Dual molecular light switches for pH and DNA based on a novel Ru(II) complex. A non-intercalating Ru(II) complex for DNA molecular light switch

Inorganic Chemistry

Volumn 50, Issue 14, 2011, Pages 6425-6436

  Zhang, An Guo ^a   Zhang, You Zhuan ^a   Duan, Zhi Ming ^a   Wang, Ke Zhi ^a   Wei, Hui Bo ^b   Bian, Zu Qiang ^b   Huang, Chun Hui ^b  

^a BEIJING NORMAL UNIVERSITY   (China)

^b PEKING UNIVERSITY   (China)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

CALF THYMUS DNA; DNA; ORGANOMETALLIC COMPOUND; RUTHENIUM; SODIUM CHLORIDE;

ANIMAL; ARTICLE; CATTLE; CHEMICAL STRUCTURE; CHEMISTRY; DRUG EFFECT; LIGHT; PH; QUANTUM THEORY; STEREOISOMERISM; SYNTHESIS; THERMODYNAMICS; TIME;

ANIMALS; CATTLE; DNA; HYDROGEN-ION CONCENTRATION; LIGHT; MODELS, MOLECULAR; MOLECULAR STRUCTURE; ORGANOMETALLIC COMPOUNDS; QUANTUM THEORY; RUTHENIUM; SODIUM CHLORIDE; STEREOISOMERISM; THERMODYNAMICS; TIME FACTORS;

EID: 79960236944     PISSN: 00201669     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ic102126m     Document Type: Article

References (88)

1. Balzani, V.; Credi, A.; Venturi, M. ChemSusChem 2008, 1, 26
2. Dalton, S. R.; Glazier, S.; Leung, B.; Win, S.; Megatulski, C.; Burgmayer, S. J. N. J. Biol. Inorg. Chem. 2008, 13, 1133
3. Spillane, C. B.; Fletcher, N. C.; Rountree, S. M.; van den Berg, H.; Chanduloy, S.; Morgan, J. L.; Keene, F. R. J. Biol. Inorg. Chem. 2007, 12, 797
4. Zou, X. H.; Ye, B. H.; Li, H.; Zhang, Q. L.; Chao, H.; Liu, J. G.; Ji, L. N.; Li, X. Y. J. Biol. Inorg. Chem. 2001, 6, 143
5. Barton, J. K. Science 1986, 233, 727
6. Metcalfe, C.; Thomas, J. A. Chem. Soc. Rev. 2003, 32, 215
7. Friedman, A. E.; Chambron, J. C.; Sauvage, J. P.; Turro, N. J.; Barton, J. K. J. Am. Chem. Soc. 1990, 112, 4960
8. Hartshorn, R. M.; Barton, J. K. J. Am. Chem. Soc. 1992, 114, 5919
9. Erkkila, K. E.; Odom, D. T.; Barton, J. K. Chem. Rev. 1999, 99, 2777
10. Ruba, E.; Hart, J. R.; Barton, J. K. Inorg. Chem. 2004, 43, 4570
11. Dupureur, C. M.; Barton, J. K. J. Am. Chem. Soc. 1994, 116, 10286
12. Delaney, S.; Pascaly, M.; Bhattarcharya, P.; Han, K.; Barton, J. K. Inorg. Chem. 2002, 41, 1966
13. Dupureur, C. M.; Barton, J. K. Inorg. Chem. 1997, 36, 33
14. Jenkins, Y.; Friedman, A. E.; Turro, N. J.; Barton, J. K. Biochemistry 1992, 31, 10809
15. Rajput, C.; Rutkaite, R.; Swanson, L.; Haq, I.; Thomas, J. A. Chem.-Eur. J. 2006, 12, 4611
16. O'Donoghue, K. A.; Penedo, J. C.; Kelly, J. M.; Kruger, P. E. Dalton Trans 2005, 1123
17. Collins, J. G.; Sleeman, A. D.; Aldrich-Wright, J. R.; Greguric, I.; Hambley, T. W. Inorg. Chem. 1998, 37, 3133
18. Ambroise, A.; Maiya, B. G. Inorg. Chem. 2000, 39, 4264
19. O'Donoghue, K. A.; Kelly, J. M.; Kruger, P. E. Dalton Trans 2004, 13
20. Han, M. J.; Duan, Z. M.; Hao, Q.; Zheng, S. Z.; Wang, K. Z. J. Phys. Chem. C 2007, 111, 16577
21. Zhen, Q. X.; Ye, B. H.; Zhang, Q. L.; Liu, J. G.; Li, H.; Ji, L. N. J. Inorg. Biochem. 1999, 76, 47
22. Li, J.; Chen, J. C.; Xu, L. C.; Zheng, K. C.; Ji, L. N. J. Organomet. Chem. 2007, 692, 831
23. Mariappan, M.; Maiya, B. G. Eur. J. Inorg. Chem. 2005, 2164
24. Lutterman, D. A.; Chouai, A.; Liu, Y.; Sun, Y.; Stewart, C. D.; Dunbar, K. R.; Turro, C. J. Am. Chem. Soc. 2008, 130, 1163
25. Olson, E. J. C.; Hu, D.; Hormann, A.; Jonkman, A. M.; Arkin, M. R.; Stemp, E. D. A.; Barton, J. K.; Barbara, P. F. J. Am. Chem. Soc. 1997, 119, 11458
26. Nair, R. B.; Cullum, B. M.; Murphy, C. J. Inorg. Chem. 1997, 36, 962
27. Coates, C. G.; Callaghan, P. L.; Mcgarvey, J. J.; Kelly, J. M.; Kruger, P. E.; Higgins, M. E. J. Raman Spectrosc. 2000, 31, 283
28. Brennaman, M. K.; Alstrum-Acevedo, J. H.; Fleming, C. N.; Jang, P.; Meyer, T. J.; Papanikolas, J. M. J. Am. Chem. Soc. 2002, 124, 15094
29. Olofsson, J.; Onfelt, B.; Lincoln, P. J. Phys. Chem. A 2004, 108, 4391
30. Batista, E. R.; Martin, R. L. J. Phys. Chem. A 2005, 109, 3128
31. Brennaman, M. K.; Meyer, T. J.; Papanikolas, J. M. J. Phys. Chem. A 2004, 108, 9938
32. Pourtois, G.; Beljonne, D.; Moucheron, C.; Schumm, S.; Mesmaeker, A. K. D.; Lazzaroni, R.; Brédas, J. L. J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 683
33. Sun, Y. J.; Lutlerman, D. A.; Turro, C. Inorg. Chem. 2008, 47, 6427
34. Stryer, L. Biochemistry, Freeman: New York, 1988.
35. Yam, V. W. W.; Kai, A. S. F. Inorg. Chim. Acta 2000, 82, 300
36. Haga, M. A.; Takasugi, T.; Tomie, A.; Ishizuya, M.; Yamada, T.; Hossain, M. D.; Inoue, M. Dalton Trans 2003, 2069
37. Allardyce, C. S.; Dyson, P. J.; Ellis, D. J.; Heath, S. L. J. Chem. Soc., Chem. Commun. 2001, 1396
38. Guardigli, M.; Flamigni, L.; Barigelletti, F.; Richards, C. S. W.; Ward, M. D. J. Phys. Chem. 1996, 100, 10620
39. Liu, F. R.; Wang, K. Z.; Bai, G. Y.; Zhang, Y. A.; Gao, L. H. Inorg. Chem. 2004, 43, 1799
40. Han, M. J.; Gao, L. H.; Lü, Y. Y.; Wang, K. Z. J. Phys. Chem. B 2006, 110, 2364
41. Gao, F.; Chao, H.; Zhou, F.; Peng, B.; Ji, L. N. Inorg. Chem. Commun. 2007, 10, 170
42. Cheng, F. X.; Tang, N. Inorg. Chem. Commun. 2008, 11, 506
43. Chen, Y. M.; Liu, Y. J.; Li, Q.; Wang, K. Z. J. Inorg. Biochem. 2009, 103, 1359
44. Fan, S. H.; Wang, K. Z.; Yang, W. C. Eur. J. Inorg. Chem. 2009, 508
45. Bashford, D.; Karplus, M. Biochemistry 1990, 29, 10219
46. Ma, Y. Z.; Yin, H. J.; Wang, K. Z. J. Phys. Chem. B 2009, 113, 11039
47. Delgadillo, A.; Romo, P.; Leiva, A. M.; Leob, B. Helv. Chim. Acta 2003, 86, 2110
48. Ji, Z. Q.; Huang, S. P.; Guadalupe, A. R. Inorg. Chim. Acta 2000, 305, 127
49. Perrin, D. D.; Armarego, W. L.; Perrin, D. R. Purification of Laboratory Chemicals, 2 nd ed.; Pergamon: Oxford, 1980.
50. Houten, J. V.; Watts, R. J. J. Am. Chem. Soc. 1976, 98, 4853
51. Chaires, J. B.; Dattagupta, N.; Crothers, D. M. Biochemistry 1982, 21, 3933
52. Zou, X. H.; Ye, B. H.; Li, H.; Liu, J. G.; Xiong, Y.; Ji, L. N. J. Chem. Soc., Dalton Trans. 1999, 1424
53. Juris, A.; Balzani, V.; Barigelletti, F.; Campagna, S.; Belser, P.; von Zelewsky, A. Coord. Chem. Rev. 1988, 84, 85
54. Barone, V.; Cossi, M. J. Phys. Chem. A 1998, 102, 1995
55. Cossi, M.; Rega, N.; Scalmani, G.; Barone, V. J. Comput. Chem. 2003, 24, 669
56. Lee, C.; Yang, W.; Parr, R. G. Phys. Rev. B: Condens. Matter Mater. Phys. 1988, 37, 785
57. Becke, A. D. Phys. Rev. A: Gen. Phys. 1988, 38, 3098
58. Becke, A. D. J. Chem. Phys. 1993, 98, 5648
59. Hehre, W. J.; Radom, L.; Schleyer, P.V. R.; Pople, J. A. Ab Initio Molecular Orbital Theory; Wiley & Sons: New York, 1986.
60. Hay, P. J.; Wadt, W. R. J. Chem. Phys. 1985, 82, 270
61. Wadt, W. R.; Hay, P. J. J. Chem. Phys. 1985, 82, 284
62. Frisch, M. J. Gaussian 03, Revision D.01; Gaussian Inc: Wallingford, CT, 2005.
63. Su, C. H.; Chen, H. Y.; Tsai, K. Y. D.; Chang, I. J. J. Phys. Chem. B 2007, 111, 6857
64. Gholamkhass, B.; Koike, K.; Negishi, N.; Hori, H.; Takeuchi, K. Inorg. Chem. 2001, 40, 756
65. Urathammakul, T.; Waller, D. J.; Beck, J. L.; Aldrich-Wright, J. R.; Ralph, S. F. Inorg. Chem. 2008, 47, 6621
66. Suh, D.; Chaires, J. B. Bioorg. Med. Chem. 1995, 3, 723
67. Ghosh, A.; Das, P.; Gill, M. R.; Kar, P.; Walker, M. G.; Thomas, J. A.; Das, A. Chem.-Eur. J. 2011, 17, 2089
68. Boger, D. L.; Fink, B. E.; Brunette, S. R.; Tse, W. C.; Hedric, M. P. J. Am. Chem. Soc. 2001, 123, 5878
69. Boger, D. L.; Fink, B. E.; Hedrick, M. P. J. Am. Chem. Soc. 2000, 122, 6382
70. Sarkar, R.; Pal, S. K. Biopolymers 2006, 83, 675
71. Tsai, C. C.; Jain, S. C.; Sobell, H. M. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1975, 72, 628
72. Breslauer, K. J.; Remeta, D. P.; Chou, W. Y.; Ferrante, R.; Curry, J.; Zaunczkowski, D.; Snyder, J. G.; Marky, L. A. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1987, 84, 8922
73. Vardevanyan, P. O.; Antonyan, A. P.; Parsadanyan, M. A.; Davtyan, H. G.; Karapetyan, A. T. Exp. Mol. Med. 2003, 35, 527
74. Bugs, M. R.; Cornélio, M. L. Eur. Biophys. J. 2002, 31, 232
75. Baguley, B. C.; Falkenhaug, E. M. Nucleic Acids Res. 1978, 5, 161
76. Palchaudhuri, R.; Hergenrother, P. J. Curr. Opin. Biotechnol. 2007, 18, 497
77. Shim, Y. H.; Arimondo, P. B.; Laigle, A.; Garbesi, A.; Lavielle, S. Org. Biomol. Chem. 2004, 2, 915
78. Cain, B. F.; Baguley, B. C.; Denny, W. A. J. Med. Chem. 1978, 21, 658
79. Heller, D. P.; Greenstock, C. L. Biophys. Chem. 1994, 50, 305
80. Jennette, K. W.; Lippard, S. J.; Vassiliades, G. A.; Baueri, W. R. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1974, 71, 3839
81. Banerjee, D.; Pal, S. K. J. Phys. Chem. B 2007, 111, 5047
82. Mudasir, W. K.; Wahyuni, E. T.; Yoshioka, N.; Inoue, H. Biophys. Chem. 2006, 121, 44
83. Record, M. T.; Lohman, T. M.; De Haseth, P. J. Mol. Biol. 1976, 107, 145
84. Pierard, F.; Guerzo, A. D.; Kirsch-De Mesmaeker, A.; Demeunynck, M.; Lhomme, J. Phys. Chem. Chem. Phys. 2001, 3, 2911
85. Satyanarayana, S.; Dabrowiak, J. C.; Chaires, J. B. Biochemistry 1992, 31, 9319
86. Lü, Y. Y.; Gao, L. H.; Han, M. J.; Wang, K. Z. Eur. J. Inorg. Chem. 2006, 430
87. Lerman, L. J. Mol. Biol. 1961, 3, 18
88. Satyanarayana, S.; Dabrowiak, J. C.; Chaires, J. B. Biochemistry 1993, 32, 2573