Transcriptional proofreading in dense RNA polymerase traffic

EPL

Volumn 96, Issue 6, 2011, Pages

  Sahoo, Mamata ^a   Klumpp, Stefan ^a  

^a MAX PLANCK INSTITUTE OF COLLOIDS AND INTERFACES   (Germany)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

EID: 83755167911     PISSN: 02955075     EISSN: 12864854     Source Type: Journal    
DOI: 10.1209/0295-5075/96/60004     Document Type: Article

References (33)

1. Greive S. J. and von Hippel P. H. 2005 Nat. Rev. 6 221
2. Abbondanzieri E. A., Greenleaf W. J., Shaevitz J. W., Landick R. and Block S. M. 2005 Nature 438 460
3. Bai L., Santangelo T. J. and Wang M. D. 2006 Annu. Rev. Biophys. Biomol. Struct. 35 343
4. Landick R. 2006 Biochem. Soc. Trans. 34 1062
5. Komissarova N. and Kashlev M. 1997 Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 94 17755
6. Nudler E., Mustaev A. and Goldfarb A. 1997 Cell 89 33
7. Shaevitz J. W., Abbondanzieri E. A., Landick R. and Block S. M. 2003 Nature 426 684
8. Galburt E. A., Grill S. W., Wiedmann A., Lubkowska L., Choy J., Nogales E., Kashlev M. and Bustamante C. 2007 Nature 446 820
9. Voliotis M., Cohen N., Molina-Paris C. and Liverpool T. B. 2008 Biophys. J. 94 334
10. Depken M., Galburt E. A. and Grill S. W. 2009 Biophys. J. 96 2189
11. Klumpp S. 2011 J. Stat. Phys. 142 1252
12. Fish R. M. and Kane C. M. 2002 Biochim. Biophys. Acta 1577 287
13. Erie D. A., Hajiseyedjavadi O., Young M. C. and von Hippel P. H. 1993 Science 262 867
14. Zenkin N., Yuzenkova Y. and Severinov K. 2006 Science 313 518
15. Klumpp S. and Hwa T. 2009 RNA Biol. 6 392
16. Epshtein V. and Nudler E. 2003 Science 300 801
17. Epshtein V., Toulme F., Rahmouni A. R., Borukhov S. and Nudler E. 2003 EMBO J. 22 4719
18. Voliotis M., Cohen N., Molina-Paris C. and Liverpool T. B. 2009 Phys. Rev. Lett. 102 258101
19. Hopfield J. 1974 Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 71 4135
20. Ninio J. 1975 Biochimie 57 587
21. Klumpp S. and Hwa T. 2008 Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 105 18159
22. Tripathi T. and Chowdhury D. 2008 Phys. Rev. E 77 011921
23. Dobrzynski M. and Bruggemann F. J. 2009 Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 106 2583
24. Chowdhury D., Santen L. and Schadschneider A. 2000 Phys. Rep. 329 199
25. Krug J. 1991 Phys. Rev. Lett. 67 1882
26. Kolomeisky A. B., Schütz G. M., Kolomeisky E. B. and Straley J. P. 1998 J. Phys. A: Math. Gen. 31 6911
27. Lipowsky R., Klumpp S. and Nieuwenhuizen T. M. 2001 Phys. Rev. Lett. 87 108101
28. Zia R. K. P., Dong J. J. and Schmittman B. 2011 J. Stat. Phys. 144 405
29. Wu C., Carta R. and Zhang L. 2005 Nucl. Acids Res. 33 e84
30. Hill T. L. 1988 Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 85 2879
31. Klumpp S., Nieuwenhuizen T. M. and Lipowsky R. 2005 Biophys. J. 88 3118
32. Shaw L. B., Zia R. K. P. and Lee K. H. 2003 Phys. Rev. E 68 021910
33. Proshkin S., Rahmouni A. R., Mironov A. and Nudler E. 2010 Science 328 504