Differentially instructive extracellular protein micro-nets

Journal of the American Chemical Society

Volumn 136, Issue 22, 2014, Pages 7889-7898

  Faruqui, Nilofar ^a   Bella, Angelo ^a   Ravi, Jascindra ^a   Ray, Santanu ^a   Lamarre, Baptiste ^a   Ryadnov, Maxim G ^a,b  

^a NATIONAL PHYSICAL LABORATORY   (United Kingdom)

^b UNIVERSITY OF EDINBURGH   (United Kingdom)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

BIOLOGICAL MATERIALS; CELL ADHESION; SELF ASSEMBLY;

APPLICATION MODELING; BIOLOGICAL MATTER; BIOLOGICAL PERFORMANCE; BIOPHYSICAL MODEL; DIFFERENTIAL RESPONSE; EFFICIENT STRATEGY; EXTRACELLULAR MATRICES; EXTRACELLULAR PROTEINS;

PROTEINS;

CELL PROTEIN; LIPOSOME; PEPTIDE; SCLEROPROTEIN;

ARTICLE; BACILLUS SUBTILIS; BACTERIAL CELL; BACTERIAL COLONIZATION; CELL ADHESION; CELL PROLIFERATION; CONTROLLED STUDY; ESCHERICHIA COLI; EXTRACELLULAR MATRIX; HUMAN; HUMAN CELL; MAMMAL CELL; MORPHOLOGY; NONHUMAN; PROTEIN FOLDING; PSEUDOMONAS AERUGINOSA; BACTERIUM; CHEMICAL STRUCTURE; CHEMISTRY; CYCLIZATION; CYTOSKELETON; DRUG EFFECTS; FIBROBLAST; GROWTH, DEVELOPMENT AND AGING; HEMOLYSIS; IN VITRO STUDY; METABOLISM; PROTEIN CONFORMATION; SYNTHESIS; ULTRASTRUCTURE;

BACTERIA; CELL ADHESION; CELL PROLIFERATION; CYCLIZATION; CYTOSKELETON; EXTRACELLULAR MATRIX PROTEINS; FIBROBLASTS; HEMOLYSIS; HUMANS; IN VITRO TECHNIQUES; LIPOSOMES; MODELS, MOLECULAR; PEPTIDES; PROTEIN CONFORMATION; PROTEIN FOLDING;

EID: 84901921572     PISSN: 00027863     EISSN: 15205126     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ja411325c     Document Type: Article

References (55)

1. Huebsch, N.; Mooney, D. J. Nature 2009, 462, 426
2. Kopeček, J.; Yang, J. Angew. Chem., Int. Ed. 2012, 51, 7396
3. Papapostolou, D.; Smith, A. M.; Atkins, E. D. T.; Oliver, S. J.; Ryadnov, M. G.; Serpell, L. C.; Woolfson, D. N. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2007, 104, 10853
4. Ryadnov, M. G.; Woolfson, D. N. Angew. Chem., Int. Ed. 2003, 42, 3021
5. Brown, A. E.; Litvinov, R. I.; Discher, D. E.; Purohit, P. K.; Weisel, J. W. Science 2009, 325, 741
6. Ryadnov, M. G.; Woolfson, D. N. J. Am. Chem. Soc. 2005, 127, 12407
7. Luo, Z.; Zhang, S. Chem. Soc. Rev. 2012, 41, 4736
8. Mager, M. D.; LaPointe, V.; Stevens, M. M. Nat. Chem. 2011, 3, 582
9. Hirst, A. R.; Roy, S.; Arora, M.; Das, A. K.; Hodson, N.; Murray, P.; Marshall, S.; Javid, N.; Sefcik, J.; Boekhoven, J.; van Esch, J. H.; Santabarbara, S.; Hunt, N. T.; Ulijn, R. V. Nat. Chem. 2010, 2, 1089
10. O'Leary, L. E. R.; Fallas, J. A.; Bakota, E. L.; Kang, M. K.; Hartgerink, J. D. Nat. Chem. 2011, 3, 821
11. Stephanopoulos, N.; Ortony, J. H.; Stupp, S. I. Acta Mater. 2013, 61, 912
12. Seeman, N. C. Annu. Rev. Biochem. 2010, 79, 65
13. Yin, P.; Hariadi, R. F.; Sahu, S.; Choi, H. M. T.; Park, S. H.; LaBean, T. H.; Reif, J. H. Science 2008, 321, 824
14. Aldaye, F. A.; Senapedis, W. T.; Silver, P. A.; Way, J. C. J. Am. Chem. Soc. 2010, 132, 14727
15. Chu, H.; Pazgier, M.; Jung, G.; Nuccio, S. P.; Castillo, P. A.; de Jong, M. F.; Winter, M. G.; Winter, S. E.; Wehkamp, J.; Shen, B.; Salzman, N. H.; Underwood, M. A.; Tsolis, R. M.; Young, G. M.; Lu, W.; Lehrer, R. I.; Bäumler, A. J.; Bevins, C. L. Science 2012, 337, 477
16. Marsden, H. R.; Kros, A. Angew. Chem., Int. Ed. 2010, 49, 2988
17. Ryadnov, M. G.; Bella, A.; Timson, S.; Woolfson, D. N. J. Am. Chem. Soc. 2009, 131, 13240
18. Bella, A.; Ray, S.; Shaw, M.; Ryadnov, M. G. Angew. Chem., Int. Ed. 2012, 51, 428
19. Pomerantz, W. C.; Yuwono, V. M.; Drake, R.; Hartgerink, J. D.; Abbott, N. L.; Gellman, S. H. J. Am. Chem. Soc. 2011, 133, 13604
20. Corrigan, A. M.; Muller, C.; Krebs, M. R. J. Am. Chem. Soc. 2005, 128, 14740
21. Sawaya, M. R.; Sambashivan, S.; Nelson, R.; Ivanova, M. I.; Sievers, S. A.; Apostol, M. I.; Thompson, M. J.; Balbirnie, M.; Wiltzius, J. J.; McFarlane, H. T.; Madsen, A. Ø.; Riekel, C.; Eisenberg, D. Nature 2007, 447, 453
22. Morrisett, J. D.; Jackson, R. L.; Gotto, A. M., Jr. Biochim. Biophys. Acta 1977, 472, 93
23. Ryadnov, M. G.; Ceyhan, B.; Niemeyer, C. M.; Woolfson, D. N. J. Am. Chem. Soc. 2003, 125, 9388
24. Pichot, V.; Risse, B.; Schnell, F.; Mory, J.; Spitzer, D. Sci. Rep. 2013, 3, 2159
25. Han, T.-H.; Park, J.-S.; Oh, J.-K.; Kim, S. O. J. Nanosci. Nanotechnol. 2008, 8, 5547
26. O'Shea, E. K.; Klemm, J. D.; Kim, P. S.; Alber, T. Science 1991, 254, 539
27. Offer, G.; Sessions, R. J. Mol. Biol. 1995, 249, 967
28. Enkhbayar, P.; Hikichi, K.; Osaki, M.; Kretsinger, R. H.; Matsushima, N. Proteins 2006, 64, 691
29. Höök, F.; Rodahl, M.; Brzezinski, P.; Kasemo, B. Langmuir 1998, 14, 729
30. Buell, A. K.; Dobson, C. M.; Welland, M. E. Methods Mol. Biol. 2012, 849, 101
31. Paul, S.; Paul, D.; Basova, T.; Ray, A. K. J. Phys. Chem. C 2008, 112, 11822
32. Geraldo, S.; Gordon-Weeks, P. R. J. Cell Sci. 2009, 122, 3595
33. Schäfer, C.; Borm, B.; Born, S.; Möhl, C.; Eibl, E. M.; Hoffmann, B. Exp. Cell Res. 2009, 315, 1212
34. Discher, D. E.; Mooney, D. J.; Zandstra, P. W. Science 2009, 324, 1673
35. Balasubramanian, L.; Yip, K. P.; Hsu, T. H.; Lo, C. M. Am. J. Physiol. Cell Physiol. 2008, 295, C954
36. Giaever, I.; Keese, C. R. Nature 1993, 366, 591
37. Atienza, J. M.; Zhu, J.; Wang, X.; Xu, X.; Abassi, Y. J. Biomol. Screen. 2005, 10, 795
38. Hicks, M. R.; Kowalski, J.; Rodger, A. Chem. Soc. Rev. 2010, 39, 3380
39. Rakowska, P. D.; Jiang, H.; Ray, S.; Pyne, A.; Lamarre, B.; Carr, M.; Judge, P. J.; Ravi, J.; Gerling, U. I.; Koksch, B.; Martyna, G. J.; Hoogenboom, B. W.; Watts, A.; Crain, J.; Grovenor, C. R.; Ryadnov, M. G. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2013, 110, 8918
40. Hall-Stoodley, L.; Costerton, J. W.; Stoodley, P. Nat. Rev. Microbiol. 2004, 2, 95
41. Liang, M. N.; Smith, S. P.; Metallo, S. J.; Choi, I. S.; Prentiss, M.; Whitesides, G. M. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2000, 97, 13092
42. Hasan, J.; Crawford, R. J.; Ivanova, E. P. Trends Biotechnol. 2013, 31, 295
43. Hook, A. L.; Chang, C. Y.; Yang, J.; Luckett, J.; Cockayne, A.; Atkinson, S.; Mei, Y.; Bayston, R.; Irvine, D. J.; Langer, R.; Anderson, D. G.; Williams, P.; Davies, M. C.; Alexander, M. R. Nat. Biotechnol. 2012, 30, 868
44. Li, Y.; Fukushima, K.; Coady, D. J.; Engler, A. C.; Liu, S.; Huang, Y.; Cho, J. S.; Guo, Y.; Miller, L. S.; Tan, J. P.; Ee, P. L.; Fan, W.; Yang, Y. Y.; Hedrick, J. L. Angew. Chem., Int. Ed. 2013, 52, 674
45. Ostuni, E.; Chapman, R. G.; Liang, M. N.; Meluleni, G. P.; Pier, G.; Ingber, D. E.; Whitesides, G. M. Langmuir 2001, 17, 6336
46. Cheng, G.; Li, G.; Xue, H.; Chen, S.; Bryers, J. D.; Jiang, S. Biomaterials 2009, 30, 5234
47. Chapman, R. G.; Ostuni, E.; Liang, M. N.; Meluleni, G.; Kim, E.; Yan, L.; Pier, G.; Warren, H. S.; Whitesides, G. M. Langmuir 2001, 17, 1225
48. Luk, Y.-Y.; Kato, M.; Mrksich, M. Langmuir 2000, 16, 9604
49. Harder, P.; Grunze, M.; Dahint, R.; Whitesides, G. M.; Laibinis, P. E. J. Phys. Chem. B 1998, 102, 426
50. Salick, D. A.; Kretsinger, J. K.; Pochan, D. J.; Schneider, J. P. J. Am. Chem. Soc. 2007, 129, 14793
51. Shai, Y. Biopolymers 2012, 66, 236
52. Stallaert, W.; Dorn, J. F.; van der Westhuizen, E.; Audet, M.; Bouvier, M. PloS One 2007, 7, e29420
53. Statz, A. R.; Park, J. P.; Chongsiriwatana, N. P.; Barron, A. E.; Messersmith, P. B. Biofouling 2008, 24, 439
54. Grinnell, F.; Feld, M. K. Cell 1979, 17, 117-129
55. Jiang, H.; Grinnell, F. Mol. Biol. Cell 2005, 16, 5070-5076