-
1
-
-
0025774845
-
-
Tchou, J.; Kasai, H.; Shibutani, S.; Chung, M. H.; Laval, J.; Grollman, A. P.; Nishimura, S. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1991, 88, 4690-4694
-
(1991)
Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A.
, vol.88
, pp. 4690-4694
-
-
Tchou, J.1
Kasai, H.2
Shibutani, S.3
Chung, M.H.4
Laval, J.5
Grollman, A.P.6
Nishimura, S.7
-
3
-
-
0024110769
-
-
Cabrera, M.; Ngheim, Y.; Miller, J. H. J. Bacteriol. 1988, 170, 5405-5407
-
(1988)
J. Bacteriol.
, vol.170
, pp. 5405-5407
-
-
Cabrera, M.1
Ngheim, Y.2
Miller, J.H.3
-
5
-
-
0026447255
-
-
Michaels, M. L.; Tchou, J.; Grollman, A. P.; Miller, J. H. Biochemistry 1992, 31, 10964-10968
-
(1992)
Biochemistry
, vol.31
, pp. 10964-10968
-
-
Michaels, M.L.1
Tchou, J.2
Grollman, A.P.3
Miller, J.H.4
-
6
-
-
84861388851
-
-
Fromme, J. C.; Banerjee, A.; Huang, S.; Verdine, G. Nature 2004, 427, 1476-1122
-
(2004)
Nature
, vol.427
, pp. 1476-1122
-
-
Fromme, J.C.1
Banerjee, A.2
Huang, S.3
Verdine, G.4
-
8
-
-
0036019716
-
-
Kampf, G.; Kapinos, L. E.; Griesser, R.; Lippert, B.; Sigel, H. J. Chem. Soc., Perkin Trans. 2002, 2, 1320-1327
-
(2002)
J. Chem. Soc., Perkin Trans.
, vol.2
, pp. 1320-1327
-
-
Kampf, G.1
Kapinos, L.E.2
Griesser, R.3
Lippert, B.4
Sigel, H.5
-
9
-
-
0029800969
-
-
Bulychev, N. V.; Varaprasad, C. V.; Dorman, G.; Miller, J. H.; Eisenberg, M.; Grollman, A. P.; Johnson, F. Biochemistry 1996, 35, 13147-13156
-
(1996)
Biochemistry
, vol.35
, pp. 13147-13156
-
-
Bulychev, N.V.1
Varaprasad, C.V.2
Dorman, G.3
Miller, J.H.4
Eisenberg, M.5
Grollman, A.P.6
Johnson, F.7
-
11
-
-
0346434114
-
-
Francis, A. W.; Helquist, S. A.; Kool, E. T.; David, S. S. J. Am. Chem. Soc. 2003, 407, 16235-16242
-
(2003)
J. Am. Chem. Soc.
, vol.407
, pp. 16235-16242
-
-
Francis, A.W.1
Helquist, S.A.2
Kool, E.T.3
David, S.S.4
-
13
-
-
0034088859
-
-
Chen, X. Y.; Berti, P. J.; Schramm, V. L. J. Am. Chem. Soc. 2000, 122, 1609-1617
-
(2000)
J. Am. Chem. Soc.
, vol.122
, pp. 1609-1617
-
-
Chen, X.Y.1
Berti, P.J.2
Schramm, V.L.3
-
17
-
-
0005703271
-
-
Lavery, R.; Pullman, A.; Pullman, B. B. Theor. Chim. Acta 1978, 50, 67-73
-
(1978)
B. Theor. Chim. Acta
, vol.50
, pp. 67-73
-
-
Lavery, R.1
Pullman, A.2
Pullman, B.3
-
18
-
-
0036019716
-
-
Kampf, G.; Kapinos, L. E.; Griesser, R.; Lippert, B.; Sigel, H. J. Chem. Soc., Perkin Trans. 2002, 2, 1320-1327
-
(2002)
Chem. Soc., Perkin Trans.
, vol.2
, pp. 1320-1327
-
-
Kampf, G.1
Kapinos, L.E.2
Griesser, R.3
Lippert, B.4
Sigel, H.J.5
-
19
-
-
0031763884
-
-
Guan, Y.; Manuel, R. C.; Arvai, A. S.; Parikh, S. S.; Mol, C. D.; Miller, J. H.; Lloyd, R. S.; Tainer, J. A. Nat. Struct. Biol. 1998, 5, 1058-1064
-
(1998)
Nat. Struct. Biol.
, vol.5
, pp. 1058-1064
-
-
Guan, Y.1
Manuel, R.C.2
Arvai, A.S.3
Parikh, S.S.4
Mol, C.D.5
Miller, J.H.6
Lloyd, R.S.7
Tainer, J.A.8
-
20
-
-
8744274358
-
-
Manuel, R. C.; Hitomi, K.; Arvai, A. S.; House, P. G.; Kurtz, A. J.; Dodson, M. L.; McCullough, A. K.; Tainer, J. A.; Lloyd, R. S. J. Biol. Chem. 1998, 279, 46930-46939
-
(1998)
J. Biol. Chem.
, vol.279
, pp. 46930-46939
-
-
Manuel, R.C.1
Hitomi, K.2
Arvai, A.S.3
House, P.G.4
Kurtz, A.J.5
Dodson, M.L.6
McCullough, A.K.7
Tainer, J.A.8
Lloyd, R.S.9
-
21
-
-
0038626733
-
-
Miller, J. H.; Chiang, C. P.; Straatsma, T. P.; Kennedy, M. J. Am. Chem. Soc. 2003, 125, 6331-6336
-
(2003)
J. Am. Chem. Soc.
, vol.125
, pp. 6331-6336
-
-
Miller, J.H.1
Chiang, C.P.2
Straatsma, T.P.3
Kennedy, M.4
-
22
-
-
28644432877
-
-
Li, H.; Robertson, A. D.; Jensen, J. H. Proteins: Struct., Funct., Bioinf. 2005, 61, 704
-
(2005)
Proteins: Struct., Funct., Bioinf.
, vol.61
, pp. 704
-
-
Li, H.1
Robertson, A.D.2
Jensen, J.H.3
-
23
-
-
57349090665
-
-
Bas, D. C.; Rogers, D. M.; Jensen, J. H. Proteins: Struct., Funct., Bioinf. 2008, 73, 765
-
(2008)
Proteins: Struct., Funct., Bioinf.
, vol.73
, pp. 765
-
-
Bas, D.C.1
Rogers, D.M.2
Jensen, J.H.3
-
24
-
-
79951476387
-
-
Olsson, M. H. M.; Sndergaard, C. R.; Rostkowski, M.; Jensen, J. H. J. Chem. Theory Comput. 2011, 7, 525
-
(2011)
J. Chem. Theory Comput.
, vol.7
, pp. 525
-
-
Olsson, M.H.M.1
Sndergaard, C.R.2
Rostkowski, M.3
Jensen, J.H.4
-
26
-
-
36449003554
-
-
Martyna, G. J.; Tobias, D. J.; Klein, M. L. J. Chem. Phys. 1994, 101, 4177-4189
-
(1994)
J. Chem. Phys.
, vol.101
, pp. 4177-4189
-
-
Martyna, G.J.1
Tobias, D.J.2
Klein, M.L.3
-
27
-
-
36449007836
-
-
Feller, S. E.; Zhang, Y.; Pastor, R. W.; Brooks, B. R. J. Chem. Phys. 1995, 103, 4613-4621
-
(1995)
J. Chem. Phys.
, vol.103
, pp. 4613-4621
-
-
Feller, S.E.1
Zhang, Y.2
Pastor, R.W.3
Brooks, B.R.4
-
28
-
-
27344436659
-
-
Phillips, J. C.; Braun, R.; Wang, W.; Gumbart, J.; Tajkhorshid, E.; Villa, E.; Chipot, C.; Skeel, R. D.; Kale, L.; Schulten, K. J. Comput. Chem. 2005, 26, 1781-1802
-
(2005)
J. Comput. Chem.
, vol.26
, pp. 1781-1802
-
-
Phillips, J.C.1
Braun, R.2
Wang, W.3
Gumbart, J.4
Tajkhorshid, E.5
Villa, E.6
Chipot, C.7
Skeel, R.D.8
Kale, L.9
Schulten, K.10
-
29
-
-
58049201323
-
-
University of California: San Francisco, CA
-
Case, D. A.; Darden, T. A.; Cheatham, T. E.; Simmerling, C. L.; Wang, J.; Duke, R. E.; Luo, R.; Crowley, M.; Walker, R. C.; Zhang, W.; Merz, K. M.; Wang, B.; Hayik, S.; Roitberg, A.; Seabra, G. AMBER 10; University of California: San Francisco, CA, 2008.
-
(2008)
AMBER 10
-
-
Case, D.A.1
Darden, T.A.2
Cheatham, T.E.3
Simmerling, C.L.4
Wang, J.5
Duke, R.E.6
Luo, R.7
Crowley, M.8
Walker, R.C.9
Zhang, W.10
Merz, K.M.11
Wang, B.12
Hayik, S.13
Roitberg, A.14
Seabra, G.15
-
30
-
-
0001398008
-
-
Wang, J.; Cieplak, P.; Kollman, P. A. J. Comput. Chem. 2000, 21, 1049-1074
-
(2000)
J. Comput. Chem.
, vol.21
, pp. 1049-1074
-
-
Wang, J.1
Cieplak, P.2
Kollman, P.A.3
-
31
-
-
33748518255
-
-
Hornak, V.; Abel, R.; Okur, A.; Strockbine, B.; Roitberg, A.; Simmerling, C. Proteins 2006, 61, 712-725
-
(2006)
Proteins
, vol.61
, pp. 712-725
-
-
Hornak, V.1
Abel, R.2
Okur, A.3
Strockbine, B.4
Roitberg, A.5
Simmerling, C.6
-
33
-
-
0037156101
-
-
Laio, A.; VandeVondele, J.; Rothlisberger, U. J. Chem. Phys. 2002, 116, 6941-6948
-
(2002)
J. Chem. Phys.
, vol.116
, pp. 6941-6948
-
-
Laio, A.1
Vandevondele, J.2
Rothlisberger, U.3
-
34
-
-
0345491105
-
-
Lee, C.; Yang, W.; Parr, R. G. Phys. Rev. B 1988, 37, 785-789
-
(1988)
Phys. Rev. B
, vol.37
, pp. 785-789
-
-
Lee, C.1
Yang, W.2
Parr, R.G.3
-
37
-
-
0542436236
-
-
Tuckerman, M.; Laasonen, K.; Sprik, M.; Parrinello, M. J. Am. Chem. Soc. 1995, 99, 5749-5752
-
(1995)
J. Am. Chem. Soc.
, vol.99
, pp. 5749-5752
-
-
Tuckerman, M.1
Laasonen, K.2
Sprik, M.3
Parrinello, M.4
-
38
-
-
0033998647
-
-
Piana, S.; Carloni, P. Proteins: Struct., Funct., Bioinf. 2000, 39, 26-36
-
(2000)
Proteins: Struct., Funct., Bioinf.
, vol.39
, pp. 26-36
-
-
Piana, S.1
Carloni, P.2
-
40
-
-
50249094329
-
-
De Vivo, M.; Dal Peraro, M.; Klein, M. L. J. Am. Chem. Soc. 2008, 130, 10955-10969
-
(2008)
J. Am. Chem. Soc.
, vol.130
, pp. 10955-10969
-
-
De Vivo, M.1
Dal Peraro, M.2
Klein, M.L.3
-
42
-
-
34347390658
-
-
Lin, I.-C.; Coutinho-Neto, M. D.; Felsenheimer, C.; von Lilienfeld, O. A.; Tavernelli, I.; Rothlisberger, U. Phys. Rev. B 2007, 75, 205131
-
(2007)
Phys. Rev. B
, vol.75
, pp. 205131
-
-
Lin, I.-C.1
Coutinho-Neto, M.D.2
Felsenheimer, C.3
Von Lilienfeld, O.A.4
Tavernelli, I.5
Rothlisberger, U.6
-
43
-
-
84889443208
-
-
von Lilienfeld, O. A.; Sebastiani, D.; Tavernelli, I.; Rothlisberger, U. Phys. Rev. Lett. 2004, 93, 153004
-
(2004)
Phys. Rev. Lett.
, vol.93
, pp. 153004
-
-
Von Lilienfeld, O.A.1
Sebastiani, D.2
Tavernelli, I.3
Rothlisberger, U.4
-
44
-
-
65249162952
-
-
Arey, J. S.; Aeberhard, P. C.; Lin, I.-C.; Rothlisberger, U. J. Phys. Chem. B 2009, 113, 4726-4732
-
(2009)
J. Phys. Chem. B
, vol.113
, pp. 4726-4732
-
-
Arey, J.S.1
Aeberhard, P.C.2
Lin, I.-C.3
Rothlisberger, U.4
-
45
-
-
62149089166
-
-
Lin, I.-C.; Seitsonen, A. P.; Coutinho-Neto, M. D.; Tavernelli, I.; Rothlisberger, U. J. Phys. Chem. B 2009, 113, 1127-1131
-
(2009)
J. Phys. Chem. B
, vol.113
, pp. 1127-1131
-
-
Lin, I.-C.1
Seitsonen, A.P.2
Coutinho-Neto, M.D.3
Tavernelli, I.4
Rothlisberger, U.5
-
46
-
-
84861412863
-
-
von Lilienfeld, O. A.; Tavernelli, I.; Hutter, J.; Rothlisberger, U. J. Chem. Phys. 1988, 122
-
(1988)
J. Chem. Phys.
, pp. 122
-
-
Von Lilienfeld, O.A.1
Tavernelli, I.2
Hutter, J.3
Rothlisberger, U.4
-
50
-
-
0037335588
-
-
Giudice, E.; Várnai, P.; Lavery, R. R. Nucleic Acid Res. 2003, 31, 1434-14430
-
(2003)
R. Nucleic Acid Res.
, vol.31
, pp. 1434-14430
-
-
Giudice, E.1
Várnai, P.2
Lavery, R.3
-
51
-
-
0036286854
-
-
Carloni, P.; Rothlisberger, U.; Parrinello, M. Acc. Chem. Res. 2002, 35, 455-464
-
(2002)
Acc. Chem. Res.
, vol.35
, pp. 455-464
-
-
Carloni, P.1
Rothlisberger, U.2
Parrinello, M.3
-
52
-
-
0037173897
-
-
Laio, A.; Vandevondele, J.; Rothlisberger, U. J. Phys. Chem. B 2002, 106, 7300-7307
-
(2002)
J. Phys. Chem. B
, vol.106
, pp. 7300-7307
-
-
Laio, A.1
Vandevondele, J.2
Rothlisberger, U.3
|