     PISSN: 00027863     EISSN: 15205126     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ja504711n     Document Type: Article

References (31)

1. Pinheiro, A. V.; Han, D.; Shih, W. M.; Yan, H. Nat. Nanotechnol. 2011, 6, 763-772
2. Niemeyer, C. M. Angew. Chem., Int. Ed. 2010, 49, 1200-1216
3. Simmel, F. C. Curr. Opin. Biotechnol. 2012, 23, 516-521
4. Kazane, S. A.; Axup, J. Y.; Kim, C. H.; Ciobanu, M.; Wold, E. D.; Barluenga, S.; Hutchins, B. A.; Schultz, P. G.; Winssinger, N.; Smider, V. V. J. Am. Chem. Soc. 2013, 135, 340-346
5. Carter, P. J. Exp. Cell Res. 2011, 317, 1261-1269
6. Beck, A.; Wurch, T.; Bailly, C.; Corvaia, N. Nat. Rev. Immunol. 2010, 10, 345-352
7. Kontermann, R. MAbs 2012, 4, 182-197
8. Chari, R. V. J. Acc. Chem. Res. 2008, 41, 98-107
9. Alley, S. C.; Okeley, N. M.; Senter, P. D. Curr. Opin. Chem. Biol. 2010, 14, 529-537
10. Gautier, A.; Juillerat, A.; Heinis, C.; Corrêa, I. R.; Kindermann, M.; Beaufils, F.; Johnsson, K. Chem. Biol. 2008, 15, 128-136
11. Keppler, A.; Gendreizig, S.; Gronemeyer, T.; Pick, H.; Vogel, H.; Johnsson, K. Nat. Biotechnol. 2003, 21, 86-89
12. Los, G. V.; Encell, L. P.; McDougall, M. G.; Hartzell, D. D.; Karassina, N.; Zimprich, C.; Wood, M. G.; Learish, R.; Ohana, R. F.; Urh, M.; Simpson, D.; Mendez, J.; Zimmerman, K.; Otto, P.; Vidugiris, G.; Zhu, J.; Darzins, A.; Klaubert, D. H.; Bulleit, R. F.; Wood, K. V. ACS Chem. Biol. 2008, 3, 373-382
13. George, N.; Pick, H.; Vogel, H.; Johnsson, N.; Johnsson, K. J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 8896-8897
14. Chen, I.; Howarth, M.; Lin, W.; Ting, A. Y. Nat. Methods 2005, 2, 99-104
15. Lin, C.-W.; Ting, A. Y. J. Am. Chem. Soc. 2006, 128, 4542-4543
16. Antos, J. M.; Miller, G. M.; Grotenbreg, G. M.; Ploegh, H. L. J. Am. Chem. Soc. 2008, 130, 16338-16343
17. Fernández-Suárez, M.; Baruah, H.; Martínez- Hernández, L.; Xie, K. T.; Baskin, J. M.; Bertozzi, C. R.; Ting, A. Y. Nat. Biotechnol. 2007, 25, 1483-1487
18. Lovrinovic, M.; Spengler, M.; Deutsch, C.; Niemeyer, C. M. Mol. BioSyst. 2005, 1, 64-69
19. Carrico, I. S.; Carlson, B. L.; Bertozzi, C. R. Nat. Chem. Biol. 2007, 3, 321-322
20. Hudak, J. E.; Barfield, R. M.; de Hart, G. W.; Grob, P.; Nogales, E.; Bertozzi, C. R.; Rabuka, D. Angew. Chem., Int. Ed. 2012, 51, 4161-4165
21. Wu, P.; Shui, W.; Carlson, B. L.; Hu, N.; Rabuka, D.; Lee, J.; Bertozzi, C. R. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2009, 106, 3000-3005
22. Rabuka, D.; Rush, J. S.; deHart, G. W.; Wu, P.; Bertozzi, C. R. Nat. Protoc. 2012, 7, 1052-1067
23. Alley, S. C.; Benjamin, D. R.; Jeffrey, S. C.; Okeley, N. M.; Meyer, D. L.; Sanderson, R. J.; Senter, P. D. Bioconjugate Chem. 2008, 19, 759-765
24. Shen, B.-Q.; Xu, K.; Liu, L.; Raab, H.; Bhakta, S.; Kenrick, M.; Parsons-Reponte, K. L.; Tien, J.; Yu, S.-F.; Mai, E.; Li, D.; Tibbitts, J.; Baudys, J.; Saad, O. M.; Scales, S. J.; McDonald, P. J.; Hass, P. E.; Eigenbrot, C.; Nguyen, T.; Solis, W. A.; Fuji, R. N.; Flagella, K. M.; Patel, D.; Spencer, S. D.; Khawli, L. A.; Ebens, A.; Wong, W. L.; Vandlen, R.; Kaur, S.; Sliwkowski, M. X.; Scheller, R. H.; Polakis, P.; Junutula, J. R. Nat. Biotechnol. 2012, 30, 184-189
25. Agarwal, P.; van der Weijden, J.; Sletten, E. M.; Rabuka, D.; Bertozzi, C. R. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2013, 110, 46-51
26. Agarwal, P.; Kudirka, R.; Albers, A. E.; Barfield, R. M.; de Hart, G. W.; Drake, P. M.; Jones, L. C.; Rabuka, D. Bioconjugate Chem. 2013, 24, 846-851
27. Wang, W.; Hong, S.; Tran, A.; Jiang, H.; Triano, R.; Liu, Y.; Chen, X.; Wu, P. Chem.-Asian J. 2011, 6, 2796-2802
28. Duriseti, S.; Goetz, D. H.; Hostetter, D. R.; LeBeau, A. M.; Wei, Y.; Craik, C. S. J. Biol. Chem. 2010, 285, 26878-26888
29. Lund, I. K.; Illemann, M.; Thurison, T.; Christensen, I. J.; Høyer-Hansen, G. Curr. Drug Targets 2011, 12, 1744-1760
30. Sa-Ardyen, P.; Vologodskii, A. V.; Seeman, N. C. Biophys. J. 2003, 84, 3829-3837
31. Zheng, J.; Lukeman, P. S.; Sherman, W. B.; Micheel, C.; Alivisatos, A. P.; Constantinou, P. E.; Seeman, N. C. Biophys. J. 2008, 95, 3340-3348