A Boolean view separates platelet activatory and inhibitory signalling as verified by phosphorylation monitoring including threshold behaviour and integrin modulation

Molecular BioSystems

Volumn 9, Issue 6, 2013, Pages 1326-1339

  Mischnik, Marcel ^a   Boyanova, Desislava ^b   Hubertus, Katharina ^c   Geiger, Jörg ^c   Philippi, Nicole ^d   Dittrich, Marcus ^b   Wangorsch, Gaby ^b   Timmer, Jens ^a   Dandekar, Thomas ^b,e  

^a UNIVERSITY OF FREIBURG   (Germany)

^b Department of Bioinformatics Biocenter ^*  (Germany)

^c Institute of Clinical Biochemistry and Pathobiochemistry   (Germany)

^d MAX PLANCK INSTITUTE FOR BIOLOGY OF AGEING   (Germany)

^e EUROPEAN MOLECULAR BIOLOGY LABORATORY   (Germany)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ACETYLSALICYLIC ACID; ANTITHROMBOCYTIC AGENT; CLOPIDOGREL; DRUG DERIVATIVE; ILOPROST; INTEGRIN; MILRINONE; PROTEIN KINASE B; TICLOPIDINE;

ARTICLE; BIOLOGICAL MODEL; BLEEDING; CARDIOVASCULAR DISEASE; DRUG EFFECT; HUMAN; METABOLISM; MOLECULAR DYNAMICS; PHOSPHORYLATION; SIGNAL TRANSDUCTION; THROMBOCYTE; THROMBOCYTE ACTIVATION; THROMBOCYTE AGGREGATION; ANALOGS AND DERIVATIVES; CARDIOVASCULAR DISEASES; DRUG EFFECTS; HEMORRHAGE;

ASPIRIN; BLOOD PLATELETS; CARDIOVASCULAR DISEASES; HEMORRHAGE; HUMANS; ILOPROST; INTEGRINS; MILRINONE; MODELS, BIOLOGICAL; MOLECULAR DYNAMICS SIMULATION; PHOSPHORYLATION; PLATELET ACTIVATION; PLATELET AGGREGATION; PLATELET AGGREGATION INHIBITORS; PROTO-ONCOGENE PROTEINS C-AKT; SIGNAL TRANSDUCTION; TICLOPIDINE;

EID: 84877764996     PISSN: 1742206X     EISSN: 17422051     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/c3mb25597b     Document Type: Article

References (87)

1. R. Abbate G. Cioni I. Ricci M. Miranda A. M. Gori Thromb. Res. 2012 129 3 235 240
2. D. Lievens P. von Hundelshausen Thromb. Haemostasis 2011 106 5 827 838
3. R. Scheppenheim Thromb. Res. 2011 128 Suppl. 1 S3 S7
4. A. A. Weber T. Hohlfeld K. Schrör Platelets 1999 10 4 238 241
5. A. Singh J. M. Nascimento S. Kowar H. Busch M. Boerries Bioinformatics 2012 28 18 i495 i501
6. J. E. Purvis M. S. Chatterjee L. F. Brass S. L. Diamond Blood 2008 112 10 4069 4079
7. M. T. Walsh J. F. Foley B. T. Kinsella J. Biol. Chem. 2000 275 27 20412 20423
8. R. Schlatter K. Schmich I. Avalos Vizcarra P. Scheurich T. Sauter C. Borner M. T. Ederer I. Merfort O. Sawodny PLoS Comput. Biol. 2009 5 12 e1000595
9. N. Philippi D. Walter R. Schlatter K. Ferreira M. Ederer O. Sawodny J. Timmer C. Borner T. Dandekar BMC Syst. Biol. 2009 3 97
10. R. Schlatter N. Philippi G. Wangorsch R. Pick O. Sawodny C. Borner J. Timmer M. T. Ederer T. Dandekar Briefings Bioinf. 2012 13 3 365 376
11. C. E. Shannon AIEE Trans. 1938 57 471 495
12. A. Singh J. M. Nascimento S. Kowar H. Busch M. Boerries Bioinformatics 2012 28 18 i495 i501
13. J. Wollbold R. Huber D. Pohlers D. Koczan R. Guthke R. W. Kinne U. Gausmann BMC Syst. Biol. 2009 3 77
14. M. Cattaneo C. Gachet Haematologica 2001 86 4 346 348
15. J. Geiger P. Hönig-Liedl P. Schanzenbächer U. Walter Eur. J. Pharmacol. 1998 351 235 246
16. P. Savi C. Labouret N. Delesque F. Guette J. Lupker J. M. Herbert Biochem. Biophys. Res. Commun. 2001 283 2 379 388
17. J. Liu T. I. Pestina M. C. Berndt S. A. Steward C. W. Jackson T. K. Gartner J. Thromb. Haemostasis 2004 2 12 2213 2222
18. D. Boyanova S. Nilla I. Birschmann T. Dandekar M. Dittrich Blood 2012 119 3 e22 e34
19. M. Billah E. G. Lapetina P. Cuatrecasas J. Biol. Chem. 1980 255 21 10227 10231
20. S. E. Rittenhouse J. P. Sasson Nouv. Rev. Fr. Hematol. 1985 27 4 239 242
21. R. I. Kirk M. R. Sanderson K. M. Lerea J. Biol. Chem. 2000 275 40 30901 30906
22. A. Smolenski J. Thromb. Haemostasis 2012 10 2 167 176
23. H. Abrahamsen T. Vang K. Taskén J. Biol. Chem. 2003 278 19 17170 17177
24. K. S. Murthy H. Zhou Am. J. Physiol.: Gastrointest. Liver Physiol. 2003 284 2 G221 G230
25. A. A. Weber T. Hohlfeld K. Schrör Platelets 1999 10 4 238 241
26. M. A. Feijge K. Ansink K. Vanschoonbeek J. W. Heemskerk Biochem. Pharmacol. 2004 67 8 1559 1567
27. J. Geiger T. Brandmann K. Hubertus B. Tjahjadi R. Schinzel U. Walter Anal. Biochem. 2010 407 2 261 269
28. J. Liu T. I. Pestina M. C. Berndt S. A. Steward C. W. Jackson T. K. Gartner J. Thromb. Haemostasis 2004 2 12 2213 2222
29. A. Braun D. Varga-Szabo C. Kleinschnitz I. Pleines M. Bender Blood 2009 113 9 2056 2063
30. M. P. Mahaut-Smith S. Jones R. J. Evans Purinergic Signalling 2011 7 3 341 356
31. S. Klamt J. Saez-Rodriguez E. D. Gilles BMC Syst. Biol. 2007 1 2
32. S. Klamt J. Saez-Rodriguez J. A. Lindquist L. Simeoni E. D. Gilles BMC Bioinf. 2006 7 56
33. A. Di Cara A. Garg G. De Micheli I. Xenarios L. Mendoza BMC Bioinf. 2007 8 462
34. J. Geiger P. Hönig-Liedl P. Schanzenbächer U. Walter Eur. J. Pharmacol. 1998 351 235 246
35. E. G. Lapetina B. Reep B. R. Ganong R. M. Bell J. Biol. Chem. 1985 260 3 1358 1361
36. K. S. Authi N. Crawford Biochem. J. 1985 230 1 247 253
37. J. R. Crittenden W. Bergmeier Y. Zhang C. L. Piffath Y. Liang D. D. Wagner D. E. Housman A. M. Graybiel Nat. Med. 2004 10 9 982 986
38. U. Liebenhoff A. Greinacher Cell Mol. Biol. 1994 40 5 645 652
39. K. S. Murthy H. Zhou Am. J. Physiol. 2003 284 2 G221 G230
40. B. Xiang G. Zhang J. Thromb. Haemostasis 2010 8 9 2032 2041
41. R. I. Kirk M. R. Sanderson K. M. Lerea J. Biol. Chem. 2000 275 40 30901 30906
42. M. Cattaneo M. T. Canciani A. Lecchi R. L. Kinlough-Rathbone M. A. Packham P. M. Mannucci J. F. Mustard Blood 1990 75 5 1081 1086
43. M. Cattaneo C. Gachet Haematologica 2001 86 4 346 348
44. G. Wangorsch E. Butt R. Mark K. Hubertus J. Geiger T. Dandekar M. Dittrich BMC Syst. Biol. 2011 5 17
45. R. L. Jones D. F. Woodward J. W. Wang R. L. Clark Br. J. Pharmacol. 2011 162 4 863 879
46. S. Grüner M. Prostredna M. Koch Y. Miura V. Schulte S. M. Jung M. Moroi B. Nieswandt Blood 2005 105 4 1492 1499
47. Y. Li B. C. Tai W. Sia Q. H. Phua M. A. Richards A. Low K. H. Chan S. G. Teo T. B. Sim C. H. Lee M. T. Roe T. C. Yeo H. C. Tan M. Y. Chan J. Thromb. Thrombolysis 2012 34 4 499 505
48. H. Haberstock-Debic P. Andre S. Mills D. R. Phillips P. B. Conley J. Pharmacol. Exp. Ther. 2011 339 1 54 61
49. D. Iyú J. R. Glenn A. E. White S. C. Fox N. Dovlatova S. Heptinstall Platelets 2011 22 7 504 515
50. R. L. Jones D. F. Woodward J. W. Wang R. L. Clark Br. J. Pharmacol. 2011 162 4 863 879
51. M. T. Walsh J. F. Foley B. T. Kinsella J. Biol. Chem. 2000 275 27 20412 20423
52. P. V. Hornbeck I. Chabra J. M. Kornhauser E. Skrzypek B. Zhang Proteomics 2004 4 6 1551 1561
53. C. D. Hu K. Kariya J. Biol. Chem. 1999 274 1 48 51
54. M. K. Thomas S. H. Francis J. D. Corbin J. Biol. Chem. 1990 265 25 14971 14978
55. M. Pozuelo Rubi D. G. Campbell N. A. Morrice C. Mackintosh Biochem. J. 2005 392 163 172
56. L. M. Brill W. Xiong K. B. Lee S. B. Ficarro A. Crain Y. Xu A. Terskikh E. Y. Snyder S. Ding Cell Stem Cell 2009 5 2 204 213
57. G. Han M. Ye Electrophoresis 2010 31 6 1080 1089
58. C. Pan J. V. Olsen H. Daub M. Mann Mol. Cell. Proteomics 2009 8 12 2796 2808
59. R. Zahedi U. Lewandrowski J. Wiesner S. Wortelkamp J. Moebius C. Schütz J. Proteome Res. 2008 7 2 526 534
60. Y. Obara K. Labudda T. J. Dillon P. J. Stork J. Cell Sci. 2004 117 Pt 25 6085 6094
61. L. Lou J. Urbani F. Ribeiro-Neto D. L. Altschuler J. Biol. Chem. 2002 277 36 32799 32806
62. Y. Miura K. Kaibuchi T. Itoh J. D. Corbin S. H. Francis Y. Takai FEBS Lett. 1992 297 1-2 171 174
63. C. D. Hu K. Kariya J. Biol. Chem. 1999 274 1 48 51
64. A. Banno M. H. Ginsberg Biochem. Soc. Trans. 2008 36 Pt 2 229 234
65. R. W. Hunter C. Mackintosh I. Hers J. Biol. Chem. 2009 284 18 12339 12348
66. C. Kroner K. Eybrechts J. W. Akkerman J. Biol. Chem. 2000 275 36 27790 27798
67. L. P. Kelley-Hickie B. T. Kinsella Br. J. Pharmacol. 2004 142 1 203 221
68. M. Leslie Science 2010 328 5978 562 564
69. A. Karniguian F. Grelac S. Levy-Toledano Y. J. Legrand F. Rendu Biochem. J. 1990 268 2 325 331
70. M. F. Hoylaerts C. Oury E. Toth-Zsamboki J. Vermylen Platelets 2000 11 6 307 309
71. A. D. Kohn F. Takeuchi R. A. Roth J. Biol. Chem. 1996 271 36 21920 21926
72. B. Hechler C. Léon C. Vial P. Vigne C. Frelin J. P. Cazenave C. Gachet Blood 1998 92 1 152 159
73. N. Watanabe L. Bodin M. Pandey M. Krause S. Coughlin V. A. Boussiotis M. H. Ginsberg S. J. Shattil J. Cell Biol. 2008 181 7 1211 1222
74. M. G. Rolf M. P. Mahaut-Smith Thromb. Haemostasis 2002 88 3 495 502
75. J. L. Daniel C. Dangelmaier J. Jin Y. B. Kim S. P. Kunapuli Thromb. Haemostasis 1999 82 4 1322 1326
76. P. K. Forsell A. O. Olsson E. Andersson L. Nallan M. H. Gelb Biochem. Pharmacol. 2005 71 1-2 144 155
77. J. Balsinde M. A. Balboa E. A. Dennis Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1998 95 14 7951 7956
78. P. C. Kam A. U. See Anaesthesia 2000 55 5 442 449
79. N. Nakahata Pharmacol. Ther. 2008 118 1 18 35
80. Y. Suzuki M. Yamamoto H. Wada M. Ito T. Nakano Y. Sasaki S. Narumiya H. Shiku M. Nishikawa Blood 1999 93 10 3408 3417
81. A. Ishii-Watabe E. Uchida H. Mizuguchi T. Hayakawa Life Sci. 2001 69 8 945 960
82. B. G. Petrich P. Marchese Z. M. Ruggeri S. Spiess R. A. Weichert F. Ye R. Tiedt R. C. Skoda S. J. Monkley D. R. Critchley M. H. Ginsberg J. Exp. Med. 2007 204 13 3103 3111
83. R. A. Armstrong Pharmacol. Ther. 1996 72 3 171 191
84. T. H. Fischer G. C. White Biochem. Biophys. Res. Commun. 1987 149 2 700 706
85. W. Siess D. A. Winegar E. G. Lapetina Biochem. Biophys. Res. Commun. 1990 170 2 944 950
86. J. Qiao O. Holian B. S. Lee F. Huang J. Zhang H. Lum Am. J. Physiol.: Cell Physiol. 2008 295 5 C1161 C1168
87. J. Jin T. M. Quinton J. Zhang S. E. Rittenhouse S. P. Kunapuli Blood 2002 99 1 193 198