How does trimethylamine N-oxide counteract the denaturing activity of urea?

Physical Chemistry Chemical Physics

Volumn 13, Issue 39, 2011, Pages 17689-17695

  Graziano, Giuseppe ^a  

^a UNIVERSITY OF SANNIO   (Italy)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

METHYLAMINE; PROTEIN; TRIMETHYLOXAMINE; UREA;

ARTICLE; CHEMISTRY; PROTEIN CONFORMATION; PROTEIN DENATURATION; SURFACE PROPERTY; THERMODYNAMICS;

METHYLAMINES; PROTEIN CONFORMATION; PROTEIN DENATURATION; PROTEINS; SURFACE PROPERTIES; THERMODYNAMICS; UREA;

EID: 80053486881     PISSN: 14639076     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/c1cp22176k     Document Type: Article

References (93)

1. P. H. Yancey M. E. Clark S. C. Hand R. D. Bowlus G. N. Somero Science 1982 217 1214 1222
2. P. H. Yancey G. N. Somero Biochem. J. 1979 183 317 323
3. T. Y. Lin S. N. Timasheff Biochemistry 1994 33 12695 12701
4. A. Wang D. W. Bolen Biochemistry 1997 36 9101 9108
5. Y. Liu D. W. Bolen Biochemistry 1995 34 12884 12891
6. D. W. Bolen G. D. Rose Annu. Rev. Biochem. 2008 77 339 362
7. I. Baskakov D. W. Bolen J. Biol. Chem. 1998 273 4831 4834
8. Y. Qu C. L. Bolen D. W. Bolen Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1998 95 9268 9273
9. D. W. Bolen I. Baskakov J. Mol. Biol. 2001 310 955 963
10. M. Auton D. W. Bolen Biochemistry 2004 43 1329 1342
11. M. Auton D. W. Bolen Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2005 102 15065 15068
12. M. Auton A. C. M. Ferreon D. W. Bolen J. Mol. Biol. 2006 361 983 992
13. G. I. Makhatadze P. L. Privalov J. Mol. Biol. 1992 226 491 505
14. W. K. Lim J. Rosgen S. W. Englander Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2009 106 2595 2600
15. L. Hua R. Zhou D. Thirumalai B. J. Berne Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2008 105 16928 16933
16. R. Zangi R. Zhou B. J. Berne J. Am. Chem. Soc. 2009 131 1535 1541
17. M. Lindgren P. O. Westlund Phys. Chem. Chem. Phys. 2010 12 9358 9366
18. D. R. Canchi D. Paschek A. E. Garcia J. Am. Chem. Soc. 2010 132 2338 2344
19. D. R. Canchi A. E. Garcia Biophys. J. 2011 100 1526 1533
20. C. C. Mello D. Barrick Protein Sci. 2003 12 1522 1529
21. S. Paul G. N. Patey J. Am. Chem. Soc. 2007 129 4476 4482
22. F. Meersman D. Bowron A. K. Soper M. H. J. Koch Biophys. J. 2009 97 2559 2566
23. B. J. Bennion V. Daggett Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2004 101 6433 6438
24. H. Kokubo C. Y. Hu B. M. Pettitt J. Am. Chem. Soc. 2011 133 1849 1858
25. G. Graziano Phys. Chem. Chem. Phys. 2010 12 14245 14252
26. G. Graziano Phys. Chem. Chem. Phys. 2011 13 12008 12014
27. A. Ben-Naim, Solvation Thermodynamics, Plenum Press, New York, 1987
28. B. Lee Biopolymers 1991 31 993 1008
29. G. Graziano Can. J. Chem. 2002 80 401 412
30. G. Graziano Chem. Phys. Lett. 2006 429 114 118
31. G. Graziano J. Phys. Chem. B 2001 105 2632 2637
32. G. Graziano Can. J. Chem. 2002 80 388 400
33. A. Ben-Naim Biopolymers 1975 14 1337 1355
34. B. Lee Biophys. Chem. 1994 51 271 278
35. E. Grunwald C. Steel J. Am. Chem. Soc. 1995 117 5687 5692
36. H. Qian J. J. Hopfield J. Chem. Phys. 1996 105 9292 9298
37. B. Lee G. Graziano J. Am. Chem. Soc. 1996 118 5163 5168
38. G. Graziano B. Lee J. Phys. Chem. B 2001 105 10367 10372
39. V. N. Uversky Protein Sci. 2002 11 739 756
40. W. Kauzmann Adv. Protein Chem. 1959 14 1 63
41. A. A. Rashin Biopolymers 1984 23 1605 1620
42. K. A. Dill Biochemistry 1990 29 7133 7155
43. W. Blokzijl J. B. F. N. Engberts Angew. Chem., Int. Ed. Engl. 1993 32 1545 1579
44. B. Lee J. Chem. Phys. 1985 83 2421 2425
45. G. Graziano J. Chem. Phys. 2004 120 4467 4471
46. G. Graziano J. Phys. Chem. B 2006 110 11421 11426
47. G. Graziano Chem. Phys. Lett. 2007 446 313 316
48. B. Lee F. M. Richards J. Mol. Biol. 1971 55 379 400
49. H. Reiss Adv. Chem. Phys. 1966 9 1 84
50. R. A. Pierotti Chem. Rev. 1976 76 717 726
51. G. Graziano Chem. Phys. Lett. 2007 440 221 223
52. G. Graziano J. Chem. Phys. 2008 129 084506
53. G. Graziano J. Phys. Chem. B 2009 113 11232 11239
54. G. S. Kell J. Chem. Eng. Data 1975 20 97 105
55. P. Venkatesu M. J. Lee H. M. Lin Biochem. Eng. J. 2008 38 326 340
56. K. Kawahara C. Tanford J. Biol. Chem. 1966 241 3228 3232
57. J. M. Sorenson G. Hura R. M. Glaeser T. Head-Gordon J. Chem. Phys. 2000 113 9149 9161
58. G. Graziano Chem. Phys. Lett. 2004 396 226 231
59. T. O. Street D. W. Bolen G. D. Rose Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2006 103 13997 14002
60. S. Weerasinghe P. E. Smith J. Phys. Chem. B 2003 107 3891 3898
61. D. Trzesniak N. F. A. van der Vegt W. F. van Gunsteren Phys. Chem. Chem. Phys. 2004 6 697 702
62. M. V. Athawale J. Dordick S. Garde Biophys. J. 2005 89 858 866
63. G. Graziano Chem. Phys. Lett. 2007 442 307 310
64. G. Graziano J. Therm. Anal. Calorim. 2007 91 73 77
65. G. Graziano Chem. Phys. Lett. 2010 497 33 36
66. D. Chandler Nature 2005 437 640 647
67. S. Rajamani T. M. Truskett S. Garde Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2005 102 9475 9480
68. H. S. Ashbaugh L. R. Pratt Rev. Mod. Phys. 2006 78 159 178
69. D. C. Rees A. D. Robertson Protein Sci. 2001 10 1187 1194
70. T. P. Creamer G. D. Rose Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1992 89 5937 5941
71. A. J. Doig M. J. E. Sternberg Protein Sci. 1995 4 2247 2251
72. J. A. D'Aquino J. Gomez V. J. Hilser K. H. Lee L. M. Amzel E. Freire Proteins 1996 25 143 156
73. J. Fitter Biophys. J. 2003 84 3924 3930
74. C. N. Pace Methods Enzymol. 1986 131 266 280
75. T. Shikata S. Itatani J. Solution Chem. 2002 31 823 844
76. V. Kocherbitov V. Veryazov O. Soderman THEOCHEM 2007 808 111 118
77. K. L. Munroe D. H. Magers N. I. Hammer J. Phys. Chem. B 2011 115 7699 7707
78. P. L. Privalov Adv. Protein Chem. 1979 33 167 237
79. G. I. Makhatadze P. L. Privalov Adv. Protein Chem. 1995 47 307 425
80. K. E. S. Tang V. A. Bloomfield Biophys. J. 2000 79 2222 2234
81. S. Weerasinghe P. E. Smith J. Chem. Phys. 2004 121 2180 2186
82. D. Paschek J. Chem. Phys. 2004 120 6674 6690
83. P. P. Shah C. J. Roberts J. Phys. Chem. B 2007 111 4467 4476
84. H. S. Ashbaugh N. J. Collett H. W. Hatch J. A. Staton J. Chem. Phys. 2010 132 124504
85. G. I. Makhatadze J. Phys. Chem. B 1999 103 4781 4785
86. K. A. Dill J. Biol. Chem. 1997 272 701 704
87. A. Ben-Naim, Hydrophobic Interactions, Plenum Press, New York, 1980
88. J. Tomasi M. Persico Chem. Rev. 1994 94 2027 2094
89. A. J. Saunders P. R. Davis-Searles D. L. Allen G. J. Pielak D. A. Erie Biopolymers 2000 53 293 307
90. J. A. Schellman Biophys. J. 2003 85 108 125
91. A. K. Soper E. W. Castner A. Luzar Biophys. Chem. 2003 105 649 666
92. M. Freda G. Onori A. Santucci J. Phys. Chem. B 2001 105 12714 12718
93. J. D. Batchelor A. Olteanu A. Tripathy G. J. Pielak J. Am. Chem. Soc. 2004 126 1958 1961