An amyloid-like fibril-forming supramolecular cross-β-structure of a model peptide: A crystallographic insight

Organic and Biomolecular Chemistry

Volumn 9, Issue 10, 2011, Pages 3787-3791

  Maity, Sibaprasad ^a   Kumar, Pankaj ^a   Haldar, Debasish ^a  

^a INDIAN INSTITUTE OF SCIENCE EDUCATION AND RESEARCH KOLKATA   (India)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ALZHEIMER'S; AMYLOID-LIKE FIBRIL; ATOMIC LEVEL STRUCTURE; BEARING SEQUENCES; CONGO RED; HYDROPHOBIC CLUSTERS; MODEL PEPTIDES; SINGLE CRYSTAL X-RAY DIFFRACTION;

ATOMIC FORCE MICROSCOPY; AZO DYES; GLYCOPROTEINS; PEPTIDES; SINGLE CRYSTALS; SUPRAMOLECULAR CHEMISTRY; X RAY DIFFRACTION;

CRYSTAL ATOMIC STRUCTURE;

AMYLOID BETA PROTEIN;

ARTICLE; CHEMICAL PHENOMENA; CHEMICAL STRUCTURE; CHEMISTRY; HYDROGEN BOND; PROTEIN MULTIMERIZATION; PROTEIN SECONDARY STRUCTURE; X RAY CRYSTALLOGRAPHY;

AMYLOID BETA-PEPTIDES; CRYSTALLOGRAPHY, X-RAY; HYDROGEN BONDING; HYDROPHOBIC AND HYDROPHILIC INTERACTIONS; MODELS, MOLECULAR; PROTEIN MULTIMERIZATION; PROTEIN STRUCTURE, SECONDARY;

EID: 79955414046     PISSN: 14770520     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/c0ob01033b     Document Type: Article

References (52)

1. P. T. Lansbury Acc. Chem. Res. 1996 29 317
2. G. Taubes Science 1996 271 1493
3. R. Baumeister S. Eimer Angew. Chem., Int. Ed. 1998 37 2978
4. S. Chen F. A. Ferrone R. Wetzel Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2002 99 11884
5. Y. N. Machida M. Kurosawa N. Nukina K. Ito T. Oda M. Tanaka Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2009 106 9679
6. L. Marzban C. B. Verchere Diabetes 2004 28 39
7. S. B. L. Ng A. Doig Chem. Soc. Rev. 1997 26 425
8. S. B. Prusiner Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1998 95 13363
9. J. C. Rochet P. T. Lansbury Curr. Opin. Struct. Biol. 2000 10 60
10. M. Sadqi F. Hernández U. Pan M. Pérez M. D. Schaeberle J. Avila V. Muñoz Biochemistry 2002 41 7150
11. E. Junn R. D. Ronchetti M. M. Quezado S. Y. Kim M. M. Mouradian Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2003 100 2047
12. B. Dermaut S. K. Singh C. D. Jonghe M. A. Cruts U. Löigren P. Lübke R. Cras P. P. Dom D. Deyn J. J. Martin C. V. Broeckhoven Brain 2001 124 2383
13. L. Puglielli R. E. Tanzi D. M. Kovacs Nat. Neurosci. 2003 6 345
14. T. S. Burkoth T. L. S. Benzinger V. Urban D. M. Morgan D. M. Gregory P. Thiyagarajan R. E. Botto S. C. Meredith D. G. Lynn J. Am. Chem. Soc. 2000 122 7883
15. G. T. Dolphin P. Dumy Garcia Angew. Chem., Int. Ed. 2006 45 2699
16. E. Gaggelli H. Kozlowski D. Valensin G. Valensin Chem. Rev. 2006 106 1995
17. E. E. Nesterov J. Skoch B. T. Hyman W. E. Klunk B. J. Bacskai T. M. Swager Angew. Chem., Int. Ed. 2005 44 5452
18. A. K. Paravastu I. Qahwash R. D. Leapman S. C. Meredth R. Tyco Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2009 106 7443
19. M. Paz L. Serranno Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2004 101 87
20. R. Azriel E. Gazit J. Biol. Chem. 2001 276 34156
21. O. S. Makin E. Atkins P. Sikorski J. Johansson L. C. Serpell Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2005 102 315
22. R. P. Friedrich K. Tepper R. Ronicke M. Soom M. Westermann K. Reymann C. Kaether M. Fandrich Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2010 107 1942
23. M. R. Sawaya S. Sambashivan R. Nelson M. I. Ivanova S. A. Sievers M. I. Apostol M. J. Thompson M. Balbirnie J. J. W. Wiltzius H. T. McFarlane A. O. Madsen C. Riekel D. Eisenberg Nature 2007 447 453
24. R. Nelson M. R. Sawaya M. Balbirnie A. O. Madsen C. Riekel R. Grothe D. Eisenberg Nature 2005 435 773
25. P. T. Lansbury P. R. Costa J. M. Griffiths E. J. Simon M. Auger K. J. Halverson D. A. Kocisko Z. S. Hendsch T. T. Ashburn R. G. S. Spencer B. Tidor R. G. Griffin Nat. Struct. Biol. 1995 2 990
26. J. Naskar M. G. B. Drew I. Deb S. Das A. Banerjee Org. Lett. 2008 10 2625
27. S. Ray A. K. Das M. G. B. Drew A. Banerjee Chem. Commun. 2006 4230
28. J. J. Balbach Y. Ishii O. N. Antzutkin R. D. Leapman N. W. Rizto F. Dyda J. Reed R. Tycko Biochemistry 2000 39 13748
29. A. T. Petkova G. Buntkowsky F. Dyda R. D. Leapman W. M. Yau R. Tycko J. Mol. Biol. 2004 335 247
30. A. T. Petkova Y. Ishii J. J. Balbach O. N. Antzutkin R. D. Leapman F. Delaglio R. Tycko Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2002 99 16742
31. K. Iwata T. Fujiwara Y. Matsuki H. Akutsu T. S. H. Naiki Y. Goto Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2006 103 18119
32. S. A. Jayasinghe R. Langen J. Biol. Chem. 2004 279 48420
33. A. Der-Sarkissian C. C. Jao J. Chen R. Langen J. Biol. Chem. 2003 278 37530
34. D. Haldar A. Banerjee Int. J. Pept. Res. Ther. 2006 12 341
35. D. Haldar A. Banerjee Int. J. Pept. Res. Ther. 2007 13 439
36. D. M. Walsh D. M. Hartley M. M. Condron D. J. Selkoe D. B. Teplow Biochem. J. 2001 355 869
37. B. Urbanc L. Cruz S. Yun S. V. Buldyrev G. Bitan D. B. Teplow H. E. Stanley Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2004 101 17345
38. J. C. Rochet P. T. Jr. Lansbury Curr. Opin. Struct. Biol. 2000 10 60
39. D. L. Taylor R. D. Allen E. P. Benditt J. Histochem. Cytochem. 1974 22 1105
40. R. Meital Y. Parot E. Gazit J. Biol. Chem. 2002 277 35475
41. Y. S. Kim T. W. Randolph M. C. Manning F. J. Stevens J. F. Carpenter J. Biol. Chem. 2003 278 10842
42. C. Toniolo M. Palumbo Biopolymers 1977 16 219 224
43. V. Moretto M. Crisma G. M. Bonora C. Toniolo H. Balaram P. Balaram Macromolecules 1989 22 2939 2944
44. G. P. Dado S. H. Gellman J. Am. Chem. Soc. 1994 116 1054
45. S. E. Blondelle B. Forood A. R. Houghten E. Peraz-Paya Biochemistry 1997 36 8393
46. P. I. Haris D. Chapman Biopolymers 1995 37 251
47. K. Channona C. E. MacPhee Soft Matter 2008 4 647
48. C. H. Gorbitz Acta Crystallogr., Sect. B: Struct. Sci. 2002 58 512
49. P. Tamamis L. A. Abramovich M. Reches K. Marshall P. Sikorski L. Serpell E. Gazit G. Archontis Biophys. J. 2009 96 5020
50. A. M. Smith R. J. Williams C. Tang P. Coppo R. F. Collins M. L. Turner A. Saiani R. V. Ulijn Adv. Mater. 2008 20 37
51. L. Chen K. Morris A. Laybourn D. Elias M. R. Hicks A. Rodger L. Serpell D. J. Adams Langmuir 2010 26 5232
52. G. M. Sheldrick, SHELX97, University of Göttingen, Germany, 1997