Analysis of serum metabolites for the discovery of amino acid biomarkers and the effect of galangin on cerebral ischemia

Molecular BioSystems

Volumn 9, Issue 9, 2013, Pages 2311-2321

  Gao, Jian ^a,b   Yang, Hongjun ^a   Chen, Jianxin ^c   Fang, Jiansong ^d   Chen, Chang ^a   Liang, Rixin ^a   Yang, Gengliang ^b   Wu, Hongwei ^a   Wu, Chuanhong ^a   Li, Shaojing ^a  

^a INSTITUTE OF CHINESE MATERIA MEDICA   (China)

^b HEBEI UNIVERSITY   (China)

^c BEIJING UNIVERSITY OF CHINESE MEDICINE   (China)

^d INSTITUTE OF MATERIA MEDICA   (China)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

RATTUS;

AGENTS INTERACTING WITH TRANSMITTER, HORMONE OR DRUG RECEPTORS; AMINO ACID; AMINO ACID TRANSPORTER; ANTIOXIDANT; BIOLOGICAL MARKER; FLAVONOID; GALANGIN; PROTEIN BINDING;

ANIMAL; ARTICLE; BLOOD; BRAIN ISCHEMIA; CHEMISTRY; CHINESE MEDICINE; DISEASE MODEL; MALE; METABOLISM; METABOLOMICS; METHODOLOGY; MOLECULAR DOCKING; PROTEIN BINDING; PROTEIN PROTEIN INTERACTION; RAT; REPRODUCIBILITY; SENSITIVITY AND SPECIFICITY; TANDEM MASS SPECTROMETRY; PROCEDURES;

AMINO ACID TRANSPORT SYSTEMS; AMINO ACIDS; ANIMALS; ANTIOXIDANTS; BIOLOGICAL MARKERS; BRAIN ISCHEMIA; DISEASE MODELS, ANIMAL; FLAVONOIDS; MALE; MEDICINE, CHINESE TRADITIONAL; METABOLOMICS; MOLECULAR DOCKING SIMULATION; NEUROTRANSMITTER AGENTS; PROTEIN BINDING; PROTEIN INTERACTION MAPS; RATS; REPRODUCIBILITY OF RESULTS; SENSITIVITY AND SPECIFICITY; TANDEM MASS SPECTROMETRY;

EID: 84881106219     PISSN: 1742206X     EISSN: 17422051     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/c3mb70040b     Document Type: Article

References (54)

1. Q. Shi P. Zhang J. Zhang X. Chen H. Lu Y. Tian T. L. Parker Y. Liu Neurosci. Lett. 2009 465 220 225
2. S. L. Mehta N. Manhas R. Raghubir Brain Res. Rev. 2007 54 34 66
3. K. Yu G. Sheng J. Sheng Y. Chen W. Xu X. Liu H. Cao H. Qu Y. Cheng L. Li J. Proteome Res. 2007 6 2413 2419
4. J. Chen W. Wang S. Lv P. Yin X. Zhao X. Lu F. Zhang G. Xu Anal. Chim. Acta 2009 650 3 9
5. S. K. Manna A. D. Patterson Q. Yang K. W. Krausz J. R. Idle A. J. Fornace F. J. Gonzale J. Proteome Res. 2011 10 4120 4133
6. X. Wang A. Zhang Y. Han P. Wang H. Sun G. Song T. Dong X. Yuan M. Zhang N. Xie H. Zhang H. Dong W. Dong Mol. Cell. Proteomics 2012 11 370 380
7. O. Shaham R. Wei T. J. Wang C. Ricciardi G. D. Lewis R. S. Vasan S. A. Carr R. Thadhani R. E. Gerszten V. K. Mootha Mol. Syst. Biol. 2008 4 214
8. C. B. Newgard J. An J. R. Bain M. J. Muehlbauer R. D. Stevens L. F. Lien A. M. Haqq S. H. Shah M. Arlotto C. A. Slentz J. Rochon D. Gallup O. Ilkayeva B. R. Wenner W. S. Yancy Jr H. Eisenson G. Musante R. S. Surwit D. S. Millington M. D. Butler L. P. Svetkey Cell Metab. 2009 9 311 326
9. X. Zhao J. Fritsche J. Wang J. Chen K. Rittig P. Schmitt-Kopplin A. Fritsche H. U. Häring E. D. Schleicher G. Xu R. Lehmann Metabolomics 2010 6 362 374
10. K. H. Pietiläinen T. Róg T. Seppänen-Laakso S. Virtue P. Gopalacharyulu J. Tang S. Rodriguez-Cuenca A. Maciejewski J. Naukkarinen A. L. Ruskeepää P. S. Niemelä L. Yetukuri C. Y. Tan V. Velagapudi S. Castillo H. Nygren T. Hyötyläinen A. Rissanen J. Kaprio H. Yki-Järvinen I. Vattulainen A. Vidal-Puig M. Oreič PLoS Biol. 2011 9 e1000623
11. E. P. Rhee S. Cheng M. G. Larson G. A. Walford G. D. Lewis E. McCabe E. Yang L. Farrell C. S. Fox C. J. O'Donnell S. A. Carr R. S. Vasan J. C. Florez C. B. Clish T. J. Wang R. E. Gerszten J. Clin. Invest. 2011 121 1402 1411
12. T. J. Wang M. G. Larson R. S. Vasan S. Cheng E. P. Rhee E. McCabe G. D. Lewis C. S. Fox P. F. Jacques C. Fernandez C. J. O'Donnell S. A. Carr V. K. Mootha J. C. Florez A. Souza O. Melander C. B. Clish R. E. Gerszten Nat. Med. 2011 17 448 453
13. S. Cheng E. P. Rhee M. G. Larson G. D. Lewis E. L. McCabe D. Shen M. J. Palma L. D. Roberts A. Dejam A. L. Souza A. A. Deik M. Magnusson C. S. Fox C. J. O'Donnell R. S. Vasan O. Melander C. B. Clish R. E. Gerszten T. J. Wang Circulation 2012 125 2222 2231
14. O. N. Goek A. Döring C. Gieger M. Heier W. Koenig C. Prehn W. Römisch-Margl R. Wang-Sattler T. Illig K. Suhre P. Sekula G. Zhai J. Adamski A. Köttgen C. Meisinger Am. J. Kidney Dis. 2012 60 197 206
15. X. Bie Y. Chen J. Han H. Dai H. Wan T. Zhao Asia Pac. J. Clin. Nutr. 2007 16 305 308
16. F. M. Faraci S. R. Lentz Stroke 2004 35 345 347
17. M. P. Mattson T. B. Shea Trends Neurosci. 2003 26 137 146
18. C. G. Zou R. Banerje Antioxid. Redox Signaling 2005 7 547 559
19. L. C. Pettigrew H. Bang L. E. Chambless V. J. Howard J. F. Toole Atherosclerosis 2008 200 345 349
20. H. Wolosker E. Dumin L. Balan V. N. Foltyn FEBS J. 2008 275 3514 3526
21. Y. Yang W. Ge Y. Chen Z. Zhang W. Shen C. Wu M. Poo S. Duan Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2003 100 15194 15199
22. E. R. Stevens M. Esguerra P. M. Kim E. A. Newman S. H. Snyder K. R. Zahs R. F. Miller Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2003 100 6789 6794
23. X. Huang H. Kong M. Tang M. Lu J. H. Ding G. Hu CNS Neurosci. Ther. 2012 18 4 13
24. T. Kagiyama A. V. Glushakov C. Sumners B. Roose D. M. Dennis M. I. Phillips M. S. Ozcan C. N. Seubert A. E. Martynyuk Stroke 2004 35 1192 1196
25. X. Gao X. Zheng Z. Li Y. Zhou H. Sun L. Zhang X. Guo G. Du X. Qin J. Ethnopharmacol. 2011 137 690 699
26. H. Bruhn J. Frahm M. L. Gyngell K. D. Merboldt W. Hänicke R. Sauter Magn. Reson. Med. 1989 9 126 131
27. Z. X. Zhang P. F. Gao X. F. Guo H. Wang H. S. Zhang Anal. Bioanal. Chem. 2011 401 1905 1914
28. R. G. Robinson W. J. Shoemaker M. Schlumpf T. Valk F. E. Bloom Nature 1975 255 332
29. R. G. Robinson Science 1979 205 707 710
30. A. Tamura D. I. Graham J. McCulloch G. M. Teasdale J. Cereb. Blood Flow Metab. 1981 1 53 60
31. H. P. Ciolino G. C. Yeh Br. J. Cancer 1999 79 1340 1346
32. L. Ebringer J. Dobias J. Krajcvoic J. Polónyi L. Krizková N. Lahitová Mutat. Res. 1996 359 85 89
33. P. O. Koh Am. J. Chin. Med. 2011 39 971 979
34. Z. Zhao N. Liu J. Huang P. H. Lu X. M. Xu J. Neurochem. 2011 116 1057 1065
35. H. A. Waisman R. A. Pastel H. G. Poncher Pediatrics 1952 10 653 659
36. H. Benveniste J. Drejer A. Schousboe N. H. Diemer J. Neurochem. 1984 43 1369 1374
37. J. W. Phillis M. H. O'Regan Neurochem. Int. 2003 43 461 467
38. N. Adachi Brain Res. Rev. 2005 50 275 286
39. P. Saransaari S. S. Oja Brain Res. 1998 807 118 124
40. W. A. Waterval J. L. Scheijen M. M. Ortmans-Ploemen C. D. Habets-van der Poel J. Bierau Clin. Chim. Acta 2009 407 36 42
41. M. Jemal Biomed. Chromatogr. 2000 14 422 429
42. W. S. Rui Z. H. Yu H. Christian C. M. Ana F. Anna H. Ying H. Katharina C. Monica H. Christina T. Barbara G. Harald X. Tao B. Erik H. Cornelia M. Kirstin D. Angela M. Christa G. Christian P. Cornelia R. M. Werner C. Maren X. Lu Y. O. Hisami G. H. Xing C. Uta T. Joachim G. Guido L. Heiko X. Lin Y. X. Li H. Boeing H. G. Joost M. H. Angelis W. Rathmann K. Suhre H. Prokisch A. Peters T. Meitinger M. Roden H. E. Wichmann T. Pischon J. Adamski T. Illig Mol. Syst. Biol. 2012 8 615
43. D. S. Wishart C. Knox A. C. Guo R. Eisner N. Young B. Gautam D. D. Hau N. Psychogios E. Dong S. Bouatra R. Mandal I. Sinelnikov J. Xia L. Jia J. A. Cruz E. Lim C. A. Sobsey S. Shrivastava P. Huang P. Liu L. Fang J. Peng R. Fradette D. Cheng D. Tzur M. Clements A. Lewis A. De Souza A. Zuniga M. Dawe Y. Xiong D. Clive R. Greiner A. Nazyrova R. Shaykhutdinov L. Li H. J. Vogel I. Forsythe Nucleic Acids Res. 2009 37 D603 D610
44. K. Y. Zhu Q. Fu K. W. Leung Z. C. Wong R. C. Choi K. W. Tsim J. Chromatogr., B: Anal. Technol. Biomed. Life Sci. 2011 879 737 742
45. R. A. Floyd FASEB J. 1990 4 2587 2597
46. B. E. Enerson L. R. Drewes J. Pharm. Sci. 2003 92 1531 1544
47. A. A. Badawy D. L. Williams B. M. Snape M. Evans Biochem. J. 1982 204 622 624
48. E. Z. Longa P. R. Weinstein S. Carlson R. Cummins Stroke 1989 20 84 91
49. Z. Huang P. L. Huang N. Panahian T. Dalkara M. C. Fishman M. A. Moskowitz Science 1994 26 1883 1885
50. S. Wold M. Sjostrom L. Eriksson Chemom. Intell. Lab. Syst. 2001 58 109 130
51. Z. Wang Z. Chen S. Yang L. Yu B. Zhang Z. Rao J. Gao S. Tu Exp. Ther. Med. 2012 4 165 171
52. K. A. Pattin J. H. Moore Expert Rev. Proteomics 2009 6 647 659
53. D. Szklarczyk A. Franceschinni M. Kuhn M. Simonovic A. Rothh P. Minguez T. Doerks M. Stark J. Muller P. Bork L. J. Jensen C. von Mering Nucleic Acids Res. 2011 39 D561 D568
54. Y. Wang J. Xiao T. O. Suzek J. Zhang J. Wang S. H. Bryant Nucleic Acids Res. 2009 37 623 633