New glycosidase substrates for droplet-based microfluidic screening

Analytical Chemistry

Volumn 85, Issue 20, 2013, Pages 9807-9814

  Najah, Majdi ^a,b   Mayot, Estelle ^a,b   Mahendra Wijaya, I Putu ^a,b   Griffiths, Andrew D ^a,c   Ladame, Sylvain ^a,d   Drevelle, Antoine ^a,b  

^a UNIVERSITÉ DE STRASBOURG   (France)

^b Division Biotechnologies OSIRIS   (France)

^c PSL RESEARCH UNIVERSITY   (France)

^d IMPERIAL COLLEGE LONDON   (United Kingdom)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

BACILLUS SUBTILIS; CELLOBIOHYDROLASES; DROPLET MICROFLUIDICS; DROPLET-BASED MICROFLUIDICS; ENZYMATIC ACTIVITIES; FLUORESCENCE PROPERTIES; FLUOROGENIC SUBSTRATE; METHANESULFONATES;

DROPS; ESCHERICHIA COLI; FLUORESCENCE; MICROFLUIDICS; PH;

SUBSTRATES;

EID: 84886903878     PISSN: 00032700     EISSN: 15206882     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ac4022709     Document Type: Article

References (44)

1. Jordan, D. B.; Bowman, M. J.; Braker, J. D.; Dien, B. S.; Hector, R. E.; Lee, C. C.; Mertens, J. A.; Wagschal, K. Biochem. J. 2012, 442 (2) 241-252
2. Octave, S.; Thomas, D. Biochimie 2009, 91 (6) 659-664
3. Tawfik, D. S.; Griffiths, A. D. Nat. Biotechnol. 1998, 16 (7) 652-656
4. Miller, O. J.; Bernath, K.; Agresti, J. J.; Amitai, G.; Kelly, B. T.; Mastrobattista, E.; Taly, V.; Magdassi, S.; Tawfik, D. S.; Griffiths, A. D. Nat. Methods 2006, 3 (7) 561-570
5. Mastrobattista, E.; Taly, V.; Chanudet, E.; Treacy, P.; Kelly, B. T.; Griffiths, A. D. Chem. Biol. 2005, 12 (12) 1291-1300
6. Bernath, K.; Hai, M.; Mastrobattista, E.; Griffiths, A. D.; Magdassi, S.; Tawfik, D. S. Anal. Biochem. 2004, 325 (1) 151-157
7. Hardiman, E.; Gibbs, M.; Reeves, R.; Bergquist, P. Appl. Biochem. Biotechnol. 2010, 161 (1-8) 301-312
8. Baret, J. C.; Miller, O. J.; Taly, V.; Ryckelynck, M.; El-Harrak, A.; Frenz, L.; Rick, C.; Samuels, M. L.; Hutchison, J. B.; Agresti, J. J.; Link, D. R.; Weitz, D. A.; Griffiths, A. D. Lab Chip 2009, 9 (13) 1850-1858
9. Agresti, J. J.; Antipov, E.; Abate, A. R.; Ahn, K.; Rowat, A. C.; Baret, J. C.; Marquez, M.; Klibanov, A. M.; Griffiths, A. D.; Weitz, D. A. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2010, 107 (9) 4004-4009
10. Kintses, B.; Hein, C.; Mohamed, M. F.; Fischlechner, M.; Courtois, F.; Laine, C.; Hollfelder, F. Chem. Biol. 2012, 19 (8) 1001-1009
11. Clausell-Tormos, J.; Lieber, D.; Baret, J. C.; El-Harrak, A.; Miller, O. J.; Frenz, L.; Blouwolff, J.; Humphry, K. J.; Koster, S.; Duan, H.; Holtze, C.; Weitz, D. A.; Griffiths, A. D.; Merten, C. A. Chem. Biol. 2008, 15 (5) 427-437
12. Granieri, L.; Baret, J. C.; Griffiths, A. D.; Merten, C. A. Chem. Biol. 2010, 17 (3) 229-235
13. Courtois, F.; Olguin, L. F.; Whyte, G.; Bratton, D.; Huck, W. T.; Abell, C.; Hollfelder, F. ChemBioChem 2008, 9 (3) 439-446
14. Fallah-Araghi, A.; Baret, J. C.; Ryckelynck, M.; Griffiths, A. D. Lab Chip 2012, 12 (5) 882-891
15. Goddard, J. P.; Reymond, J. L. Curr. Opin. Biotechnol. 2004, 15 (4) 314-322
16. Ge, Y.; Antoulinakis, E. G.; Gee, K. R.; Johnson, I. Anal. Biochem. 2007, 362 (1) 63-68
17. van, T. H.; Pettersson, G.; Bhikabhai, R.; De, B. H.; Claeyssens, M. Eur. J. Biochem. 1985, 148 (2) 329-334
18. van, T. H.; Loontiens, F. G.; Engelborgs, Y.; Claeyssens, M. Eur. J. Biochem. 1989, 184 (3) 553-559
19. Wu, N.; Courtois, F.; Zhu, Y.; Oakeshott, J.; Easton, C.; Abell, C. Electrophoresis 2010, 31 (18) 3121-3128
20. Woronoff, G.; El Harrak, A.; Mayot, E.; Schicke, O.; Miller, O. J.; Soumillion, P.; Griffiths, A. D.; Ryckelynck, M. Anal. Chem. 2011, 83 (8) 2852-2857
21. Bjerregaard, S.; Pedersen, H.; Vedstesen, H.; Vermehren, C.; Soderberg, I.; Frokjaer, S. Int. J. Pharm. 2001, 215 (1-2) 13-27
22. Pays, K.; Giermanska-Kahn, J.; Pouligny, B.; Bibette, J.; Leal-Calderon, F. J. Controlled Release 2002, 79 (1-3) 193-205
23. Cheng, J.; Chen, J. F.; Zhao, M.; Luo, Q.; Wen, L. X.; Papadopoulos, K. D. J. Colloid Interface Sci. 2007, 305 (1) 175-182
24. Skhiri, Y.; Gruner, P.; Semin, B.; Brosseau, Q.; Pekin, D.; Mazutis, L.; Goust, V.; Kleinschmidt, F.; El Harrak, A.; Hutchison, J. B.; Mayot, E.; Bartolo, J. F.; Griffiths, A. D.; Taly, V.; Baret, J. C. Soft Matter 2012, 8 (41) 10618-10627
25. Wen, L.; Papadopoulos, K. D. Colloids Surf., A 2000, 174, 159-167
26. Huque, F. T. T.; Jones, K.; Saunders, R. A.; Platts, J. A. J. Fluorine Chem. 2002, 115 (2) 119-128
27. Scott, R. L. J. Am. Chem. Soc. 1948, 70 (12) 4090-4093
28. Simons, J. H.; Linevsky, M. J. J. Am. Chem. Soc. 1952, 74 (19) 4750-4751
29. Courtois, F.; Olguin, L. F.; Whyte, G.; Theberge, A. B.; Huck, W. T.; Hollfelder, F.; Abell, C. Anal. Chem. 2009, 81 (8) 3008-3016
30. Coleman, D. J.; Studler, M. J.; Naleway, J. J. Anal. Biochem. 2007, 371 (2) 146-153
31. Wittrup, K. D.; Bailey, J. E. Biotechnol. Bioeng. 1990, 35 (5) 525-532
32. Chang, C.; Sustarich, J.; Bharadwaj, R.; Chandrasekaran, A.; Adams, P. D.; Singh, A. K. Lab Chip 2013, 13 (9) 1817-1822
33. Gee, K. R.; Haugland, R. P.; Sun, W. C. Derivatives of 6,8-difluoro-7-hydroxycoumarin. GB2319250, 1997.
34. Alcaro, S.; Arena, A.; Neri, S.; Ottana, R.; Ortuso, F.; Pavone, B.; Vigorita, M. G. Bioorg. Med. Chem. 2004, 12 (7) 1781-1791
35. Camponovo, J.; Hadad, C.; Ruiz, J.; Cloutet, E.; Gatard, S.; Muzart, J.; Bouquillon, S.; Astruc, D. J. Org. Chem. 2009, 74 (14) 5071-5074
36. McIlvaine, T. C. J. Biol. Chem. 1921, 49 (1) 183-186
37. Duffy, D. C.; McDonald, J. C.; Schueller, O. J.; Whitesides, G. M. Anal. Chem. 1998, 70 (23) 4974-4984
38. Holtze, C.; Rowat, A. C.; Agresti, J. J.; Hutchison, J. B.; Angile, F. E.; Schmitz, C. H.; Koster, S.; Duan, H.; Humphry, K. J.; Scanga, R. A.; Johnson, J. S.; Pisignano, D.; Weitz, D. A. Lab Chip 2008, 8 (10) 1632-1639
39. Mazutis, L.; Araghi, A. F.; Miller, O. J.; Baret, J. C.; Frenz, L.; Janoshazi, A.; Taly, V.; Miller, B. J.; Hutchison, J. B.; Link, D.; Griffiths, A. D.; Ryckelynck, M. Anal. Chem. 2009, 81 (12) 4813-4821
40. Koenigs, W.; Knorr, E. Ber. Dtsch. Chem. Ges. 1901, 34 (1) 957-981
41. Nukada, T.; Berces, A.; Zgierski, M. Z.; Whitfield, D. M. J. Am. Chem. Soc. 1998, 120 (51) 13291-13295
42. Huisman, O.; D'Ari, R.; George, J. J. Bacteriol. 1980, 142 (3) 819-828
43. Love, P. E.; Yasbin, R. E. J. Bacteriol. 1984, 160 (3) 910-920
44. Baroud, C. N.; Gallaire, F.; Dangla, R. Lab Chip 2010, 10 (16) 2032-2045