An oligonucleotide-based label-free luminescent switch-on probe for RNA detection utilizing a G-quadruplex-selective iridium(iii) complex

Nanoscale

Volumn 6, Issue 15, 2014, Pages 8489-8494

  Ma, Dik Lung ^a   Lin, Sheng ^a   Leung, Ka Ho ^a   Zhong, Hai Jing ^b   Liu, Li Juan ^b   Chan, Daniel Shiu Hin ^a   Bourdoncle, Anne ^c,e   Mergny, Jean Louis ^c,d   Wang, Hui Min David ^f   Leung, Chung Hang ^b  

^a HONG KONG BAPTIST UNIVERSITY   (Hong Kong)

^b China Macau University of Science and Technology Zhuhai MUST Science and Technology Research Institute   (Macao)

^c UNIVERSITÉ DE BORDEAUX   (France)

^d INSERM U869   (France)

^e UNIVERSITÉ DE POITIERS   (France)

^f KAOHSIUNG MEDICAL UNIVERSITY   (Taiwan)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

OLIGONUCLEOTIDES; RNA;

IRIDIUM COMPLEX; LABEL FREE; RNA DETECTION; SWITCH-ON;

LUMINESCENCE;

GUANINE QUADRUPLEX; IRIDIUM; MICRORNA; OLIGONUCLEOTIDE; RNA; SINGLE STRANDED DNA;

BINDING SITE; CHEMISTRY; GENETIC PROCEDURES; HUMAN; LUMINESCENCE; MUTATION; NANOTECHNOLOGY; PROCEDURES; TEMPERATURE;

BINDING SITES; BIOSENSING TECHNIQUES; DNA, SINGLE-STRANDED; G-QUADRUPLEXES; HUMANS; IRIDIUM; LUMINESCENCE; LUMINESCENT MEASUREMENTS; MICRORNAS; MUTATION; NANOTECHNOLOGY; OLIGONUCLEOTIDES; RNA; TEMPERATURE;

EID: 84901635101     PISSN: 20403364     EISSN: 20403372     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/c4nr00541d     Document Type: Article

References (73)

1. C. M. Croce Nat. Rev. Genet. 2009 10 704
2. J. Jiang E. J. Lee Y. Gusev T. D. Schmittgen Nucleic Acids Res. 2005 33 5394
3. A. W. Wark H. J. Lee R. M. Corn Angew. Chem., Int. Ed. 2008 47 644
4. L. Levinger M. Mörl C. Florentz Nucleic Acids Res. 2004 32 5430
5. P. Conforti C. Ramos B. L. Apostol D. A. Simmons H. P. Nguyen O. Riess L. M. Thompson C. Zuccato E. Cattaneo Mol. Cell. Neurosci. 2008 39 1
6. T. M. Wheeler C. A. Thornton Curr. Opin. Neurol. 2007 20 572
7. G. S. Pall C. Codony-Servat J. Byrne L. Ritchie A. Hamilton Nucleic Acids Res. 2007 35 e60
8. P. T. Nelson D. A. Baldwin L. M. Scearce J. C. Oberholtzer J. W. Tobias Z. Mourelatos Nat. Methods 2004 1 155
9. J. Li B. Yao H. Huang Z. Wang C. Sun Y. Fan Q. Chang S. Li X. Wang J. Xi Anal. Chem. 2009 81 5446
10. C. K. Raymond B. S. Roberts P. Garrett-Engele L. P. Lim J. M. Johnson RNA 2005 11 1737
11. E. M. Harcourt E. T. Kool Nucleic Acids Res. 2012 40 e65
12. H. Dong J. Zhang H. Ju H. Lu S. Wang S. Jin K. Hao H. Du X. Zhang Anal. Chem. 2012 84 4587
13. Y.-Q. Liu M. Zhang B.-C. Yin B.-C. Ye Anal. Chem. 2012 84 5165
14. Y. Tu W. Li P. Wu H. Zhang C. Cai Anal. Chem. 2013 85 2536
15. P. Shah A. Rørvig-Lund S. B. Chaabane P. W. Thulstrup H. G. Kjaergaard E. Fron J. Hofkens S. W. Yang T. Vosch ACS Nano 2012 6 8803
16. L. Cui Z. Chen Z. Zhu X. Lin X. Chen C. J. Yang Anal. Chem. 2013 85 2269
17. Y. Tu P. Wu H. Zhang C. Cai Chem. Commun. 2012 48 10718
18. B.-C. Yin Y.-Q. Liu B.-C. Ye J. Am. Chem. Soc. 2012 134 5064
19. Y. Wen Y. Xu X. Mao Y. Wei H. Song N. Chen Q. Huang C. Fan D. Li Anal. Chem. 2012 84 7664
20. H. Dong S. Jin H. Ju K. Hao L.-P. Xu H. Lu X. Zhang Anal. Chem. 2012 84 8670
21. H. Dong J. Lei L. Ding Y. Wen H. Ju X. Zhang Chem. Rev. 2013 113 6207
22. Z. Chen K.-w. Zheng Y.-h. Hao Z. Tan J. Am. Chem. Soc. 2009 131 10430
23. S. Neidle Curr. Opin. Struct. Biol. 2009 19 239
24. Y. Zhao Z.-y. Kan Z.-x. Zeng Y.-h. Hao H. Chen Z. Tan J. Am. Chem. Soc. 2004 126 13255
25. Y. Xue Z.-y. Kan Q. Wang Y. Yao J. Liu Y.-h. Hao Z. Tan J. Am. Chem. Soc. 2007 129 11185
26. Y. Krishnan-Ghosh D. Liu S. Balasubramanian J. Am. Chem. Soc. 2004 126 11009
27. Y. Krishnan F. C. Simmel Angew. Chem., Int. Ed. 2011 50 3124
28. S. Pitchiaya Y. Krishnan Chem. Soc. Rev. 2006 35 1111
29. B. Y.-W. Man D. S.-H. Chan H. Yang S.-W. Ang F. Yang S.-C. Yan C.-M. Ho P. Wu C.-M. Che C.-H. Leung D.-L. Ma Chem. Commun. 2010 46 8534
30. D.-L. Ma D. S.-H. Chan B. Y.-W. Man C.-H. Leung Chem.-Asian. J. 2011 6 986
31. K. Qu C. Zhao J. Ren X. Qu Mol. BioSyst. 2012 8 779
32. H.-Z. He H. Yang D. S.-H. Chan C.-H. Leung J. Zhou A. Bourdoncle J.-L. Mergny D.-L. Ma Biosens. Bioelectron. 2013 41 871
33. H.-Z. He D. S.-H. Chan C.-H. Leung D.-L. Ma Chem. Commun. 2012 48 9462 9464
34. D.-L. Ma H.-Z. He K.-H. Leung H.-J. Zhong D. S.-H. Chan C.-H. Leung Chem. Soc. Rev. 2013 42 3427
35. C. Zhao L. Wu J. Ren X. Qu Chem. Commun. 2011 47 5461
36. H.-Z. He D. S.-H. Chan C.-H. Leung D.-L. Ma Nucleic Acids Res. 2013 41 4345
37. S. Deng L. Cheng J. Lei Y. Cheng Y. Huang H. Ju Nanoscale 2013 5 5435
38. Y. Peng X. Wang Y. Xiao L. Feng C. Zhao J. Ren X. Qu J. Am. Chem. Soc. 2009 131 13813
39. Z. Chen Y. Lin C. Zhao J. Ren X. Qu Chem. Commun. 2012 48 11428
40. C. Wang J. Wu C. Zong H. Ju F. Yan Analyst 2011 136 4295
41. H.-Z. He V. P.-Y. Ma K.-H. Leung D. S.-H. Chan H. Yang Z. Cheng C.-H. Leung D.-L. Ma Analyst 2012 137 1538
42. K.-H. Leung H.-Z. He V. P.-Y. Ma D. S.-H. Chan C.-H. Leung D.-L. Ma Chem. Commun. 2013 49 771
43. D. Lin J. Wu F. Yan S. Deng H. Ju Anal. Chem. 2011 83 5214
44. M. Yin Z. Li Z. Liu J. Ren X. Yang X. Qu Chem. Commun. 2012 48 6556
45. X. Su X. Zhu C. Zhang X. Xiao M. Zhao Anal. Chem. 2012 84 5059
46. X. Su C. Zhang X. Zhu S. Fang R. Weng X. Xiao M. Zhao Anal. Chem. 2013 85 9939
47. D. Hu Z. Huang F. Pu J. Ren X. Qu Chem.-Eur. J. 2011 17 1635
48. C.-H. Leung H.-J. Zhong H.-Z. He L. Lu D. S.-H. Chan D.-L. Ma Chem. Sci. 2013 4 3781
49. K.-H. Leung H.-Z. He V. P.-Y. Ma H.-J. Zhong D. S.-H. Chan J. Zhou J.-L. Mergny C.-H. Leung D.-L. Ma Chem. Commun. 2013 49 5630
50. K.-H. Leung H.-Z. He W. Wang H.-J. Zhong D. S.-H. Chan C.-H. Leung D.-L. Ma ACS Appl. Mater. Interfaces 2013 23 12249
51. H.-Z. He K.-H. Leung W. Wang D. S.-H. Chan C.-H. Leung D.-L. Ma Chem. Commun. 2014 50 5313
52. Q. Zhao F. Li C. Huang Chem. Soc. Rev. 2010 39 3007
53. Q. Zhao T. Cao F. Li X. Li H. Jing T. Yi C. Huang Organometallics 2007 26 2077
54. J. Liu Y. Liu Q. Liu C. Li L. Sun F. Li J. Am. Chem. Soc. 2011 133 15276
55. M. R. Gill J. A. Thomas Chem. Soc. Rev. 2012 41 3179
56. V. Gonzalez T. Wilson I. Kurihara A. Imai J. A. Thomas J. Otsuki Chem. Commun. 2008 1868
57. Y. Yang Q. Zhao W. Feng F. Li Chem. Rev. 2012 113 192
58. Q. Zhao C. Huang F. Li Chem. Soc. Rev. 2011 40 2508
59. C. Li M. Yu Y. Sun Y. Wu C. Huang F. Li J. Am. Chem. Soc. 2011 133 11231
60. C. Metcalfe J. A. Thomas Chem. Soc. Rev. 2003 32 215
61. D. Monchaud C. Allain H. Bertrand N. Smargiasso F. Rosu V. Gabelica A. De Cian J. L. Mergny M. P. Teulade-Fichou Biochimie 2008 90 1207
62. F. Hamon E. Largy A. Guédin-Beaurepaire M. Rouchon-Dagois A. Sidibe D. Monchaud J.-L. Mergny J.-F. Riou C.-H. Nguyen M.-P. Teulade-Fichou Angew. Chem., Int. Ed. 2011 50 8745
63. X. Cheng X. Liu T. Bing Z. Cao D. Shangguan Biochemistry 2009 48 7817
64. B. Jin X. Zhang W. Zheng X. Liu C. Qi F. Wang D. Shangguan Anal. Chem. 2013 86 943
65. J. Seenisamy S. Bashyam V. Gokhale H. Vankayalapati D. Sun A. Siddiqui-Jain N. Streiner K. Shin-ya E. White W. D. Wilson L. H. Hurley J. Am. Chem. Soc. 2005 127 2944
66. A. Guédin J. Gros P. Alberti J.-L. Mergny Nucleic Acids Res. 2010 38 7858
67. H. Yu C. Zhao Y. Chen M. Fu J. Ren X. Qu J. Med. Chem. 2009 53 492
68. J. Zhu L. Zhang E. Wang Chem. Commun. 2012 48 11990
69. S. Volinia M. Galasso S. Costinean L. Tagliavini G. Gamberoni A. Drusco J. Marchesini N. Mascellani M. E. Sana R. Abu Jarour C. Desponts M. Teitell R. Baffa R. Aqeilan M. V. Iorio C. Taccioli R. Garzon G. Di Leva M. Fabbri M. Catozzi M. Previati S. Ambs T. Palumbo M. Garofalo A. Veronese A. Bottoni P. Gasparini C. C. Harris R. Visone Y. Pekarsky A. de la Chapelle M. Bloomston M. Dillhoff L. Z. Rassenti T. J. Kipps K. Huebner F. Pichiorri D. Lenze S. Cairo M.-A. Buendia P. Pineau A. Dejean N. Zanesi S. Rossi G. A. Calin C.-G. Liu J. Palatini M. Negrini A. Vecchione A. Rosenberg C. M. Croce Genome Res. 2010 20 589
70. A. Bhattacharya J. D. Ziebarth Y. Cui Nucleic Acids Res. 2013 41 D977
71. D. J. Allendorf R. S. Davis JAMA, J. Am. Med. Assoc. 2011 305 95
72. K. Jazdzewski E. L. Murray K. Franssila B. Jarzab D. R. Schoenberg A. de la Chapelle Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2008 105 7269
73. J. Shen C. B. Ambrosone R. A. DiCioccio K. Odunsi S. B. Lele H. Zhao Carcinogenesis 2008 29 1963