Receptor domains of two-component signal transduction systems

Molecular BioSystems

Volumn 7, Issue 5, 2011, Pages 1388-1398

  Perry, Julie ^a   Koteva, Kalinka ^a   Wright, Gerard ^a  

^a MCMASTER UNIVERSITY   (Canada)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ADENOSINE TRIPHOSPHATE; CELL SURFACE RECEPTOR; LIGAND; PROTEIN HISTIDINE KINASE; PROTEIN KINASE; PROTEIN-HISTIDINE KINASE;

ARTICLE; BINDING SITE; BIOLOGICAL MODEL; METABOLISM; PHOSPHORYLATION; PROTEIN BINDING; SIGNAL TRANSDUCTION;

ADENOSINE TRIPHOSPHATE; BINDING SITES; LIGANDS; MODELS, BIOLOGICAL; PHOSPHORYLATION; PROTEIN BINDING; PROTEIN KINASES; RECEPTORS, CELL SURFACE; SIGNAL TRANSDUCTION;

ARCHAEA; FUNGI; PROKARYOTA;

EID: 79954505968     PISSN: 1742206X     EISSN: 17422051     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/c0mb00329h     Document Type: Article

References (119)

1. M. Y. Galperin Curr. Opin. Microbiol. 2010 13 150 159
2. E. Zientz J. Bongaerts G. Unden J. Bacteriol. 1998 180 5421 5425
3. A. Busch J. Lacal A. Martos J. L. Ramos T. Krell Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2007 104 13774 13779
4. S. B. Williams V. Stewart Mol. Microbiol. 1997 26 911 925
5. B. L. Bassler R. Losick Cell (Cambridge, Mass.) 2006 125 237 246
6. R. P. Novick S. J. Projan J. Kornblum H. F. Ross G. Ji B. Kreiswirth F. Vandenesch S. Moghazeh MGG, Mol. Gen. Genet. 1995 248 446 458
7. E. V. Pestova L. S. Havarstein D. A. Morrison Mol. Microbiol. 1996 21 853 862
8. D. Schultz P. G. Wolynes E. Ben Jacob J. N. Onuchic Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2009 106 21027 21034
9. J. S. Wright, III G. J. Lyon E. A. George T. W. Muir R. P. Novick Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2004 101 16168 16173
10. P. Mayville G. Ji R. Beavis H. Yang M. Goger R. P. Novick T. W. Muir Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1999 96 1218 1223
11. J. G. Cao E. A. Meighen J. Biol. Chem. 1989 264 21670 21676
12. B. L. Bassler M. Wright R. E. Showalter M. R. Silverman Mol. Microbiol. 1993 9 773 786
13. J. M. Henke B. L. Bassler J. Bacteriol. 2004 186 6902 6914
14. W. L. Ng Y. Wei L. J. Perez J. Cong T. Long M. Koch M. F. Semmelhack N. S. Wingreen B. L. Bassler Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2010 107 5575 5580
15. J. Cheung W. A. Hendrickson Curr. Opin. Microbiol. 2010 13 116 123
16. A. M. Stock V. L. Robinson P. N. Goudreau Annu. Rev. Biochem. 2000 69 183 215
17. J. Cheung C. A. Bingman M. Reyngold W. A. Hendrickson C. D. Waldburger J. Biol. Chem. 2008 283 13762 13770
18. U. S. Cho M. W. Bader M. F. Amaya M. E. Daley R. E. Klevit S. I. Miller W. Xu J. Mol. Biol. 2006 356 1193 1206
19. J. Cheung W. A. Hendrickson J. Biol. Chem. 2008 283 30256 30265
20. L. Pappalardo I. G. Janausch V. Vijayan E. Zientz J. Junker W. Peti M. Zweckstetter G. Unden C. Griesinger J. Biol. Chem. 2003 278 39185 39188
21. S. Reinelt E. Hofmann T. Gerharz M. Bott D. R. Madden J. Biol. Chem. 2003 278 39189 39196
22. M. Sevvana V. Vijayan M. Zweckstetter S. Reinelt D. R. Madden R. Herbst-Irmer G. M. Sheldrick M. Bott C. Griesinger S. Becker J. Mol. Biol. 2008 377 512 523
23. M. B. Neiditch M. J. Federle S. T. Miller B. L. Bassler F. M. Hughson Mol. Cell 2005 18 507 518
24. M. B. Neiditch M. J. Federle A. J. Pompeani R. C. Kelly D. L. Swem P. D. Jeffrey B. L. Bassler F. M. Hughson Cell (Cambridge, Mass.) 2006 126 1095 1108
25. J. Cheung W. A. Hendrickson Structure 2009 17 190 201
26. J. O. Moore W. A. Hendrickson Structure 2009 17 1195 1204
27. C. Baraquet L. Theraulaz M. Guiral D. Lafitte V. Mejean C. Jourlin-Castelli J. Biol. Chem. 2006 281 38189 38199
28. J. Cheung M. Le-Khac W. A. Hendrickson Proteins: Struct., Funct., Bioinf. 2009 77 235 241
29. B. L. Taylor I. B. Zhulin Microbiol. Mol. Biol. Rev. 1999 63 479 506
30. J. Key V. Srajer R. Pahl K. Moffat Biochemistry 2007 46 4706 4715
31. R. A. Ayers K. Moffat Biochemistry 2008 47 12078 12086
32. M. Bekker S. Alexeeva W. Laan G. Sawers J. Teixeira de Mattos K. Hellingwerf J. Bacteriol. 2010 192 746 754
33. R. Malpica B. Franco C. Rodriguez O. Kwon D. Georgellis Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2004 101 13318 13323
34. Y. S. Ho L. M. Burden J. H. Hurley EMBO J. 2000 19 5288 5299
35. L. M. Podust A. Ioanoviciu P. R. Ortiz de Montellano Biochemistry 2008 47 12523 12531
36. H. Y. Cho H. J. Cho Y. M. Kim J. I. Oh B. S. Kang J. Biol. Chem. 2009 284 13057 13067
37. X. Yang J. Kuk K. Moffat Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2009 106 15639 15644
38. X. Yang J. Kuk K. Moffat Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2008 105 14715 14720
39. D. R. Scott E. A. Marcus Y. Wen S. Singh J. Feng G. Sachs J. Bacteriol. 2010 192 94 103
40. J. A. Gegner D. R. Graham A. F. Roth F. W. Dahlquist Cell (Cambridge, Mass.) 1992 70 975 982
41. Y. Liu M. Levit R. Lurz M. G. Surette J. B. Stock EMBO J. 1997 16 7231 7240
42. J. Stock Curr. Biol. 1999 9 R364 367
43. V. L. Robinson D. R. Buckler A. M. Stock Nat. Struct. Biol. 2000 7 626 633
44. A. M. Bilwes L. A. Alex B. R. Crane M. I. Simon Cell (Cambridge, Mass.) 1999 96 131 141
45. T. Tanaka S. K. Saha C. Tomomori R. Ishima D. Liu K. I. Tong H. Park R. Dutta L. Qin M. B. Swindells T. Yamazaki A. M. Ono M. Kainosho M. Inouye M. Ikura Nature 1998 396 88 92
46. M. Tsuzuki K. Ishige T. Mizuno Mol. Microbiol. 1995 18 953 962
47. H. Zhou D. F. Lowry R. V. Swanson M. I. Simon F. W. Dahlquist Biochemistry 1995 34 13858 13870
48. M. Kato T. Mizuno T. Shimizu T. Hakoshima Cell (Cambridge, Mass.) 1997 88 717 723
49. K. I. Varughese Madhusudan X. Z. Zhou J. M. Whiteley J. A. Hoch Mol. Cell 1998 2 485 493
50. Q. Xu V. Nguyen A. H. West Acta Crystallogr. 1999 55 291 293
51. H. Sugawara Y. Kawano T. Hatakeyama T. Yamaya N. Kamiya H. Sakakibara Protein Sci. 2005 14 202 208
52. P. Casino V. Rubio A. Marina Curr. Opin. Struct. Biol. 2010 20 763 771
53. P. Casino V. Rubio A. Marina Cell (Cambridge, Mass.) 2009 139 325 336
54. M. Perego C. Hanstein K. M. Welsh T. Djavakhishvili P. Glaser J. A. Hoch Cell (Cambridge, Mass.) 1994 79 1047 1055
55. A. Marina C. D. Waldburger W. A. Hendrickson EMBO J. 2005 24 4247 4259
56. J. B. Stock A. M. Stock J. M. Mottonen Nature 1990 344 395 400
57. D. Wylie A. Stock C. Y. Wong J. Stock Biochem. Biophys. Res. Commun. 1988 151 891 896
58. A. M. Spronk H. Yoshida H. G. Wood Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1976 73 4415 4419
59. W. T. Wolodko M. E. Fraser M. N. James W. A. Bridger J. Biol. Chem. 1994 269 10883 10890
60. S. Morera M. Chiadmi G. LeBras I. Lascu J. Janin Biochemistry 1995 34 11062 11070
61. M. M. McEvoy F. W. Dahlquist Curr. Opin. Struct. Biol. 1997 7 793 797
62. Y. Kim K. H. Pesis H. R. Matthews Biochim. Biophys. Acta, Mol. Cell Res. 1995 1268 221 228
63. G. Di Sabato W. P. Jencks J. Am. Chem. Soc. 1961 83 4400 4405
64. R. S. Anthony L. B. Spector J. Biol. Chem. 1972 247 2120 2125
65. I. S. Ridder H. J. Rozeboom B. W. Dijkstra Acta Crystallogr. 1999 55 1273 1290
66. D. A. Sanders B. L. Gillece-Castro A. M. Stock A. L. Burlingame D. E. Koshland, Jr. J. Biol. Chem. 1989 264 21770 21778
67. W. P. Jencks Adv. Enzymol. Relat. Areas Mol. Biol. 1980 51 75 106
68. C. Tanford FEBS Lett. 1984 166 1 7
69. L. Aravind M. Y. Galperin E. V. Koonin Trends Biochem. Sci. 1998 23 127 129
70. C. M. Pickart W. P. Jencks J. Biol. Chem. 1984 259 1629 1643
71. R. B. Bourret Curr. Opin. Microbiol. 2010 13 142 149
72. R. D. Finn J. Mistry J. Tate P. Coggill A. Heger J. E. Pollington O. L. Gavin P. Gunasekaran G. Ceric K. Forslund L. Holm E. L. Sonnhammer S. R. Eddy A. Bateman Nucleic Acids Res. 2010 38 D211 D222
73. D. R. Buckler Y. Zhou A. M. Stock Structure 2002 10 153 164
74. I. Baikalov I. Schroder M. Kaczor-Grzeskowiak K. Grzeskowiak R. P. Gunsalus R. E. Dickerson Biochemistry 1996 35 11053 11061
75. D. J. Sidote C. M. Barbieri T. Wu A. M. Stock Structure 2008 16 727 735
76. M. Goulian Curr. Opin. Microbiol. 2010 13 184 189
77. T. Miyashiro M. Goulian Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2008 105 17457 17462
78. A. A. Gusa J. R. Scott Mol. Microbiol. 2005 56 1195 1207
79. A. Francez-Charlot J. Frunzke C. Reichen J. Z. Ebneter B. Gourion J. A. Vorholt Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2009 106 3467 3472
80. J. A. Lesley C. D. Waldburger J. Biol. Chem. 2001 276 30827 30833
81. E. H. Sousa G. Gonzalez M. A. Gilles-Gonzalez Biochemistry 2005 44 15359 15365
82. S. Kaspar R. Perozzo S. Reinelt M. Meyer K. Pfister L. Scapozza M. Bott Mol. Microbiol. 1999 33 858 872
83. J. Ouyang X. L. Tian J. Versey A. Wishart Y. H. Li Antimicrob. Agents Chemother. 2010 54 3895 3906
84. R. Ohki Giyanto K. Tateno W. Masuyama S. Moriya K. Kobayashi N. Ogasawara Mol. Microbiol. 2003 49 1135 1144
85. M. I. Hutchings H. J. Hong M. J. Buttner Mol. Microbiol. 2006 59 923 935
86. L. J. Kenney Arch. Biochem. Biophys. 1997 346 303 311
87. I. G. Janausch I. Garcia-Moreno G. Unden J. Biol. Chem. 2002 277 39809 39814
88. J. Li R. V. Swanson M. I. Simon R. M. Weis Biochemistry 1995 34 14626 14636
89. O. Kwon D. Georgellis E. C. Lin J. Bacteriol. 2000 182 3858 3862
90. M. T. Laub M. Goulian Annu. Rev. Genet. 2007 41 121 145
91. J. R. Kirby Annu. Rev. Microbiol. 2009 63 45 59
92. M. Jiang W. Shao M. Perego J. A. Hoch Mol. Microbiol. 2000 38 535 542
93. D. Burbulys K. A. Trach J. A. Hoch Cell (Cambridge, Mass.) 1991 64 545 552
94. E. Alm K. Huang A. Arkin PLoS Comput. Biol. 2006 2 e143
95. M. M. Igo A. J. Ninfa J. B. Stock T. J. Silhavy Genes Dev. 1989 3 1725 1734
96. B. L. Wanner J. Cell. Biochem. 1993 51 47 54
97. M. Arthur C. Molinas P. Courvalin J. Bacteriol. 1992 174 2582 2591
98. G. D. Wright T. R. Holman C. T. Walsh Biochemistry 1993 32 5057 5063
99. S. L. Fisher W. Jiang B. L. Wanner C. T. Walsh J. Biol. Chem. 1995 270 23143 23149
100. A. Siryaporn M. Goulian Mol. Microbiol. 2008 70 494 506
101. A. J. Ninfa S. Ueno-Nishio T. P. Hunt B. Robustell B. Magasanik J. Bacteriol. 1986 168 1002 1004
102. J. F. Hess K. Oosawa P. Matsumura M. I. Simon Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1987 84 7609 7613
103. B. E. Scharf Curr. Opin. Microbiol. 2010 13 246 252
104. G. S. Lukat W. R. McCleary A. M. Stock J. B. Stock Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1992 89 718 722
105. A. Ferre J. De La Mora T. Ballado L. Camarena G. Dreyfus J. Bacteriol. 2004 186 5172 5177
106. R. E. Silversmith M. D. Levin E. Schilling R. B. Bourret J. Biol. Chem. 2008 283 756 765
107. J. M. Kee B. Villani L. R. Carpenter T. W. Muir J. Am. Chem. Soc. 2010 132 14327 14329
108. H. K. Carlson L. Plate M. S. Price J. J. Allen K. M. Shokat M. A. Marletta Anal. Biochem. 397 139 143
109. P. M. Wolanin D. J. Webre J. B. Stock Biochemistry 2003 42 14075 14082
110. C. M. Barbieri A. M. Stock Anal. Biochem. 2008 376 73 82
111. D. L. Purich Methods Enzymol. 2002 354 168 177
112. P. G. Besant P. V. Attwood Int. J. Biochem. Cell Biol. 2000 32 243 253
113. P. G. Besant P. V. Attwood Mol. Cell. Biochem. 2009 329 93 106
114. Two-component Signalling Systems Part A, ed., M. I. Simon,,, B. R. Crane, and, A. Crane,, 2007
115. Two-Component Signalling Systems Part B, ed., M. I. Simon,,, B. R. Crane, and, A. Crane,, 2007
116. K. Koteva H. J. Hong X. D. Wang I. Nazi D. Hughes M. J. Naldrett M. J. Buttner G. D. Wright Nat. Chem. Biol. 2010 6 327 329
117. M. Arthur C. Molinas T. D. Bugg G. D. Wright C. T. Walsh P. Courvalin Antimicrob. Agents Chemother. 1992 36 867 869
118. H. J. Hong M. I. Hutchings M. J. Buttner Adv. Exp. Med. Biol. 2008 631 200 213
119. C. D. Waldburger R. T. Sauer J. Biol. Chem. 1996 271 26630 26636