Intercalation is not required for DNA light-switch behavior

Journal of the American Chemical Society

Volumn 130, Issue 4, 2008, Pages 1163-1170

  Lutterman, Daniel A ^a   Chouai, Abdellatif ^b   Liu, Yao ^a   Sun, Yujie ^a   Stewart, Cristina D ^a   Dunbar, Kim R ^b   Turro, Claudia ^a  

^a OHIO STATE UNIVERSITY   (United States)

^b TEXAS A AND M UNIVERSITY   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

COMPLEXATION; CONCENTRATION (PROCESS); DNA; VISCOSITY;

LIGHT-SWITCH BEHAVIOR; NONEMISSIVE CHARACTER;

INTERCALATION;

2,2' BIPYRIDINE DERIVATIVE; DNA; METAL COMPLEX; ORGANIC SOLVENT; PHENAZINE DERIVATIVE; RUTHENIUM DERIVATIVE; WATER;

ABSORPTION SPECTROSCOPY; ARTICLE; DENSITY FUNCTIONAL THEORY; ELECTROCHEMISTRY; INTERCALATION COMPLEX; LIGHT; LUMINESCENCE; NONHUMAN; PHOTOCHEMISTRY; PROTON NUCLEAR MAGNETIC RESONANCE; REVERSED PHASE HIGH PERFORMANCE LIQUID CHROMATOGRAPHY; SYNTHESIS;

ANIMALS; CATTLE; DNA; ELECTROCHEMISTRY; FISHES; HYDROGEN-ION CONCENTRATION; INTERCALATING AGENTS; LIGANDS; LIGHT; MAGNETIC RESONANCE SPECTROSCOPY; MALE; NUCLEIC ACID CONFORMATION; SPERMATOZOA; THYMUS GLAND; ZINC;

EID: 38649108493     PISSN: 00027863     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ja071001v     Document Type: Article

References (66)

1. Friedman, A. E.; Chambron, J. C.; Sauvage, J. P.; Turro, N. J.; Barton, J. K. J. Am. Chem. Soc. 1990, 112, 4960.
2. Hartshorn, R. M.; Barton, J. K. J. Am. Chem. Soc. 1992, 114, 5919.
3. Holmlin, R. E.; Barton, J. K. Inorg. Chem. 1995, 34, 7.
4. Holmlin, R. E.; Tong, R. T.; Barton, J. K. J. Am. Chem. Soc. 1998, 120, 9724.
5. Moucheron, C.; Kirsch-De Mesmaeker, A.; Choua, S. Inorg. Chem. 1997, 36, 584.
6. Arounaguiri, S.; Maiya, B. G. Inorg. Chem. 1999, 38, 842.
7. Zhang, Q.-L.; Liu, J.-H.; Ren, X.-Z.; Xu, H.; Huang, Y.; Liu, J.-Z.; Ji, L.-N. J. Inorg. Biochem. 2003, 95, 194.
8. Nair, R. B.; Murphy, C. J. J. Inorg. Biochem. 1998, 69, 129.
9. Tuite, E.; Lincoln, P.; Norden, B. J. Am. Chem. Soc. 1997, 119, 239.
10. Liu, Y.; Chouai, A.; Degtyareva, N. N.; Lutterman, D. A.; Dunbar, K. R.; Turro, C. J. Am. Chem. Soc. 2005, 127, 10796.
11. Ling, L.-S.; He, Z.-H.; Song, G.-W.; Zeng, Y. E.; Wang, C.; Bai, C.-L.; Chen, X.-D.; Shen, P. Anal. Chim. Acta 2001, 436, 207.
12. Ling, L.-S.; He, Z.-K.; Chen, F.; Zeng, Y.-E. Talanta 2003, 59, 269.
13. de Silva, A. P.; McClenaghan, N. D. Chem. - Eur. J. 2004, 10, 574.
14. Jiang, Y.; Fang, X.; Bai, C. Anal. Chem. 2004, 76, 5230.
15. Erkkila, K. E.; Odom, D. T.; Barton, J. K. Chem. Rev. 1999, 99, 2777.
16. Holmlin, R. E.; Yao, J. A.; Barton, J. K. Inorg. Chem. 1999, 38, 174.
17. Delaney, S.; Pascaly, M.; Bhattacharya, P. K.; Han, K.; Barton, J. K. Inorg. Chem. 2002, 41, 1966.
18. Mariappan, M.; Maiya, B. G. Eur. J. Inorg. Chem. 2005, 2164.
19. Ji, L.-N.; Zou, X.-H.; Liu, J.-G. Coord. Chem. Rev. 2001, 216, 513.
20. Brennaman, M. K.; Alstrum-Acevedo, J. H.; Fleming, C. N.; Jang, P.; Meyer, T. J.; Papanikolas, J. M. J. Am. Chem. Soc. 2002, 124, 15094.
21. Brennaman, M. K.; Meyer, T. J.; Papanikolas, J. M. J. Phys. Chem. A 2004, 108, 9938.
22. Pourtois, G.; Beljonne, D.; Moucheron, C.; Schumm, S.; Mesmaeker, A. K.-D.; Lazzaroni, R.; Bredas, J.-L. J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 683.
23. Rajput, C.; Rutkaite, R.; Swanson, L.; Haq, I.; Thomas, J. A. Chem. - Eur. J. 2006, 12, 4611.
24. Bolger, J.; Gourdon, A.; Ishow, E.; Launay, J. Inorg. Chem. 1996, 35, 2937.
25. Ishow, E.; Gourdon, A.; Launay, J.; Lecante, P.; Vereist, M.; Chiorboli, C.; Scandola, F.; Bignozzi, C. Inorg. Chem. 1998, 37, 3603.
26. Calvert, J. M.; Caspar, J. V.; Binstead, R. A.; Westmoreland, T. D.; Meyer, T. J. J. Am. Chem. Soc. 1982, 104, 6620.
27. Demas, J. N.; Crosby, G. A. J. Phys. Chem. 1971, 75, 991.
28. Rieger, P.H. Electrochemistry, 2nd ed.; Chapman & Hall: New York, 1994.
29. Smith, S. R.; Neyhart, G. A.; Karlsbeck, W. A.; Thorp, H. H. New J. Chem. 1994, 18, 397.
30. Carter, M. T.; Rodriguez, M.; Bard, A. J. J. Am. Chem. Soc. 1989, 111, 8901.
31. Bradley, P. M.; Angeles-Boza, A. M.; Dunbar, K. R.; Turro, C. Inorg. Chem. 2004, 43, 2450.
32. Nair, R. B.; Teng, E. S.; Kirkland, S. L.; Murphy, C. J. Inorg. Chem. 1998, 37, 139.
33. Pyle, A. M.; Rehman, J. P.; Mehoyrer, R.; Kumar, C. V.; Turro, N. J.; Barton, J. K. J. Am. Chem. Soc. 1989, 111, 3051.
34. Frisch, M. J.; Trucks, G. W.; Schlegel, H. B.; Scuseria, G. E.; Robb, M. A.; Cheeseman, J. R.; Montgomery, J. A., Jr.; Vreven, T.; Kudin, K. N.; Burant, J. C.; Millam, J. M.; Iyengar, S. S.; Tomasi, J.; Barone, V.; Mennucci, B.; Cossi, M.; Scalmani, G.; Rega, N.; Petersson, G. A.; Nakatsuji, H.; Hada, M.; Ehara, M.; Toyota, K.; Fukuda, R.; Hasegawa, J.; Ishida, M.; Nakajima, T.; Honda, Y.; Kitao, O.; Nakai, H.; Klene, M.; Li, X.; Knox, J. E.; Hratchian, H. P.; Cross, J. B.; Adamo, C.; Jaramillo, J.; Gomperts, R.; Stratmann, R. E.; Yazyev, O.; Austin, A. J.; Cammi, R.; Pomelli, C.; Ochterski, J. W.; Ayala, P. Y.; Morokuma, K.; Voth, G. A.; Salvador, P.; Dannenberg, J. J.; Zakrzewski, V. G.; Dapprich, S.; Daniels, A. D.; Strain, M. C.; Farkas, O.; Malick, D. K.; Rabuck, A. D.; Raghavachari, K.; Foresman, J. B.; Ortiz, J. V.; Cui, Q.; Baboul, A. G.; Clifford, S.; Cioslowski, J.; Stefanov, B. B.; Liu, G.; Liashenko, A.; Piskorz, P.; Komaromi, I.; Martin, R. L.; Fox, D. J.; Keith, T.; Al-Laham, M. A.; Peng, C. Y.; Nanayakkara, A.; Challacombe, M.; Gill, P. M. W.; Johnson, B.; Chen, W.; Wong, M. W.; Gonzalez, C.; Pople, J. A. Gassian 03, revision C.02; Gaussian, Inc.: Wallingford, CT, 2004.
35. Becke, A. D. Phys. Rev. A: Gen. Phys. 1988, 38, 3098.
36. Becke, A. D. J. Chem. Phys. 1993, 98, 5648.
37. Lee, C.; Yang, W.; Parr, R. G. Phys. Rev. B: Condens. Matter Mater. Phys. 1988, 37, 785.
38. Hehre, W. J.; Radom, L.; Schleyer, P. v. R.; Pople, J. A. Ab Initio Molecular Orbital Theory; Wiley & Sons: New York, 1986.
39. Dolg, M.; Stoll, H.; Preuss, H. Theor. Chim. Acta 1993, 85, 441.
40. Wedig, U.; Dolg, M.; Stoll, H. Quantum Chemistry; The Challenge of Transition Metals and Coordination Chemistry; D. Reidel: Dordrecht, The Netherlands, 1986.
41. Fantacci, S.; De Angelis, F.; Selloni, A. J. Am. Chem. Soc. 2003, 125, 4381.
42. De Angelis, F.; Fantacci, S.; Selloni, A. Chem. Phys. Lett. 2004, 389, 204.
43. Cances, M. T.; Mennucci, B.; Tomasi, J. J. Chem. Phys. 1997, 107, 3032.
44. Tomasi, J.; Persico, M. Chem. Rev. 1994, 94, 2027.
45. Cossi, M.; Barone, V.; Mennucci, B.; Tomasi, J. Chem. Phys. Lett. 1998, 286, 253.
46. Mennucci, B.; Tomasi, J. J. Chem. Phys. 1997, 106, 5151.
47. Cossi, M.; Scalmani, G.; Rega, N.; Barone, V. J. Chem. Phys. 2002, 117, 43.
48. Flükiger, P.; Lüthi, H. P.; Portmann, S.; Weber, J. MOLEKEL 4.3; Swiss National Supercomputing Centre CSCS: Manno, Switzerland, 2000; www.cscs.ch/molekel.
49. Juris, A.; Balzani, V; Barigelletti, F.; Campagna, S.; Belser, P.; Von Zelewsky, A. Coord. Chem. Rev. 1988, 84, 85.
50. Watts, R. J. J. Chem. Educ. 1983, 60, 834.
51. Chiorboli, C.; Bignozzi, C. A.; Scandola, F.; Ishow, E.; Gourdon, A.; Launay, J.-P. Inorg. Chem. 1999, 38, 2402.
52. Chen, P.; Meyer, T. J. Chem. Rev. 1998, 98, 1439.
53. Gordon, A. J.; Ford, R. A. The Chemist Companion: A Handbook of Practical Data, Techniques, and References; Wiley & Sons: New York, 1972.
54. Caspar, J. V.; Meyer, T. J. J. Am. Chem. Soc. 1983, 105, 5583.
55. Timpson, C. J.; Bignozzi, C. A.; Sullivan, B. P.; Kober, E. M.; Meyer, T. J. J. Phys. Chem. 1996, 100, 2915.
56. Angeles-Boza, A. M.; Bradley, P. M.; Fu, P. K.-L.; Wicket, S. E.; Bacsa, J.; Dunbar, K. R.; Turro, C. Inorg. Chem. 2004, 43, 8510.
57. Suh, D.; Oh, Y.-K.; Chaires, J. B. Process Biochem. 2001, 37, 521.
58. Comings, D. C. Chromosoma 1975, 52, 229.
59. Haq, I.; Lincoln, P.; Suh, D.; Norden, B.; Chowdhry, B. Z.; Chaires, J. B. J. Am. Chem. Soc. 1995, 117, 4788.
60. Lohman, T. M.; Mascotti, D. P. Methods Enzymol. 1992, 212, 424.
61. Record, M. T.; Anderson, C. F.; Lohman, T. M. Q. Rev. Biophys. 1978, 86, 469.
62. Mudasir, Wijaya, K.; Wahyuni, E. T.; Yoshioka, N.; Inoue, H. Biophys. Chem. 2006, 121, 44.
63. Liu, F.; Wang, K.; Bai, G.; Zhang, Y.; Gao, L. Inorg. Chem. 2004, 43, 1799.
64. Hopkins, H. P.; Wilson, W. D. Biopolymers 1987, 26, 1347.
65. Wilhelmsson, L. M.; Westerlund, F.; Lincoln, P.; Nordén, B. J. Am. Chem. Soc. 2001, 123, 3630.
66. Pinnick, D. V.; Durham, B. Inorg. Chem. 1984, 23, 1440.