SCOPUS 정보 검색 플랫폼

Molecular BioSystems

Volumn 10, Issue 8, 2014, Pages 2247-2258

Uncovering allosteric pathways in caspase-1 using Markov transient analysis and multiscale community detection

(4) Amor, B a Yaliraki, S N a Woscholski, R a Barahona, M a

a IMPERIAL COLLEGE LONDON (United Kingdom)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

INTERLEUKIN 1BETA CONVERTING ENZYME;

ALLOSTERISM; BINDING SITE; BIOLOGY; CHEMICAL STRUCTURE; CHEMISTRY; ENZYME ACTIVE SITE; HUMAN; PROBABILITY; PROCEDURES; SIGNAL TRANSDUCTION;

ALLOSTERIC REGULATION; ALLOSTERIC SITE; CASPASE 1; CATALYTIC DOMAIN; COMPUTATIONAL BIOLOGY; HUMANS; MARKOV CHAINS; MODELS, MOLECULAR; SIGNAL TRANSDUCTION;

EID: 84903752906 PISSN: 1742206X EISSN: 17422051 Source Type: Journal
DOI: 10.1039/c4mb00088a Document Type: Article

Times cited : (32)

References (45)

1
- 48249141040
- Q. Cui M. Karplus Protein Sci. 2008 17 1295 1307
- (2008) Protein Sci. , vol.17 , pp. 1295-1307
- Cui, Q.¹ Karplus, M.²

2
- 0013863816
- D. Koshland Jr G. Nemethy D. Filmer Biochemistry 1966 5 365 385
- (1966) Biochemistry , vol.5 , pp. 365-385
- Koshland Jr., D.¹ Nemethy, G.² Filmer, D.³

3
- 78651189765
- J. Monod J. Wyman J. Changeux J. Mol. Biol. 1965 12 88 118
- (1965) J. Mol. Biol. , vol.12 , pp. 88-118
- Monod, J.¹ Wyman, J.² Changeux, J.³

4
- 32344434479
- J. Swain L. Gierasch Curr. Opin. Struct. Biol. 2006 16 102 108
- (2006) Curr. Opin. Struct. Biol. , vol.16 , pp. 102-108
- Swain, J.¹ Gierasch, L.²

5
- 6344219895
- K. Gunasekaran B. Ma R. Nussinov Proteins: Struct., Funct., Bioinf. 2004 57 433 443
- (2004) Proteins: Struct., Funct., Bioinf. , vol.57 , pp. 433-443
- Gunasekaran, K.¹ Ma, B.² Nussinov, R.³

6
- 0021658956
- A. Cooper D. Dryden Eur. Biophys. J. 1984 11 103 109
- (1984) Eur. Biophys. J. , vol.11 , pp. 103-109
- Cooper, A.¹ Dryden, D.²

7
- 33748363077
- N. Popovych S. Sun R. Ebright C. Kalodimos Nat. Struct. Mol. Biol. 2006 13 831 838
- (2006) Nat. Struct. Mol. Biol. , vol.13 , pp. 831-838
- Popovych, N.¹ Sun, S.² Ebright, R.³ Kalodimos, C.⁴

8
- 37249032102
- K. Henzler-Wildman D. Kern Nature 2007 450 964 972
- (2007) Nature , vol.450 , pp. 964-972
- Henzler-Wildman, K.¹ Kern, D.²

9
- 79951681020
- P. Zhuravlev G. Papoian Q. Rev. Biophys. 2010 43 295 332
- (2010) Q. Rev. Biophys. , vol.43 , pp. 295-332
- Zhuravlev, P.¹ Papoian, G.²

10
- 68149157248
- A. del Sol C. Tsai B. Ma R. Nussinov Structure 2009 17 1042 1050
- (2009) Structure , vol.17 , pp. 1042-1050
- Del Sol, A.¹ Tsai, C.² Ma, B.³ Nussinov, R.⁴

11
- 0033536602
- S. Lockless R. Ranganathan Science 1999 286 295 299
- (1999) Science , vol.286 , pp. 295-299
- Lockless, S.¹ Ranganathan, R.²

12
- 0347753736
- E. Fuentes C. Der A. Lee J. Mol. Biol. 2004 335 1105 1115
- (2004) J. Mol. Biol. , vol.335 , pp. 1105-1115
- Fuentes, E.¹ Der, C.² Lee, A.³

13
- 33750795402
- E. Fuentes S. Gilmore R. Mauldin A. Lee J. Mol. Biol. 2006 364 337 351
- (2006) J. Mol. Biol. , vol.364 , pp. 337-351
- Fuentes, E.¹ Gilmore, S.² Mauldin, R.³ Lee, A.⁴

14
- 58949102247
- Y. Kong M. Karplus Proteins: Struct., Funct., Bioinf. 2009 74 145 154
- (2009) Proteins: Struct., Funct., Bioinf. , vol.74 , pp. 145-154
- Kong, Y.¹ Karplus, M.²

15
- 22444450449
- N. Ota D. Agard J. Mol. Biol. 2005 351 345 354
- (2005) J. Mol. Biol. , vol.351 , pp. 345-354
- Ota, N.¹ Agard, D.²

16
- 33646922285
- V. Hilser E. Bertrand García-Moreno T. Oas G. Kapp S. Whitten Chem. Rev. 2006 106 1545 1558
- (2006) Chem. Rev. , vol.106 , pp. 1545-1558
- Hilser, V.¹ Bertrand García-Moreno, E.² Oas, T.³ Kapp, G.⁴ Whitten, S.⁵

17
- 0034710950
- H. Pan J. Lee V. Hilser Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2000 97 12020
- (2000) Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. , vol.97 , pp. 12020
- Pan, H.¹ Lee, J.² Hilser, V.³

18
- 33745461893
- A. Del Sol H. Fujihashi D. Amoros R. Nussinov Mol. Syst. Biol. 2006 2 19
- (2006) Mol. Syst. Biol. , vol.2 , pp. 19
- Del Sol, A.¹ Fujihashi, H.² Amoros, D.³ Nussinov, R.⁴

19
- 34548815693
- A. Del Sol M. Araúzo-Bravo D. Amoros R. Nussinov Genome Biol. 2007 8 R92
- (2007) Genome Biol. , vol.8 , pp. 92
- Del Sol, A.¹ Araúzo-Bravo, M.² Amoros, D.³ Nussinov, R.⁴

20
- 66149086947
- A. Sethi J. Eargle A. Black Z. Luthey-Schulten Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2009 106 6620
- (2009) Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. , vol.106 , pp. 6620
- Sethi, A.¹ Eargle, J.² Black, A.³ Luthey-Schulten, Z.⁴

21
- 35648944297
- A. Ghosh S. Vishveshwara Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2007 104 15711
- (2007) Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. , vol.104 , pp. 15711
- Ghosh, A.¹ Vishveshwara, S.²

22
- 84903790121
- C. Chennubhotla I. Bahar PLoS Comput. Biol. 2007 3 e172
- (2007) PLoS Comput. Biol. , vol.3 , pp. 172
- Chennubhotla, C.¹ Bahar, I.²

23
- 79951518651
- K. Park D. Kim BMC Bioinf. 2011 12 S23
- (2011) BMC Bioinf. , vol.12 , pp. 23
- Park, K.¹ Kim, D.²

24
- 73549086114
- H. Lu J. Liang PLoS Comput. Biol. 2009 5 e1000526
- (2009) PLoS Comput. Biol. , vol.5 , pp. 1000526
- Lu, H.¹ Liang, J.²

25
- 33749055796
- C. Chennubhotla I. Bahar Mol. Syst. Biol. 2006 2 36
- (2006) Mol. Syst. Biol. , vol.2 , pp. 36
- Chennubhotla, C.¹ Bahar, I.²

26
- 77955641547
- J. Delvenne S. Yaliraki M. Barahona Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2010 107 12755 12760
- (2010) Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. , vol.107 , pp. 12755-12760
- Delvenne, J.¹ Yaliraki, S.² Barahona, M.³

27
- 33745012299
- M. E. Newman Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2006 103 8577 8582
- (2006) Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. , vol.103 , pp. 8577-8582
- Newman, M.E.¹

28
- 33846126275
- S. Fortunato M. Barthelemy Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2007 104 36 41
- (2007) Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. , vol.104 , pp. 36-41
- Fortunato, S.¹ Barthelemy, M.²

29
- 84857539615
- M. T. Schaub J.-C. Delvenne S. N. Yaliraki M. Barahona PLoS One 2012 7 e32210
- (2012) PLoS One , vol.7 , pp. 32210
- Schaub, M.T.¹ Delvenne, J.-C.² Yaliraki, S.N.³ Barahona, M.⁴

30
- 33646727594
- J. Scheer M. Romanowski J. Wells Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2006 103 7595 7600
- (2006) Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. , vol.103 , pp. 7595-7600
- Scheer, J.¹ Romanowski, M.² Wells, J.³

31
- 48749120889
- D. Datta J. Scheer M. Romanowski J. Wells J. Mol. Biol. 2008 381 1157 1167
- (2008) J. Mol. Biol. , vol.381 , pp. 1157-1167
- Datta, D.¹ Scheer, J.² Romanowski, M.³ Wells, J.⁴

32
- 0025108763
- P. Sleath R. Hendrickson S. Kronheim C. March R. Black J. Biol. Chem. 1990 265 14526 14528
- (1990) J. Biol. Chem. , vol.265 , pp. 14526-14528
- Sleath, P.¹ Hendrickson, R.² Kronheim, S.³ March, C.⁴ Black, R.⁵

33
- 54249096028
- J. Li J. Yuan Oncogene 2008 27 6194 6206
- (2008) Oncogene , vol.27 , pp. 6194-6206
- Li, J.¹ Yuan, J.²

34
- 0028170376
- K. Wilson J. Black J. Thomson E. Kim J. Griffith M. Navia M. Murcko S. Chambers R. Aldape S. Raybuck et al. Nature 1994 370 270 275
- (1994) Nature , vol.370 , pp. 270-275
- Wilson, K.¹ Black, J.² Thomson, J.³ Kim, E.⁴ Griffith, J.⁵ Navia, M.⁶ Murcko, M.⁷ Chambers, S.⁸ Aldape, R.⁹ Raybuck, S.¹⁰

35
- 4143096903
- M. Romanowski J. Scheer T. O'Brien R. McDowell Structure 2004 12 1361 1371
- (2004) Structure , vol.12 , pp. 1361-1371
- Romanowski, M.¹ Scheer, J.² O'Brien, T.³ McDowell, R.⁴

36
- 0033954256
- H. Berman J. Westbrook Z. Feng G. Gilliland T. Bhat H. Weissig I. Shindyalov P. Bourne Nucleic Acids Res. 2000 28 235 242
- (2000) Nucleic Acids Res. , vol.28 , pp. 235-242
- Berman, H.¹ Westbrook, J.² Feng, Z.³ Gilliland, G.⁴ Bhat, T.⁵ Weissig, H.⁶ Shindyalov, I.⁷ Bourne, P.⁸

37
- 80052687731
- A. Delmotte E. Tate S. Yaliraki M. Barahona Phys. Biol. 2011 8 055010
- (2011) Phys. Biol. , vol.8 , pp. 055010
- Delmotte, A.¹ Tate, E.² Yaliraki, S.³ Barahona, M.⁴

38
- 0033614004
- J. M. Word S. C. Lovell J. S. Richardson D. C. Richardson J. Mol. Biol. 1999 285 1735 1747
- (1999) J. Mol. Biol. , vol.285 , pp. 1735-1747
- Word, J.M.¹ Lovell, S.C.² Richardson, J.S.³ Richardson, D.C.⁴

39
- 0035427398
- D. Jacobs A. Rader L. Kuhn M. Thorpe Proteins: Struct., Funct., Bioinf. 2001 44 150 165
- (2001) Proteins: Struct., Funct., Bioinf. , vol.44 , pp. 150-165
- Jacobs, D.¹ Rader, A.² Kuhn, L.³ Thorpe, M.⁴

40
- 9144240095
- S. Mayo B. Olafson W. Goddard J. Phys. Chem. 1990 94 8897 8909
- (1990) J. Phys. Chem. , vol.94 , pp. 8897-8909
- Mayo, S.¹ Olafson, B.² Goddard, W.³

41
- 56349094785
- V. Blondel J. Guillaume R. Lambiotte E. Lefebvre J. Stat. Mech.: Theory Exp. 2008 2008 P10008
- (2008) J. Stat. Mech.: Theory Exp. , vol.2008 , pp. 10008
- Blondel, V.¹ Guillaume, J.² Lambiotte, R.³ Lefebvre, E.⁴

42
- 43049089442
- B. Karrer E. Levina M. Newman Phys. Rev. E: Stat., Nonlinear, Soft Matter Phys. 2008 77 046119
- (2008) Phys. Rev. E: Stat., Nonlinear, Soft Matter Phys. , vol.77 , pp. 046119
- Karrer, B.¹ Levina, E.² Newman, M.³

43
- 33947156744
- M. Meila Journal of Multivariate Analysis 2007 98 873 895
- (2007) Journal of Multivariate Analysis , vol.98 , pp. 873-895
- Meila, M.¹

44
- 25444448065
- MIT Press
- C. E. Rasmussen, Gaussian processes for machine learning, MIT Press, 2006
- (2006) Gaussian Processes for Machine Learning
- Rasmussen, C.E.¹

45
- 84875990947
- D. Datta C. L. McClendon M. P. Jacobson J. A. Wells J. Biol. Chem. 2013 288 9971 9981
- (2013) J. Biol. Chem. , vol.288 , pp. 9971-9981
- Datta, D.¹ McClendon, C.L.² Jacobson, M.P.³ Wells, J.A.⁴

* 이 정보는 Elsevier사의 SCOPUS DB에서 KISTI가 분석하여 추출한 것입니다.