Structure of the HECT C-lobe of the UBR5 E3 ubiquitin ligase

Acta Crystallographica Section F: Structural Biology and Crystallization Communications

Volumn 68, Issue 10, 2012, Pages 1158-1163

  Matta Camacho, Edna ^a   Kozlov, Guennadi ^a   Menade, Marie ^a   Gehring, Kalle ^a  

^a MCGILL UNIVERSITY   (Canada)

Author keywords

C lobe; E3 ubiquitin ligases; HECT domains; UBR5

Indexed keywords

UBIQUITIN PROTEIN LIGASE; UBR5 PROTEIN, HUMAN;

AMINO ACID SEQUENCE; ARTICLE; CHEMICAL STRUCTURE; CHEMISTRY; HUMAN; MOLECULAR GENETICS; PROTEIN TERTIARY STRUCTURE; SEQUENCE ALIGNMENT;

AMINO ACID SEQUENCE; HUMANS; MODELS, MOLECULAR; MOLECULAR SEQUENCE DATA; PROTEIN STRUCTURE, TERTIARY; SEQUENCE ALIGNMENT; UBIQUITIN-PROTEIN LIGASES;

EID: 84867243933     PISSN: None     EISSN: 17443091     Source Type: Journal    
DOI: 10.1107/S1744309112036937     Document Type: Article

References (42)

1. Ardley, H. C., Hung, C.-C. & Robinson, P. A. (2005). FEBS Lett. 579, 571-576.
2. Arnold, J., Dawson, S., Fergusson, J., Lowe, J., Landon, M. & Mayer, R. J. (1998). Prog. Brain Res. 117, 23-34.
3. Bartels, C., Xia, T. H., Billeter, M., Guntert, P. & Wuthrich, K. (1995). J. Biomol. NMR, 6, 1-10.
4. Choi,W. S., Jeong, B.-C., Joo, Y. J., Lee,M.-R., Kim, J., Eck, M. J. & Song, H. K. (2010). Nature Struct. Mol. Biol. 17, 1175-1181.
5. Clancy, J. L. et al. (2003). Oncogene, 22, 5070-5081.
6. Cojocaru, M., Bouchard, A., Cloutier, P., Cooper, J. J., Varzavand, K., Price, D. H. & Coulombe, B. (2010). J. Biol. Chem. 286, 5012-5022.
7. Delaglio, F., Grzesiek, S., Vuister, G.W., Zhu, G., Pfeifer, J. & Bax, A. (1995). J. Biomol. NMR, 6, 277-293.
8. Deo, R. C., Sonenberg, N. & Burley, S. K. (2001). Proc. Natl Acad. Sci. USA, 98, 4414-4419.
9. Eblen, S. T., Kumar, N. V., Shah, K., Henderson, M. J., Watts, C. K., Shokat, K. M. & Weber, M. J. (2003). J. Biol. Chem. 278, 14926-14935.
10. Emsley, P. & Cowtan, K. (2004). Acta Cryst. D60, 2126-2132.
11. Fuja, T. J., Lin, F., Osann, K. E. & Bryant, P. J. (2004). Cancer Res. 64, 942-951.
12. Hamilton, K. S., Ellison, M. J. & Shaw, G. S. (2000a). J. Biomol. NMR, 16, 351-352.
13. Hamilton, K. S., Ellison, M. J. & Shaw, G. S. (2000b). J. Biomol. NMR, 18, 319-327.
14. Hay-Koren, A., Caspi, M., Zilberberg, A. & Rosin-Arbesfeld, R. (2010). Mol. Biol. Cell, 22, 399-411.
15. Henderson, M. J., Munoz, M. A., Saunders, D. N., Clancy, J. L., Russell, A. J., Williams, B., Pappin, D., Khanna, K. K., Jackson, S. P., Sutherland, R. L. & Watts, C. K. (2006). J. Biol. Chem. 281, 39990-40000.
16. Henderson, M. J., Russell, A. J., Hird, S., Mun oz, M., Clancy, J. L., Lehrbach, G. M., Calanni, S. T., Jans, D. A., Sutherland, R. L. & Watts, C. K. (2002). J. Biol. Chem. 277, 26468-26478.
17. Hershko, A. & Ciechanover, A. (1986). Prog. Nucleic Acid Res. Mol. Biol. 33, 19-56.
18. Hershko, A. & Ciechanover, A. (1998). Annu. Rev. Biochem. 67, 425-479.
19. Hofmann, R. M. & Pickart, C. M. (2001). J. Biol. Chem. 276, 27936-27943.
20. Honda, Y., Tojo, M., Matsuzaki, K., Anan, T., Matsumoto, M., Ando, M., Saya, H. & Nakao, M. (2002). J. Biol. Chem. 277, 3599-3605.
21. Hu, G., Wang, X., Saunders, D. N., Henderson, M., Russell, A. J., Herring, B. P. & Zhou, J. (2010). J. Biol. Chem. 285, 11800-11809.
22. Huang, L., Kinnucan, E., Wang, G., Beaudenon, S., Howley, P. M., Huibregtse, J. M. & Pavletich, N. P. (1999). Science, 286, 1321-1326.
23. Huibregtse, J. M., Scheffner, M., Beaudenon, S. & Howley, P. M. (1995). Proc. Natl Acad. Sci. USA, 92, 2563-2567.
24. Kamadurai, H. B., Souphron, J., Scott, D. C., Duda, D. M., Miller, D. J., Stringer, D., Piper, R. C. & Schulman, B. A. (2009). Mol. Cell, 36, 1095-1102.
25. Kim, H. C. & Huibregtse, J. M. (2009). Mol. Cell. Biol. 29, 3307-3318.
26. Kim, H. C., Steffen, A. M., Oldham, M. L., Chen, J. & Huibregtse, J. M. (2011). EMBO Rep. 12, 334-341.
27. Kozlov, G., Nguyen, L., Lin, T., De Crescenzo, G., Park, M. & Gehring, K. (2007). J. Biol. Chem. 282, 35787-35795.
28. Kozlov, G., Trempe, J.-F., Khaleghpour, K., Kahvejian, A., Ekiel, I. & Gehring, K. (2001). Proc. Natl Acad. Sci. USA, 98, 4409-4413.
29. Makiniemi, M., Hillukkala, T., Tuusa, J., Reini, K., Vaara, M., Huang, D., Pospiech, H., Majuri, I.,Westerling, T., Makela, T. P. & Syvaoja, J. E. (2001). J. Biol. Chem. 276, 30399-30406.
30. Maspero, E., Mari, S., Valentini, E., Musacchio, A., Fish, A., Pasqualato, S. & Polo, S. (2011). EMBO Rep. 12, 342-349.
31. Matta-Camacho, E., Kozlov, G., Li, F. F. & Gehring, K. (2010). Nature Struct. Mol. Biol. 17, 1182-1187.
32. Murshudov, G. N., Skubá k, P., Lebedev, A. A., Pannu, N. S., Steiner, R. A., Nicholls, R. A., Winn, M. D., Long, F. & Vagin, A. A. (2011). Acta Cryst. D67, 355-367.
33. Ogunjimi, A. A., Briant, D. J., Pece-Barbara, N., Le Roy, C., Di Guglielmo, G. M., Kavsak, P., Rasmussen, R. K., Seet, B. T., Sicheri, F. & Wrana, J. L. (2005). Mol. Cell, 19, 297-308.
34. Ogunjimi, A. A.,Wiesner, S., Briant, D. J., Varelas, X., Sicheri, F., Forman-Kay, J. & Wrana, J. L. (2010). J. Biol. Chem. 285, 6308-6315.
35. Otwinowski, Z. & Minor, W. (1997). Methods Enzymol. 276, 307-326.
36. Pandya, R. K., Partridge, J. R., Love, K. R., Schwartz, T. U. & Ploegh, H. L. (2010). J. Biol. Chem. 285, 5664-5673.
37. Read, R. J. (2001). Acta Cryst. D57, 1373-1382.
38. Tasaki, T., Mulder, L. C. F., Iwamatsu, A., Lee, M. J., Davydov, I. V., Varshavsky, A., Muesing,M. & Kwon, Y. T. (2005). Mol. Cell. Biol. 25, 7120-7136.
39. Thompson, J. D., Higgins, D. G. & Gibson, T. J. (1994). Nucleic Acids Res. 22, 4673-4680.
40. Verdecia, M. A., Joazeiro, C. A., Wells, N. J., Ferrer, J.-L., Bowman, M. E., Hunter, T. & Noel, J. P. (2003). Mol. Cell, 11, 249-259.
41. Wang, M. & Pickart, C. M. (2005). EMBO J. 24, 4324-4333.
42. Yoshida, M., Yoshida, K., Kozlov, G., Lim, N. S., De Crescenzo, G., Pang, Z., Berlanga, J. J., Kahvejian, A., Gehring, K., Wing, S. S. & Sonenberg, N. (2006). EMBO J. 25, 1934-1944.