Metabolomics analysis of major metabolites in medicinal herbs

Analytical Methods

Volumn 3, Issue 12, 2011, Pages 2898-2908

  Teo, Chin Chye ^a,b   Tan, Swee Ngin ^a   Hong Yong, Jean Wan ^c   Ra, Tenmoli ^a   Liew, Peiling ^a,b   Ge, Liya ^a  

^a NANYANG TECHNOLOGICAL UNIVERSITY   (Singapore)

^b NANYANG TECHNOLOGICAL UNIVERSITY   (Singapore)

^c SINGAPORE UNIVERSITY OF TECHNOLOGY AND DESIGN   (Singapore)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

CARBON FLOW; CULTIVATION CONDITIONS; DITERPENES; FUMARATES; FUNCTIONAL GENOMICS; HPLC-UV; MAIN COMPONENT; MEDICINAL HERB; METABOLIC PATHWAYS; METABOLOMICS; OXIDATIVE PENTOSE PHOSPHATE PATHWAYS; PLANT RESPIRATION; REGULATORY MECHANISM; SECONDARY METABOLITES; SHIKIMIC ACIDS; STEVIA REBAUDIANA; SUCCINIC ACIDS; TRICARBOXYLIC ACIDS;

AMINO ACIDS; BIOCHEMISTRY; BIOMOLECULES; BIOSYNTHESIS; CULTIVATION; FATTY ACIDS; METABOLISM; METABOLITES; OLEFINS; SUGAR SUBSTITUTES; SUGARS;

PRINCIPAL COMPONENT ANALYSIS;

EID: 82555169371     PISSN: 17599660     EISSN: 17599679     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/c1ay05334e     Document Type: Article

References (57)

1. W. Weckwerth O. Fiehn Curr. Opin. Biotechnol. 2002 13 156
2. W. Weckwerth Annu. Rev. Plant Biol. 2003 54 669
3. G. Guy J. Kopa M. Thomas Physiol. Planta. 2008 132 113
4. S. F. Graham E. Amigues M. Migaud R. A. Browne Metabolomics 2009 5 302
5. R. Bhalla K. Narasimham S. Swarup Plant Cell Rep. 2005 24 562
6. A. P. Alonso H. Vigeolas P. Raymond D. Rolin M. D. Noubhani Plant Physiol. 2005 138 4 2220
7. A. R. Fernie F. Carrari L. J. Sweetlove Curr. Opin. Biotechnol. 2004 7 254
8. K. M. Oksman-Caldentey D. Inze Trends Plant Sci. 2004 9 433
9. M. D. Paul, Medicinal Natural Products A Biosynthetic Approach 2nd Edition. Wiley, Chichester, England, 2001
10. C. Bowsher, M. Steer, A. Tobin, Plant Biochemistry, Garland Science, Abingdon, UK, 2008
11. J. Han M. Ye M. Xu X. Qiao H. L. Chen B. R. Wang J. H. Zheng D. A. Guo Planta Med. 2008 74 873
12. Y. Li B. Shrestha A. Vertes Anal. Chem. 2008 80 407
13. W. Schliemann C. Ammer D. Strack Phytochemistry 2008 69 1 112
14. O. Fiehn J. Kopka P. Dormann T. Altman R. N. Trethewey L. Willmitzer Nat. Biotechnol. 2000 18 1157
15. K. A. Leiss Y. H. Choi I. B. Abdel-Farid R. Verpoorte P. G. L. Klinkhamer J. Chem. Bio. 2009 35 219
16. L. L. Zhang Y. M. Lin Molecules 2008 13 2986
17. S. Tianniam L. Tarachiwin T. Bamba A. Kobayashi E. Fukusaki J. Biosci. Bioeng. 2008 105 655
18. I. H. Cho Y. S. Kim H. K. Choi J. Pharm. Biomed. Anal. 2007 43 900
19. H. K. Choi K. H. Kim K. H. Kim Y. S. Kim M. W. Lee W. K. Whang J. Pharm. Biomed. Anal. 2006 41 1047
20. Y. F. Ren T. Wang Y. F. Peng B. Xia L. J. Qu J. Genet. Genomics 2009 36 621
21. K. Ali F. Maltese E. Zyprian M. Rex Y. H. Choi R. Verpoorte J. Agric. Food Chem. 2009 57 9599
22. C. Deborde M. Maucourt P. Baldet S. Bernillon B. Biais G. Talon C. Ferrand D. Jacob H. Ferry-Dumazet A. Daruvar D. Rolin A. Moing Metabolomics 2009 5 183
23. L. Takachiwin O. Masako E. Fukusaki J. Agric. Food Chem. 2008 56 5827
24. C. C. Teo S. N. Tan J. W. H. Yong C. S. Hew E. S. Ong J. Sep. Sci. 2009 32 613
25. C. C. Teo S. N. Tan J. W. H. Yong C. S. Hew E. S. Ong J. Chromatogr., A 2008 1182 34
26. X. L. Shu T. Frank Q. Y. Shu K. R. Engel J. Agric. Food Chem. 2008 56 11612
27. W. Wu Q. Zhang Y. M. Zhu H. M. Lam Z. W. Cai D. J. Guo J. Agric. Food Chem. 2008 56 11132
28. K. Ruben D. V. Lieven S. Michael D. Dieter V. B. Jan J. Chromatogr., B: Anal. Technol. Biomed. Life Sci. 2008 871 37
29. K. Okazaki N. Oka T. Shinano M. Osaki M. Takebe Plant Cell Physiol. 2008 49 2 170
30. O. Fiehn Plant Mol. Biol. 2002 48 155
31. H. S. Son G. S. Hwang H. J. Ahn W. M. Park C. H. Lee Y. S. Hong Food Res. Int. 2009 42 1483
32. V. Kurt, F. Peter, Introduction to Multivariate Statistical Analysis in Chemometrics. CRC Press, Abingdon, UK, 2009
33. V. Arbona D. J. Iglesias M. Talon A. Gomez-Cadenas J. Agric. Food Chem. 2009 57 7338
34. M. P. Davey F. I. Woodward W. P. Quick Metabolomics 2009 5 138
35. L. M. Raamsdonk B. Teusink D. Broadhurst N. Zang A. Hayes M. C. Walsh Nat. Biotechnol. 2006 19 45
36. Y. S. Liang Y. H. Choi H. K. Kim H. J. M. Linthorst R. Verpoorte Phytochem. 2006 67 2503
37. S. K. Cho S. O. Yang S. H. Kim H. Kim J. S. Ko K. Z. Riu H. Y. Lee H. K. Choi J. Pharm. Biomed. Anal. 2009 49 567
38. C. F. Ma H. H. Wang X. Lu G. W. Xu B. Liu J. Chromatogr., A 2008 1186 412
39. K. Jumtee T. Bamba A. Okazawa E. Fukusaki A. Kobayashi J. Exp. Bot. 2008 59 1187
40. J. Lisec N. Schauer J. Kopka L. Willmitzer A. R. Fernie Nat. Protoc. 2006 1 387
41. R. Dauwe K. Morreel G. Goeminne B. Gielen Plant J. 2007 52 263
42. J. Gullberg P. Jonsson A. Nordstrom M. Sjostrom T. Moritz Anal. Biochem. 2004 331 283
43. J. R. Lloyd J. Kossmann G. Ritte Trends Plant Sci. 2005 10 3 130
44. W. B. Dunn D. I. Ellis TrAC, Trends Anal. Chem. 2005 24 285
45. X. D. He, J. H. Zou, Chinese Materia Medica, First ed., Chemistry Press, Beijing, China, 1998
46. W. Li Y. L. Deng R. J. Dai Y. H. Yu M. K. Saeed L. Li W. W. Meng X. S. Zhang J. Pharm. Biomed. Anal. 2007 45 38
47. J. E. Brandle P. G. Telmer Phytochem. 2007 68 1855
48. I. S. Markovic Z. A. Djarmati B. F. Abramovic J. Serb. Chem. Soc. 2008 73 283
49. Z. Xie J. Kapteyn D. R. Ganf Plant J. 2008 54 3 349
50. P. A. Kashulin M. N. Merzlyak P. M. Zhiboedov V. K. Zhirov Biochem. Soc. Trans. 2008 28 6 865
51. C. Hourton-Cabassa A. Mesneau B. Miroux J. Roussaux D. Ricquier A. Zachowski F. Moreau J. Biol. Chem. 2002 277 44 41533
52. A. M. Smith S. C. Zeeman S. M. Smith Annu. Rev. Plant Biol. 2005 56 73
53. S. C. Zeeman S. M. Smith A. M. Smith Biochem. J. 2007 401 13
54. K. M. Hawkins C. D. Smolke Nat. Chem. Biol. 2008 4 9 564
55. T. B. Karyagina O. A. Gaevskaya E. A. Gukasova T. V. Timchenko D. I. Bairamashvili Russ. J. Plant Physiol. 2007 54 2 267
56. H. W. Jung T. J. Tschaplinski L. Wang J. Glazebrook J. T. Greenberg Science 2009 324 89
57. S. Blechert W. Brodschelm S. Holder L. Kammerer T. M. Kutchan M. J. Mueller Z. Q. Xia M. H. Zenk Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1995 92 10 4099