Energy transfer in single-stranded DNA-templated stacks of naphthalene chromophores

Journal of Physical Chemistry C

Volumn 115, Issue 21, 2011, Pages 10550-10560

  Stevens, Amy L ^a   Janssen, Pim G A ^b   Ruiz Carretero, Amparo ^b   Surin, Mathieu ^c   Schenning, Albertus P H J ^b   Herz, Laura M ^a  

^a UNIVERSITY OF OXFORD   (United Kingdom)

^b EINDHOVEN UNIVERSITY OF TECHNOLOGY   (Netherlands)

^c UNIVERSITY OF MONS   (Belgium)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ASSEMBLY STRUCTURES; CHIRAL ASSEMBLY; CIRCULAR DICHROISM; COMPLEX ASSEMBLY; DNA-TEMPLATE; DNA-TEMPLATED ASSEMBLY; DONOR-ACCEPTORS; EFFICIENT ENERGY TRANSFER; ENERGY-TRANSFER RATE; HYBRID STRUCTURE; LUMINESCENCE DECAYS; LUMINESCENCE LIFETIME; MOLECULAR DYNAMICS SIMULATIONS; MOLECULAR WIRES; NAPHTHALENE DERIVATIVES; SELF-ASSEMBLED DNA; TIME RESOLVED MEASUREMENT; TRANSFER EFFICIENCY; TRANSFER RATES;

CHROMOPHORES; DICHROISM; DNA; ENERGY TRANSFER; LUMINESCENCE; MOLECULAR DYNAMICS; STACKING FAULTS;

NAPHTHALENE;

EID: 79957870530     PISSN: 19327447     EISSN: 19327455     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp2036444     Document Type: Article

References (74)

1. Lehn, J. M.; Mascal, M.; Decian, A.; Fischer, J. J. Chem. Soc., Chem. Commun. 1990, 479-481
2. Lehn, J. M.; Rigault, A. Angew. Chem., Int. Ed. Engl. 1988, 27, 1095-1097
3. Lehn, J. M.; Rigault, A.; Siegel, J.; Harrowfield, J.; Chevrier, B.; Moras, D. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1987, 84, 2565-2569
4. Chang, M. H.; Hoeben, F. J. M.; Jonkheijm, P.; Schenning, A. P. H. J.; Meijer, E. W.; Silva, C.; Herz, L. M. Chem. Phys. Lett. 2006, 418, 196-201
5. Sherwood, G. A.; Cheng, R.; Smith, T. M.; Werner, J. H.; Shreve, A. P.; Peteanu, L. A.; Wildeman, J. J. Phys. Chem. C 2009, 113, 18851-18862
6. Spada, G. P.; Lena, S.; Masiero, S.; Pieraccini, S.; Surin, M.; Samor, P. Adv. Mater. 2008, 20, 2433-2438
7. Hannah, K. C.; Armitage, B. A. Acc. Chem. Res. 2004, 37, 845-853
8. Zhao, Z.; Yan, H.; Liu, Y. Angew. Chem., Int. Ed. 2010, 49, 1414-1417
9. Nakamura, M.; Ohtoshi, Y.; Yamana, K. Chem. Commun. 2005, 5163-5165
10. Janssen, P. G. A.; van Dongen, J. L. J.; Meijer, E. W.; Schenning, A. P. H. J. Chem.-Eur. J. 2009, 15, 352-360
11. Cooper, V. R.; Thonhauser, T.; Puzder, A.; Schröder, E.; Lundqvist, B. I.; Langreth, D. C. J. Am. Chem. Soc. 2008, 130, 1304-1308
12. Rothemund, P. W. K. Nature 2006, 440, 297-302
13. Dietz, H.; Douglas, S. M.; Shih, W. M. Science 2009, 325, 725-730
14. Park, S. H.; Yin, P.; Liu, Y.; Reif, J. H.; Labean, T. H.; Yan, H. Nano Lett. 2005, 5, 729-733
15. Pinto, Y. Y.; Le, J. D.; Seeman, N. C.; Musier-Forsyth, K.; Taton, T. A.; Kiehl, R. A. Nano Lett. 2005, 5, 2399-2402
16. Mayer-enthart, E.; Wagner, C.; Barbaric, J.; Wagenknecht, H. A. Tetrahedron 2007, 63, 3434-3439
17. Häner, R.; Samain, F.; Malinovskii, V. L. Chem.-Eur. J. 2009, 15, 5701-5708
18. Ueno, Y.; Komatsuzaki, S.; Takasu, K.; Kawai, S.; Kitamura, Y.; Kitade, Y. Eur. J. Org. Chem. 2009, 2009, 4763-4769
19. Iwaura, R.; Hoeben, F. J. M.; Masuda, M.; Schenning, A. P. H. J.; Meijer, E. W.; Shimizu, T. J. Am. Chem. Soc. 2006, 128, 13298-13304
20. Iwaura, R.; Yoshida, K.; Masuda, M.; Ohnishi-kameyama, M.; Yoshida, M.; Shimizu, T. Angew. Chem., Int. Ed. 2003, 42, 1009-1012
21. Janssen, P. G. A.; Brankaert, N. J. M.; Vila, X.; Schenning, A. P. H. J. Soft Matter 2010, 6, 1494-1502
22. Yang, W.; Xia, P. F.; Wong, M. S. Org. Lett. 2010, 12, 4018-4021
23. Shroff, H.; Reinhard, B. M.; Siu, M.; Agarwal, H.; Spakowitz, A.; Liphardt, J. Nano Lett. 2005, 5, 1509-1514
24. Johansson, M. K.; Fidder, H.; Dick, D.; Cook, R. M. J. Am. Chem. Soc. 2002, 124, 6950-6956
25. Sánchesz-Mosteiro, G.; van Dijk, E. M. H. P.; Hernando, J.; Heilemann, M.; Tinnefeld, P.; Sauer, M.; Koberlin, F.; Patting, M.; Wahl, M.; Erdmann, R.; van Hulst, N. F.; García-Parajó, M. F. J. Phys. Chem. B 2006, 110, 26349-26353
26. Hannestad, J. K.; Sandin, P.; Albinsson, B. J. Am. Chem. Soc. 2008, 130, 15889-15895
27. Johansson, M. K.; Cook, R. M. Chem.-Eur. J. 2003, 9, 3466-3471
28. Somsen, O. J. G.; Keukens, L. B.; de Keijzer, M. N.; van Hoek, A.; van Amerongen, H. ChemPhysChem 2005, 6, 1622-1627
29. Martí, A. A.; Jockusch, S.; Li, Z. M.; Ju, J. Y.; Turro, N. J. Nucleic Acids Res. 2006, 34, e50
30. Förster, T. H. Discuss. Faraday Soc. 1959, 27, 7-17
31. Lunz, M.; Bradley, A. L.; Chen, W. Y.; Gun'ko, Y. K. J. Phys. Chem. C 2009, 113, 3084-3088
32. Parkinson, P.; Aharon, E.; Chang, M. H.; Dosche, C.; Frey, G. L.; Köhler, A.; Herz, L. M. Phys. Rev. B 2007, 75, 165206
33. Herz, L. M.; Daniel, C.; Silva, C.; Hoeben, F. J. M.; Schenning, A. P. H. J.; Meijer, E. W.; Friend, R. H.; Phillips, R. T. Phys. Rev. B 2003, 68, 45203
34. Maliwal, B. P.; Kuśba, J.; Lakowicz, J. R. Biopolymers 1995, 35, 245-255
35. Chang, M. H.; Frampton, M. J.; Anderson, H. L.; Herz, L. M. Phys. Rev. Lett. 2007, 98, 27402
36. Chang, M. H.; Hoffmann, M.; Anderson, H. L.; Herz, L. M. J. Am. Chem. Soc. 2008, 130, 10171-10178
37. Beljonne, D.; Hennebicq, E.; Daniel, C.; Herz, L. M.; Silva, C.; Scholes, G. D.; Hoeben, F. J. M.; Jonkheijm, P.; Schenning, A. P. H. J.; Meskers, S. C. J.; Phillips, R. T.; Friend, R. H.; Meijer, E. W. J. Phys. Chem. B 2005, 109, 10594-10604
38. Janssen, P. G. A.; Ruiz-Carretero, A.; González-Rodríguez, D.; Meijer, E. W.; Schenning, A. P. H. J. Angew. Chem., Int. Ed. 2009, 48, 8103-8106
39. Ruiz-Carretero, A.; Janssen, P. G. A.; Stevens, A. L.; Surin, M.; Herz, L. M.; Schenning, A. P. H. J. Chem. Commun. 2011, 47, 884
40. Janssen, P. G. A. DNA templated self-assembly. Ph.D. Thesis, Eindhoven University of Technology, Eindhoven, The Netherlands, 2009
41. Janssen, P. G. A.; Jabbari-farouji, S.; Surin, M.; Vila, X.; Gielen, J. C.; de Greef, T. F. A.; Vos, M. R. J.; Bomans, P. H. H.; Sommerdijk, N. A. J. M.; Christianen, P. C. M.; Leclére, P.; Lazzaroni, R.; van der Schoot, P.; Meijer, E. W.; Schenning, A. P. H. J. J. Am. Chem. Soc. 2009, 131, 1222-1231
42. Janssen, P. G. A.; Vandenbergh, J.; van Dongen, J. L. J.; Meijer, E. W.; Schenning, A. P. H. J. J. Am. Chem. Soc. 2007, 129, 6078-6079
43. Surin, M.; Janssen, P. G. A.; Lazzaroni, R.; Leclére, P.; Meijer, E. W.; Schenning, A. P. H. J. Adv. Mater. 2009, 21, 1126-1130
44. Kasha, M.; Rawls, H. R.; Ashraf El Bayoumi, M. Pure Appl. Chem. 1965, 11, 371-392
45. Harvey, B. J.; Levitus, M. J. Fluoresc. 2009, 19, 443-448
46. Sanborn, M. E.; Connolly, B. K.; Gurunathan, K.; Levitus, M. J. Phys. Chem. B 2007, 111, 11064-11074
47. Torimura, M.; Kurata, S.; Yamada, K.; Yokomaku, T.; Kamagata, Y.; Kanagawa, T.; Kurane, R. Anal. Sci. 2001, 17, 155-160
48. Lv, W.; Chen, X. D.; Aumiler, D.; Xia, A. D. Sci. China Ser. B: Chem. 2009, 52, 1148-1153
49. Iqbal, A.; Arslan, S.; Okumus, B.; Wilson, T. J.; Giraud, G.; Norman, D. G.; Ha, T.; Lilley, D. M. J. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2008, 105, 11176-11181
50. Levitus, M.; Negri, R. M.; Aramendía, P. F. J. Phys. Chem. 1995, 99, 14231-14239
51. Herz, L. M.; Silva, C.; Friend, R. H.; Phillips, R. T.; Setayesh, S.; Becker, S.; Marsitsky, D.; Müllen, K. Phys. Rev. B 2001, 64, 195203
52. Beljonne, D.; Pourtois, G.; Silva, C.; Hennebicq, E.; Herz, L. M.; Friend, R. H.; Scholes, G. D.; Setayesh, S.; Müllen, K.; Brédas, J. L. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2002, 99, 10982-10987
53. Herz, L. M.; Silva, C.; Grimsdale, A. C.; Müllen, K.; Phillips, R. T. Phys. Rev. B 2004, 70 165207
54. Berberan-Santos, M. N.; Bodunov, E. N.; Valeur, B. Chem. Phys. 2005, 315, 171-182
55. Baumann, J.; Fayer, M. D. J. Chem. Phys. 1986, 85, 4087-4107
56. Blumen, A.; Manz, J. J. Chem. Phys. 1979, 71, 4694-4702
57. Norman, D. G.; Grainger, R. J.; Uhrín, D.; Lilley, D. M. J. Biochemistry 2000, 39, 6317-6324
58. Pariser, R.; Parr, R. G. J. Chem. Phys. 1953, 21, 466-471
59. Platt, J. R. J. Chem. Phys. 1949, 17, 484-495
60. Klevens, H. B.; Platt, J. R. J. Chem. Phys. 1949, 17, 470-481
61. McClure, D. S. J. Chem. Phys. 1954, 22, 1668-1675
62. Pariser, R. J. Chem. Phys. 1956, 24, 250-268
63. Craig, D. P.; Hollas, J. M.; Redies, M. F.; Wait, S. C. Philos. Trans. R. Soc. London 1961, 253, 543
64. Berden, G.; Meerts, W. L.; Plusquellic, D. F.; Fujita, I.; Pratt, D. W. J. Chem. Phys. 1996, 104, 3935-3946
65. Hashimoto, T.; Nakano, H.; Hirao, K. J. Chem. Phys. 1996, 104, 6244-6258
66. Sony, P.; Shukla, A. Phys. Rev. B 2007, 75 155208
67. Iqbal, A.; Wang, L.; Thompson, K. C.; Lilley, D. M. J.; Norman, D. G. Biochemistry 2008, 47, 7857-7862
68. Ohta, N.; Matsunami, S.; Okazaki, S.; Yamazaki, I. Langmuir 1994, 10, 3909-3912
69. Ranjit, S.; Gurunathan, K.; Levitus, M. J. Phys. Chem. B 2009, 113, 7861-7866
70. Maksimov, M. Z.; Rozman, I. M. Opt. Spectrosc. 1961, 12, 337-338
71. Harvey, B. J.; Perez, C.; Levitus, M. Photochem. Photobiol. Sci. 2009, 8, 1105-1110
72. Schmid, S. A.; Abbel, R.; Schenning, A. P. H. J.; Meijer, E. W.; Herz, L. M. Phys. Rev. B 2010, 81 085438
73. Daniel, C.; Herz, L. M.; Beljonne, D.; Hoeben, F. J. M.; Jonkheijm, P.; Schenning, A. P. H. J.; Meijer, E. W.; Phillips, R. T.; Silva, C. Synth. Met. 2004, 147, 29-35
74. Schmid, S. A.; Abbel, R.; Schenning, A. P. H.; Meijer, E. W.; Sijbesma, R. P.; Herz, L. M. J. Am. Chem. Soc. 2009, 131, 17696-17704