Impact of residual dipolar couplings on the accuracy of NMR structures determined from a minimal number of NOE restraints [9]

Journal of the American Chemical Society

Volumn 121, Issue 27, 1999, Pages 6513-6514

  Marius Clore, G ^a   Stanch, Mary R ^a   Bewley, Carole A ^a   Cai, Mengli ^a   Kuszewski, John ^a  

^a NATIONAL INSTITUTE OF DIABETES AND DIGESTIVE AND KIDNEY DISEASES   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ACCURACY; HYDROGEN BOND; LETTER; MOLECULAR DYNAMICS; NUCLEAR MAGNETIC RESONANCE; NUCLEAR OVERHAUSER EFFECT;

EID: 0344258272     PISSN: 00027863     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ja991143s     Document Type: Letter

References (23)

1. Gardner, K. H.; Kay, L. E. Annu. Rev. Biophys. Biomol. Struct. 1998, 27, 357-406.
2. Vuister, G. W.; Kim, S.-J.; Wu, C.; Bax, A. J. Am. Chem. Soc. 1994, 116, 9206-9210; Grzesiek, S., Wingfield, P. T., Stahl, S. J.; Kaufman, J. D.; Bax, A. J. Am. Chem. Soc. 1995, 117, 9594-9595; Metzler, W. J.; Wittekind M.; Goldfarb, V.; Mueller, L.; Farmer, B. T., II. J. Am. Chem. Soc. 1996, 118, 6800-6801; Smith, B. O.; Rosen, M. K.; Gardner, K. H.; Willis, R. C.; Parris, W. E., Pawson, T.; Kay, L. E. J. Mol. Biol. 1996, 263, 627-636; Ito, Y.; Raine, A.; Teichmann, S.; Ben-Tovim, L.; Nietlispach, D.; Broadhurst, R. W.; Terada, T.; Kelly, M.; Oschkinat, H.; Shibata, T.; Yokoyama, S.; Laue, E. D. J. Biomol. NMR 1996, 8, 360-368. Gardner, K. H.; Rosen M. K.; Kay, L. E. Biochemistry 1997, 36, 1389-1401; Wang, H.; Janowick, D. A.; Schkeryantz, J. M.; Liu, X.; Fesik, S. W. J. Am. Chem. Soc. 1999, 121, 1611- 1612.
3. Vuister, G. W.; Kim, S.-J.; Wu, C.; Bax, A. J. Am. Chem. Soc. 1994, 116, 9206-9210; Grzesiek, S., Wingfield, P. T., Stahl, S. J.; Kaufman, J. D.; Bax, A. J. Am. Chem. Soc. 1995, 117, 9594-9595; Metzler, W. J.; Wittekind M.; Goldfarb, V.; Mueller, L.; Farmer, B. T., II. J. Am. Chem. Soc. 1996, 118, 6800-6801; Smith, B. O.; Rosen, M. K.; Gardner, K. H.; Willis, R. C.; Parris, W. E., Pawson, T.; Kay, L. E. J. Mol. Biol. 1996, 263, 627-636; Ito, Y.; Raine, A.; Teichmann, S.; Ben-Tovim, L.; Nietlispach, D.; Broadhurst, R. W.; Terada, T.; Kelly, M.; Oschkinat, H.; Shibata, T.; Yokoyama, S.; Laue, E. D. J. Biomol. NMR 1996, 8, 360-368. Gardner, K. H.; Rosen M. K.; Kay, L. E. Biochemistry 1997, 36, 1389-1401; Wang, H.; Janowick, D. A.; Schkeryantz, J. M.; Liu, X.; Fesik, S. W. J. Am. Chem. Soc. 1999, 121, 1611- 1612.
4. Vuister, G. W.; Kim, S.-J.; Wu, C.; Bax, A. J. Am. Chem. Soc. 1994, 116, 9206-9210; Grzesiek, S., Wingfield, P. T., Stahl, S. J.; Kaufman, J. D.; Bax, A. J. Am. Chem. Soc. 1995, 117, 9594-9595; Metzler, W. J.; Wittekind M.; Goldfarb, V.; Mueller, L.; Farmer, B. T., II. J. Am. Chem. Soc. 1996, 118, 6800-6801; Smith, B. O.; Rosen, M. K.; Gardner, K. H.; Willis, R. C.; Parris, W. E., Pawson, T.; Kay, L. E. J. Mol. Biol. 1996, 263, 627-636; Ito, Y.; Raine, A.; Teichmann, S.; Ben-Tovim, L.; Nietlispach, D.; Broadhurst, R. W.; Terada, T.; Kelly, M.; Oschkinat, H.; Shibata, T.; Yokoyama, S.; Laue, E. D. J. Biomol. NMR 1996, 8, 360-368. Gardner, K. H.; Rosen M. K.; Kay, L. E. Biochemistry 1997, 36, 1389-1401; Wang, H.; Janowick, D. A.; Schkeryantz, J. M.; Liu, X.; Fesik, S. W. J. Am. Chem. Soc. 1999, 121, 1611- 1612.
5. Vuister, G. W.; Kim, S.-J.; Wu, C.; Bax, A. J. Am. Chem. Soc. 1994, 116, 9206-9210; Grzesiek, S., Wingfield, P. T., Stahl, S. J.; Kaufman, J. D.; Bax, A. J. Am. Chem. Soc. 1995, 117, 9594-9595; Metzler, W. J.; Wittekind M.; Goldfarb, V.; Mueller, L.; Farmer, B. T., II. J. Am. Chem. Soc. 1996, 118, 6800-6801; Smith, B. O.; Rosen, M. K.; Gardner, K. H.; Willis, R. C.; Parris, W. E., Pawson, T.; Kay, L. E. J. Mol. Biol. 1996, 263, 627-636; Ito, Y.; Raine, A.; Teichmann, S.; Ben-Tovim, L.; Nietlispach, D.; Broadhurst, R. W.; Terada, T.; Kelly, M.; Oschkinat, H.; Shibata, T.; Yokoyama, S.; Laue, E. D. J. Biomol. NMR 1996, 8, 360-368. Gardner, K. H.; Rosen M. K.; Kay, L. E. Biochemistry 1997, 36, 1389-1401; Wang, H.; Janowick, D. A.; Schkeryantz, J. M.; Liu, X.; Fesik, S. W. J. Am. Chem. Soc. 1999, 121, 1611- 1612.
6. Vuister, G. W.; Kim, S.-J.; Wu, C.; Bax, A. J. Am. Chem. Soc. 1994, 116, 9206-9210; Grzesiek, S., Wingfield, P. T., Stahl, S. J.; Kaufman, J. D.; Bax, A. J. Am. Chem. Soc. 1995, 117, 9594-9595; Metzler, W. J.; Wittekind M.; Goldfarb, V.; Mueller, L.; Farmer, B. T., II. J. Am. Chem. Soc. 1996, 118, 6800-6801; Smith, B. O.; Rosen, M. K.; Gardner, K. H.; Willis, R. C.; Parris, W. E., Pawson, T.; Kay, L. E. J. Mol. Biol. 1996, 263, 627-636; Ito, Y.; Raine, A.; Teichmann, S.; Ben-Tovim, L.; Nietlispach, D.; Broadhurst, R. W.; Terada, T.; Kelly, M.; Oschkinat, H.; Shibata, T.; Yokoyama, S.; Laue, E. D. J. Biomol. NMR 1996, 8, 360-368. Gardner, K. H.; Rosen M. K.; Kay, L. E. Biochemistry 1997, 36, 1389-1401; Wang, H.; Janowick, D. A.; Schkeryantz, J. M.; Liu, X.; Fesik, S. W. J. Am. Chem. Soc. 1999, 121, 1611- 1612.
7. Vuister, G. W.; Kim, S.-J.; Wu, C.; Bax, A. J. Am. Chem. Soc. 1994, 116, 9206-9210; Grzesiek, S., Wingfield, P. T., Stahl, S. J.; Kaufman, J. D.; Bax, A. J. Am. Chem. Soc. 1995, 117, 9594-9595; Metzler, W. J.; Wittekind M.; Goldfarb, V.; Mueller, L.; Farmer, B. T., II. J. Am. Chem. Soc. 1996, 118, 6800-6801; Smith, B. O.; Rosen, M. K.; Gardner, K. H.; Willis, R. C.; Parris, W. E., Pawson, T.; Kay, L. E. J. Mol. Biol. 1996, 263, 627-636; Ito, Y.; Raine, A.; Teichmann, S.; Ben-Tovim, L.; Nietlispach, D.; Broadhurst, R. W.; Terada, T.; Kelly, M.; Oschkinat, H.; Shibata, T.; Yokoyama, S.; Laue, E. D. J. Biomol. NMR 1996, 8, 360-368. Gardner, K. H.; Rosen M. K.; Kay, L. E. Biochemistry 1997, 36, 1389-1401; Wang, H.; Janowick, D. A.; Schkeryantz, J. M.; Liu, X.; Fesik, S. W. J. Am. Chem. Soc. 1999, 121, 1611- 1612.
8. Vuister, G. W.; Kim, S.-J.; Wu, C.; Bax, A. J. Am. Chem. Soc. 1994, 116, 9206-9210; Grzesiek, S., Wingfield, P. T., Stahl, S. J.; Kaufman, J. D.; Bax, A. J. Am. Chem. Soc. 1995, 117, 9594-9595; Metzler, W. J.; Wittekind M.; Goldfarb, V.; Mueller, L.; Farmer, B. T., II. J. Am. Chem. Soc. 1996, 118, 6800-6801; Smith, B. O.; Rosen, M. K.; Gardner, K. H.; Willis, R. C.; Parris, W. E., Pawson, T.; Kay, L. E. J. Mol. Biol. 1996, 263, 627-636; Ito, Y.; Raine, A.; Teichmann, S.; Ben-Tovim, L.; Nietlispach, D.; Broadhurst, R. W.; Terada, T.; Kelly, M.; Oschkinat, H.; Shibata, T.; Yokoyama, S.; Laue, E. D. J. Biomol. NMR 1996, 8, 360-368. Gardner, K. H.; Rosen M. K.; Kay, L. E. Biochemistry 1997, 36, 1389-1401; Wang, H.; Janowick, D. A.; Schkeryantz, J. M.; Liu, X.; Fesik, S. W. J. Am. Chem. Soc. 1999, 121, 1611-1612.
9. (a) Tjandra, N., Omichinski, J. G.; Gronenborn, A. M.; Clore, G. M.; Bax, A. Nat. Struct. Biol. 1997, 4, 732-728.
10. (b) Ramirez, B. E.; Bax, A. J. Am. Chem. Soc. 1998, 120, 9106-9107.
11. (a) Tjandra, N.; Bax, A. Science 1997, 278, 1111-1114.
12. (b) Clore, G. M.; Starich, M. R.; Gronenborn, A. M. J. Am. Chem. Soc. 1998, 120, 10571-10572.
13. (a) Cai, M.; Huang, Y.; Zheng, R.; Wei, S.-Q.; Ghirlando, R.; Lee, M. S.; Craigie, R.; Gronenborn, A. M.; Clore, G. M. Nat. Struct. Biol. 1998, 5, 903-909.
14. (b) Bewley, C. A.; Gustafson, K. R.; Boyd, M. R.; Covell, D. G.; Bax, A.; Clore, G. M.; Gronenborn, A. M. Nat. Struct. Biol. 1998, 5, 571-578.
15. Brünger, A. T. XPLOR: A system for X-ray crystallography and NMR; Yale University Press: New Haven, 1993.
16. (a) Stein, E. G.; Rice, L. M.; Brünger, A. T. J. Magn. Reson. 1997, 124, 154-164.
17. (b) Nilges, M.; Gronenborn, A. M.; Brünger, A. T.; Clore, G. M. Protein Eng. 1988, 2, 27-38.
18. (c) Clore, G. M.; Gronenborn, A. M.; Tjandra, N. J. Magn. Reson. 1998, 131, 159-162.
19. (d) Kuszewski, J.; Gronenborn, A. M.; Clore, G. M. J. Magn. Reson. 1997, 125, 171-177.
20. (e) Kuszewski, J.; Gronenborn, A. M.; Clore, G. M. J. Am. Chem. Soc. 1999, 121, 2337-2338.
21. Gronenborn, A. M.; Filpula, D. R.; Essig, N. Z.; Achari, A.; Whitlow, M.; Wingfield, P. T.; Clore, G. M. Science 1991, 253, 657-661.
22. Cornilescu, G.; Ramirez, B.; Frank, M. K.; Clore, G. M.; Gronenborn, A. M.; Bax, A. J. Am. Chem. Soc., in press.
23. Gallagher, T.; Alexander, P.; Bryan, P., Gilliland, G. L. Biochemistry 1994, 33, 4721-4729.