Infrared spectromicroscopy of biochemistry in functional single cells

Analyst

Volumn 136, Issue 16, 2011, Pages 3219-3232

  Quaroni, Luca ^a   Zlateva, Theodora ^b  

^a PAUL SCHERRER INSTITUTE   (Switzerland)

^b Department of Biochemistry and Saskatchewan Cancer Center ^*  (Canada)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

EID: 79960955638     PISSN: 00032654     EISSN: 13645528     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/c1an15060j     Document Type: Review

References (98)

1. J. M. Chalmers, in Biomedical Applications of Synchrotron Infrared Spectromicroscopy, ed., D. Moss,, Royal Society of Chemistry, Cambridge, 2011, vol. 11, pp. 29-66
2. S. Kumar A. Barth Sensors 2010 10 2626 2637
3. C. Kotting K. Gerwert ChemPhysChem 2005 6 881 888
4. B. Warscheid S. Brucker A. Kallenbach H. E. Meyer K. Gerwert C. Kotting Vib. Spectrosc. 2008 48 28 36
5. A. Barth Biochim. Biophys. Acta, Bioenerg. 2007 1767 1073 1101
6. J. L. R. Arrondo F. M. Goni Prog. Biophys. Mol. Biol. 1999 72 367 405
7. E. Goormaghtigh V. Raussens J. M. Ruysschaert Biochim. Biophys. Acta, Rev. Biomembr. 1999 1422 105 185
8. L. K. Tamm S. A. Tatulian Q. Rev. Biophys. 1997 30 365 429
9. F. Garczarek K. Gerwert Nature 2006 439 109 112
10. M. Diem M. J. Romeo S. Boydston-White C. Matthaus Spectrochem. Anal. Using Infrared Multichannel Detect. 2005 189 203
11. D. L. Wetzel S. M. LeVine Science 1999 285 1224 1225
12. D. L. Wetzel and S. M. LeVine, Microbeam Analysis 2000, Proceedings, 2000, pp. 65-66
13. I. W. Levin R. Bhargava Annu. Rev. Phys. Chem. 2005 56 429 474
14. L. Quaroni and T. Zlateva, FTIR Functional Spectromicroscopy in Living Cells 978-0-9783761-3-0, Canadian Light Source, Inc., 2009
15. Biomedical Applications of Synchrotron Infrared Microspectroscopy, ed., D. Moss,, Royal Society of Chemistry, Cambridge, 2011
16. M. Leslie Science 2011 331 24 26
17. E. A. Arriaga Anal. Bioanal. Chem. 2009 393 73 80
18. F. L. Martin J. G. Kelly V. Llabjani P. L. Martin-Hirsch I. I. Patel J. Trevisan N. J. Fullwood M. J. Walsh Nat. Protoc. 2010 5 1748 1760
19. M. Chabre Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1978 75 5471 5474
20. L. Quaroni T. Zlateva D. Bedolla S. Massaro V. Torre ChemPhysChem 2008 9 1380 1382
21. D. E. Wolf Methods Cell Biol. 2003 72 157 184
22. L. M. Miller G. L. Carr G. P. Williams M. R. Chance Biophys. J. 1997 72 TU445
23. P. Dumas G. L. Carr G. P. Williams Analysis 2000 28 68 74
24. L. M. Miller, P. Dumas, N. Jamin, J. L. Teillaud, J. L. Bantignies and G. L. Carr, Microbeam Analysis 2000, Proceedings, 2000, pp. 75-76
25. G. L. Carr, M. Ramotowski and L. M. Miller, Microbeam Analysis 2000, Proceedings, 2000, pp. 51-52
26. M. C. Martin U. Schade P. Lerch P. Dumas TrAC, Trends Anal. Chem. 2010 29 453 463
27. E. Levenson P. Lerch M. C. Martin Infrared Phys. Technol. 2008 51 413 416
28. A. Marcelli and G. Cinque, in Biomedical Applications of Synchrotron Infrared Spectromicroscopy, ed., D. Moss,, Royal Society of Chemistry, Cambridge, 2011, vol. 11, pp. 67-104
29. N. Jamin P. Dumas J. Moncuit W. H. Fridman J. L. Teillaud G. L. Carr G. P. Williams Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1998 95 4837 4840
30. N. Jamin P. Dumas J. Moncuit W. H. Fridman J. L. Teillaud G. L. Carr G. P. Williams Cell. Mol. Biol. 1998 44 9 13
31. H. Y. N. Holman K. A. Bjornstad M. P. McNamara M. C. Martin W. R. McKinney E. A. Blakely J. Biomed. Opt. 2002 7 417 424
32. H. Y. Holman M. C. Martin E. A. Blakely K. Bjornstad W. R. McKinney Biopolymers 2000 57 329 335
33. H.-Y. N. Holman R. Goth-Goldstein M. C. Martin M. L. Russell W. R. McKinney Environ. Sci. Technol. 2000 34 2513 2517
34. E. Levenson P. Lerch M. C. Martin Infrared Phys. Technol. 2006 49 45 52
35. L. M. Miller R. J. Smith Vib. Spectrosc. 2005 38 237 240
36. G. L. Carr, O. Chubar and P. Dumas, Spectrochemical Analysis Using Infrared Multichannel Detectors, 2005, 56 84
37. G. L. Carr, L. M. Miller and P. Dumas, in Biomedical Applications of Synchrotron Infrared Spectromicroscopy, ed., D. Moss,, Royal Society of Chemistry, Cambridge, 2011, vol. 11, pp. 226-259
38. C. Petibois G. Deleris M. Piccinini M. Cestelli-Guidi A. Marcelli Nat. Photonics 2009 3 178 178
39. L. M. Miller P. Dumas Biochim. Biophys. Acta, Biomembr. 2006 1758 846 857
40. M. J. Nasse R. Reininger T. Kubala S. Janowski C. Hirschmugl Nucl. Instrum. Methods Phys. Res., Sect. A 2007 582 107 110
41. M. J. Nasse M. J. Walsh E. C. Mattson R. Reininger A. Kajdacsy-Balla V. Macias R. Bhargava C. J. Hirschmugl Nat. Methods 2011 8 413 416
42. K. L. Goff L. Quaroni K. E. Wilson Analyst 2009 134 2216 2219
43. H.-Y. N. Holman M. C. Martin W. R. McKinney Spectroscopy 2003 17 139 159
44. P. Dumas N. Jamin J. L. Teillaud L. M. Miller B. Beccard Faraday Discuss. 2004 126 289 302
45. P. Heraud J. Beardall D. McNaughton B. Wood Phycologia 2005 44 104
46. J. R. Mourant R. R. Gibson T. M. Johnson S. Carpenter K. W. Short Y. R. Yamada J. P. Freyer Phys. Med. Biol. 2003 48 243 257
47. E. J. Marcsisin C. M. Uttero M. Miljkovic M. Diem Analyst 2010 135 3227 3232
48. I. Noda Front. Mol. Spectrosc. 2009 367 381
49. S. Massaro T. Zlateva V. Torre L. Quaroni Anal. Bioanal. Chem. 2008 390 317 322
50. L. Quaroni E. Normand Am. Inst. Phys. Conf.Proc. 2009 1214 66 68
51. M. Diem L. Chiriboga P. Lasch A. Pacifico Biopolymers 2002 61 349 353
52. P. Lasch M. Boese A. Pacifico M. Diem Vib. Spectrosc. 2002 28 147 157
53. M. Diem M. Romeo S. Boydston-White M. Miljkovic C. Matthaeus Analyst 2004 129 880 885
54. S. Y. Venyaminov F. G. Prendergast Anal. Biochem. 1997 248 234 245
55. M. Miljkovic M. Romeo C. Matthaus M. Diem Biopolymers 2004 74 172 175
56. D. A. Moss M. Keese R. Pepperkok Vib. Spectrosc. 2005 38 185 191
57. C. Matthaus, B. Bird, M. Miljkovic, T. Chernenko, M. Romeo and M. Diem, Biophysical Tools for Biologists, Vol. 2: in Vivo Techniques, 2008, vol. 89, p. 275
58. M. K. Kuimova K. L. Chan S. G. Kazarian Appl. Spectrosc. 2009 63 164 171
59. D. A. Moss K. Fuechsle R. Masuch A. Wolf Proc. SPIE-Int. Soc. Opt. Eng. 2000 3918 97 103
60. K. L. Goff L. Quaroni K. E. Wilson T. Pedersen Am. Inst. Phys. Conf.Proc. 2009 1214 54 56
61. H. Y. N. Holman E. Wozei Z. Lin L. R. Comolli D. A. Ball S. Borglin M. W. Fields T. C. Hazen K. H. Downing Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2009 106 12599 12604
62. D. J. Kushner A. Baker T. G. Dunstall Can. J. Physiol. Pharmacol. 1999 77 79 88
63. D. L. Wetzel D. N. Slatkin S. M. Levine Cell. Mol. Biol. 1998 44 15 27
64. R. Zhao L. Quaroni A. G. Casson Analyst 2010 135 53 61
65. P. Heraud B. R. Wood M. J. Tobin J. Beardall D. McNaughton FEMS Microbiol. Lett. 2005 249 219 225
66. M. J. Tobin L. Puskar R. L. Barber E. C. Harvey P. Heraud B. R. Wood K. R. Bambery C. T. Dillon K. L. Munro Vib. Spectrosc. 2010 53 34 38
67. H. Y. N. Holman R. Miles Z. Hao E. Wozei L. M. Anderson H. Yang Anal. Chem. 2009 81 8564 8570
68. M. J. Nasse S. Ratti M. Giordano C. J. Hirschmugl Appl. Spectrosc. 2009 63 1181 1186
69. H. Y. N. Holman M. C. Martin W. R. McKinney J. Biol. Phys. 2003 29 275 286
70. Crystran, Optical Materials;
71. Handbook of Optical Constants of Solids, ed., E. D. Palik,, Academic Press, Boston, 1985
72. B. J. Davis P. S. Carney R. Bhargava Anal. Chem. 2010 82 3487 3499
73. P. Bassan H. J. Byrne J. Lee F. Bonnier C. Clarke P. Dumas E. Gazi M. D. Brown N. W. Clarke P. Gardner Analyst 2009 134 1171 1175
74. M. J. Pilling P. Gardner S. Le Vent Surf. Sci. 2005 582 1 13
75. B. Mohlenhoff M. Romeo M. Diem B. R. Wood Biophys. J. 2005 88 3635 3640
76. P. Bassan H. J. Byrne F. Bonnier J. Lee P. Dumas P. Gardner Analyst 2009 134 1586 1593
77. P. Bassan A. Kohler H. Martens J. Lee H. J. Byrne P. Dumas E. Gazi M. Brown N. Clarke P. Gardner Analyst 2010 135 268 277
78. P. Bassan A. Kohler H. Martens J. Lee E. Jackson N. Lockyer P. Dumas M. Brown N. Clarke P. Gardner J. Biophotonics 2010 3 609 620
79. P. Bassan and P. Gardner, in Biomedical Applications of Synchrotron Infrared Spectromicroscopy, ed., D. Moss,, Royal Society of Chemistry, Cambridge, 2011, vol. 11, pp. 260-276
80. H. C. van de Hulst, Light Scattering by Small Particles, Dover, New York, 1981
81. B. J. Davis P. S. Carney R. Bhargava Anal. Chem. 2010 82 3474 3486
82. M. Wenning S. Scherer D. Naumann Vib. Spectrosc. Med. Diagn. 2008 71 96
83. M. Beekes P. Lasch D. Naumann Vet. Microbiol. 2007 123 305 319
84. Vibrational Spectroscopy for Medical Diagnosis, ed., M. Diem,,, P. R. Griffiths, and, J. M. Chalmers,, 2008
85. P. Heraud B. R. Wood J. Beardall D. McNaughton ACS Symp. Ser. 2007 963 85 106
86. J. Beardall T. Berman P. Heraud M. O. Kadiri B. R. Light G. Patterson S. Roberts B. Sulzberger E. Sahan U. Uehlinger B. Wood Aquat. Sci. 2001 63 107 121
87. S. A. Patel F. Currie N. Thakker R. Goodacre Analyst 2008 133 1707 1713
88. J. N. Murdock D. L. Wetzel Appl. Spectrosc. Rev. 2009 44 335 361
89. H. Y. N. Holman M. C. Martin W. R. McKinney Spectrosc.-Int. J. 2003 17 139 159
90. H. Y. Holman M. C. Martin E. A. Blakely K. Bjornstad W. R. McKinney Biopolymers 2000 56 6 329 335
91. P. Heraud M. J. Tobin Stem Cell Res. 2009 3 12 14
92. S. Navea R. Tauler E. Goormaghtigh A. de Juan Proteins: Struct., Funct., Bioinf. 2006 63 527 541
93. E. Goormaghtigh J. M. Ruysschaert V. Raussens Biophys. J. 2006 90 2946 2957
94. F. DeLange P. H. M. Bovee-Geurts A. M. A. Pistorius K. J. Rothschild W. J. DeGrip Biochemistry 1999 38 13200 13209
95. S. Nickell P. S. H. Park W. Baumeister K. Palczewski J. Cell Biol. 2007 177 917 925
96. C. J. Hirschmugl Z. E. Bayarri M. Bunta J. B. Holt M. Giordano Infrared Phys. Technol. 2006 49 57 63
97. M. Giordano M. Kansiz P. Heraud J. Beardall B. Wood D. McNaughton J. Phycol. 2001 37 271 279
98. H.-Y. Holman E. Wozei Z. Lin L. R. Comolli D. A. Ball S. Borlin M. W. Fields T. C. Hazen K. H. Downing Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A., Early Ed. 2009 1-6 6