Computationally Designed Peptide Inhibitors of the Ubiquitin E3 Ligase SCFFbx4

ChemBioChem

Volumn 14, Issue 4, 2013, Pages 445-451

  Lee, Junglim ^a   Sammond, Deanne W ^a   Fiorini, Zeno ^a   Saludes, Jonel P ^a   Resch, Michael G ^b   Hao, Bing ^c   Wang, Wei ^a   Yin, Hang ^a   Liu, Xuedong ^a  

^a UNIVERSITY OF COLORADO   (United States)

^b NATIONAL RENEWABLE ENERGY LABORATORY   (United States)

^c UNIVERSITY OF CONNECTICUT HEALTH CENTER   (United States)

Author keywords

Inhibitors; Ligases; Protein protein interactions; Telomere repeat binding factor 1; Ubiquitylation

Indexed keywords

LIGASE INHIBITOR; METHIONYLPROLYLISOLEUCYLALANYLTRYPTOPHYLYSYLPHENYLALANYLHISTIDYLARGINYLMETHIONYLSERYLLYSYLMETHIONYLGLYCYLTHREONYLGLYCINE; METHIONYLPROLYLISOLEUCYLPHENYLALANYLTRYPTOPHYLYSYLALANYLHISTIDYLARGINYLMETHIONYLSERYLLYSYLMETHIONYLGLYCYLTHREONYLGLYCINE; METHIONYLPROLYLISOLEUCYLPHENYLALANYLTRYPTOPHYLYSYLPHENYLALANYLHISTIDYLARGINYLMETHIONYLSERYLLYSYLMETHIONYLGLYCYLTHREONYLGLYCINE; UBIQUITIN PROTEIN LIGASE E3; UBIQUITIN PROTEIN LIGASE E3 INHIBITOR; UNCLASSIFIED DRUG;

ARTICLE; CRYSTAL STRUCTURE; DRUG DESIGN; DRUG PROTEIN BINDING; ENZYME SUBSTRATE; IC 50; MOLECULAR MODEL; PRIORITY JOURNAL; UBIQUITINATION;

AMINO ACID SEQUENCE; DRUG DESIGN; F-BOX PROTEINS; HUMANS; MODELS, MOLECULAR; MOLECULAR SEQUENCE DATA; MUTATION; PEPTIDES; PROTEIN BINDING; PROTEIN INTERACTION MAPS; TELOMERIC REPEAT BINDING PROTEIN 1; UBIQUITINATION;

EID: 84874371299     PISSN: 14394227     EISSN: 14397633     Source Type: Journal    
DOI: 10.1002/cbic.201200777     Document Type: Article

References (43)

1. J. Feng, W. D. Funk, S. S. Wang, S. L. Weinrich, A. A. Avilion, C. P. Chiu, R. R. Adams, E. Chang, R. C. Allsopp, J. Yu et al., Science 1995, 269, 1236.
2. C. A. Schmitt, Nat. Rev. Cancer 2003, 3, 286.
3. N. W. Kim, M. A. Piatyszek, K. R. Prowse, C. B. Harley, M. D. West, P. L. Ho, G. M. Coviello, W. E. Wright, S. L. Weinrich, J. W. Shay, Science 1994, 266, 2011.
4. J. W. Shay, Cancer J. Sci. Am. 1998, 4, S26.
5. J. Murakami, N. Nagai, K. Shigemasa, K. Ohama, Eur. J. Cancer 1999, 35, 1027.
6. E. Pascolo, C. Wenz, J. Lingner, N. Hauel, H. Priepke, I. Kauffmann, P. Garin-Chesa, W. J. Rettig, K. Damm, A. Schnapp, J. Biol. Chem. 2002, 277, 15566.
7. C. Strahl, E. H. Blackburn, Nucleic Acids Res. 1994, 22, 893.
8. J. T. Chang, Y. C. Lu, Y. J. Chen, C. P. Tseng, Y. L. Chen, C. W. Fang, A. J. Cheng, Br. J. Cancer 2006, 94, 870.
9. M. A. Shammas, C. G. Simmons, D. R. Corey, R. J. Shmookler Reis, Oncogene 1999, 18, 6191.
10. M. W. Djojosubroto, A. C. Chin, N. Go, S. Schaetzlein, M. P. Manns, S. Gryaznov, C. B. Harley, K. L. Rudolph, Hepatology 2005, 42, 1127.
11. M. Read, R. J. Harrison, B. Romagnoli, F. A. Tanious, S. H. Gowan, A. P. Reszka, W. D. Wilson, L. R. Kelland, S. Neidle, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2001, 98, 4844.
12. A. M. Rankin, D. V. Faller, R. A. Spanjaard, Anti-Cancer Drugs 2008, 19, 329.
13. A. Smogorzewska, B. van Steensel, A. Bianchi, S. Oelmann, M. R. Schaefer, G. Schnapp, T. de Lange, Mol. Cell. Biol. 2000, 20, 1659.
14. B. van Steensel, T. de Lange, Nature 1997, 385, 740.
15. K. Ancelin, M. Brunori, S. Bauwens, C. E. Koering, C. Brun, M. Ricoul, J. P. Pommier, L. Sabatier, E. Gilson, Mol. Cell. Biol. 2002, 22, 3474.
16. J. Karlseder, D. Broccoli, Y. Dai, S. Hardy, T. de Lange, Science 1999, 283, 1321.
17. A. Smogorzewska, T. de Lange, EMBO J. 2002, 21, 4338.
18. Y. R. Her, I. K. Chung, J. Biol. Chem. 2009, 284, 8557.
19. Z. Zeng, W. Wang, Y. Yang, Y. Chen, X. Yang, J. A. Diehl, X. Liu, M. Lei, Dev. Cell 2010, 18, 214.
20. R. Y. Tsai, Cell Cycle 2009, 8, 2912.
21. Q. Zhu, H. Yasumoto, R. Y. Tsai, Mol. Cell. Biol. 2006, 26, 9279.
22. Q. Zhu, L. Meng, J. K. Hsu, T. Lin, J. Teishima, R. Y. Tsai, J. Cell Biol. 2009, 185, 827.
23. T. H. Lee, K. Perrem, J. W. Harper, K. P. Lu, X. Z. Zhou, J. Biol. Chem. 2006, 281, 759.
24. X. Z. Zhou, K. P. Lu, Cell 2001, 107, 347.
25. W. Chang, J. N. Dynek, S. Smith, Genes Dev. 2003, 17, 1328.
26. L. T. Vassilev, B. T. Vu, B. Graves, D. Carvajal, F. Podlaski, Z. Filipovic, N. Kong, U. Kammlott, C. Lukacs, C. Klein, N. Fotouhi, E. A. Liu, Science 2004, 303, 844.
27. P. H. Kussie, S. Gorina, V. Marechal, B. Elenbaas, J. Moreau, A. J. Levine, N. P. Pavletich, Science 1996, 274, 948.
28. M. Liu, C. Li, M. Pazgier, C. Li, Y. Mao, Y. Lv, B. Gu, G. Wei, W. Yuan, C. Zhan, W. Y. Lu, W. Lu, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2010, 107, 14321.
29. J. A. Kritzer, M. E. Hodsdon, A. Schepartz, J. Am. Chem. Soc. 2005, 127, 4118.
30. J. A. Kritzer, R. Zutshi, M. Cheah, F. A. Ran, R. Webman, T. M. Wongjirad, A. Schepartz, ChemBioChem 2006, 7, 29.
31. N. London, B. Raveh, D. Movshovitz-Attias, O. Schueler-Furman, Proteins Struct. Funct. Bioinf. 2010, 78, 3140.
32. D. W. Sammond, Z. M. Eletr, C. Purbeck, R. J. Kimple, D. P. Siderovski, B. Kuhlman, J. Mol. Biol. 2007, 371, 1392.
33. S. J. Fleishman, T. A. Whitehead, D. C. Ekiert, C. Dreyfus, J. E. Corn, E. M. Strauch, I. A. Wilson, D. Baker, Science 2011, 332, 816.
34. C. A. Rohl, C. E. Strauss, K. M. Misura, D. Baker, Methods Enzymol. 2004, 383, 66.
35. C. Cenciarelli, D. S. Chiaur, D. Guardavaccaro, W. Parks, M. Vidal, M. Pagano, Curr. Biol. 1999, 9, 1177.
36. D. I. Lin, O. Barbash, K. G. Kumar, J. D. Weber, J. W. Harper, A. J. Klein-Szanto, A. Rustgi, S. Y. Fuchs, J. A. Diehl, Mol. Cell 2006, 24, 355.
37. P. G. Richardson, B. Barlogie, J. Berenson, S. Singhal, S. Jagannath, D. Irwin, S. V. Rajkumar, G. Srkalovic, M. Alsina, R. Alexanian, D. Siegel, R. Z. Orlowski, D. Kuter, S. A. Limentani, S. Lee, T. Hideshima, D. L. Esseltine, M. Kauffman, J. Adams, D. P. Schenkein, K. C. Anderson, N. Engl. J. Med. 2003, 348, 2609.
38. R. Aurora, G. D. Rose, Protein Sci. 1998, 7, 21.
39. G. Dantas, C. Corrent, S. L. Reichow, J. J. Havranek, Z. M. Eletr, N. G. Isern, B. Kuhlman, G. Varani, E. A. Merritt, D. Baker, J. Mol. Biol. 2007, 366, 1209.
40. B. A. Schulman, A. C. Carrano, P. D. Jeffrey, Z. Bowen, E. R. Kinnucan, M. S. Finnin, S. J. Elledge, J. W. Harper, M. Pagano, N. P. Pavletich, Nature 2000, 408, 381.
41. Y. Chen, Y. Yang, M. van Overbeek, J. R. Donigian, P. Baciu, T. de Lange, M. Lei, Science 2008, 319, 1092.
42. B. Hao, N. Zheng, B. A. Schulman, G. Wu, J. J. Miller, M. Pagano, N. P. Pavletich, Mol. Cell 2005, 20, 9.
43. B. Demeler in Analytical Ultracentrifugation: Techniques and Methods (Eds.: D. J. Scott, S. E. Harding, A. J. Rowe), Royal Society of Chemistry, Cambridge, 2005, pp. 210-229.