Biotransformations using cutinase

ACS Symposium Series

Volumn 1043, Issue , 2010, Pages 141-158

  Baker, Peter James ^a   Montclare, Jin Kim ^a,b  

^a NEW YORK UNIVERSITY   (United States)

^b Downstate Health Sciences University   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

BIOLOGICAL MATERIALS;

BIOTECHNOLOGY APPLICATIONS; BIOTRANSFORMATION REACTIONS; CUTINASE; INDUSTRIAL MANUFACTURING; NON-RENEWABLE; PHYTOPATHOGENS; SYNTHETIC APPROACH;

INDUSTRIAL CHEMICALS;

EID: 84888007123     PISSN: 00976156     EISSN: 19475918     Source Type: Book Series    
DOI: 10.1021/bk-2010-1043.ch011     Document Type: Conference Paper

References (109)

1. Kolattukudy, P. E. Lipids 1973, 8 (2), 90-2.
2. Kunst, L.; Samuels, L. Curr. Opin. Plant Biol. 2009.
3. Pollard, M.; Beisson, F.; Li, Y.; Ohlrogge, J. B. Trends Plant Sci. 2008, 13 (5), 236-46.
4. Riederer, M.; Schreiber, L. J. Exp. Bot. 2001, 52 (363), 2023-32.
5. Purdy, R. E.; Kolattukudy, P. E. Biochemistry 1975, 14 (13), 2824-31.
6. Purdy, R. E.; Kolattukudy, P. E. Biochemistry 1975, 14 (13), 2832-40.
7. Woloshuk, C. P.; Kolattukudy, P. E. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1986, 83 (6), 1704-1708.
8. Purdy, R. E.; Kolattukudy, P. E. Arch. Biochem. Biophys. 1973, 159 (1), 61-9.
9. Sweigard, J. A.; Chumley, F. G.; Valent, B. Mol. Gen. Genet. 1992, 232 (2), 174-82.
10. Kolattukudy, P. Ann. Rev. Phytopathol. 1985, 23, 223-50.
11. Fett, W. F.; Gerard, H. C.; Moreau, R. A.; Osman, S. F.; Jones, L. E. Appl. Environ. Microbiol. 1992, 58 (7), 2123-2130.
12. Baker, C. J.; Bateman, D. F. Phytopathology 1978, 68, 1577-1584.
13. Egmond, M. R.; de Vlieg, J. Biochimie 2000, 82 (11), 1015-21.
14. Pio, T. F.; Macedo, G. A. Adv. Appl. Microbiol. 2009, 66, 77-95.
15. Martinez, C.; De Geus, P.; Lauwereys, M.; Matthyssens, G.; Cambillau, C. Nature 1992, 356 (6370), 615-8.
16. Liu, Z.; Gosser, Y.; Baker, P. J.; Ravee, Y.; Lu, Z.; Alemu, G.; Li, H.; Butterfoss, G. L.; Kong, X. P.; Gross, R.; Montclare, J. K. J. Am. Chem. Soc. 2009.
17. Nyon, M. P.; Rice, D. W.; Berrisford, J. M.; Hounslow, A. M.; Moir, A. J.; Huang, H.; Nathan, S.; Mahadi, N. M.; Bakar, F. D.; Craven, C. J. J. Mol. Biol. 2009, 385 (1), 226-35.
18. Shayk, M.; Kolattukudy, P. E. Plant Physiol. 1977, 60 (6), 907-915.
19. Sebastian, J.; Chandra, A. K.; Kolattukudy, P. E. J. Bacteriol. 1987, 169 (1), 131-6.
20. Melo, E. P.; Aires-Barros, M. R.; Cabral, J. M. Appl. Biochem. Biotechnol. 1995, 50 (1), 45-56.
21. Borreguero, C.; Carvalho, C. M.; Cabral, J. M. S.; Sinisterra, J. V.; Alcantara, A. R. J. Mol. Catal. B: Enzym. 2001, 11, 613-622.
22. de Barros, D. P. C.; Fonseca, L. P.; Fernandes, P.; Cabral, J. M. S.; Mojovic, L. J. Mol. Catal. B: Enzym. 2009, 60, 178-185.
23. Longhi, S.; Czjzek, M.; Lamzin, V.; Nicolas, A.; Cambillau, C. J. Mol. Biol. 1997, 268 (4), 779-99.
24. Maugard, T.; Remaud-Simeon, M.; Monsan, P. Biochim. Biophys. Acta 1998, 1387 (1-2), 177-83.
25. Zaks, A.; Klibanov, A. M. Science 1984, 224 (4654), 1249-51.
26. Kwon, M. A.; Kim, H. S.; Yang, T. H.; Song, B. K.; Song, J. K. Protein Expression Purif. 2009, 68 (1), 104-9.
27. Ollis, D. L.; Cheah, E.; Cygler, M.; Dijkstra, B.; Frolow, F.; Franken, S. M.; Harel, M.; Remington, S. J.; Silman, I.; Schrag, J.; et al. Protein Eng. 1992, 5 (3), 197-211.
28. Nardini, M.; Dijkstra, B. W. Curr. Opin. Struct. Biol. 1999, 9 (6), 732-7.
29. Matthews, B. W.; Sigler, P. B.; Henderson, R.; Blow, D. M. Nature 1967, 214 (5089), 652-6.
30. Huber, R.; Kukla, D.; Bode, W.; Schwager, P.; Bartels, K.; Deisenhofer, J.; Steigemann, W. J. Mol. Biol. 1974, 89 (1), 73-101.
31. Kraut, J. Annu. Rev. Biochem. 1977, 46, 331-58.
32. Reis, P.; Holmberg, K.; Watzke, H.; Leser, M. E.; Miller, R. Adv. Colloid Interface Sci. 2009, 147-148, 237-50.
33. Brzozowski, A. M.; Derewenda, U.; Derewenda, Z. S.; Dodson, G. G.; Lawson, D. M.; Turkenburg, J. P.; Bjorkling, F.; Huge-Jensen, B.; Patkar, S. A.; Thim, L. Nature 1991, 351 (6326), 491-4.
34. Anthonsen, H. W.; Baptista, A.; Drablos, F.; Martel, P.; Petersen, S. B.; Sebastiao, M.; Vaz, L. Biotechnol. Annu. Rev. 1995 (315-371).
35. Petersen, M. T. N.; Fojan, P.; Petersen, S. B. J. Biotechnol. 2001, 85, 115-147.
36. Shah, D. B.; Wilson, J. B. J. Bacteriol. 1965, 89, 949-53.
37. Nicolas, A.; Egmond, M.; Verrips, C. T.; de Vlieg, J.; Longhi, S.; Cambillau, C.; Martinez, C. Biochemistry 1996, 35 (2), 398-410.
38. Frey, P. A.; Whitt, S. A.; Tobin, J. B. Science 1994, 264 (5167), 1927-30.
39. Bruice, T. C. Annu. Rev. Biochem. 1976, 45, 331-73.
40. Blow, D. M.; Birktoft, J. J.; Hartley, B. S. Nature 1969, 221 (5178), 337-40.
41. Blow, D. M. Biochem. J. 1969, 112 (3), 261-8.
42. Zhang, X.; Houk, K. N. Acc. Chem. Res. 2005, 38 (5), 379-85.
43. Martinez, C.; Nicolas, A.; van Tilbeurgh, H.; Egloff, M. P.; Cudrey, C.; Verger, R.; Cambillau, C. Biochemistry 1994, 33 (1), 83-9.
44. Audit, M.; Barbier, M.; Soyer-Gobillard, M. O.; Albert, M.; Geraud, M. L.; Nicolas, G.; Lenaers, G. Biol. Cell 1996, 86 (1), 1-10.
45. Mannesse, M. L.; Cox, R. C.; Koops, B. C.; Verheij, H. M.; de Haas, G. H.; Egmond, M. R.; van der Hijden, H. T.; de Vlieg, J. Biochemistry 1995, 34 (19), 6400-7.
46. Longhi, S.; Cambillau, C. Biochim. Biophys. Acta 1999, 1441 (2-3), 185-96.
47. Egmond, M. R.; van Bemmel, C. J. Methods Enzymol. 1997, 284, 119-29.
48. Petersen, S. B.; Jonson, P. H.; Fojan, P.; Petersen, E. I.; Petersen, M. T.; Hansen, S.; Ishak, R. J.; Hough, E. J. Biotechnol. 1998, 66 (1), 11-26.
49. Klibanov, A. M. Nature 2001, 409 (6817), 241-6.
50. Wasserman, A. E.; Hopkins, W. J. Appl. Microbiol. 1958, 6 (1), 49-52.
51. Flipsen, J. A.; van der Hijden, H. T.; Egmond, M. R.; Verheij, H. M. Chem. Phys. Lipids 1996, 84 (2), 105-15.
52. Rogalska, E.; Douchet, I.; Verger, R. Biochem. Soc. Trans. 1997, 25 (1), 161-4.
53. Mannesse, M. L.; de Haas, G. H.; van der Hijden, H. T.; Egmond, M. R.; Verheij, H. M. Biochem. Soc. Trans. 1997, 25 (1), 165-70.
54. Klibanov, A. M. Anal. Biochem. 1979, 93 (1), 1-25.
55. Klibanov, A. M. Science 1983, 219 (4585), 722-727.
56. Hunsen, M.; Abul, A.; Xie, W.; Gross, R. Biomacromolecules 2008, 9 (2), 518-22.
57. Hunsen, M.; Azim, A.; Mang, H.; Wallner, S. R.; Ronkvist, A.; Xie, W.; Gross, R. A. Macromolecules 2007, 40, 148-150.
58. Costa, L.; Brissos, V.; Lemos, F.; Ribeiro, F. R.; Cabral, J. M. Bioprocess Biosyst. Eng. 2009, 32 (1), 53-61.
59. Costa, L.; Brissos, V.; Lemos, F.; Ribeiro, F. R.; Cabral, J. M. Bioprocess Biosyst. Eng. 2008, 31 (4), 323-7.
60. Sereti, V.; Stamatis, H.; Kolisis, F. N. Biotechnol. Tech. 1997, 11, 661-665.
61. Figueroa, Y.; Hinks, D.; Montero, G. Biotechnol. Prog. 2006, 22 (4), 1209-14.
62. Garcia, S.; Vidinha, P.; Arvana, H.; Gomaes da Silva, M. D. R.; Ferreira, M.; Cabral, J. M. S.; Macedo, E. A.; Harper, N.; Barreiros, S. J. Supercrit. Fluids 2004, 35, 62-69.
63. Goncalves, A. P.; Cabral, J. M.; Aires-Barros, M. R. Appl. Biochem. Biotechnol. 1996, 60 (3), 217-28.
64. Ternstrom, T.; Svendsen, A.; Akke, M.; Adlercreutz, P. Biochim. Biophys. Acta 2005, 1748 (1), 74-83.
65. Melo, E. P.; Carvalho, C. M.; Aires-Barros, M. R.; Costa, S. M.; Cabral, J. M. Biotechnol. Bioeng. 1998, 58 (4), 380-6.
66. Melo, E. P.; Costa, S. M.; Cabral, J. M. Ann. N. Y. Acad. Sci. 1995, 750, 85-8.
67. Brissos, V.; Eggert, T.; Cabral, J. M.; Jaeger, K. E. Protein Eng., Des. Sel. 2008, 21 (6), 387-93.
68. Brissos, V.; Melo, E. P.; Martinho, J. M.; Cabral, J. M. Biochim. Biophys. Acta 2008, 1784 (9), 1326-34.
69. Vidinha, P.; Augusto, V.; Almeida, M.; Fonseca, I.; Fidalgo, A.; Ilharco, L.; Cabral, J. M.; Barreiros, S. J. Biotechnol. 2006, 121 (1), 23-33.
70. Vidinha, P.; Augusto, V.; Nunes, J.; Lima, J. C.; Cabral, J. M.; Barreiros, S. J. Biotechnol. 2008, 135 (2), 181-9.
71. Cabral, J. M.; Aires-Barros, M. R.; Pinheiro, H.; Prazeres, D. M. J. Biotechnol. 1997, 59 (1-2), 133-43.
72. Serralha, F. N.; Lopes, J. M.; Aires-Barros, M. R.; Prazeres, D. M.; Cabral, J. M. S.; Lemos, F.; Ramoa Ribeiro, F. Enzymes Microb. Technol. 2002, 31, 29-34.
73. Hodneland, C. D.; Lee, Y. S.; Min, D. H.; Mrksich, M. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2002, 99 (8), 5048-52.
74. Betancor, L.; Luckarift, H. R. Trends Biotechnol. 2008, 26 (10), 566-72.
75. Orlich, B.; Schomacker, R. Adv. Biochem. Eng. Biotechnol. 2002, 75, 185-208.
76. Melo, E. P.; Baptista, R. P.; Cabral, J. M. S. J. Mol. Catal. B: Enzym. 2003, 22, 299-306.
77. Carvalho, C. M.; Cabral, J. M. S. Biochimie 2002, 82, 1063-1085.
78. Stamatis, H.; Xenakis, A.; Kolisis, F. N. Biotechnol. Adv. 1999, 17 (4-5), 293-318.
79. Carvalho, C. M.; Aires-Barros, M. R.; Cabral, J. M. Biotechnol. Bioeng. 1999, 66 (1), 17-34.
80. Sebastiao, M. J.; Cabral, J. M.; Aires-Barros, M. R. Biotechnol. Bioeng. 1993, 42 (3), 326-32.
81. Vermue, M. H.; Tramper, J. Pure Appl. Chem 1995, 67, 345-373.
82. Goncalves, A. M.; Serro, A. P.; Aires-Barros, M. R.; Cabral, J. M. Biochim. Biophys. Acta 2000, 1480 (1-2), 92-106.
83. Melo, E. P.; Costa, S. M.; Cabral, J. M.; Fojan, P.; Petersen, S. B. Chem. Phys. Lipids 2003, 124 (1), 37-47.
84. Ellerby, L. M.; Nishida, C. R.; Nishida, F.; Yamanaka, S. A.; Dunn, B.; Valentine, J. S.; Zink, J. I. Science 1992, 255 (5048), 1113-5.
85. Eggers, D. K.; Valentine, J. S. Protein Sci. 2001, 10 (2), 250-61.
86. Klibanov, A. M. Trends Biotechnol. 1997, 15 (3), 97-101.
87. Klibanov, A.; Samokhin, G. P.; Martinek, K.; Berezin, I. V. Biotechnol. Bioeng. 1977, 19 (9), 1351-61.
88. Klibanov, A. M. Trends Biochem. Sci. 1989, 14 (4), 141-4.
89. Zaks, A.; Klibanov, A. M. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1985, 82 (10), 3192-6.
90. Vidinha, P.; Harper, N.; Micaelo, N.; Lourenco, N. M.; Gomaes da Silva, M. D. R.; Cabral, J. M. S.; afonso, C. A.; Soares, C. M.; Barreiros, S. Biotechnol. Bioeng. 2003, 85, 442-449.
91. Costantino, H. R.; Griebenow, K.; Langer, R.; Klibanov, A. M. Biotechnol. Bioeng. 1997, 53 (3), 345-8.
92. Klibanov, A. M. Nature 1995, 374 (6523), 596.
93. Karmee, S. K.; Casiraghi, L.; Greiner, L. Biotechnol. J. 2008, 3 (1), 104-11.
94. Ramsey, E.; Sun, Q.; Zhang, Z.; Zhang, C.; Gou, W. J. Environ. Sci. (China) 2009, 21 (6), 720-6.
95. Kao, F. J.; Ekhorutomwen, S. A.; Sawan, S. P. Biotechnol. Tech. 1997, 11, 849-852.
96. Oliveria, M. V.; Rebocho, S. F.; Ribeiro, A. S.; Macedo, E. A.; Loureiro, J. M. J. Supercrit. Fluids 2009, 50, 138-145.
97. Kamat, S. V.; Iwaskewycz, B.; Beckman, E. J.; Russell, A. J. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1993, 90 (7), 2940-4.
98. Song, J. H.; Murphy, R. J.; Narayan, R.; Davies, G. B. Philos. Trans. R. Soc. London, B 2009, 364 (1526), 2127-39.
99. Murphy, C. A.; Cameron, J. A.; Huang, S. J.; Vinopal, R. T. Appl. Environ. Microbiol. 1996, 62 (2), 456-60.
100. Maeda, H.; Yamagata, Y.; Abe, K.; Hasegawa, F.; Machida, M.; Ishioka, R.; Gomi, K.; Nakajima, T. Appl. Microbiol. Biotechnol. 2005, 67 (6), 778-88.
101. Ronkvist, A.; Xie, W.; Lu, W.; Gross, R. A. Macromolecules 2009, 42, 5128-38.
102. Eberl, A.; Heumann, S.; Kotek, R.; Kaufmann, F.; Mitsche, S.; Cavaco- Paulo, A.; Gubitz, G. M. J. Biotechnol. 2008, 135 (1), 45-51.
103. Ronkvist, A.; Lu, W.; Feder, D.; Gross, R. A. Macromolecules 2009, 42, 6086-97.
104. Gubitz, G.; Paulo, A. Curr. Opin. Biotechnol. 2003, 14 (6), 577-582.
105. Nimchua, T.; Eveleigh, D. E.; Sangwatanaroj, U.; Punnapayak, H. J. Ind. Microbiol. Biotechnol. 2008, 35 (8), 843-50.
106. Araujo, R.; Silva, C.; O'Neill, A.; Micaelo, N.; Guebitz, G.; Soares, C. M.; Casal, M.; Cavaco-Paulo, A. J. Biotechnol. 2007, 128 (4), 849-57.
107. Matama, T.; Vaz, F.; Gubitz, G. M.; Cavaco-Paulo, A. Biotechnol. J. 2006, 1 (7-8), 842-9.
108. Gross, R. A.; Kalra, B.; Kumar, A. Appl. Microbiol. Biotechnol. 2001, 55 (6), 655-60.
109. Gross, R. A.; Kumar, A.; Kalra, B. Chem. Rev. 2001, 101 (7), 2097-124.