Discovery of small-molecule interleukin-2 inhibitors from a DNA-encoded chemical library

Chemistry - A European Journal

Volumn 18, Issue 25, 2012, Pages 7729-7737

  Leimbacher, Markus ^a   Zhang, Yixin ^a   Mannocci, Luca ^b   Stravs, Michael ^a   Geppert, Tim ^a   Scheuermann, Jçrg ^a   Schneider, Gisbert ^a   Neri, Dario ^a  

^a ETH ZURICH   (Switzerland)

^b PHILOCHEM AG   (Switzerland)

Author keywords

DNA encoded chemical libraries; Drug discovery; Highthroughput screening; Inhibitors; Ligands

Indexed keywords

BINDING MODES; BINDING MOLECULES; CHEMICAL LIBRARIES; CYTOKINES; DNA CODES; DRUG DISCOVERY; HIGH QUALITY; HIGH-THROUGHPUT; HIGH-THROUGHPUT SCREENING; INTERLEUKIN-2; MOLECULAR DOCKING; PHARMACOPHORES; POTENT INHIBITOR; PROTEIN-PROTEIN INTERACTIONS; ROBUST IDENTIFICATION; SMALL MOLECULES; SYSTEMATIC ANALYSIS;

BINDING ENERGY; CHEMICAL COMPOUNDS; CORROSION INHIBITORS; DIAGNOSIS; DNA; DRUG INTERACTIONS; LIBRARIES; LIGANDS; MOLECULES; PROTEINS; THROUGHPUT;

GENE ENCODING;

CA9 PROTEIN, HUMAN; CARBONATE DEHYDRATASE; CARBONATE DEHYDRATASE INHIBITOR; DNA; INTERLEUKIN 2 INHIBITOR; LIGAND; LYMPHOKINE; TUMOR ANTIGEN;

ARTICLE; CHEMICAL STRUCTURE; CHEMISTRY; COMBINATORIAL CHEMISTRY; DRUG DEVELOPMENT; DRUG EFFECT; GENETICS; HUMAN; MOLECULAR LIBRARY; SYNTHESIS;

ANTIGENS, NEOPLASM; CARBONIC ANHYDRASE INHIBITORS; CARBONIC ANHYDRASES; COMBINATORIAL CHEMISTRY TECHNIQUES; DNA; DRUG DISCOVERY; HUMANS; LIGANDS; LYMPHOKINES; MOLECULAR STRUCTURE; SMALL MOLECULE LIBRARIES;

EID: 84862608034     PISSN: 09476539     EISSN: 15213765     Source Type: Journal    
DOI: 10.1002/chem.201200952     Document Type: Article

References (35)

1. B. A. Posner, Curr. Opin. Drug Discov. Devel. 2005, 8, 487.
2. P. J. Hajduk, J. Greer, Nat. Rev. Drug Discovery 2007, 6, 211.
3. L. M. Mayr, D. Bojanic, Curr. Opin. Pharmacol. 2009, 9, 580.
4. D. R. Halpin, P. B. Harbury, PLoS Biol. 2004, 2, e174.
5. Z. J. Gartner, B. N. Tse, R. Grubina, J. B. Doyon, T. M. Snyder, D. R. Liu, Science 2004, 305, 1601.
6. S. Melkko, J. Scheuermann, C. E. Dumelin, D. Neri, Nat. Biotechnol. 2004, 22, 568.
7. M. A. Clark, R. A. Acharya, C. C. Arico-Muendel, S. L. Belyanskaya, D. R. Benjamin, N. R. Carlson, P. A. Centrella, C. H. Chiu, S. P. Creaser, J. W. Cuozzo, C. P. Davie, Y. Ding, G. J. Franklin, K. D. Franzen, M. L. Gefter, S. P. Hale, N. J. Hansen, D. I. Israel, J. Jiang, M. J. Kavarana, M. S. Kelley, C. S. Kollmann, F. Li, K. Lind, S. Mataruse, P. F. Medeiros, J. A. Messer, P. Myers, H. ÖKeefe, M. C. Oliff, C. E. Rise, A. L. Satz, S. R. Skinner, J. L. Svendsen, L. Tang, K. van Vloten, R. W. Wagner, G. Yao, B. Zhao, B. A. Morgan, Nat. Chem. Biol. 2009, 5, 647.
8. M. Ciobanu, K. T. Huang, J. P. Daguer, S. Barluenga, O. Chaloin, E. Schaeffer, C. G. Mueller, D. A. Mitchell, N. Winssinger, Chem. Commun. 2011, 47, 9321.
9. S. Brenner, R. A. Lerner, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1992, 89, 5381.
10. G. Georghiou, R. E. Kleiner, M. Pulkoski-Gross, D. R. Liu, M. A. Seeliger, Nat. Chem. Biol. 2012, 8, 366.
11. Y. He, D. R. Liu, J. Am. Chem. Soc. 2011, 133, 9972.
12. J. P. Daguer, M. Ciobanu, S. Alvarez, S. Barluenga, N. Winssinger, Chem. Sci. 2011, 2, 625.
13. O. Ramstrom, J. M. Lehn, Nat. Rev. Drug Discovery 2002, 1, 26
14. G. P. Smith, Science 1985, 228, 1315.
15. D. R. Bentley, S. Balasubramanian, H. P. Swerdlow, G. P. Smith, J. Milton, C. G. Brown, K. P. Hall, D. J. Evers, C. L. Barnes, H. R. Bignell, J. M. Boutell, J. Bryant, R. J. Carter, R. K. Cheetham, A. J. Cox, D. J. Ellis, M. R. Flatbush, N. A. Gormley, S. J. Humphray, L. J. Irving, M. S. Karbelashvili, S. M. Kirk, H. Li, X. Liu, K. S. Maisinger et al., Nature 2008, 456, 53.
16. S. Fox, S. Filichkin, T. C. Mockler, Methods Mol. Biol. 2009, 553, 79.
17. C. A. Lipinski, F. Lombardo, B. W. Dominy, P. J. Feeney, Adv. Drug Delivery Rev. 2001, 46, 3.
18. M. M. Hann, T. I. Oprea, Curr. Opin. Chem. Biol. 2004, 8, 255.
19. P. D. Leeson, B. Springthorpe, Nat. Rev. Drug Discovery 2007, 6, 881.
20. L. Mannocci, Y. Zhang, J. Scheuermann, M. Leimbacher, G. De Bellis, E. Rizzi, C. Dumelin, S. Melkko, D. Neri, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2008, 105, 17670.
21. C. T. Supuran, Nat. Rev. Drug Discovery 2008, 7, 168.
22. D. Neri, C. T. Supuran, Nat. Rev. Drug Discovery 2011, 10, 767.
23. A. Weber, M. Bohm, C. T. Supuran, A. Scozzafava, C. A. Sotriffer, G. Klebe, J. Chem. Inf. Model. 2006, 46, 2737.
24. J. Pouysségur, F. Dayan, N. M. Mazure, Nature 2006, 441, 437.
25. J. K. Ahlskog, C. E. Dumelin, S. Trussel, J. Marlind, D. Neri, Bioorg. Med. Chem. Lett. 2009, 19, 4851.
26. Y. Lou, P. C. McDonald, A. Oloumi, S. Chia, C. Ostlund, A. Ahmadi, A. Kyle, U. Auf dem Keller, S. Leung, D. Huntsman, B. Clarke, B. W. Sutherland, D. Waterhouse, M. Bally, C. Roskelley, C. M. Overall, A. Minchinton, F. Pacchiano, F. Carta, A. Scozzafava, N. Touisni, J. Y. Winum, C. T. Supuran, S. Dedhar, Cancer Res. 2011, 71, 3364.
27. M. R. Arkin, J. A. Wells, Nat. Rev. Drug Discovery 2004, 3, 301.
28. J. A. Wells, C. L. McClendon, Nature 2007, 450, 1001.
29. J. W. Tilley, L. Chen, D. C. Fry, S. D. Emerson, G. D. Powers, D. Biondi, T. Varnell, R. Trilles, R. Guthrie, F. Mennona, G. Kaplan, R. A. LeMahieu, M. Carson, R. J. Han, C. M. Liu, R. Palermo, G. Ju, J. Am. Chem. Soc. 1997, 119, 7589.
30. M. R. Arkin, M. Randal, W. L. DeLano, J. Hyde, T. N. Luong, J. D. Oslob, D. R. Raphael, L. Taylor, J. Wang, R. S. McDowell, J. A. Wells, A. C. Braisted, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2003, 100, 1603.
31. M. Rickert, X. Wang, M. J. Boulanger, N. Goriatcheva, K. C. Garcia, Science 2005, 308, 1477.
32. G. Jones, P. Willett, R. C. Glen, J. Mol. Biol. 1995, 245, 43.
33. F. Buller, M. Steiner, K. Frey, D. Mircsof, J. Scheuermann, M. Kalisch, P. Buhlmann, C. T. Supuran, D. Neri, ACS Chem. Biol. 2011, 6, 336.
34. F. Buller, L. Mannocci, J. Scheuermann, D. Neri, Bioconjugate Chem. 2010, 21, 1571.
35. L. Mannocci, M. Leimbacher, M. Wichert, J. Scheuermann, D. Neri, Chem. Commun. 2011, 47, 12747.