Initiation of assembly of tau(273-284) and its Δk280 mutant: An experimental and computational study

Physical Chemistry Chemical Physics

Volumn 15, Issue 23, 2013, Pages 8916-8928

  Larini, Luca ^a   Gessel, Megan Murray ^a,b   Lapointe, Nichole E ^a   Do, Thanh D ^a   Bowers, Michael T ^a   Feinstein, Stuart C ^a   Shea, Joan Emma ^a  

^a UNIVERSITY OF CALIFORNIA   (United States)

^b VANDERBILT UNIVERSITY MEDICAL CENTER   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

HEPARIN; TAU PROTEIN;

AMINO ACID SEQUENCE; ARTICLE; CHEMISTRY; GENE DELETION; GENETICS; HUMAN; METABOLISM; MOLECULAR DYNAMICS; POINT MUTATION; PROTEIN CONFORMATION; PROTEIN MULTIMERIZATION; TAUOPATHY; ULTRASTRUCTURE;

AMINO ACID SEQUENCE; HEPARIN; HUMANS; MOLECULAR DYNAMICS SIMULATION; POINT MUTATION; PROTEIN CONFORMATION; PROTEIN MULTIMERIZATION; SEQUENCE DELETION; TAU PROTEINS; TAUOPATHIES;

EID: 84878078985     PISSN: 14639076     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/c3cp00063j     Document Type: Article

References (74)

1. N. Hirokawa Y. Noda Y. Tanaka S. Niwa Nat. Rev. Mol. Cell Biol. 2009 10 682
2. E. Nogales Annu. Rev. Biochem. 2000 69 277
3. C. Conde A. Cáceres Nat. Rev. Neurosci. 2009 10 319
4. A. Desai T. J. Mitchison Annu. Rev. Cell Dev. Biol. 1997 13 83
5. J. Avila J. J. Lucas M. Pérez F. Hernández Physiol. Rev. 2004 84 361
6. V. M.-Y. Lee M. Goedert J. Q. Trojanowski Annu. Rev. Neurosci. 2001 24 1121
7. E.-M. Mandelkow E. Mandelkow Trends Biochem. Sci. 1993 18 480
8. E.-M. Mandelkow E. Mandelkow Trends Cell Biol. 1998 8 425
9. P. Friedhoff M. von Bergen E.-M. Mandelkow E. Mandelkow Biochim. Biophys. Acta, Mol. Basis Dis. 2000 1502 122
10. M. Goedert Trends Neurosci. 1993 16 460
11. C. A. Rankin T. C. Gamblin J. Alzheimer's Dis. 2008 14 411
12. F. Chiti C. M. Dobson Annu. Rev. Biochem. 2006 75 333
13. C. M. Dobson Trends Biochem. Sci. 1999 24 329
14. A. L. Fink Folding Des. 1998 3 R9
15. M. Bucciantini E. Giannoni F. Chiti F. Baroni L. Formigli J. Zurdo N. Taddei G. Ramponi C. M. Dobson M. Stefani Nature 2002 416 507
16. S. K. Maji L. Wang J. Greenwald R. Riek FEBS Lett. 2009 583 2620
17. M. Stefani Neuroscientist 2007 13 519
18. S. Baglioni F. Casamenti M. Bucciantini L. M. Luheshi N. Taddei F. Chiti C. M. Dobson M. Stefani J. Neurosci. 2006 26 8160
19. M. R. Sawaya S. Sambashivan R. Nelson M. I. Ivanova S. A. Sievers M. I. Apostol M. J. Thompson M. Balbirnie J. J. W. Wiltzius H. T. McFarlane A. O. Madsen C. Riekel D. Eisenberg Nature 2007 447 453
20. O. Schweers E. Schonbrunn-Hanebeck A. Marx E. Mandelkow J. Biol. Chem. 1994 269 24290
21. D. W. Peterson H. Zhou F. W. Dahlquist J. Lew Biochemistry 2008 47 7393
22. M. von Bergen S. Barghorn L. Li A. Marx J. Biernat E.-M. Mandelkow E. Mandelkow J. Biol. Chem. 2001 276 48165
23. W. Li V. M.-Y. Lee Biochemistry 2006 45 15692
24. B. Combs K. Voss T. Gamblin Biochemistry 2011 50 9446
25. Q. Zhong E. E. Congdon H. N. Nagaraja J. Kuret J. Biol. Chem. 2012 287 20711
26. M. E. King T. C. Gamblin J. Kuret L. I. Binder J. Neurochem. 2000 74 1749
27. W. J. Goux L. Kopplin A. D. Nguyen K. Leak M. Rutkofsky V. D. Shanmuganandam D. Sharma H. Inouye D. A. Kirschner J. Biol. Chem. 2004 279 26868
28. H. J. C. Berendsen D. van der Spoel R. van Drunen Comput. Phys. Commun. 1995 91 43
29. B. Hess C. Kutzner D. van der Spoel E. Lindahl J. Chem. Theory Comput. 2008 4 435
30. E. Lindahl B. Hess D. van der Spoel J. Mol. Model. 2001 7 306
31. D. van der Spoel E. Lindahl B. Hess G. Groenhof A. E. Mark H. J. C. Berendsen J. Comput. Chem. 2005 26 1701
32. W. L. Jorgensen D. S. Maxwell J. Tirado-Rives J. Am. Chem. Soc. 1996 118 11225
33. G. A. Kaminski R. Friesner J. Tirado-Rives W. Jorgensen J. Phys. Chem. B 2001 105 6474
34. R. C. Rizzo W. L. Jorgensen J. Am. Chem. Soc. 1999 121 4827
35. W. L. Jorgensen J. Chandrasekhar J. D. Madura R. W. Impey M. L. Klein J. Chem. Phys. 1983 79 926
36. B. Hess H. Bekker H. J. C. Berendsen J. G. E. M. Fraaije J. Comput. Chem. 1997 18 1463
37. S. Miyamoto P. A. Kollman J. Comput. Chem. 1992 13 952
38. T. Darden D. York L. L. Pedersen J. Chem. Phys. 1993 98 10089
39. U. Essman L. Perela M. L. Berkowitz T. Darden H. Lee L. G. Pedersen J. Chem. Phys. 1995 103 8577
40. W. G. Hoover Phys. Rev. A: At., Mol., Opt. Phys. 1985 31 1695
41. S. Nosé Mol. Phys. 1984 52 255
42. S. Nosé J. Chem. Phys. 1984 81 511
43. L. Verlet Phys. Rev. 1967 159 98
44. K. Hukushima K. Nemoto J. Phys. Soc. Jpn. 1996 65 1604
45. A. Patriksson D. van der Spoel Phys. Chem. Chem. Phys. 2008 10 2073
46. Y. Sugita Y. Okamoto Chem. Phys. Lett. 1999 314 141
47. X. Daura K. Gademann B. Jaun D. Seebach W. F. van Gunsteren A. E. Mark Angew. Chem., Int. Ed. 1999 38 236
48. M. F. Mesleh J. M. Hunter A. A. Shvartsburg G. C. Schatz M. F. Jarrold J. Phys. Chem. 1996 100 16082
49. M. F. Mesleh J. M. Hunter A. A. Shvartsburg G. C. Schatz M. F. Jarrold J. Phys. Chem. A 1997 101 968
50. A. A. Shvartsburg M. F. Jarrold Chem. Phys. Lett. 1996 261 86
51. P. Kemper N. Duipuis M. T. Bowers Int. J. Mass Spectrom. 2009 287 46
52. S. L. Bernstein N. F. Dupuis N. D. Lazo T. Wyttenbach M. M. Condron G. Bitan D. B. Teplow J. E. Shea B. T. Ruotolo C. V. Robinson M. T. Bowers Nat. Chem. 2009 1 326
53. C. Bleiholder N. F. Dupuis T. Wyttenbach M. T. Bowers Nat. Chem. 2011 3 172
54. N. F. Dupuis C. Wu J. E. Shea M. T. Bowers J. Am. Chem. Soc. 2011 133 7240
55. J. Gidden E. S. Baker A. Ferzoco M. T. Bowers Int. J. Mass Spectrom. 2005 240 183
56. E. A. Mason and E. W. McDaniel, Transport Properties of Ions in Gases, Wiley, New York, 1978
57. M. E. King V. Ahuja L. I. Binder J. Kuret Biochemistry 1999 38 14851
58. S. Barghorn Q. Zheng-Fischhöfer M. Ackmann J. Biernat M. von Bergen E.-M. Mandelkow E. Mandelkow Biochemistry 2000 39 11714
59. S. L. Bernstein T. Wyttenbach A. Baumketner J. E. Shea G. Bitan D. B. Teplow M. T. Bowers J. Am. Chem. Soc. 2005 127 2075
60. S. Barghorn E. Mandelkow Biochemistry 2002 41 14885
61. K. R. Patterson C. Remmers Y. Fu S. Brooker N. M. Kanaan L. Vana S. Ward J. F. Reyes K. Philibert M. J. Glucksman L. I. Binder J. Biol. Chem. 2011 286 23063
62. H. Wille G. Drewes J. Biernat E.-M. Mandelkow E. Mandelkow J. Cell Biol. 1992 118 573
63. M. S. Li N. T. Co G. Reddy C.-K. Hu J. E. Straub D. Thirumalai Phys. Rev. Lett. 2010 105 218101
64. J. E. Straub D. Thirumalai Annu. Rev. Phys. Chem. 2011 62 437
65. D. Thirumalai G. Reddy J. E. Straub Acc. Chem. Res. 2012 45 83
66. H. B. Nam M. Kouza H. Zung M. S. Li J. Chem. Phys. 2010 132 165104
67. P. E. Wright J. H. Dyson Curr. Opin. Struct. Biol. 2009 19 31
68. M. W. West W. Wang J. Patterson J. D. Mancias J. R. Beasley M. H. Hecht Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1999 96 11211
69. H. Xiong B. L. Buckwalter H. M. Shieh M. H. Hecht Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1995 92 6349
70. M. Sandal F. Valle I. Tessari S. Mammi E. Bergantino F. Musiani M. Brucale L. Bubacco B. Samorì PLoS Biol. 2008 6 e6
71. M. Brucale M. Sandal S. Di Maio A. Rampioni I. Tessari L. Tosatto M. Bisaglia L. Bubacco B. Samorì ChemBioChem 2009 10 176
72. R. Hervás J. Oroz A. Galera-Prat O. Goñi A. Valbuena A. M. Vera À. Gómez-Sicilia F. Losada-Urzáiz V. N. Uversky M. Menéndez D. V. Laurents M. Bruix M. Carrión-Vázquez PLoS Biol. 2012 10 e1001335
73. D. K. Klimov J. E. Straub D. Thirumalai Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2004 101 14760
74. N. Sibille A. Sillen A. Leroy J.-M. Wieruszessi B. Mulloy I. Landrieu G. Lippens Biochemistry 2006 45 12560