Structural basis for the activation of platelet integrin αiIbβ3 by calcium- and integrin-binding protein 1

Journal of the American Chemical Society

Volumn 134, Issue 8, 2012, Pages 3864-3872

  Huang, Hao ^a,b   Vogel, Hans J ^a  

^a UNIVERSITY OF CALGARY   (Canada)

^b MOUNT SINAI HOSPITAL   (Canada)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

BINDING INTERFACE; BINDING PARTNERS; BLOOD COAGULATION; COMPLEX STRUCTURE; CROSS-SATURATION; CYTOPLASMIC DOMAINS; DATA-DRIVEN; HYDROPHOBIC POCKETS; INTEGRIN BINDING; METHYL GROUP; MOLECULAR MECHANISM; N-TERMINALS; PLATELET AGGREGATION; PLATELET INTEGRIN; POSITIVELY CHARGED; PROTEIN COMPLEXES; PROTEIN-PROTEIN INTERACTIONS; PROTONATED; RADIO FREQUENCIES; SOLUTION STRUCTURES; SPECIFIC BINDING; STRUCTURAL BASIS; SYNTHETIC PEPTIDE;

DEUTERIUM; FUNCTIONAL GROUPS; NUCLEAR MAGNETIC RESONANCE SPECTROSCOPY; PEPTIDES; PLATELETS;

CALCIUM;

BINDING PROTEIN; CALCIUM AND INTEGRIN BINDING PROTEIN 1; INTEGRIN; INTEGRIN ALPHAIIB BETA3; UNCLASSIFIED DRUG;

ALPHA HELIX; AMINO TERMINAL SEQUENCE; ARTICLE; CARBOXY TERMINAL SEQUENCE; COMPLEX FORMATION; CONTROLLED STUDY; CYTOPLASM; HYDROPHOBICITY; ISOTOPE LABELING; MOLECULAR DYNAMICS; NUCLEAR MAGNETIC RESONANCE SPECTROSCOPY; PROTEIN BINDING; PROTEIN DOMAIN; PROTEIN PROTEIN INTERACTION; PROTEIN STRUCTURE; PROTON TRANSPORT; RADIOFREQUENCY RADIATION; THROMBOCYTE;

BLOOD PLATELETS; CALCIUM; CALCIUM-BINDING PROTEINS; NUCLEAR MAGNETIC RESONANCE, BIOMOLECULAR; PLATELET GLYCOPROTEIN GPIIB-IIIA COMPLEX; PROTEIN CONFORMATION;

EID: 84863272301     PISSN: 00027863     EISSN: 15205126     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ja2111306     Document Type: Article

References (63)

1. Luo, B. H.; Carman, C. V.; Springer, T. A. Annu. Rev. Immunol. 2007, 25, 619-647
2. Hynes, R. O. Cell 2002, 110, 673-687
3. Leisner, T. M.; Yuan, W. P.; DeNofrio, J. C.; Liu, J.; Parise, L. V. Curr. Opin. Hematol. 2007, 14, 255-261
4. Kim, M.; Carman, C. V.; Springer, T. A. Science 2003, 301, 1720-1725
5. Ulmer, T. S.; Yaspan, B.; Ginsberg, M. H.; Campbell, I. D. Biochemistry 2001, 40, 7498-7508
6. Weljie, A. M.; Hwang, P. M.; Vogel, H. J. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2002, 99, 5878-5883
7. Yang, J.; Ma, Y. Q.; Page, R. C.; Misra, S.; Plow, E. F.; Qin, J. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2009, 106, 17729-17734
8. Metcalf, D. G.; Moore, D. T.; Wu, Y.; Kielec, J. M.; Molnar, K.; Valentine, K. G.; Wand, A. J.; Bennett, J. S.; DeGrado, W. F. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2010, 107, 22481-22486
9. Wegener, K. L.; Partridge, A. W.; Han, J.; Pickford, A. R.; Liddington, R. C.; Ginsberg, M. H.; Campbell, I. D. Cell 2007, 128, 171-182
10. Naik, U. P.; Patel, P. M.; Parise, L. V. J. Biol. Chem. 1997, 272, 4651-4654
11. Gifford, J. L.; Walsh, M. P.; Vogel, H. J. Biochem. J. 2007, 405, 199-221
12. Yamniuk, A. P.; Vogel, H. J. Protein Sci. 2005, 14, 1429-1437
13. Barry, W. T.; Boudignon-Proudhon, C.; Shock, D. D.; McFadden, A.; Weiss, J. M.; Sondek, J.; Parise, L. V. J. Biol. Chem. 2002, 277, 28877-28883
14. Tsuboi, S. J. Biol. Chem. 2002, 277, 1919-1923
15. Burgoyne, R. D. Biochim. Biophys. Acta 2004, 1742, 59-68
16. Yamniuk, A. P.; Nguyen, L. T.; Hoang, T. T.; Vogel, H. J. Biochemistry 2004, 43, 2558-2568
17. Huang, H.; Ishida, H.; Yamniuk, A. P.; Vogel, H. J. J. Biol. Chem. 2011, 286, 17181-17192
18. Yamniuk, A. P.; Ishida, H.; Vogel, H. J. J. Biol. Chem. 2006, 281, 26455-26464
19. Tsuboi, S.; Nonoyama, S.; Ochs, H. D. EMBO Rep. 2006, 7, 506-511
20. Yuan, W. P.; Leisner, T. M.; McFadden, A. W.; Wang, Z. Y.; Larson, M. K.; Clark, S.; Boudignon-Proudhon, C.; Lam, S. C. T.; Parise, L. V. J. Cell. Biol. 2006, 172, 169-175
21. Tugarinov, V.; Kanelis, V.; Kay, L. E. Nat. Protoc. 2006, 1, 749-754
22. Hansen, M. R.; Mueller, L.; Pardi, A. Nat. Struct. Biol. 1998, 5, 1065-1074
23. Ruckert, M.; Otting, G. J. Am. Chem. Soc. 2000, 122, 7793-7797
24. Yang, D. W.; Venters, R. A.; Mueller, G. A.; Choy, W. Y.; Kay, L. E. J. Biomol. NMR 1999, 14, 333-343
25. Cordier, F.; Dingley, A. J.; Grzesiek, S. J. Biomol. NMR 1999, 13, 175-180
26. Takahashi, H.; Miyazawa, M.; Ina, Y.; Fukunishi, Y.; Mizukoshi, Y.; Nakamura, H.; Shimada, I. J. Biomol. NMR 2006, 34, 167-177
27. Chou, J. J.; Li, S. P.; Bax, A. J. Biomol. NMR 2000, 18, 217-227
28. Cornilescu, G.; Delaglio, F.; Bax, A. J. Biomol. NMR 1999, 13, 289-302
29. Venters, R. A.; Farmer, B. T.; Fierke, C. A.; Spicer, L. J. Mol. Biol. 1996, 264, 1101-1116
30. Huang, H.; Ishida, H.; Vogel, H. J. Protein Sci. 2010, 19, 475-485
31. Chou, J. J.; Li, S. P.; Klee, C. B.; Bax, A. Nat. Struct. Biol. 2001, 8, 990-997
32. Park, C. J.; Lee, J. H.; Choi, B. S. Nucleic. Acids. Res. 2005, 33, 4172-4181
33. Pennestri, M.; Melino, S.; Contessa, G. M.; Casavola, E. C.; Paci, M.; Ragnini-Wilson, A.; Cicero, D. O. J. Biol. Chem. 2007, 282, 667-679
34. Verdone, G.; Corazza, A.; Colebrooke, S. A.; Cicero, D.; Eliseo, T.; Boyd, J.; Doliana, R.; Fogolari, F.; Viglino, P.; Colombatti, A.; Campbell, I. D.; Esposito, G. J. Biomol. NMR 2009, 43, 79-96
35. Gifford, J. L.; Ishida, H.; Vogel, H. J. J. Biomol. NMR 2011, 50, 71-81
36. Arnold, K.; Bordoli, L.; Kopp, J.; Schwede, T. Bioinformatics 2006, 22, 195-201
37. Dominguez, C.; Boelens, R.; Bonvin, A. M. J. J. J. Am. Chem. Soc. 2003, 125, 1731-1737
38. De Vries, S. J.; van Dijk, M.; Bonvin, A. M. J. J. Nat. Protoc. 2010, 5, 883-897
39. Hwang, P. M.; Vogel, H. J. J. Mol. Recognit. 2000, 13, 83-92
40. Laskowski, R. A.; Macarthur, M. W.; Moss, D. S.; Thornton, J. M. J. Appl. Crystallogr. 1993, 26, 283-291
41. Clore, G. M.; Starich, M. R.; Bewley, C. A.; Cai, M. L.; Kuszewski, J. J. Am. Chem. Soc. 1999, 121, 6513-6514
42. Prestegard, J. H.; Bougault, C. M.; Kishore, A. I. Chem. Rev. 2004, 104, 3519-3540
43. Meiler, J.; Prompers, J. J.; Peti, W.; Griesinger, C.; Bruschweiler, R. J. Am. Chem. Soc. 2001, 123, 6098-6107
44. Fischer, M. W.; Losonczi, J. A.; Weaver, J. L.; Prestegard, J. H. Biochemistry 1999, 38, 9013-9022
45. Jain, N. U.; Wyckoff, T. J.; Raetz, C. R.; Prestegard, J. H. J. Mol. Biol. 2004, 343, 1379-1389
46. Cornilescu, G.; Marquardt, J. L.; Ottiger, M.; Bax, A. J. Am. Chem. Soc. 1998, 120, 6836-6837
47. Takahashi, H.; Nakanishi, T.; Kami, K.; Arata, Y.; Shimada, I. Nat. Struct. Biol. 2000, 7, 220-223
48. Shimada, I. Methods Enzymol. 2005, 394, 483-506
49. Kalk, A.; Berendsen, H. J. C. J. Magn. Reson. 1976, 24, 343-366
50. Takeda, M.; Terasawa, H.; Sakakura, M.; Yamaguchi, Y.; Kajiwara, M.; Kawashima, H.; Miyasaka, M.; Shimada, I. J. Biol. Chem. 2003, 278, 43550-43555
51. Shimada, I.; Ueda, T.; Matsumoto, M.; Sakakura, M.; Osawa, M.; Takeuchi, K.; Nishida, N.; Takahashi, H. Prog. Nucl. Magn. Reson. Spectrosc. 2009, 54, 123-140
52. Ikura, M.; Clore, G. M.; Gronenborn, A. M.; Zhu, G.; Klee, C. B.; Bax, A. Science 1992, 256, 632-638
53. Post, C. B. Curr. Opin. Struct. Biol. 2003, 13, 581-588
54. Koloka, V.; Christofidou, E. D.; Vaxevanelis, S.; Dimitriou, A. A.; Tsikaris, V.; Tselepis, A. D.; Panou-Pomonis, E.; Sakarellos-Daitsiotis, M.; Tsoukatos, D. C. Platelets 2008, 19, 502-511
55. Yamniuk, A. P.; Gifford, J. L.; Linse, S.; Vogel, H. J. Biochemistry 2008, 47, 1696-1707
56. Yamniuk, A. P.; Vogel, H. J. Calcium Binding Proteins 2006, 1, 150-155
57. Metcalf, D. G.; Kulp, D. W.; Bennett, J. S.; DeGrado, W. F. J. Mol. Biol. 2009, 392, 1087-1101
58. Lau, T. L.; Kim, C.; Ginsberg, M. H.; Ulmer, T. S. EMBO J. 2009, 28, 1351-1361
59. Vinogradova, O.; Velyvis, A.; Velyviene, A.; Hu, B.; Haas, T. A.; Plow, E. F.; Qin, J. Cell 2002, 110, 587-597
60. Wang, W.; Luo, B. H. J. Cell. Biochem. 2010, 109, 447-452
61. Zhu, J.; Luo, B. H.; Barth, P.; Schonbrun, J.; Baker, D.; Springer, T. A. Mol. Cell 2009, 34, 234-249
62. Vijayan, K. V.; Liu, Y.; Li, T. T.; Bray, P. F. J. Biol. Chem. 2004, 279, 33039-33042
63. Koradi, R.; Billeter, M.; Wuthrich, K. J. Mol. Graphics 1996, 14, 51-55