Isolated β-turn model systems investigated by combined IR/UV spectroscopy

ChemPhysChem

Volumn 13, Issue 6, 2012, Pages 1576-1582

  Schwing, Kirsten ^a   Fricke, Holger ^a   Bartl, Kristina ^a   Polkowska, Jolanta ^b   Schrader, Thomas ^b   Gerhards, Markus ^a  

^a Rheinland Pfälzische Technische Universität Kaiserslautern Landau   (Germany)

^b UNIVERSITY OF DUISBURG ESSEN   (Germany)

Author keywords

density functional calculations; IR spectroscopy; molecular beams; peptides; protein structures

Indexed keywords

CHROMOPHORES; DENSITY FUNCTIONAL THEORY; INFRARED SPECTROSCOPY; LASER SPECTROSCOPY; PEPTIDES;

AROMATIC CHROMOPHORES; BIOACTIVE MOLECULES; DFT CALCULATION; DISPERSION CORRECTION; PROTECTING GROUP; PROTECTION GROUP; PROTEIN STRUCTURES; STRUCTURAL ASSIGNMENTS;

MOLECULAR BEAMS;

EID: 84859906496     PISSN: 14394235     EISSN: 14397641     Source Type: Journal    
DOI: 10.1002/cphc.201100805     Document Type: Article

References (57)

1. L. Wu, D. McElheny, T. Takekiyo, T. A. Keiderling, Biochemistry 2010, 49, 4705-4714.
2. R. Mahalakshmi, S. Raghothama, P. Balaram, J. Am. Chem. Soc. 2006, 128, 1125-1138.
3. L. Eidenschink, B. L. Kier, K. N. L. Huggins, N. H. Andersen, Proteins Struct. Funct. Bioinf. 2009, 75, 308-322.
4. C. D. Tatko, M. L. Waters, J. Am. Chem. Soc. 2002, 124, 9372-9373.
5. S. M. Butterfield, W. J. Cooper, M. L. Waters, J. Am. Chem. Soc. 2005, 127, 24-25.
6. E. A. Meyer, R. K. Castellano, F. Diederich, Angew. Chem. 2003, 115, 1244-1287
7. Angew. Chem. Int. Ed. 2003, 42, 1210-1250.
8. R. Chelli, F. L. Gervasio, P. Procacci, V. Schettino, J. Am. Chem. Soc. 2002, 124, 6133-6143.
9. H. Fricke, A. Gerlach, C. Unterberg, M. Wehner, T. Schrader, M. Gerhards, Angew. Chem. 2009, 121, 916-921
10. Angew. Chem. Int. Ed. 2009, 48, 900-904.
11. L. Tjernberg, W. Hosia, N. Bark, J. Thyberg, J. Johansson, J. Biol. Chem. 2002, 277, 43243-43246.
12. E. Gazit, Faseb J. 2002, 16, 77-83.
13. R. H. Page, Y. R. Shen, Y. T. Lee, J. Chem. Phys. 1988, 88, 4621-4636.
14. C. Riehn, C. Lahmann, B. Wassermann, B. Brutschy, Chem. Phys. Lett. 1992, 197, 443-450.
15. S. Tanabe, T. Ebata, M. Fujii, N. Mikami, Chem. Phys. Lett. 1993, 215, 347-352.
16. T. S. Zwier, Annu. Rev. Phys. Chem. 1996, 47, 205-241.
17. E. G. Robertson, M. R. Hockridge, P. D. Jelfs, J. P. Simons, J. Phys. Chem. A 2000, 104, 11714-11724.
18. M. Mons, I. Dimicoli, B. Tardivel, F. Piuzzi, E. G. Robertson, J. P. Simons, J. Phys. Chem. A 2001, 105, 969-973.
19. M. Gerhards, C. Unterberg, Phys. Chem. Chem. Phys. 2002, 4, 1760-1765.
20. M. Gerhards, C. Unterberg, A. Gerlach, Phys. Chem. Chem. Phys. 2002, 4, 5563-5565.
21. H. Fricke, A. Gerlach, M. Gerhards, Phys. Chem. Chem. Phys. 2006, 8, 1660-1662.
22. T. R. Rizzo, Y. D. Park, L. A. Peteanu, D. H. Levy, J. Chem. Phys. 1986, 84, 2534-2541.
23. J. R. Cable, M. J. Tubergen, D. H. Levy, J. Am. Chem. Soc. 1988, 110, 7349-7355.
24. S. J. Martinez, J. C. Alfano, D. H. Levy, J. Mol. Spectrosc. 1992, 156, 421-430.
25. T. D. Vaden, S. A. N. Gowers, L. C. Snoek, Phys. Chem. Chem. Phys. 2009, 11, 5843-5850.
26. J. M. Bakker, L. M. Aleese, G. Meijer, G. von Helden, Phys. Rev. Lett. 2003, 91, 203003.
27. H. Fricke, A. Gerlach, C. Unterberg, P. Rzepecki, T. Schrader, M. Gerhards, Phys. Chem. Chem. Phys. 2004, 6, 4636-4641.
28. E. E. Baquero, W. H. James, S. H. Choi, S. H. Gellman, T. S. Zwier, J. Am. Chem. Soc. 2008, 130, 4795-4807.
29. H. Fricke, A. Funk, T. Schrader, M. Gerhards, J. Am. Chem. Soc. 2008, 130, 4692-4698.
30. T. Häber, K. Seefeld, G. Engler, S. Grimme, K. Kleinermanns, Phys. Chem. Chem. Phys. 2008, 10, 2844-2851.
31. T. D. Vaden, S. A. N. Gowers, L. C. Snoek, J. Am. Chem. Soc. 2009, 131, 2472-2474.
32. E. Gloaguen, B. de Courcy, J. P. Piquemal, J. Pilme, O. Parisel, R. Pollet, H. S. Biswal, F. Piuzzi, B. Tardivel, M. Broquier, M. Mons, J. Am. Chem. Soc. 2010, 132, 11860-11863.
33. E. Gloaguen, H. Valdes, F. Pagliarulo, R. Pollet, B. Tardivel, P. Hobza, F. Piuzzi, M. Mons, J. Phys. Chem. A 2010, 114, 2973-2982.
34. M. Gerhards, in Principles of Mass Spectrometry Applied to Biomolecules (Eds.:, J. Laskin, C. Lifshitz,), Wiley, New York, 2006, p. 3-61.
35. W. Chin, J. P. Dognon, F. Piuzzi, I. Dimicoli, M. Mons, Mol. Phys. 2005, 103, 1579-1587.
36. V. Brenner, F. Piuzzi, I. Dimicoli, B. Tardivel, M. Mons, Angew. Chem. 2007, 119, 2515-2518
37. Angew. Chem. Int. Ed. 2007, 46, 2463-2466.
38. C. Unterberg, A. Gerlach, T. Schrader, M. Gerhards, J. Chem. Phys. 2003, 118, 8296-8300.
39. A. G. Abo-Riziq, J. E. Bushnell, B. Crews, M. P. Callahan, L. Grace, M. S. De Vries, Int. J. Quantum Chem. 2005, 105, 437-445.
40. T. Häber, K. Seefeld, K. Kleinermanns, J. Phys. Chem. A 2007, 111, 3038-3046.
41. H. Valdes, V. Spiwok, J. Rezac, D. Reha, A. G. Abo-Riziq, M. S. de Vries, P. Hobza, Chem. Eur. J. 2008, 14, 4886-4898.
42. M. Gerhards, Opt. Commun. 2004, 241, 493-497.
43. CFF Consistent Force Field and DISCOVERY Molecular Simulation Programme, Version 2000, Accelrys Inc., City, 2000.
44. Gaussian 03, Revision C.02, G. W. T. M. J. Frisch, H. B. Schlegel, G. E. Scuseria, M. A. Robb, J. R. Cheeseman, J. A. Montgomery, Jr., T. Vreven, K. N. Kudin, J. C. Burant, J. M. Millam, S. S. Iyengar, J. Tomasi, V. Barone, B. Mennucci, M. Cossi, G. Scalmani, N. Rega, G. A. Petersson, H. Nakatsuji, M. Hada, M. Ehara, K. Toyota, R. Fukuda, J. Hasegawa, M. Ishida, T. Nakajima, Y. Honda, O. Kitao, H. Nakai, M. Klene, X. Li, J. E. Knox, H. P. Hratchian, J. B. Cross, V. Bakken, C. Adamo, J. Jaramillo, R. Gomperts, R. E. Stratmann, O. Yazyev, A. J. Austin, R. Cammi, C. Pomelli, J. W. Ochterski, P. Y. Ayala, K. Morokuma, G. A. Voth, P. Salvador, J. J. Dannenberg, V. G. Zakrzewski, S. Dapprich, A. D. Daniels, M. C. Strain, O. Farkas, D. K. Malick, A. D. Rabuck, K. Raghavachari, J. B. Foresman, J. V. Ortiz, Q. Cui, A. G. Baboul, S. Clifford, J. Cioslowski, B. B. Stefanov, G. Liu, A. Liashenko, P. Piskorz, I. Komaromi, R. L. Martin, D. J. Fox, T. Keith, M. A. Al-Laham, C. Y. Peng, A. Nanayakkara, M. Challacombe, P. M. W. Gill, B. Johnson, W. Chen, M. W. Wong, C. Gonzalez, J. A. Pople, Gaussian, Inc., Wallingford, 2004.
45. V. Brenner, F. Piuzzi, I. Dimicoli, B. Tardivel, M. Mons, J. Phys. Chem. A 2007, 111, 7347-7354.
46. R. Ahlrichs, M. Bar, M. Haser, H. Horn, C. Kolmel, Chem. Phys. Lett. 1989, 162, 165-169.
47. O. Treutler, R. Ahlrichs, J. Chem. Phys. 1995, 102, 346-354.
48. R. Bauernschmitt, R. Ahlrichs, Chem. Phys. Lett. 1996, 256, 454-464.
49. S. Grimme, J. Comput. Chem. 2004, 25, 1463-1473
50. S. Grimme, J. Comput. Chem. 2006, 27, 1787-1799.
51. Y. Bouteiller, J. C. Gillet, G. Gregoire, J. P. Schermann, J. Phys. Chem. A 2008, 112, 11656-11660.
52. Y. Bouteiller, J. C. Poully, C. Desfrancois, G. Gregoire, J. Phys. Chem. A 2009, 113, 6301-6307.
53. H. Fricke, K. Schwing, A. Gerlach, C. Unterberg, M. Gerhards, Phys. Chem. Chem. Phys. 2010, 12, 3511-3521.
54. K. Schwing, C. Reyheller, A. Schaly, S. Kubik, M. Gerhards, ChemPhysChem 2011, 12, 1981-1988.
55. M. Gerhards, C. Unterberg, A. Gerlach, A. Jansen, Phys. Chem. Chem. Phys. 2004, 6, 2682-2690.
56. H. Fricke, G. Schafer, T. Schrader, M. Gerhards, Phys. Chem. Chem. Phys. 2007, 9, 4592-4597.
57. W. Chin, M. Mons, J. P. Dognon, R. Mirasol, G. Chass, I. Dimicoli, F. Piuzzi, P. Butz, B. Tardivel, I. Compagnon, G. von Helden, G. Meijer, J. Phys. Chem. A 2005, 109, 5281-5288.