IR/UV spectra and quantum chemical calculations of Trp-Ser: Stacking interactions between backbone and indole side-chain

Physical Chemistry Chemical Physics

Volumn 10, Issue 19, 2008, Pages 2844-2851

  Häber, Thomas ^a   Seefeld, Kai ^a   Engler, Gernot ^a   Grimme, Stefan ^b   Kleinermanns, Karl ^a  

^a HEINRICH HEINE UNIVERSITY   (Germany)

^b UNIVERSITY OF MÜNSTER   (Germany)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

EID: 43449117193     PISSN: 14639076     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/b718710f     Document Type: Article

References (62)

1. F. London Z. Phys. 1930 63 245 279
2. A. J. Stone, The Theory of Intermolecular Forces, Oxford University Press, Oxford, 1997
3. S. Grimme Angew. Chem., Int. Ed. 2006 45 4460 4464
4. S. Grimme M. Steinmetz M. Korth J. Chem. Theory Comput. 2007 3 42 45
5. T. Schwabe S. Grimme Phys. Chem. Chem. Phys. 2007 9 3397 3406
6. D. Reha H. Valdes J. Vondrasek P. Hobza A. Abu-Riziq B. Crews M. S. de Vries Chem.-Eur. J. 2005 11 6803 6817
7. S. Grimme J. Antony T. Schwabe C. Mück-Lichtenfeld Org. Biomol. Chem. 2007 5 741 758
8. T. van Mourik P. G. Karamertzanis S. L. Price J. Phys. Chem. A 2006 110 8 12
9. J. Richardson Adv. Protein Chem. 1981 34 167 339
10. T. E. Creighton, Proteins: Structures and Molecular Properties, W. H. Freeman and Company, 2nd edn, 1993
11. J. P. Simons C. R. Chim. 2003 6 17 31
12. E. Robertson J. Simons Phys. Chem. Chem. Phys. 2001 3 1 18
13. T. Zwier J. Phys. Chem. A 2001 105 8827 8839
14. R. Weinkauf J.-P. Schermann M. de Vries K. Kleinermanns Eur. Phys. J. D 2002 20 309 316
15. W. Chin F. Piuzzi I. Dimicoli M. Mons Phys. Chem. Chem. Phys. 2006 8 1033 1048
16. M. S. de Vries P. Hobza Annu. Rev. Phys. Chem. 2007 58 585 612
17. A. G. Abo-Riziq B. Crews J. E. Bushnell M. P. Callahan M. S. de Vries Mol. Phys. 2005 103 1491 1495
18. A. Abo-Riziq J. E. Bushnell B. Crews M. Callahan L. Grace M. S. de Vries Chem. Phys. Lett. 2006 431 227 230
19. S. Grimme J. Chem. Phys. 2006 124 034108
20. S. Grimme T. Schwabe Phys. Chem. Chem. Phys. 2006 8 4398 4401
21. S. Grimme J. Comput. Chem. 2006 27 1787 1799
22. A. D. Becke J. Chem. Phys. 1997 107 8554 8560
23. S. Grimme J. Comput. Chem. 2004 25 1463 1473
24. P. Jurecka J. Cerny P. Hobza D. R. Salahub J. Comput. Chem. 2007 28 555 569
25. R. Ahlrichs R. Penco G. Scoles Chem. Phys. 1977 19 119 130
26. M. Elstner P. Hobza T. Frauenheim S. Suhai E. Kaxiras J. Chem. Phys. 2001 114 5149 5155
27. B. Zou K. Dreger C. Mück-Lichtenfeld S. Grimme H. J. Schäfer H. Fuchs L. Chi Langmuir 2005 21 1364 1370
28. M. Piacenza S. Grimme ChemPhysChem. 2005 6 1554 1558
29. M. Parac M. Etinski M. Peric S. Grimme J. Chem. Theory Comput. 2005 1 1110 1118
30. M. Piacenza S. Grimme J. Am. Chem. Soc. 2005 127 14841 14848
31. J. Antony S. Grimme Phys. Chem. Chem. Phys. 2006 8 5287 5293
32. S. Grimme C. Mück-Lichtenfeld J. Antony J. Phys. Chem. C 2007 111 11199 11207
33. J. Cerny P. Jurecka P. Hobza H. Valdes J. Phys. Chem. A 2007 111 1146 1154
34. C. Janzen D. Spangenberg W. Roth K. Kleinermanns J. Chem. Phys. 1999 110 9898 9907
35. I. Hünig K. Kleinermanns Phys. Chem. Chem. Phys. 2004 6 2650 2658
36. T. Häber K. Seefeld K. Kleinermanns J. Phys. Chem. A 2007 111 3038 3046
37. M. Gerhards Opt. Commun. 2004 241 493 497
38. R. Ahlrichs, M. Bär, H.-P. Baron, R. Bauernschmitt, S. Böcker, N. Crawford, P. Deglmann, M. Ehrig, K. Eichkorn, S. Elliott, F. Furche, F. Haase, M. Häser, C. Hättig, A. Hellweg, H. Horn, C. Huber, U. Huniar, M. Kattannek, A. Köhn, C. Kölmel, M. Kollwitz, K. May, P. Nava, C. Ochsenfeld, H. Öhm, H. Patzelt, D. Rappoport, O. Rubner, A. Schäfer, U. Schneider, M. Sierka, O. Treutler, B. Unterreiner, M. von Arnim, F. Weigend, P. Weis and H. Weiss, Turbomole, version 5.9, Universität Karlsruhe, 2006, see http://www.turbomole.com
39. R. Ahlrichs M. Bär M. Häser H. Horn C. Kölmel Chem. Phys. Lett. 1989 162 165 169
40. A. Schäfer C. Huber R. Ahlrichs J. Chem. Phys. 1994 100 5829 5835
41. The basis sets are available from the turbomole homepage via the ftp server button (in the subdirectories basen, jbasen, and cbasen). see http://www.turbomole.com
42. F. Weigend M. Häser Theor. Chem. Acc. 1997 97 331 340
43. F. Weigend A. Köhn C. Hättig J. Chem. Phys. 2002 116 3175 3183
44. K. Eichkorn O. Treutler H. Öhm M. Häser R. Ahlrichs Chem. Phys. Lett. 1995 240 283 289
45. K. Eichkorn F. Weigend O. Treutler R. Ahlrichs Theor. Chem. Acc. 1997 97 119 124
46. J. P. McNamara I. H. Hillier Phys. Chem. Chem. Phys. 2007 9 2362
47. N. L. Allinger Y. H. Yuh J.-H. Lii J. Am. Chem. Soc. 1989 111 8551 8566
48. J. Neugebauer M. Reiher C. Kind B. A. Hess J. Comput. Chem. 2002 23 895
49. PCmodel 9.1, Serena Software, Bloomington, 2005
50. I. Hünig K. A. Seefeld K. Kleinermanns Chem. Phys. Lett. 2003 369 173 179
51. N. Mikami A. Hiraya I. Fujiwara M. Ito Chem. Phys. Lett. 1980 74 531 535
52. J. M. Bakker C. Plützer I. Hünig T. Häber I. Compagnon G. von Helden G. Meijer K. Kleinermanns ChemPhysChem. 2005 6 120 128
53. B. C. Dian A. Longarte T. S. Zwier J. Chem. Phys. 2003 118 2696 2706
54. C. Unterberg A. Jansen M. Gerhards J. Chem. Phys. 2000 113 7945 7954
55. P. Imhof W. Roth C. Janzen D. Spangenberg K. Kleinermanns Chem. Phys. 1999 242 153 159
56. A. D. Becke J. Chem. Phys. 1993 98 5648 5652
57. P. J. Stephens F. J. Devlin C. F. Chabalowski M. J. Frisch J. Phys. Chem. 1994 98 11623 11627
58. L. C. Snoek R. T. Kroemer M. R. Hockridge J. P. Simons Phys. Chem. Chem. Phys. 2001 3 1819 1826
59. J. M. Bakker, PhD thesis, Radboud Universiteit Nijmegen, 2004
60. K. Seefeld R. Brause T. Hber K. Kleinermanns J. Phys. Chem. A 2007 111 6217 6221
61. M. Mons F. Piuzzi I. Dimicoli L. Gorb J. Leszczynski J. Phys. Chem. A 2006 110 10921 10924
62. C. M. Marian J. Phys. Chem. A 2007 111 1545 1553